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Aérobie
Un milieu est dit aérobie s'il contient du dioxygène.
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Acide aminé protéinogène
groupe aldéhyde sur l'atome d'azote de l'amine primaire Un acide aminé protéinogène est un acide aminé incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.
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Acide fumarique
L'acide fumarique, ou acide trans-butènedioïque, est un acide dicarboxylique insaturé de formule chimique HOOC–CH.
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Acide gras
Un acide gras est un acide carboxylique à chaîne aliphatique.
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Acide lactique
Les acides lactiques (acides hydroxypropanoïques) sont des acides organiques dont la chaîne est composée de trois atomes de carbone.
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Acide phosphorique
L’acide phosphorique (ou acide orthophosphorique) est un composé chimique de formule.
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Acide succinique
Solution d'acide succinique, d'alcool et d'eau, étendue sur une feuille, forme des cristaux. Février 2023. L'acide succinique ou acide butane-1,4-dioïque est un diacide carboxylique aliphatique de formule semi-développée.
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Acidithiobacillus ferrooxidans
L'espèce bactérienne Acidithiobacillus ferrooxidans est composée de bactéries à Gram négatif capables d'oxyder le fer et connues sous le nom de Thiobacillus ferrooxidans jusqu'en.
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Adénosine diphosphate
L'adénosine diphosphate ou ADP est un nucléotide.
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Adénosine triphosphate
L’adénosine triphosphate, ou ATP, est un nucléotide formé à partir d'un nucléoside associé à un triphosphate.
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Algue
Les algues sont des organismes vivants capables de produire de la photosynthèse oxygénique et dont le cycle de vie se déroule généralement en milieu aquatique.
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Ammoniac
L'ammoniac est un composé chimique de formule NH (du groupe générique des nitrures d'hydrogène).
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Animal
Biomasse animale totale (en gigatonne de carbone). Les Animaux (Animalia) (du latin animalis « animé, vivant, animal ») sont en biologie, selon la classification classique, des êtres vivants hétérotrophes (c’est-à-dire qui se nourrissent de substances organiques) et possédant du collagène dans leurs matrices extracellulaires.
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Anion
Un anion (du grec ana-: « en haut » et iôn: « qui va ») est un ion qui, ayant gagné un ou plusieurs électrons, porte une ou plusieurs charges électriques élémentaires négatives: par exemple, l’ion chlorure Cl est l’atome de chlore ayant gagné un électron.
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Antenne collectrice
Structure tri-dimensionnelle d'une antenne collectrice associée au photosystème II chez une plante. Une antenne collectrice est un ensemble de pigments photosynthétiques et de protéines associés à la chlorophylle ''a'' dans la membrane des thylakoïdes.
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Archaea
sources chaudes volcaniques. Les archées ou Archaea (du grec ancien, « originel, primitif »), anciennement appelés archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries.
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Atome d'hydrogène
L'atome d'hydrogène est le plus simple de tous les atomes du tableau périodique, étant composé d'un proton et d'un électron.
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ATP synthase
L'ATP synthase (EC 7.1.2.2) est un complexe protéique enzymatique qui se trouve dans les crêtes mitochondriales, la membrane interne des thylakoïdes, et la membrane plasmique des bactéries et des archées.
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Électron
L'électron, un des composants de l'atome avec les neutrons et les protons, est une particule élémentaire qui possède une charge élémentaire de signe négatif.
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Évolution (biologie)
En biologie, l’évolution est la transformation du monde vivant au cours du temps, qui se manifeste par des changements phénotypiques des organismes à travers les générations.
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Bactérie
Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.
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Bactérie photosynthétique
Les bactéries photosynthétiques sont des procaryotes qui utilisent la lumière comme source initiale d'énergie.
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Bactérie pourpre
Une bactérie pourpre est une protéobactérie phototrophe, c'est-à-dire capable de produire son énergie métabolique par photosynthèse;. Ces bactéries sont pigmentées par de la bactériochlorophylle a et b avec divers caroténoïdes qui leur donnent des couleurs allant de l'orange au pourpre en passant par le brun et le rouge.
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Bactériochlorophylle
Schéma général de la structure des bactériochlorophylles. Les bactériochlorophylles sont des pigments photosynthétiques présents chez différentes bactéries autotrophes.
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Biomolécule
Une biomolécule est une molécule présente naturellement dans un organisme vivant et qui participe à son métabolisme et à son entretien, par exemple les glucides, les lipides, les protéines, et les acides nucléiques.
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Biosynthèse
Cuir de champignon, produit d'une biosynthèse La biosynthèse est la formation de substances par un être vivant ou son symbiote, dans son milieu interne ou dans les excrêtats que sont le mucus, les coquilles des œufs ou des mollusques, l’écorce Elle intéresse les chimistes et les biotechnologistes qui découvrent dans les cellules ou les organismes de nouveaux moyens, moins polluants ou moins énergivores, de produire des molécules complexes.
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Canal ionique
Un canal ionique est une protéine membranaire qui permet le passage à grande vitesse d'un ou plusieurs ions.
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Catabolisme
Le catabolisme est l'ensemble des réactions de dégradations moléculaires de l'organisme considéré.
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Cation
Un cation (du grec cata-: « en bas » et iôn: « qui va ») est un ion qui, ayant perdu un ou plusieurs électrons, porte une ou plusieurs charges électriques positives: à l’inverse, un anion contient plus d'électrons que de protons.
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Cellule (biologie)
consulté le.
