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Acide aminé protéinogène

Indice Acide aminé protéinogène

groupe aldéhyde sur l'atome d'azote de l'amine primaire Un acide aminé protéinogène est un acide aminé incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.

145 relations: Acide, Acide aminé, Acide aminé essentiel, Acide aminé non protéinogène, Acide aspartique, Acide carboxyglutamique, Acide carboxylique, Acide désoxyribonucléique, Acide glutamique, Acide γ-aminobutyrique, Acide nucléique, Acide ribonucléique, Acide ribonucléique messager, Adrénaline, Alanine, Alberta, Aldéhyde, Alimentation, Amide, Amine (chimie), Ammonium, Analogue structurel, Antioxydant, Archaea, Arginine, Asparagine, Atome, Azoline, Azote, Élément PYLIS, Élément SECIS, État natif (biochimie), Bactérie, Base (chimie), Bioessays, Biosynthèse des protéines, Carboxyle, Chaîne latérale, Changement conformationnel, Charge électrique, Chiralité (chimie), Chloroplaste, Chymotrypsine, Code génétique, Codon, Codon-stop, Collagène, Composé aliphatique, Composé aromatique, Composé cyclique, ..., Constante d'acidité, Corps humain, Cystéine, Cystine, Cytosol, DOPA, Encombrement stérique, Endosome, Enzyme, Enzyme digestive, Espèce chimique, Eukaryota, Feuillet bêta, Fluorescence, Glutamine, Glycine (acide aminé), Groupe fonctionnel, Guanidine, Hélice alpha, Histidine, Homo sapiens, Hormone thyroïdienne, Hydrogène, Hydrophilie, Hydrophobie (physique), Hydroxylation, Hydroxyle, Hydroxyproline, Imidazole, Indole, Insuline, Ion, Ionisation, Isoleucine, Kératine, Labilité, Leucine, Lysine, Lysosome, Masse moléculaire, Mélanine, Métabolisme, Métabolisme méthanogène, Métal, Méthionine, Méthyle, Mitochondrie, Modification post-traductionnelle, Molécule, N-Formylméthionine, Noyau (biologie), Pepsine, Phénol (groupe), Phénylalanine, Phényle, Point isoélectrique, Polarité (chimie), Polypeptide, Pont disulfure, Potentiel d'oxydoréduction, Précurseur (chimie), Prokaryota, Proline, Protéine, Protonation, Pyrrolysine, Rayon de van der Waals, Réducteur (chimie), Résidu (biochimie), Repliement des protéines, Ribonucléase pancréatique bovine, Ribosome, Sélénium, Sélénocystéine, Séquence (acide nucléique), Sérine, Sérotonine, Solubilité, Solvatochromisme, Soufre, Structure secondaire, Structure tertiaire, Thréonine, Traduction génétique, Tryptophane, Tyrosine, Union internationale de biochimie et de biologie moléculaire, Union internationale de chimie pure et appliquée, Unité de masse atomique unifiée, Université de Calgary, Université du Tennessee, Université Pierre-et-Marie-Curie, Valine, Vertébrés, Zwitterion. Développer l'indice (95 plus) »

Acide

Un acide est un composé chimique minéral ou organique accepteur, au sens large, de doublets électroniques.

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Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

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Acide aminé essentiel

Formule de la L-Lysine, un acide aminé dont la présence est cruciale en alimentation humaine. Un acide aminé essentiel, ou acide aminé indispensable (en anglais: IAA), est un acide aminé qui ne peut être synthétisé de novo par l'organisme ou qui est synthétisé à une vitesse insuffisante, et doit donc être apporté par l'alimentation, condition nécessaire au bon fonctionnement de l'organisme.

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Acide aminé non protéinogène

Un acide aminé non protéinogène est un acide aminé qui ne peut pas être incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.

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Acide aspartique

L’acide aspartique (abréviations IUPAC-IUBMB: Asp et D), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAU et GAC.

