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Acide aminé
carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.
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Acide ascorbique
L'acide ascorbique, ou acide oxo-3-gulofuranolactone (forme énolique), est un acide organique ayant des propriétés antioxydantes.
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Acide lipoïque
L'acide lipoïque, ou acide alpha-lipoïque, appelé aussi acide thioctique, à ne pas confondre avec l'acide α-linolénique, est un composé organosulfuré dérivant de l'acide octanoïque, un acide carboxylique, et possédant un cycle 1,2-dithiolane.
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Adénosine diphosphate
L'adénosine diphosphate ou ADP est un nucléotide.
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Adénosine triphosphate
L’adénosine triphosphate, ou ATP, est un nucléotide formé à partir d'un nucléoside associé à un triphosphate.
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Apoenzyme
Une apoenzyme est une enzyme sans son coenzyme, c'est-à-dire la protéine à laquelle la coenzyme se liera pour produire une holoenzyme active.
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Autotrophie
L’autotrophie est la production, par un organisme vivant, de toute la matière organique nécessaire par réduction de matière minérale.
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Auxotrophie
L'auxotrophie est l'incapacité d'un organisme vivant de synthétiser un composé organique nécessaire à son développement.
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Catalyse enzymatique
La catalyse enzymatique est le processus par lequel des réactions chimiques sont catalysées dans les systèmes vivants par des protéines spécialisées ou des ARN appelés enzymes.
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Cellule (biologie)
consulté le.
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Cluster fer-soufre
Les clusters fer-soufre, abrégés en clusters Fe-S, (ou Iron-Sulfur Cluster, abrégé en ISC en anglais) sont des agrégats atomiques contenant des atomes de fer et de soufre.
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Coenzyme A
La coenzyme A (CoA) est une coenzyme de transfert de groupements acyle intervenant dans de très nombreuses voies du métabolisme (cycle de Krebs, bêta-oxydation).
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Coenzyme Q10
Figure 1: Structure chimique des ubiquinones. ''n'' peut varier de 6 à 10 et forme une chaîne polyisoprénique. La coenzyme Q (CoQ, ou plus simplement Q), également connue sous le nom d’ubiquinone, est une 1,4-Benzoquinone pour laquelle Q fait référence au groupe quinone et 10 au nombre d'unités isopréniques dans sa chaîne latérale.
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Cofacteur (biochimie)
centres fer-soufre et hème. En biochimie, un cofacteur est un composé chimique non protéique mais qui est nécessaire à l'activité biologique d'une protéine, le plus souvent une enzyme.
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Complexe (biologie)
En biologie et en chimie supramoléculaire, le mot complexe désigne généralement toute association de molécules basée sur des forces autres que la liaison covalente.
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Cycle catalytique
Exemple de cycle catalytique: le procédé Monsanto. En chimie, un cycle catalytique est un terme désignant un mécanisme réactionnel à plusieurs étapes impliquant un catalyseur.
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Cystéine
La cystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Cys et C), du grec ancien (« vessie »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UGU et UGC.
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Cytidine triphosphate
La cytidine triphosphate (CTP) est un coenzyme de transfert de groupements phosphate qui est associé de façon non covalente (c'est un co-substrat) aux enzymes de la classe des kinases.
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Cytochrome
Les cytochromes sont des coenzymes intermédiaires de la chaîne respiratoire.
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Décarboxylase
Les décarboxylases sont des groupes d'enzymes réalisant la décarboxylation d'acides aminés, d'α-cétaocides ou de β-cétoacides (2-cétoacides ou 3-cétoacides), c'est-à-dire qui catalysent une transformation chimique de ces acides aboutissant à la perte d'un groupe carboxyle (COO−).
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Enzyme
stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.
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Flavine adénine dinucléotide
La flavine adénine dinucléotide (FAD) est une coenzyme d'oxydo-réduction dérivant de la riboflavine (vitamine B2).
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Flavine mononucléotide
La flavine mononucléotide (FMN), ou riboflavine-5′-phosphate, est une biomolécule produite à partir de la riboflavine (vitamine B2) par l'enzyme riboflavine kinase et agit comme groupement prosthétique de diverses oxydo-réductases, comme la NADH déshydrogénase, mais aussi comme cofacteur avec les bio-photorécepteurs de lumière bleue.
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Glutathion
Le glutathion est un pseudo-tripeptide formé par la condensation d'acide glutamique, de cystéine et de glycine:. Le glutathion, qui existe sous forme oxydée et réduite, intervient dans le maintien du potentiel redox du cytoplasme de la cellule.
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Groupement prosthétique
Il s'agit d'un composé organique non protéique maintenu dans une structure protéique (nommée alors apoprotéine) au moyen de liaisons covalentes permanentes, mais aussi éventuellement de liaisons faibles (ex: liaisons ioniques, liaisons hydrogène).
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Guanosine triphosphate
Le guanosine triphosphate (GTP) est une coenzyme de transfert de groupements phosphate.
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Hème
hème ''b''. hème ''b''. hème ''a''. L’hème est un cofacteur contenant un atome de métal, souvent du fer, servant à accueillir un gaz diatomique (par exemple du dioxygène) au centre d’un large anneau organique appelé porphyrine.
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Hémoglobine
L'hémoglobine, couramment symbolisée Hb, parfois Hgb, est un pigment respiratoire (de la famille moléculaire des métalloprotéines, ici contenant du fer) présent essentiellement dans le sang des vertébrés, au sein de leurs globules rouges, ainsi que dans les tissus de certains invertébrés.