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Centre réactionnel
Le centre réactionnel d'un photosystème est la partie dans laquelle se produit la réaction de séparation de charge d'une chlorophylle excitée.
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Chaîne respiratoire
ATP. 320x320px En biochimie, on appelle chaîne respiratoire une chaîne de transport d'électrons réalisant l'oxydation des coenzymes réduites issues de la dégradation de composés organiques ou minéraux.
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Chimiosmose
diffuser le solvant contre l'énergie potentielle gravitationnelle. réaction chimique endergonique. En biochimie, la chimiosmose est le couplage de la phosphorylation de l'ADP en ATP par l'ATP synthase en utilisant l'énergie libérée par la dissipation d'un gradient de concentration de cations — généralement de protons H+ — à travers une membrane.
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Chimiotrophie
La chimiotrophie est un des types trophiques caractérisant le mode de nutrition des organismes vivants.
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Chlorobi
Les bactéries sulfureuses vertes sont une famille de bactéries anaérobies photoautotrophes.
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Chloroflexia
Les Chloroflexia (les Chloroflexes) sont une classe de bactéries filamenteuses photosynthétiques à Gram négatif de l'embranchement des Chloroflexota.
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Chlorophylle
bandes d'absorption (bleu et rouge) dans le spectre lumineux, ce qui se traduit par une valeur maximale de la réflectance autour du vert, d'où la couleur verte des plantes. La chlorophylle est présente à haute concentration dans les chloroplastes des cellules végétales vivantes. Teneur moyenne des eaux marines de surface en chlorophylle (SeaWIFS) pour la période 1998-2006 (échelle logarithmique). Numérotation conventionnelle des atomes de la porphine. chlorophylle ''a''. - en vert: magnésium; - en bleu: azote; - en noir: carbone; - en blanc: hydrogène; - en rouge: oxygène. Les chlorophylles (mot composé en 1816 à partir du grec ancien / (« vert ») et / (« feuille ») sont les principaux pigments assimilateurs des végétaux photosynthétiques. Leur nom est introduit par Joseph Bienaimé Caventou et Joseph Pelletier en 1816. Ces pigments, situés dans les chloroplastes des cellules végétales, interviennent dans la photosynthèse pour intercepter l'énergie lumineuse, première étape dans la conversion de cette énergie en énergie chimique. Leurs spectres d'absorption du rayonnement lumineux sont responsables de la couleur verte des végétaux; la longueur d'onde la moins absorbée étant le vert, cette couleur est perçue dans la lumière réfléchie vers l'œil par la feuille. L'assimilation chlorophyllienne est l'assimilation active du dioxyde de carbone par voie de photosynthèse au moyen de la chlorophylle. Elle est un processus biologique de transformation de l’énergie lumineuse en énergie chimique de liaison grâce aux chloroplastes chlorophylliens. La synthèse chlorophyllienne est la forme la plus fréquente de photosynthèse.
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Chloroplaste
Schéma d'un chloroplaste d'une plante. Chloroplastes dans des cellules végétales de ''Plagiomnium'' observées au microscope optique Photographie d'une feuille d'''élodée du Canada'' au microscope optique après une coloration au lugol (coloration des grains d'amidon bien visibles dans les chloroplastes). Les chloroplastes sont des organites présents dans le cytoplasme des cellules eucaryotes photosynthétiques (plantes, algues).
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Cluster fer-soufre
Les clusters fer-soufre, abrégés en clusters Fe-S, (ou Iron-Sulfur Cluster, abrégé en ISC en anglais) sont des agrégats atomiques contenant des atomes de fer et de soufre.
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Coenzyme
Les coenzymes (n. f.) sont des molécules organiques particulières, pouvant inclure des ions métalliques, ayant pour spécificité de servir de cofacteurs à certaines enzymes, en participant obligatoirement à la réaction catalytique.
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Coenzyme Q-cytochrome c réductase
complexe III. L'espace intermembranaire mitochondrial est en haut, la membrane mitochondriale interne est représentée en gris au milieu, et la matrice mitochondriale est en bas. en Schéma de principe du cycle Q. La coenzyme Q-cytochrome c réductase, ou complexe de la chaîne respiratoire, également appelée complexe bc1, est une oxydoréductase membranaire qui catalyse la réaction: Cette enzyme est présente dans la membrane plasmique de la plupart de bactéries et dans la membrane mitochondriale interne de tous les eucaryotes aérobies.
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Coenzyme Q10
Figure 1: Structure chimique des ubiquinones. ''n'' peut varier de 6 à 10 et forme une chaîne polyisoprénique. La coenzyme Q (CoQ, ou plus simplement Q), également connue sous le nom d’ubiquinone, est une 1,4-Benzoquinone pour laquelle Q fait référence au groupe quinone et 10 au nombre d'unités isopréniques dans sa chaîne latérale.
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Cofacteur (biochimie)
centres fer-soufre et hème. En biochimie, un cofacteur est un composé chimique non protéique mais qui est nécessaire à l'activité biologique d'une protéine, le plus souvent une enzyme.
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Complexe (chimie)
En chimie, plus particulièrement en chimie inorganique, un complexe est un édifice polyatomique constitué d'une ou de plusieurs entités indépendantes (ions ou molécules), en interaction.
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Complexe cytochrome b6f
Le complexe cytochrome b6f, ou complexe de cytochromes b6f, est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette réaction est analogue à celle catalysée par la coenzyme Q-cytochrome ''c'' réductase de la chaîne respiratoire dans les mitochondries.