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Acide carboxyglutamique

L’acide carboxyglutamique, souvent appelé acide gamma-carboxyglutamique et abrégé conventionnellement en Gla, est un rare présent dans certaines protéines, non pas à l'issue de la biosynthèse des protéines, mais à la suite d'une modification post-traductionnelle intervenant sur des résidus glutamate une fois la protéine synthétisée.

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Acide carboxylique

Modèle éclaté d'un groupe carboxyle. En chimie organique, le terme acide carboxylique désigne une molécule comprenant un groupe carboxyle (–C(O)OH).

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Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide glutamique

L'acide glutamique (abréviations IUPAC-IUBMB: Glu et E), ou glutamate sous la forme anionique de l'acide glutamique, est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAA et GAG.

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Acide γ-aminobutyrique

L'acide γ-aminobutyrique, souvent abrégé en GABA (de l'anglais gamma-aminobutyric acid), est le principal neurotransmetteur inhibiteur du système nerveux central chez les mammifères et les oiseaux.

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Acide nucléique

Un acide nucléique (désoxyribonucléique ou ribonucléique) est un assemblage de macromolécules, un polymère, dont l’unité de base, ou monomère, est un nucléotide et dont les nucléotides sont reliés entre eux par des liaisons phosphodiesters.

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Acide ribonucléique

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Acide ribonucléique messager

Représentation schématique de la synthèse et de la maturation d'un ARN messager dans une cellule eucaryote. L'acide ribonucléique messager, ARN messager, ou ARNm (en anglais, mRNA, pour messenger ribonucleic acid), est une molécule intermédiaire d'acide ribonucléique (ARN), consistant en une copie transitoire d'une portion de l'ADN correspondant à un ou plusieurs gènes d'un organisme biologique.

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Adrénaline

L’adrénaline est un neurotransmetteur et une hormone appartenant à la famille des catécholamines.

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Alanine

L'alanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ala et A) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GCU, GCC, GCA et GCG.

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Alberta

LAlberta (prononcé en anglais canadien) est une province du Canada.

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Aldéhyde

Structure atomique de l'aldéhyde. Un aldéhyde est un composé organique, faisant partie de la famille des composés carbonylés, dont l'un des atomes de carbone primaire (relié au plus à 1 atome de carbone) de la chaîne carbonée porte un groupement carbonyle.

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Alimentation

L’alimentation est le choix et l'intégration de la nourriture (ensemble d'aliments) par un être vivant.

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Amide

Structure générale des amides Un amide est un composé organique dérivé d'un acide carboxylique.

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Amine (chimie)

Structure de l'ammoniac. Une amine est un composé organique dérivé de l'ammoniac dont au moins un atome d'hydrogène a été remplacé par un groupe carboné.

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Ammonium

L'ion ammonium de formule brute NH4+ est un ion polyatomique de charge électrique positive.

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Analogue structurel

En chimie, un analogue structurel, analogue chimique ou simplement analogue, est un composé ayant une structure chimique similaire à un autre composé, mais différant de celui-ci par un certain composant.

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Antioxydant

hydrogène et de carbone. Un antioxydant (AOX) est une molécule qui ralentit ou empêche l'oxydation d'autres substances chimiques à leur contact.

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Archaea

sources chaudes volcaniques. Les archées ou Archaea (du grec ancien, « originel, primitif »), anciennement appelés archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries.

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Arginine

L'arginine (abréviations IUPAC-IUBMB: Arg et R) est un α-aminé.

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Asparagine

L'asparagine (abréviations IUPAC-IUBMB: Asn et N) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons AAU et AAC.

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Atome

hélium 4, agrandi à droite, est formé de deux protons et de deux neutrons. Atomes de carbone à la surface de graphite observés par microscope à effet tunnel. Un atome est la plus petite partie d'un corps simple pouvant se combiner chimiquement avec un autre.

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Azoline

Les azolines ou pyrrolines, aussi connues sous le nom de dihydroazoles ou dihydropyrroles, sont un groupe de trois types de composés hétérocycliques ayant un cycle à 5 atomes dont un atome d'azote.

