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Cycle de Krebs

Indice Cycle de Krebs

Le cycle de Krebs, aussi appelé cycle de l'acide citrique par anglicisme, est une voie métabolique présente chez tous les organismes aérobies et dont la fonction première est d'oxyder les groupes acétyle, issus notamment de la dégradation des glucides, des graisses et des protéines, pour en récupérer l'énergie sous forme de huit électrons à haut potentiel de transfert et d'une molécule de GTP ou d'ATP; les électrons à haut potentiel de transfert, récupérés sur le NADH et l'ubiquinol (ou 10 réduite), peuvent ensuite circuler à travers la chaîne respiratoire pour permettre à leur tour la formation de molécules d'ATP supplémentaires par la phosphorylation oxydative.

226 relations: Aérobie, Acétyl-coenzyme A, Acétyle, Acide acétique, Acide aconitique, Acide alpha-cétoglutarique, Acide aminé, Acide aminé cétoformateur, Acide aminé essentiel, Acide aminé glucoformateur, Acide aminé protéinogène, Acide aspartique, Acide biliaire, Acide citrique, Acide désoxyribonucléique, Acide fumarique, Acide glutamique, Acide gras, Acide isocitrique, Acide lactique, Acide malique, Acide malonique, Acide nucléique, Acide oxaloacétique, Acide oxalosuccinique, Acide phosphoénolpyruvique, Acide phosphorique, Acide pyruvique, Acide ribonucléique, Acide succinique, Acidocétose diabétique, Aconitase, Adénosine diphosphate, Adénosine monophosphate cyclique, Adénosine triphosphate, Adrénaline, Alanine, Albert Szent-Györgyi, Allostérie, Alpha-Cétoglutarate déshydrogénase, Alpha-Cétoglutarate synthase, Amine (chimie), Anaérobie, Anabolisme, Angiogenèse, Animal, Années 1930, Apoptose, Archaea, Arginine, ..., Asparagine, Atome, ATP citrate lyase, ATP synthase, Évolution (biologie), Bactérie, Base azotée, Bêta-oxydation, Biochimie, Biologie moléculaire, Biosynthèse, Biosynthèse des acides gras, Calcium, Carbone, Carboxylation, Catabolisme, Cation, Cétoacide, Cœur, Cellule (biologie), Chaîne carbonée, Chaîne respiratoire, Cholestérol, Citrate synthase, Clivage (chimie), Coenzyme, Coenzyme A, Coenzyme Q10, Cofacteur (biochimie), Complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase, Complexe pyruvate déshydrogénase, Concentration molaire, Corps cétoniques, Crotonisation, Cycle du glyoxylate, Cytochrome, Cytoplasme, Cytosol, Décarboxylation, Décarboxylation du pyruvate, Déshydrogénase, Diabète sucré, Dihydrolipoamide S-succinyltransférase, Dihydrolipoyl déshydrogénase, Dihydroxyacétone phosphate, Dioxyde de carbone, Dioxygène, Eau, Enzyme, Espèce, Eukaryota, Facteur de transcription, Facteur induit par l’hypoxie, Fermentation, Flavine adénine dinucléotide, Flavoprotéine, Foie, Fructose-1,6-bisphosphate, Fumarase, Fungi, Glucagon, Glucide, Glucose, Glutamine, Glycéraldéhyde-3-phosphate, Glycérol, Glycolyse, Graisse alimentaire, Groupe fonctionnel, Groupement prosthétique, Guanosine diphosphate, Guanosine triphosphate, Hans Adolf Krebs, Hémoglobine, Hémoprotéine, Helicobacter pylori, Homéostasie, Hormone stéroïdienne, Hydrolase, Hydrolyse, Hydroxylation, In vitro, In vivo, Inhibiteur enzymatique, Insuline, Ion, Isocitrate déshydrogénase, Isoforme, Isoleucine, Isomérie, Jeûne, Leucine, Lipide, Lipoamide, Lipolyse, Lyase, Lysine, Magnésium, Malate déshydrogénase, Mammifère, Manganèse, Matrice mitochondriale, Métabolite, Membrane mitochondriale interne, Mitochondrie, Mole (unité), Muscle squelettique, Myocyte, Myoglobine, Navette mitochondriale, Néoglucogenèse, Nicotinamide adénine dinucléotide, Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate, Nucléotide, Organisme (physiologie), Origine de la vie, Oxydoréductase, Peptidase, Phénylalanine, Phosphate de pyridoxal, Phosphoénolpyruvate carboxykinase, Phosphofructokinase-1, Phosphorylation, Phosphorylation oxydative, Plante, Polypeptide, Polysaccharide, Porphyrine, Précurseur (chimie), Procollagène-proline dioxygénase, Prokaryota, Proline, Propionyl-coenzyme A, Protéine, Protista, Purine, Pyrimidine, Pyruvate carboxylase, Pyruvate déshydrogénase, Pyruvate déshydrogénase phosphatase, Quinone, Réaction anaplérotique, Réaction d'hydratation, Réaction d'oxydoréduction, Réaction de condensation, Réaction de déshydratation, Résidu (biochimie), Rein, Respiration aérobie, Respiration cellulaire, Sang, Semialdéhyde succinique, Substrat enzymatique, Succinate déshydrogénase, Succinate-semialdéhyde déshydrogénase, Succinyl-CoA:acétate CoA-transférase, Succinyl-coenzyme A, Succinyl-coenzyme A synthétase, Synthase, Taxon, Thermodynamique, Thiamine pyrophosphate, Thioester, Tissu biologique, Transamination, Triglycéride, Tryptophane, Tyrosine, Ubiquinol, Ubiquinone, Ubiquitine ligase, Vitamine D, Voie des pentoses phosphates, Voie métabolique, 2-Oxoglutarate décarboxylase, 3-Oxoacide CoA-transférase. Développer l'indice (176 plus) »