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Composé organique
Les composés organiques sont les composés dont un des éléments chimiques constitutifs est le carbone, à quelques exceptions près.
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Cuivre
Le cuivre est l'élément chimique de numéro atomique 29, de symbole Cu.
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Cupriavidus metallidurans
Cupriavidus metallidurans souche CH34 est une bactérie à Gram négatif, non sporulante, aérobie-anaérobie facultative appartenant à la famille des bêta-protéobactéries.
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Cyanobacteriota
Les Cyanobacteriota sont des bactéries photosynthétiques qui forment un embranchement.
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Cycle de Calvin
Le cycle de Calvin (aussi connu comme le cycle de Calvin-Benson-Bassham) est une série de réactions biochimiques des organismes photosynthétiques ayant lieu dans le stroma des chloroplastes chez les eucaryotes ou dans le cytoplasme chez les procaryotes.
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Cycle Q
2 en représente la forme ubiquinol. Le cycle Q est un ensemble de réactions qui aboutissent au pompage de protons par la cytochrome ''c'' réductase, ou de la chaîne respiratoire, à travers une membrane biologique alors que des électrons traversent cette enzyme de la forme réduite de la 10, l'ubiquinol, vers le cytochrome ''c''.
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Cystéine
La cystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Cys et C), du grec ancien (« vessie »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UGU et UGC.
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Cytochrome
Les cytochromes sont des coenzymes intermédiaires de la chaîne respiratoire.
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Cytochrome b
bibcode.
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Cytochrome c
Le cytochrome c est une petite hémoprotéine contenant une centaine de résidus d'acides aminés pour une masse d'environ.
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Cytochrome c oxydase
bibcode.
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Cytochrome f
Le cytochrome f (cyt f) est la plus grosse sous-unité du cytochrome ''b''6''f'', ce dernier étant fonctionnellement et structurellement apparenté au cytochrome ''bc''1 des mitochondries; le y joue un rôle analogue à celui du cytochrome ''c''1 bien qu'ils aient une structure différente.
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Cytochrome oxydase
La cytochrome oxydase désigne un gène mitochondrial.
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Dérivé réactif de l'oxygène
Les dérivés réactifs de l'oxygène (DRO) ou espèces réactives de l'oxygène (ERO), ou ROS, sont des espèces chimiques oxygénées telles que des radicaux libres, des ions oxygénés et des peroxydes, rendus chimiquement très réactifs par la présence d'électrons de valence non appariés.
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Déshydrogénase
Une déshydrogénase (appelée aussi DHO dans la littérature) est une enzyme qui oxyde un substrat par le transfert d'un ou plusieurs ions (H) à un accepteur, généralement un coenzyme type NAD+/NADP+ ou flavine comme le FAD ou le FMN.
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Desulforudis audaxviator
Desulforudis audaxviator est une bactérie sulfato-réductrice monotypique à Gram positif résidant dans les eaux souterraines à une profondeur de.
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Diazote
Le diazote, communément nommé azote, est une molécule diatomique composée de deux atomes d'azote.
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Dihydrogène
Le dihydrogène est la forme moléculaire de l'élément hydrogène qui existe à l'état gazeux aux conditions normales de température et de pression.
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Dimère
Le saccharose, ou sucre de table, est un dimère composé de glucose et de fructose. En chimie, un dimère est une molécule de la famille des polymères ne comportant que deux sous-unités.
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Dioxyde de carbone
Le dioxyde de carbone, aussi appelé gaz carbonique ou anhydride carbonique, est un composé inorganique dont la formule chimique est, la molécule ayant une structure linéaire de la forme O.
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Dioxygène
Le dioxygène, communément nommé oxygène, est une substance constituée de molécules (constituées chacune de deux atomes d'oxygène).
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Domaine (biologie)
En classifications biologiques, le domaine (néolatinisé en dominium) est le premier niveau de rang, au-dessus des règnes.
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Eau
L'eau est une substance chimique constituée de molécules.
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Enterobacteriaceae
Les Enterobacteriaceae sont une famille de bacilles Gram négatifs de l'ordre des Enterobacterales.
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Enthalpie libre
L’enthalpie libre, appelée aussi énergie libre de Gibbs ou simplement énergie de Gibbs, est une fonction d'état extensive introduite par Willard Gibbs, et généralement notée.
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Enzyme
stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.
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Escherichia coli
Escherichia coli, en abrégée E. coli, est une bactérie intestinale des organismes à sang chaud, Gram négatif, du genre Escherichia, en forme de bâtonnet appelée parfois colibacille.
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Espace intermembranaire mitochondrial
L'espace intermembranaire mitochondrial est situé entre la membrane mitochondriale externe et la membrane mitochondriale interne.
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Espèce
classification du vivant. Dans les sciences du vivant, l’espèce (du latin species, « type » ou « apparence ») est le taxon de base de la systématique.
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Eukaryota
Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.
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Excitation (physique)
Excitation physique En physique, on appelle excitation tout phénomène qui sort un système de son état de repos pour l'amener à un état d'énergie supérieure.
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Fer
Le fer est l'élément chimique de numéro atomique 26, de symbole Fe.
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Ferrédoxine
Une ferrédoxine est une protéine fer-soufre réalisant des transferts d'électrons dans un grand nombre de réactions d'oxydoréduction du métabolisme cellulaire grâce à leurs dont les cations de fer oscillent entre les états d'oxydation +2 (ferreux) et +3 (ferrique).
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Ferrédoxine-NADP+ réductase
La ferrédoxine-NADP+ réductase (FNR) est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette enzyme est la dernière à intervenir dans le transfert des électrons au cours de la photosynthèse.