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Azote

L'azote est l'élément chimique de numéro atomique 7, de symbole N (du latin nitrogenium).

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Élément PYLIS

bases nucléiques sur l'élément PYLIS. Un élément PYLIS, de l'anglais pyrrolysine insertion sequence, est un élément cis-régulateur d'ARN messager affectant l'expression du codon-STOP Ambre UAG, qui est alors traduit par un acide aminé, la pyrrolysine, présent chez certaines archées méthanogènes.

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Élément SECIS

bases nucléiques sur l'élément SECIS. Un élément SECIS, de l'anglais selenocysteine insertion structure, est un élément cis-régulateur d'ARN messager long d'une soixantaine de nucléotides caractérisé par sa forme en épingle à cheveux, ou « tige-boucle ».

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État natif (biochimie)

Cys and Arg active site of ubiquitin activating enzyme. En biochimie, l'état natif d'une protéine est sa forme fonctionnelle ou opérative.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Base (chimie)

Bouteille d'ammoniaque à 25-28%. Une base est un produit chimique qui, à l'inverse d'un acide, est capable de capturer un ou plusieurs protons ou, réciproquement, de fournir des électrons.

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Bioessays

BioEssays est une revue scientifique, éditée mensuellement par la maison John Wiley & Sons.

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Biosynthèse des protéines

ARN messager en protéine par un ribosome. ARN de transfert. L'anticodon est en rouge. ARNm. La biosynthèse des protéines est l'ensemble des processus biochimiques permettant aux cellules de produire leurs protéines à partir de leurs gènes afin de compenser les pertes en protéines par sécrétion ou par dégradation.

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Carboxyle

En chimie organique, un groupe carboxyle est un groupe fonctionnel composé d'un atome de carbone, lié par une double liaison à un premier atome d'oxygène, et par une liaison simple à un second atome d'oxygène, lui-même relié à un atome d'hydrogène.

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Chaîne latérale

acides aminés protéinogènes ont la même base, mais chacun a une chaîne latérale différente. En chimie organique et en biochimie, une chaîne latérale est une partie de molécule rattachée au cœur ou à la chaîne principale de la structure.

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Changement conformationnel

Exemple de changement conformationnel En biochimie, un changement conformationnel est la transition entre deux géométries moléculaires, souvent induite par des facteurs environnementaux.

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Charge électrique

La charge électrique est une propriété fondamentale de la matière qui lui permet d'interagir par le biais de champs électromagnétiques.

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Chiralité (chimie)

En chimie, un composé est dit chiral (du grec χείρ: la main) s'il n'est pas superposable à son image dans un miroir plan.

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Chloroplaste

Schéma d'un chloroplaste d'une plante. Chloroplastes dans des cellules végétales de ''Plagiomnium'' observées au microscope optique Photographie d'une feuille d'''élodée du Canada'' au microscope optique après une coloration au lugol (coloration des grains d'amidon bien visibles dans les chloroplastes). Les chloroplastes sont des organites présents dans le cytoplasme des cellules eucaryotes photosynthétiques (plantes, algues).

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Chymotrypsine

La chymotrypsine est une peptidase digestive sécrétée par le pancréas, de la famille des protéases à sérine, qui catalyse des protéolyses.

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Code génétique

bases nucléiques; à droite, les codons correspondants, chacun spécifiant un acide aminé protéinogène. Le code génétique est l'ensemble des règles permettant de traduire les informations contenues dans le génome des cellules vivantes afin de synthétiser les protéines.

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Codon

Un codon est une séquence de trois nucléotides sur un acide ribonucléique messager (ARNm) spécifiant l'un des vingt-deux acides aminés protéinogènes dont la succession sur l'ARN messager détermine la structure primaire de la protéine à synthétiser.

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Codon-stop

alt.