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Hétérotrophie
Cycle de transfert de matière organique entre organismes autotrophes et hétérotrophes L'hétérotrophie est le mode de nutrition des organismes vivants hétérotrophes.
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Holoenzyme
Le terme holoenzyme (ou plus rarement hétéroenzyme), du grec holos, entier, est l'assemblage du cofacteur (qui peut être un ion métallique, un agrégat atomique ou une molécule organique) et d'une ou plusieurs chaînes protéiques, formant ainsi une enzyme complète et active.
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Liaison covalente
Une liaison covalente est une liaison chimique dans laquelle deux atomes se partagent deux électrons (un électron chacun ou deux électrons venant du même atome) d'une de leurs couches externes afin de former un doublet d'électrons liant les deux atomes.
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Liaison π
Une liaison (prononcé pi) est une liaison chimique covalente dans laquelle deux lobes d'une orbitale atomique occupée par un électron unique se recouvrent avec deux lobes d'une orbitale occupée par un électron d'un autre atome.
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Métabolisme
Le métabolisme est l'ensemble des réactions chimiques qui se déroulent à l'intérieur de chaque cellule d'un être vivant et lui permettent notamment de se maintenir en vie, de se reproduire (se diviser), de se développer et de répondre aux stimuli de son environnement (échanges par exemple).
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Nicotinamide adénine dinucléotide
Le nicotinamide adénine dinucléotide (NAD) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.
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Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate
Le nicotinamide adénine dinucléotide phosphate (NADP) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.
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Nucléotide
Un nucléotide est une molécule organique qui est composée d'une base nucléique (ou base azotée), d'un ose à cinq atomes de carbone, dit pentose, dont l'association forme un nucléoside, et enfin de un à trois groupes phosphate.
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Phosphate de pyridoxal
Le phosphate de pyridoxal (PLP) est une coenzyme dérivée d'une vitamine, la 6).
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Porphyrine
Les porphyrines sont des molécules à structures cycliques impliquées dans le transport du dioxygène et pouvant jouer le rôle de cofacteur lié (groupement prosthétique) à certaines enzymes.
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Pyridoxine
La pyridoxine est avec la pyridoxamine et le pyridoxal, une des formes de la.
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Pyrophosphate de thiamine
Le Pyrophosphate de thiamine ou thiamine pyrophosphate (TPP) ou diphosphate de thiamine ou thiamine diphosphate (ThDP), est un dérivé de la 1, ou thiamine, qui se forme sous l'action d'une enzyme, la thiamine diphosphokinase.
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S-Adénosylméthionine
La S-adénosylméthionine, ou SAM, est un métabolite présent dans les cellules et qui est impliqué en premier lieu comme coenzyme dans les réactions de transfert de groupes méthyle.
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Stœchiométrie
Équation de réaction équilibrée illustrant la stœchiométrie de la réaction de combustion du méthane. En chimie, la stœchiométrie, du grec ancien / (« élément ») et / (« mesure »), est un calcul qui permet d'analyser les quantités de réactifs et de produits qui sont en jeu au cours d'une réaction chimique.
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Thymidine triphosphate
La désoxythymidine triphosphate (dTTP), est un désoxyribonucléotide précurseur de l'ADN.
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Transaminase
Une transaminase ou aminotransférase est une enzyme qui catalyse un type de réaction entre un acide aminé et un acide α-cétonique.
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Uridine triphosphate
L'uridine triphosphate est un nucléotide, coenzyme de transfert de groupements phosphate qui est associé de façon non covalente (c'est un co-substrat) aux enzymes de la classe des kinases.
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Vitamine
Une vitamine est une substance organique, nécessaire en quantité mineure (moins de 100 mg/jour - voir tableau ci-dessous) au métabolisme d'un organisme vivant, qui ne peut être synthétisée en quantité suffisante par cet organisme.
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Vitamine B1
La thiamine ou vitamine (ou encore aneurine) est une vitamine hydrosoluble de la famille des vitamines B que les animaux doivent trouver dans leur alimentation.
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Vitamine B12
La, également appelée cobalamine, est une vitamine hydrosoluble essentielle au fonctionnement normal du cerveau (elle participe à la synthèse des neurotransmetteurs), du système nerveux (elle est indispensable au maintien de l'intégrité du système nerveux et tout particulièrement de la gaine de myéline qui protège les nerfs et optimise leur fonctionnement) et à la formation du sang.
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Vitamine B5
La vitamine B5, correspondant à l’acide pantothénique, est une vitamine hydrosoluble.
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Vitamine B6
Phosphate de pyridoxal. Structure de la pyridoxine. La vitamine est une vitamine hydrosoluble représentée par trois formes principales: la pyridoxine, le pyridoxal et la pyridoxamine.
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Vitamine B8
La vitamine, correspondant à la biotine, est une vitamine hydrosoluble encore souvent appelée coenzyme R,, ou encore 7''' dans de nombreux pays, notamment en Allemagne ou dans les pays anglo-saxons (chez ces derniers, la est une appellation erronée pour l'AMP, tandis qu'en France la désigne improprement l'inositol, ces deux composés n'ayant aucun rapport entre eux ni avec la biotine).
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Voie métabolique
Une voie métabolique est un ensemble de réactions chimiques catalysées par une série d'enzymes qui agissent de manière séquentielle.
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3'-Phosphoadénosine 5'-phosphosulfate
La 3'-phosphoadénosine 5'-phosphosulfate, dont l'anion est couramment abrégé en PAPS, est un dérivé de l'AMP phosphorylé en position 3' et avec un groupe sulfate sur le phosphate de la position 5'.
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