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Fixation biologique du diazote
symbiose fixatrice d'azote. Cette image (en fort grossissement) montre le réticulum endoplasmique, le dictyosome et la paroi cellulaire. La fixation biologique de l'azote, ou diazotrophie (du grec di, « deux », azo, « azote », et trophos, « alimentation »), est le processus du cycle de l'azote qui permet à un organisme de produire (indirectement) des substances protéiques à partir de l'azote gazeux (N2) présent dans l'atmosphère et l'environnement.
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Flavine adénine dinucléotide
La flavine adénine dinucléotide (FAD) est une coenzyme d'oxydo-réduction dérivant de la riboflavine (vitamine B2).
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Flavine mononucléotide
La flavine mononucléotide (FMN), ou riboflavine-5′-phosphate, est une biomolécule produite à partir de la riboflavine (vitamine B2) par l'enzyme riboflavine kinase et agit comme groupement prosthétique de diverses oxydo-réductases, comme la NADH déshydrogénase, mais aussi comme cofacteur avec les bio-photorécepteurs de lumière bleue.
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Formiate déshydrogénase
Une formiate déshydrogénase est une oxydoréductase qui catalyse l'oxydation du formiate en dioxyde de carbone.
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Fungi
spores fongiques dans les conditions optimales. Autre agent actif d'une pourriture du bois, l'Hypholome en touffes, champignon saprotrophe très commun. Les Fonges, également appelés Mycètes, sont un règne d'organismes eucaryotes appelés communément champignons.
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Glutamate synthase (ferrédoxine)
La glutamate synthase à ferrédoxine est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans le métabolisme de l'azote.
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Glycérol-3-phosphate
Le glycérol-3-phosphate est un composé chimique de formule.
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Glycérol-3-phosphate déshydrogénase
Une glycérol-3-phosphate déshydrogénase (GPDH) est une oxydoréductase qui catalyse une réaction du type: Ces enzymes constituent un lien essentiel entre le métabolisme des glucides et celui des lipides, et sont également essentielles à la chaîne respiratoire des mitochondries dans le cadre de la navette du glycérol-3-phosphate, l'une des deux navettes mitochondriales.
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Gradient électrochimique
Pour traverser la membrane d'une cellule, un ion est soumis à un gradient électrochimique (ou driving force en anglais), qui s'exprime par la différence entre le potentiel de membrane (Vm) de la cellule et le potentiel d'équilibre de l'ion considéré (Eion).
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Gradient de concentration
Lorsque la concentration d'un composé chimique ou d'un ion est différente d'un côté à l'autre d'une membrane, cela crée un gradient de concentration.
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Groupe fonctionnel
En chimie, les composés organiques peuvent être considérés comme constitués d'un squelette relativement non réactif appelé lalcane parent en nomenclature substitutive, et d’un ou plusieurs groupes fonctionnels.
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Halothiobacillus
Halothiobacillus est un genre de bactéries halophiles aérobies obligatoires à Gram négatif de l'ordre des Chromatiales.
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Hème
hème ''b''. hème ''b''. hème ''a''. L’hème est un cofacteur contenant un atome de métal, souvent du fer, servant à accueillir un gaz diatomique (par exemple du dioxygène) au centre d’un large anneau organique appelé porphyrine.
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Hydrogène
Lhydrogène est l'élément chimique de numéro atomique 1, de symbole H. L'hydrogène présent sur Terre est presque entièrement constitué de l'isotope H (ou protium, comportant un proton et zéro neutron) et d'environ 0,01 % de deutérium H (un proton, un neutron).
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Hydrogénase
Les hydrogénases sont des enzymes qui catalysent de façon réversible la conversion des ions H+ (« protons ») en dihydrogène selon la réaction: Les sites actifs de ces enzymes sont de nature organométallique et diffèrent entre eux notamment par la nature des métaux qui les composent.
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Hydrophilie
L'hydrophilie (du grec, « d’eau, aqueux », dérivé de, « eau », et de, « aimer ») caractérise un composé ou une partie de ce composé, ayant une affinité pour l'eau et tendance à s'y dissoudre.
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Hydrophobie (physique)
L’hydrophobie (du bas latin, issu du grec, de, « eau », et, « action de chasser, d’effaroucher, d’effrayer ») caractérise les surfaces qui semblent repousser l'eau.
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Hydroxyde
Un hydroxyde est un sel métallique de formule générique (comme NaOH, KOH,,...), constitué d'un cation métallique et d'un ou de plusieurs anions hydroxydes.
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Ion
+) a comme logique d'avoir la même structure électronique que le gaz noble (cadre rouge) le plus proche. Un ion est un atome ou un groupe d'atomes portant une charge électrique, parce que son nombre d'électrons est différent de son nombre de protons.
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Lactate déshydrogénase
Les lactates déshydrogénases (LDH) ou déshydrogénases lactiques sont des enzymes présentes dans une grande diversité d'organismes, aussi bien végétaux qu'animaux.
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Lumen (cytologie)
Le lumen en cytologie est l'espace intérieur d'organites creux, comme l'intérieur des thylakoïdes dans les plastes ou l'intérieur des saccules du réticulum endoplasmique.
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Mammifère
Les Mammifères (Mammalia) sont une classe d'animaux vertébrés caractérisés par la présence de fourrure (excepté pour certains mammifères marins), d'une oreille moyenne comportant trois os, d'un néocortex et de glandes mammaires, dont les représentants femelles nourrissent leurs juvéniles à partir d'une sécrétion cutanéo-glandulaire spécialisée appelée lait (on dit alors qu'elles allaitent).