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Collagène

Fibres de collagène de type I provenant d'un tissu pulmonaire de mammifère, observées au microscope électronique en transmission (MET). Le collagène est une protéine structurale, le plus souvent présente sous forme fibrillaire.

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Composé aliphatique

Les composés aliphatiques (du grec aleiphat-, aleiphar, -atos: huile, graisse), sont les hydrocarbures à chaîne ouverte (linéaire ou ramifiée), et ceux comprenant un ou plusieurs cycles non-aromatiques (composés alicycliques).

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Composé aromatique

Le benzène est la molécule aromatique la plus simple. En chimie organique, les composés aromatiques sont des molécules telles que le benzène dont les atomes forment des structures cycliques et planes particulièrement stables.

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Composé cyclique

Le benzène est un composé cyclique. En chimie organique, un composé cyclique est une substance dans laquelle au moins une série d'atomes, notamment de carbone, est liée de manière successive par des liaisons covalentes pour former un cycle (une molécule cyclique).

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Constante d'acidité

eau dans une réaction d'équilibre donnant l'ion acétate et l'ion hydronium (code couleur: rouge.

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Corps humain

Le corps humain est la structure culturelle et physique d'un être humain.

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Cystéine

La cystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Cys et C), du grec ancien (« vessie »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UGU et UGC.

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Cystine

La cystine est un composé organique formé par deux monomères de cystéine, un acide aminé protéinogène, liés par un pont disulfure, appelé dans ce cas pont cystine.

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Cytosol

Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux), aussi appelé ergastoplasme 6. Appareil de Golgi 7. Cytosquelette 8. Réticulum endoplasmique lisse 9. Mitochondrie 10. Vacuole dans les cellules végétales 11. '''Cytosol''' 12. Lysosome dans les cellules animales 13. Centriole Le cytosol ou cytosole est, en biologie cellulaire, la phase liquide dans laquelle baignent les organites cytoplasmiques présents à l'intérieur des cellules.

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DOPA

La 3,4-dihydroxyphénylalanine (abréviée en DOPA ou dopa) est une substance intermédiaire dans la synthèse des catécholamines.

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Encombrement stérique

''tert''-butyle en vert, l’azote en bleu. L' est la gêne provoquée par la disposition et le volume d'une partie d'une molécule lors de l'approche d'un réactif ou d'une autre partie de la molécule.

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Endosome

microscopie électronique des endosomes dans les cellules HeLa humaines. On peut y voir des endosomes précoces (E.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Enzyme digestive

Une enzyme digestive a pour fonction de dégrader les macromolécules biologiques en libérant les petites unités moléculaires (monomères) qui les constituent afin de faciliter leur assimilation par l'organisme.

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Espèce chimique

En chimie, le terme « espèce chimique » est une appellation générique se référant à un ensemble d'entités chimiques identiques: chaque entité est soit un atome (espèce chimique atomique), soit un groupe d'atomes liés qui peut, selon sa charge électrique et sa configuration électronique, être une molécule, un ion ou un radical.

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Eukaryota

Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.

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Feuillet bêta

Les feuillets β ou feuillets β plissés est la deuxième forme de structure secondaire régulière observée dans les protéines, avec une fréquence de présence plus faible que les hélices α.

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Fluorescence

La fluorescence est une émission lumineuse provoquée par l'excitation des électrons d'une molécule (ou atome), généralement par absorption d'un photon immédiatement suivie d'une émission spontanée.

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Glutamine

La glutamine (abréviations IUPAC-IUBMB: Gln et Q) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CAA et CAG.

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Glycine (acide aminé)

La glycine (abréviations UICPA-UIBBM: Gly et G) est un α-aminé et l'un des vingt-deux acides aminés protéinogènes.

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Groupe fonctionnel

En chimie, les composés organiques peuvent être considérés comme constitués d'un squelette relativement non réactif appelé lalcane parent en nomenclature substitutive, et d’un ou plusieurs groupes fonctionnels.

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Guanidine

La guanidine est un composé cristallin formé lors de l'oxydation de la guanine.