Aérobie

Le terme aérobie s'applique à un organisme vivant ou à un moteur qui a besoin de dioxygène pour vivre ou fonctionner.

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Acétyl-coenzyme A

L'acétyl-coenzyme A, usuellement écrite acétyl-CoA, est la forme « activée » de l'acide acétique, c'est-à-dire le thioester que forme ce dernier avec la coenzyme A. C'est une molécule à haut potentiel d'hydrolyse située au carrefour de plusieurs voies métaboliques importantes.

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Acétyle

Le groupe acétyle est le groupement acyle de l'acide acétique.

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Acide acétique

L'acide acétique ou acide éthanoïque est un acide carboxylique avec une chaîne carbonée théorique en C2, analogue à l'éthane, de masse molaire et de formule chimique brute C2H4O2 ou semi-développée CH3-CO-OH.

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Acide aconitique

L’acide aconitique, ou acide équisétique, est un acide tricarboxylique de formule.

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Acide alpha-cétoglutarique

L’acide α-cétoglutarique, également appelé acide 2-oxoglutarique, est l'une des deux cétones dérivées de l'acide glutarique, l'autre étant l'acide β-glutarique, bien moins courant.

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Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

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Acide aminé cétoformateur

Un acide aminé cétoformateur est un acide aminé susceptible d'être converti en corps cétoniques par la cétogenèse, par opposition aux acides aminés glucoformateurs qui sont, quant à eux, convertis en glucose.

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Acide aminé essentiel

Un acide aminé essentiel ou indispensable (en anglais, IAA), est un acide aminé qui ne peut être synthétisé de novo par l'organisme (généralement humain) ou qui est synthétisé à une vitesse insuffisante, et doit donc être apporté par l'alimentation, condition nécessaire au bon fonctionnement de l'organisme.

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Acide aminé glucoformateur

Un acide aminé glucoformateur est un acide aminé susceptible d'être converti en glucose par la néoglucogenèse, par opposition aux acides aminés lipoformateurs et acides aminés cétoformateurs, qui sont convertis en corps cétoniques par la cétogenèse.

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Acide aminé protéinogène

groupe aldéhyde sur l'atome d'azote de l'amine primaire Un acide aminé protéinogène est un acide aminé incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.

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Acide aspartique

L’acide aspartique (abréviations IUPAC-IUBMB: Asp et D), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAU et GAC.

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Acide biliaire

Les acides biliaires (également connus sous le nom de sels biliaires) sont formés par des dérivés du cholestérol et par des stéroïdes acides sécrétés par le foie et se trouvent principalement dans la bile des mammifères.