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Masse moléculaire
La masse moléculaire (absolue) est la masse d'une molécule, exprimée en unité de masse atomique: « uma » (équivalente à un douzième, soit 1/12, de la masse d'un atome de). Elle peut être obtenue par l'addition de la masse atomique (absolue, mesurée en uma) de chaque atome de la molécule multipliée par leur indice numérique dans la formule brute ou mesurée expérimentalement par spectrométrie de masse.
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Matrice mitochondriale
Dans une mitochondrie, on appelle matrice mitochondriale le milieu, délimité par la membrane mitochondriale interne, qui contient les ribosomes, le matériel génétique et les enzymes solubles impliquées dans la production d'acétyl-CoA — β-oxydation, complexe pyruvate déshydrogénase — et l'oxydation de ce métabolite — cycle de Krebs.
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Mécanisme réactionnel
En chimie, un mécanisme réactionnel est l'enchainement d'étapes, de réactions élémentaires, par lequel un changement chimique a lieu.
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Ménaquinone
Une ménaquinone, ou, est une naphtoquinone pourvue d'une chaîne latérale isoprénique de typiquement 4 à 7 unités.
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Métabolisme
Le métabolisme est l'ensemble des réactions chimiques qui se déroulent à l'intérieur de chaque cellule d'un être vivant et lui permettent notamment de se maintenir en vie, de se reproduire (se diviser), de se développer et de répondre aux stimuli de son environnement (échanges par exemple).
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Métabolisme méthanogène
Les organismes à métabolisme méthanogène, ou simplement les méthanogènes, sont des micro-organismes qui produisent du méthane comme sous-produit métabolique de la vie en conditions anoxiques, par méthanogenèse.
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Métalloprotéine
En biochimie, le terme métalloprotéine désigne une protéine qui comporte un ou plusieurs cofacteurs métalliques.
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Membrane (biologie)
Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux) (REG) (6) Appareil de Golgi (7) Cytosquelette (8) Réticulum endoplasmique lisse (9) Mitochondries (10) Vacuole (11) Cytosol (12) Lysosome (13) Centrosome (constitué de deux centrioles) (14) '''Membrane plasmique''' La membrane, en biologie cellulaire, est un assemblage de molécules en un double feuillet séparant la cellule de son environnement et délimitant le cytoplasme cellulaire, ainsi que les organites à l'intérieur de celui-ci.
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Membrane mitochondriale interne
Dans une mitochondrie, la membrane mitochondriale interne délimite la matrice mitochondriale et contient un grand nombre de protéines membranaires essentiellement hydrophobes impliquées notamment dans la respiration cellulaire, la production d'ATP et le transport de divers métabolites.
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Membrane plasmique
La membrane plasmique, également appelée membrane cellulaire, membrane cytoplasmique, voire plasmalemme, est une membrane biologique séparant l'intérieur d'une cellule, appelé cytoplasme, de son environnement extérieur, c'est-à-dire du milieu extracellulaire.
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Micro-organisme sulfato-réducteur
µm de longueur. Les micro-organismes sulfato-réducteurs (MSR) ou réducteurs de sulfate, encore appelés procaryotes sulfato-réducteurs (PSR) sont un groupe de microorganismes comprenant les bactéries sulfato-réductrices (BSR) et les archées sulfato-réducteurs (ASR).
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Mitochondrie
Une mitochondrie est un organite, possédant toutes les caractéristiques d'un organisme procaryote, entourée d'une double membrane composée chacune d'une double couche phospholipidique, et retrouvée chez la plupart des cellules eucaryotes.
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Molécule d'eau
La molécule d’eau, de formule, est le constituant essentiel de l’eau pure.
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Monomère
En chimie, un monomère est une substance, le plus souvent organique, utilisée dans la synthèse des oligomères et des polymères au cours d'une réaction d'oligomérisation ou de polymérisation.
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Monoxyde de carbone
Le monoxyde de carbone est le plus simple des oxydes du carbone.
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NADH déshydrogénase
La NADH déshydrogénase, ou complexe de la chaîne respiratoire, est une oxydoréductase membranaire qui catalyse la réaction: Cette enzyme est présente chez un très grand nombre d'êtres vivants, allant des procaryotes jusqu'aux humains.
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Nicotinamide adénine dinucléotide
Le nicotinamide adénine dinucléotide (NAD) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.
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Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate
Le nicotinamide adénine dinucléotide phosphate (NADP) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.
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Nitrate
Vue planaire de la structure de l'ion nitrate. Vue en 3D de la structure de l'ion nitrate. Modèle boules et bâtonnets de la structure de l'ion nitrate. Niveaux de nitrates à la surface des océans''World Ocean Atlas''.. L'ion nitrate est l'ion polyatomique de formule chimique.
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Nitrate réductase
La nitrate réductase est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Il s'agit d'une famille d'enzymes essentielles dans le cycle de l'azote Certains organismes bactériens permettent l'assimilation de l'azote ou la respiration anaérobie.
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Nitrite
L'ion nitrite est la base conjuguée de l'acide nitreux.
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Nitrobacter
Nitrobacter est un genre de bactérie principalement en forme de bâtonnet, gram négatif et chimioautotrophe de la famille des Bradyrhizobiaceaehttp://www.bioconlabs.com/nitribactfacts.html.
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Nitrosomonas
Nitrosomonas est un genre de bactérie chimiotrophe de la famille des Nitrosomonadaceae.