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Hélice alpha

Exemple d'hélice alpha. L’hélice alpha (hélice α) est une structure secondaire courante des protéines.

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Histidine

L'histidine (abréviations IUPAC-IUBMB: His et H), du grec ancien, (« mât de navire », « métier à tisser », « voile de navire »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, l'un des acides aminés essentiels et fait partie des acides aminés glucoformateur.

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Homo sapiens

Homo sapiens, plus communément appelé « homme moderne », « homme », « humain », ou « être humain », est une espèce de primates originaire d'Afrique qui s'est aujourd'hui répandue et naturalisée sur l'ensemble de la planète hormis l'Antarctique.

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Hormone thyroïdienne

L-thyroxine (T4). L-triiodothyronine (T3). Les hormones thyroïdiennes, c'est-à-dire la thyroxine (T4) la triiodothyronine (T3) et la diiodothyronine (T2), sont des hormones produites par les cellules folliculaires de la thyroïde à partir de la thyroglobuline et d'iodure.

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Hydrogène

Lhydrogène est l'élément chimique de numéro atomique 1, de symbole H. L'hydrogène présent sur Terre est presque entièrement constitué de l'isotope H (ou protium, comportant un proton et zéro neutron) et d'environ 0,01 % de deutérium H (un proton, un neutron).

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Hydrophilie

L'hydrophilie (du grec, « d’eau, aqueux », dérivé de, « eau », et de, « aimer ») caractérise un composé ou une partie de ce composé, ayant une affinité pour l'eau et tendance à s'y dissoudre.

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Hydrophobie (physique)

L’hydrophobie (du bas latin, issu du grec, de, « eau », et, « action de chasser, d’effaroucher, d’effrayer ») caractérise les surfaces qui semblent repousser l'eau.

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Hydroxylation

L'hydroxylation est une réaction chimique consistant à introduire un groupe hydroxyle (-OH) sur une molécule.

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Hydroxyle

Protonation hydroxyle. En chimie et en minéralogie, le nom hydroxyle ou oxhydryle désigne l'entité OH comportant un atome d'oxygène et d'hydrogène liés.

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Hydroxyproline

L'hydroxyproline, ou (2S,4R)-4-hydroxyproline (abrégé en Hyp dans PDB), est un acide aminé dérivé de la proline par hydroxylation.

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Imidazole

L'imidazole (deux tautomères, 1H et 3H) est un composé organique aromatique hétérocyclique.

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Indole

Lindole est un composé organique aromatique hétérocyclique.

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Insuline

Les deux chaines de l'insuline bovine. En rouge les ponts disulfures. Modélisation 3D d'une molécule d'insuline. L'insuline (du « île ») est une hormone protéique sécrétée par les cellules β des îlots de Langerhans dans le pancréas, ainsi que dans les corps de Brockmann de certains poissons téléostéens.

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Ion

+) a comme logique d'avoir la même structure électronique que le gaz noble (cadre rouge) le plus proche. Un ion est un atome ou un groupe d'atomes portant une charge électrique, parce que son nombre d'électrons est différent de son nombre de protons.

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Ionisation

L'ionisation est l'action qui consiste à ajouter ou enlever des charges à un atome ou une molécule électriquement neutre, qui devient ainsi un ion (chargé positivement ou négativement).

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Isoleucine

L’isoleucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ile et I) est un α-aminé faisant partie des 20 acides aminés majeurs codés par le génome (exception faite de la Sélénocystéine) servant à la synthèse des protéines.

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Kératine

cornes des rhinocéros (un mammifère), comme leur peau, sont en grande partie constituées de kératine. cyclostome) est munie de « dents » cornées formées de kératine. La kératine est une famille de protéines, synthétisée et utilisée par de nombreux êtres vivants comme élément de structure, et également l'exemple-type de protéine fibreuse.

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Labilité

La labilité est la propension d'une chose à changer, à bouger, à être mobile.

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Leucine

La leucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Leu et L), du grec ancien (blanc, éclatant), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Lysine

La lysine (abréviations IUPAC-IUBMB: Lys et K) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des neuf acides aminés essentiels pour l'homme.

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Lysosome

Les principaux organites d'une cellule. Les lysosomes sont légendés en haut à gauche Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux) (REG) (6) Appareil de Golgi (7) Cytosquelette (8) Réticulum endoplasmique lisse (9) Mitochondries (10) Vacuole (11) Cytosol (12) Lysosome (13) Centrosome (constitué de deux centrioles) (14) Membrane plasmique Les lysosomes sont des organites cellulaires de 0,2 à 0,5 micron présents dans le cytosol de toutes les cellules eucaryotes, animales, à l'exception des érythrocytes (« globules rouges »).

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Masse moléculaire

La masse moléculaire (absolue) est la masse d'une molécule, exprimée en unité de masse atomique: « uma » (équivalente à un douzième, soit 1/12, de la masse d'un atome de). Elle peut être obtenue par l'addition de la masse atomique (absolue, mesurée en uma) de chaque atome de la molécule multipliée par leur indice numérique dans la formule brute ou mesurée expérimentalement par spectrométrie de masse.

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Mélanine

Photomicrographie d'un mélanome pigmenté par la mélanine Le mot mélanine est un mot générique qui désigne de nombreux pigments biologiques foncés qui sont notamment responsables de la coloration des téguments dans le règne animal.

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Métabolisme

Le métabolisme est l'ensemble des réactions chimiques qui se déroulent à l'intérieur de chaque cellule d'un être vivant et lui permettent notamment de se maintenir en vie, de se reproduire (se diviser), de se développer et de répondre aux stimuli de son environnement (échanges par exemple).

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Métabolisme méthanogène

Les organismes à métabolisme méthanogène, ou simplement les méthanogènes, sont des micro-organismes qui produisent du méthane comme sous-produit métabolique de la vie en conditions anoxiques, par méthanogenèse.

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Métal

En chimie, les métaux sont des matériaux dont les atomes sont unis par des liaisons métalliques.

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Méthionine

La méthionine (abréviations IUPAC-IUBMB: Met et M) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.

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Méthyle

En chimie, le groupe méthyle (souvent abrégé Me) est le radical alkyle hydrophobe dérivé du méthane (CH4).

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Mitochondrie

Une mitochondrie est un organite, possédant toutes les caractéristiques d'un organisme procaryote, entourée d'une double membrane composée chacune d'une double couche phospholipidique, et retrouvée chez la plupart des cellules eucaryotes.

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Modification post-traductionnelle

Une modification post-traductionnelle est une modification chimique d'une protéine, réalisée le plus souvent par une enzyme, après sa synthèse ou au cours de sa vie dans la cellule.

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Molécule

alt.

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N-Formylméthionine

La N-formylméthionine, abrégée en fMet, est un dérivé d'acide aminé protéinogène.

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Noyau (biologie)

En biologie cellulaire, le noyau est une structure cellulaire présente dans la majorité des cellules eucaryotes et chez tous les organismes eucaryotes, et contenant l'essentiel du matériel génétique de la cellule (ADN).

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Pepsine

La pepsine (du grec pepsis, signifiant digestion; peptein.

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Phénol (groupe)

phénol, le plus simple des composés phénoliques. En chimie organique, les phénols sont des composés constitués d'un cycle aromatique hydrocarboné (arène) et d'un ou plusieurs groupes hydroxyle –OH qui y sont attachés.

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Phénylalanine

La phénylalanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Phe et F) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.

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Phényle

OH. Le terme phényle désigne le groupe fonctionnel aromatique de formule brute C6H5-R. Ce groupe fait partie de la famille des aryles et est un dérivé du benzène par perte d'un atome d'hydrogène.