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Nombre d'oxydation
Le nombre d'oxydation (n.o.), ou degré d'oxydation (d.o.), est le nombre de charges électriques élémentaires réelles ou fictives que porte un atome au sein d'une espèce chimique (molécule, radical ou ion).
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Organite
Les organites (de temps en temps nommés organelles par anglicisme) sont les différentes structures spécialisées contenues dans le cytoplasme et délimitées du reste de la cellule par une membrane phospholipidique.
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Oxydant
Le pictogramme international pour les produits chimiques oxydants. Un oxydant ou agent oxydant ou agent d'oxydation est un corps simple, un composé ou un ion qui reçoit au moins un électron d'une autre espèce chimique lors d'une réaction d'oxydoréduction.
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Oxydase
Une oxydase est une enzyme catalysant une réaction d'oxydo-réduction impliquant une molécule de dioxygène (O2) comme accepteur d'électron.
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Peroxyde
Utilisé avec un coagent, un peroxyde organique permet de vulcaniser un élastomère. Un peroxyde (consulté le 14 mai 2016).
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Peter Mitchell
Oxidative phosphorylation Peter Dennis Mitchell est un chimiste anglais.
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Phosphate
Atlas mondial des océans).. Phosphate dans une coupelle. Un phosphate est un composé dérivé de l'acide phosphorique par perte ou substitution d'un ou plusieurs atomes d'hydrogène, par d'autres atomes ou groupes fonctionnels.
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Phosphite
L'ion phosphite (HPO32−), appelé aussi phosphanate, est un ion polyatomique avec un atome central de phosphore.
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Phosphorylation
chaîne latérale de sérine phosphorylée. Les atomes d'oxygène sont en rouge, ceux de phosphore, en orange, le carbone en gris et l'azote en bleu. Les atomes d'hydrogène ne sont pas représentés. La phosphorylation est l'addition d'un groupe phosphate (un phosphoryl PO32− plus précisément) qui est transféré à une protéine ou à une petite molécule, tel le glucose, l'adénine ou les glycérolipides.
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Phosphorylation oxydative
pompes à protons pour générer un gradient de concentration de protons autour de la membrane mitochondriale interne. Le gradient électrochimique qui en résulte fournit l'énergie nécessaire pour actionner un rotor moléculaire qui permet à l'ATP synthase de produire de l'ATP. En biologie moléculaire, la phosphorylation oxydative est le processus permettant la phosphorylation de l'ADP en ATP grâce à l'énergie libérée par l'oxydation de donneurs d'électrons par la chaîne respiratoire.
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Photon
Pas de description.
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Photophosphorylation
La photophosphorylation est l'ensemble des processus permettant la production d'ATP, la plupart du temps couplée à la production de NADPH par oxydation de l'eau, à partir de l'énergie lumineuse au cours de la photosynthèse.
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Photosynthèse
produire des glucides. Équation de la photosynthèse. spermatophytes. Vue composite montrant la distribution de l'activité photosynthétique à la surface de la Terre, le rouge foncé indiquant les zones les plus actives du phytoplancton des milieux aquatiques et le bleu-vert celles de la végétation sur la terre ferme. La photosynthèse (du grec φῶς phōs « lumière » et σύνθεσις sýnthesis « combinaison ») est le processus bioénergétique qui permet à des organismes de synthétiser de la matière organique en utilisant l'énergie lumineuse, l'eau et le dioxyde de carbone.
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Photosystème
Un photosystème est un ensemble formé par des protéines et des pigments - dont la chlorophylle - et se trouve dans les membranes thylakoïdales des cyanobactéries et des chloroplastes dans les cellules végétales.
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Photosystème I
Le photosystème I (PSI) est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Ce complexe enzymatique est le second à intervenir dans les réactions de la photosynthèse dépendantes de la lumière.
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Photosystème II
Le photosystème II (PSII) est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Ce complexe enzymatique est le premier à intervenir dans les réactions de la photosynthèse dépendantes de la lumière.
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Phototrophie
La phototrophie (du grec ancien, photos « lumière » et, trophein « nourriture ») est le type trophique des organismes vivants qui tirent leur énergie à partir de la lumière, par photosynthèse ou grâce à des protéines comme les bactériorhodopsines.
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Phycobiline
Structure de la phycoérythrobiline. Structure de la phycourobiline. Structure de la phycocyanobiline. Une phycobiline est un chromophore présent chez les cyanobactéries et dans les chloroplastes — plus précisément dans le lumen des thylacoïdes — des algues rouges, des glaucophytes et des cryptophytes.
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Phylloquinone
La phylloquinone, également appelée ou phytoménadione, est une 2-méthyl-1,4-naphtoquinone substituée avec un résidu 3-phytyle.
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Pigment biologique
Un pigment biologique est une substance synthétisée par des organismes vivants qui a une couleur résultant de l'absorption sélective des couleurs.
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Planctomycetota
Les planctomycètes ou Planctomycetota (anciennement Planctomycetes) forment un phylum de bactéries aquatiques, qui se trouvent dans des terrains saumâtres, marins ou d'eau douce, mais aussi de bactéries terrestres qui jouent un rôle important dans le processus anammox.
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Plante
Les plantes (Plantae) sont des organismes photosynthétiques et autotrophes, caractérisés par des cellules végétales.
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Plastocyanine
consulté le.
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Plastoquinone
La plastoquinone est une coenzyme de la famille des quinones participant à la chaîne de transport d'électrons de la photophosphorylation au cours de la photosynthèse.