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Point isoélectrique

Représentation de l'évolution de la charge électrique en fonction du pH de la Glycine. Le point isoélectrique (pI ou pKi) ou potentiel hydrogène isoélectrique (pH(I)) est ainsi défini.

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Polarité (chimie)

En chimie, la polarité est la façon dont les charges électriques négatives et positives sont réparties dans une molécule ou une liaison chimique.

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Polypeptide

Un polypeptide est une chaîne d'acides aminés reliés par des liaisons peptidiques.

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Pont disulfure

Un pont disulfure (liaison S-S) est une liaison covalente qui se forme par oxydation dans les protéines, de manière post-traductionnelle ou par des agents oxydants mis en œuvre par l'homme.

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Potentiel d'oxydoréduction

Le potentiel d'oxydoréduction, ou potentiel redox, est une grandeur empirique exprimée en volts et généralement notée E_ (ou, pour le potentiel redox standard, où désigne un métal quelconque).

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Précurseur (chimie)

En chimie, un précurseur est un composé participant à une réaction qui produit un ou plusieurs autres composés.

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Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Proline

La proline (abréviations IUPAC-IUBMB: Pro et P) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CCU, CCC, CCA et CCG.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Protonation

Exemple de protonation. La protonation est une réaction chimique au cours de laquelle un proton (ion 1H+) est ajouté à un atome, une molécule ou un ion.

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Pyrrolysine

La pyrrolysine (abréviations IUPAC-IUBMB: Pyl et O) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par le codon-stop ambre UAG en présence d'une séquence d'insertion appelée Pyrrolysine Insertion Sequence.

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Rayon de van der Waals

Le rayon de van der Waals, r_, d'un atome est le rayon d'une sphère géométrique théorique qui peut être utilisée, dans beaucoup de raisonnements adéquats, pour modéliser l'atome.

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Réducteur (chimie)

En chimie, un réducteur est un corps simple, un composé ou un ion qui cède au moins un électron à une autre espèce chimique lors d'une réaction d'oxydoréduction.

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Résidu (biochimie)

acides aminés. En biochimie et en biologie moléculaire, un résidu est la partie d'une molécule, généralement un monomère, qui est restée inchangée après être entrée dans la composition d'une biomolécule complexe ou d'un polymère.

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Repliement des protéines

Repliement des protéines Le repliement des protéines est le processus physique par lequel un polypeptide se replie dans sa structure tridimensionnelle caractéristique dans laquelle il est fonctionnel.

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Ribonucléase pancréatique bovine

La ribonucléase pancréatique bovine, ou ribonucléase A, est la ribonucléase pancréatique extraite de l'espèce Bos taurus.

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Ribosome

Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux) (REG) (6) Appareil de Golgi (7) Cytosquelette (8) Réticulum endoplasmique lisse (9) Mitochondries (10) Vacuole (absent des cellules animales) (11) Cytosol (12) Lysosome (13) Centrosome (constitué de deux centrioles) (14) Membrane plasmique Les ribosomes sont des complexes ribonucléoprotéiques présents dans les cellules eucaryotes et procaryotes.

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Sélénium

Le sélénium est l'élément chimique de numéro atomique 34, de symbole Se.

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Sélénocystéine

La sélénocystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Sec et U) est un α-aminé non standard dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par le codon-stop opale UGA en présence d'une séquence d'insertion dite Selenocysteine Insertion Sequence.

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Séquence (acide nucléique)

ARN messager faisant apparaître ses codons. La séquence d'un acide nucléique — ADN ou ARN — est la succession des nucléotides qui le constituent.

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Sérine

La sérine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ser et S) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UCU, UCC, UCA, UCG, AGU et AGC.

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Sérotonine

La sérotonine, encore appelée 5-hydroxytryptamine (5-HT), est une monoamine de la famille des indolamines.

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Solubilité

La réaction de précipitation, effectuée à partir d'une solution ou d'une suspension, forme un précipité et un liquide surnageant, observés ici dans un tube à essai. La solubilité est la capacité d'une substance, appelée soluté, à se dissoudre dans une autre substance, appelée solvant, pour former un mélange homogène appelé solution.