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Pompe à protons
Une pompe à protons est une protéine transmembranaire, et plus précisément un transporteur membranaire actif, qui déplace les ions H+ contre leur gradient de concentration en utilisant de l'énergie.
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Potentiel électrochimique de membrane
Toute cellule biologique est entourée d'une membrane dite membrane plasmique.
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Potentiel d'oxydoréduction
Le potentiel d'oxydoréduction, ou potentiel redox, est une grandeur empirique exprimée en volts et généralement notée E_ (ou, pour le potentiel redox standard, où désigne un métal quelconque).
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Potentiel hydrogène
Pas de description.
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Prix Nobel de chimie
Le prix Nobel de chimie est une récompense décernée une fois par an, depuis 1901, par l'Académie royale des sciences de Suède à un scientifique dont l'œuvre et les travaux ont rendu de grands services à l'humanité par une contribution exceptionnelle en chimie.
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Produit de réaction
Les produits de réaction de la combustion du méthane sont le dioxyde de carbone et l'eau. Un produit de réaction est une substance résultant d'une réaction chimique.
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Prokaryota
Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).
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Protéine
groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.
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Protéine découplante
pmc.
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Protéine fer-soufre
Une protéine fer-soufre, abrégée en protéine Fe-S, est une protéine non héminique possédant dans sa structure un cluster fer-soufre consistant en des groupes de deux, trois ou quatre atomes de fer — chacun dans un état d'oxydation propre — liés à des anions sulfure S2−.
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Protéine membranaire
Les protéines membranaires constituent l'une des trois principales classes de protéines à côté des protéines fibreuses et des protéines globulaires.
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Protéine membranaire intégrale
Exemples de protéines membranaires polytopiques. Exemples de protéines membranaires monotopiques. Une protéine membranaire intégrale, ou protéine intégrale de membrane, est une protéine en interaction permanente avec une membrane biologique.
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Protista
Les protistes, sont des microorganismes eucaryotes à organisation cellulaire dite simple, unicellulaire le plus souvent, multicellulaire parfois mais sans tissus spécialisés.
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Proton
Le proton est une particule subatomique portant une charge électrique élémentaire positive.
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Pseudomonas
Les bactéries du genre Pseudomonas peuvent être définies par.
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Quinone
Les quinones constituent une série de diènes plutôt que des composés aromatiques comportant un noyau de benzène sur lequel deux atomes d'hydrogène sont remplacés par deux atomes d'oxygène formant deux liaisons carbonyles (dicétones éthylèniques conjuguées cycliques).
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Radical (chimie)
Un radical (souvent appelé radical libre) est une espèce chimique possédant un ou plusieurs électrons non appariés sur sa couche externe.
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Réaction d'oxydoréduction
L'aluminothermie est une réaction d'oxydoréduction entre l'aluminium et certains oxydes métalliques. Une réaction d'oxydoréduction ou réaction rédox est une réaction chimique au cours de laquelle se produit un transfert d'électrons.
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Réaction endergonique
Graphe de l'évolution de l'énergie par le temps dans une réaction endergonique. Une réaction endergonique est une réaction chimique nécessitant un apport d'énergie.
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Résidu (biochimie)
acides aminés. En biochimie et en biologie moléculaire, un résidu est la partie d'une molécule, généralement un monomère, qui est restée inchangée après être entrée dans la composition d'une biomolécule complexe ou d'un polymère.
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Respiration anaérobie
La respiration anaérobie est un mécanisme dans lequel des électrons passent sur une chaîne de transporteurs dont l'accepteur final est une substance minérale autre que le dioxygène, contrairement à une respiration aérobie où l'accepteur final est du dioxygène.
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Respiration cellulaire
Schéma de principe de la phosphorylation oxydative dans une mitochondrie illustrant l'intégration du cycle de Krebs avec la chaîne respiratoire, et le couplage de celle-ci avec l'ATP synthase au moyen d'un gradient électrochimique issu d'un gradient de concentration de protons à travers la membrane mitochondriale interne. La respiration cellulaire est l'ensemble des processus du métabolisme cellulaire convertissant l'énergie chimique contenue dans le glucose en adénosine triphosphate (ATP).
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Rhodobacteraceae
Les Rhodobacteraceae sont une famille de protéobactéries de l'ordre des Rhodobacterales dans le sous-groupe alpha.
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Semiquinone
Une semiquinone résulte formellement de l'addition d'un électron sur une quinone.
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Soufre
Le soufre est l'élément chimique de numéro atomique 16, de symbole S. C'est un membre du groupe des chalcogènes.
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Stéroïde
Les stéroïdes sont un groupe de lipides dérivant de triterpénoïdes (lipides à 30 atomes de carbone), majoritairement le squalène.
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Stress oxydant
Le stress oxydant, appelé aussi stress oxydatif (anglicisme) ou pression oxydative, est un type d'agression des constituants de la cellule.
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Stroma (cytologie)
membrane interne du chloroplaste et la membrane des thylakoïdes. En cytologie, le stroma est le fluide incolore qui entoure les thylakoïdes dans les chloroplastes des cellules végétales.
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Substrat enzymatique
En enzymologie, on désigne par substrat enzymatique toute molécule subissant une réaction chimique catalysée par une enzyme (ex: l'amidon est hydrolysé par l'amylase en glucose).
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Succinate déshydrogénase
La succinate déshydrogénase (SDH), ou complexe de la chaîne respiratoire, également appelée succinate-coenzyme Q réductase (SQR), est une oxydoréductase membranaire qui catalyse la réaction: Cette enzyme est présente chez un très grand nombre d'êtres vivants.
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Sulfate
Un sulfate est un sel de l'acide sulfurique HSO.
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Sulfite
Les sulfites sont les sels de l'hypothétique acide sulfureux (H2SO3).
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Sulfure
En chimie, un sulfure est un composé chimique où le soufre, avec un degré d'oxydation de −II, est combiné à un autre élément chimique ou un de ses radicaux.
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Sulfure d'hydrogène
Le sulfure d'hydrogène, ou hydrogène sulfuré, est un composé chimique de formule, constitué de soufre et d'hydrogène.
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Superoxyde
L'ion superoxyde, noté •− ou − (la deuxième écriture ne fait pas apparaître explicitement le caractère radicalaire) est issu de la réduction monoélectronique du dioxygène.
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Terpénoïde
Les terpénoïdes, parfois appelés isoprénoïdes, forment une classe large et diverse de composés organiques rencontrés dans la nature, similaires aux terpènes, dérivant d'unités isopréniques à cinq atomes de carbone assemblées et modifiées de milliers de façons.
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Théorie chimiosmotique
La théorie chimiosmotique, formulée par Peter Mitchell en 1961, postule que l'« intermédiaire de haute énergie » dans les processus cellulaires de transduction énergétique (respiration cellulaire et photosynthèse) est un gradient de concentration de protons établi à travers la membrane interne de l'organite concerné, mitochondrie ou chloroplaste, ou à travers la membrane plasmique chez les bactéries.
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Théorie endosymbiotique
Schéma de formation d'une cellule eucaryote hétérotrophe et autotrophe par absorption de bactéries. Origine des eucaryotes selon la théorie endosymbiotique. La théorie endosymbiotique, ou hypothèse de l'endosymbiose, est l'hypothèse selon laquelle les deux organites intervenants dans la gestion de l'énergie (chloroplastes et mitochondries) des cellules eucaryotes proviennent de l’incorporation (endocytose) par certaines archées, des bactéries avec lesquelles elles auraient entretenu une relation endosymbiotique.
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Thermodynamique
La thermodynamique est la branche de la physique qui traite de la dépendance des propriétés physiques des corps à la température, des phénomènes où interviennent des échanges thermiques, et des transformations de l'énergie entre différentes formes.
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Thermogénine
protéines découplantes. La thermogénine, ou UCP1, est une protéine découplante présente dans les mitochondries du tissu adipeux brun où elle est responsable de la thermogenèse.
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Thermogenèse
La thermogenèse est la production de chaleur de l’organisme chez les animaux par augmentation du métabolisme cellulaire.
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Thiol
groupe sulfhydryle en bleu. Un thiol est un composé organosulfuré de formule générique R–SH, où R est un radical organique (alkyle ou aryle, par exemple) et –SH le groupe sulfhydryle, analogue au groupe hydroxyle –OH des alcools en remplaçant l'atome d'oxygène par un atome de soufre.
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Thiotrichaceae
Les Thiotrichaceae sont une famille de bactéries, de l'embranchement des Pseudomonadota.
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Thylakoïde
Le thylakoïde (on peut aussi écrire: thylacoïde) est un ensemble de membranes présent chez les cyanobactéries et dans les chloroplastes où se déroule la phase photochimique (ou claire) de la photosynthèse.
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Tissu adipeux brun
Tissu adipeux brun chez une femme (tomographie par émission de positons.) Le tissu adipeux brun ou graisse brune est l'un des types de tissu adipeux (les autres étant le tissu adipeux blanc et la moelle hématopoïétique; et le tissu adipeux beige ou brite pour brown in white) présent chez les mammifères.
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Type trophique
Le type trophique (du mot grec θροφη, « nourriture ») définit la manière dont un organisme vivant constitue sa propre matière organique et produit l'énergie dont il a besoin.
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Ubiquinol
L’ubiquinol est une benzoquinone réduite (forme phénolique), liposoluble présente dans pratiquement toutes les cellules des mammifères.
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Ubiquinone
Structure générique des ubiquinones. Une ubiquinone est une molécule appartenant à une famille de composés qui se distinguent par leur nombre n d'unités terpéniques — n typiquement compris entre 6 et 10 — présents chez tous les êtres vivants et jouant le rôle de transporteurs d'électrons dans la chaîne respiratoire.
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Unité de masse atomique unifiée
Lunité de masse atomique unifiée.
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Valeur algébrique
La valeur algébrique d'un vecteur \vec v, porté par (ou parallèle à) un axe (une droite orientée) de vecteur unitaire \vec u, est le nombre réel (ou \bar vOn utilise surtout la notation \bar v quand on a déjà choisi de noter le module \|\vec v\|, toujours positif ou nul.) tel que: On peut le calculer à l'aide du produit scalaire: On dit parfois d'une grandeur physique de nature scalaire qu'on la prend en valeur algébrique, ou qu'elle est plus grande qu'une autre en valeur algébrique, pour préciser que sa valeur peut être positive, nulle ou négative et qu'il ne s'agit pas de sa valeur absolue (toujours positive ou nulle).
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Vibrio
Vibrio (en français les Vibrions) est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Vibrionaceae.
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Voie métabolique
Une voie métabolique est un ensemble de réactions chimiques catalysées par une série d'enzymes qui agissent de manière séquentielle.
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2,4-Dinitrophénol
Le 2,4-dinitrophénol (DNP) est un composé chimique aromatique de formule CHNO.
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