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Solvatochromisme

Le solvatochromisme est la propriété d'une molécule à changer de couleur selon la polarité du solvant dans lequel elle est dissoute.

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Soufre

Le soufre est l'élément chimique de numéro atomique 16, de symbole S. C'est un membre du groupe des chalcogènes.

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Structure secondaire

feuillets β. Cette protéine est la première dont la structure a été résolue par cristallographie en 1958, par Max Perutz et John Kendrew, ce qui leur a valu l'attribution du prix Nobel de chimie en 1962. En biochimie et en biologie structurale, la structure secondaire se rapporte uniquement à la description de la structure tridimensionnelle localement adoptée par certains segments de molécules biologiques (molécules définies comme étant des biopolymères, comme c’est le cas pour les protéines et les acides nucléiques (ADN/ARN)).

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Structure tertiaire

En biochimie, la structure tertiaire ou tridimensionnelle est le repliement dans l'espace d'une chaîne polypeptidique.

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Thréonine

La thréonine (abréviations IUPAC-IUBMB: Thr et T) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.

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Traduction génétique

Cycle de l'élongation de la traduction par le ribosome. Les ARNt (vert foncé) apportent les acides aminés (carrés) au site A. Une fois l'accommodation codon-anticodon réalisée, il y a formation de la nouvelle liaison peptidique, puis translocation du ribosome d'un codon le long de l'ARNm. En biologie moléculaire, la traduction génétique est l'étape de synthèse des protéines par les ribosomes, à partir de l'information génétique contenue dans les ARN messagers.

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Tryptophane

Le tryptophane (abréviations IUPAC-IUBMB: Trp et W) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Tyrosine

La tyrosine (abréviations IUPAC-IUBMB: Tyr et Y) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, codé sur les ARN messagers par les codons UAU et UAC.

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Union internationale de biochimie et de biologie moléculaire

LUnion internationale de biochimie et de biologie moléculaire (en anglais, International union for biochemistry and molecular biology ou IUBMB) est une Organisation non gouvernementale internationale qui fédère les sociétés savantes nationales dans le domaine de la biochimie et de la biologie moléculaire.

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Union internationale de chimie pure et appliquée

L’Union internationale de chimie pure et appliquée (UICPA, en anglais: International Union of Pure and Applied Chemistry, IUPAC) est une organisation non gouvernementale ayant son siège à Zurich, créée en 1919 qui s’intéresse aux progrès en chimie, chimie physique, biochimie Elle a pour membres des sociétés nationales de chimie.

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Unité de masse atomique unifiée

Lunité de masse atomique unifiée.

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Université de Calgary

L’Université de Calgary (en anglais, University of Calgary: UofC) est une université canadienne située à Calgary, en Alberta.

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Université du Tennessee

L'université du Tennessee, en The University of Tennessee, également appelée The University of Tennessee, Knoxville - UT Knoxville - UTK ou UT, est une université américaine de recherche publique qui se trouve à Knoxville dans le Tennessee.

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Université Pierre-et-Marie-Curie

Luniversité Pierre-et-Marie-CurieNom d’usage dont s'est doté l'établissement par délibération de son conseil d’administration.

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Valine

La valine (abréviations IUPAC-IUBMB: Val et V) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.

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Vertébrés

Les Vertébrés (Vertebrata) forment un sous-embranchement très diversifié d'animaux chordés appartennant au clade des Olfactoriens et ayant pour particularité principale de posséder un squelette interne composé d'un crâne ainsi que d'une colonne vertébrale.

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Zwitterion

Un zwitterion (prononcé, de l'allemand Zwitter « hybride », « hermaphrodite ») ou amphion est une espèce chimique moléculaire possédant des charges électriques formelles d’une unité, de signes opposés et situées en général sur des atomes non adjacents (dans le cas où les deux charges formelles sont portées par deux atomes adjacents, on parle d'ylures).

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