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Acide citrique

L'acide citrique est un acide tricarboxylique α-hydroxylé présent en abondance dans le citron, d'où son nom. Il s'agit d'un acide faible qui joue un rôle important en biochimie comme métabolite du cycle de Krebs, une voie métabolique majeure chez tous les organismes aérobies. Plus d'un million de tonnes d'acide citrique sont produites industriellement chaque année. Il est largement utilisé comme exhausteur de goût, comme régulateur alimentaire de pH et comme chélateur.

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Acide désoxyribonucléique

noyau. Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique ou ADN (en anglais, deoxyribonucleic acid ou deoxyribose nucleic acid ou DNA) est une macromolécule biologique présente dans toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide fumarique

L'acide fumarique, ou acide trans-butènedioïque, est un acide dicarboxylique insaturé de formule chimique HOOC–CH.

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Acide glutamique

L'acide glutamique (abréviations IUPAC-IUBMB: Glu et E), ou glutamate sous la forme anionique de l'acide glutamique, est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAA et GAG.

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Acide gras

En chimie, un acide gras est un acide carboxylique à chaîne aliphatique.

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Acide isocitrique

L’acide isocitrique est un composé chimique de formule.

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Acide lactique

L'acide lactique est un acide organique qui joue un rôle dans divers processus biochimiques.

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Acide malique

L'acide malique est un acide alpha-hydroxylé de formule.

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Acide malonique

L'acide malonique est un diacide carboxylique aliphatique de formule HOOC-CH-COOH.

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Acide nucléique

Les acides nucléiques sont des macromolécules, c’est-à-dire de grosses molécules relativement complexes.

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Acide oxaloacétique

L'acide oxaloacétique, dont la base conjuguée est l'oxaloacétate, est un acide dicarboxylique de formule.

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Acide oxalosuccinique

L’acide oxalosuccinique est un cétoacide tricarboxylique de formule.

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Acide phosphoénolpyruvique

L’acide phosphoénolpyruvique — ou phosphoénolpyruvate sous forme déprotonée, abrégée en PEP — est un composé organique important en biochimie, en raison notamment de son groupe phosphate à haut potentiel de transfert (ΔG°'.

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Acide phosphorique

L’acide phosphorique est un composé chimique de formule.

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Acide pyruvique

L’acide pyruvique est un composé chimique de formule.

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Acide ribonucléique

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Acide succinique

L'acide succinique est un diacide carboxylique aliphatique, dénommé également acide butane-1,4-dioïque et de formule semi-développée.

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Acidocétose diabétique

L'acidocétose diabétique est une complication principalement du diabète de type I, mais parfois présent dans le type 2 lorsqu'il y a absence de production d'insuline, puisque l'insuline prévient: la dégradation des lipides, la production des corps cétoniques liée à cette dégradation et l'acidocétose diabétique.

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Aconitase

L’aconitase, ou aconitate hydratase, est une lyase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient notamment dans le cycle de Krebs pour réaliser l'isomérisation stéréospécifique du citrate en isocitrate via le.

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Adénosine diphosphate

L'adénosine diphosphate ou ADP est un nucléotide.

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Adénosine monophosphate cyclique

L'adénosine monophosphate cyclique (ou AMP cyclique ou AMPc) agit souvent en tant qu'intermédiaire, dans l'action des hormones ou des neurotransmetteurs notamment.

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Adénosine triphosphate

L’adénosine triphosphate, ou ATP, est un nucléotide formé à partir d'un nucléoside à un triphosphate. Dans la biochimie de tous les êtres vivants connus, l'ATP fournit l'énergie nécessaire aux réactions chimiques du métabolisme, à la locomotion, à la division cellulaire, ou encore au transport actif d'espèces chimiques à travers les membranes biologiques. Afin de libérer cette énergie, la molécule d'ATP est clivée, par hydrolyse, en adénosine diphosphate (ADP) et en phosphate, réaction qui s'accompagne d'une variation d'enthalpie libre standard ΔG de, sur de, Harvard Medical School.. Les cellules régénèrent ensuite l'ATP à partir de l'ADP essentiellement de trois manières différentes: par phosphorylation oxydative dans le cadre de la respiration cellulaire, par photophosphorylation dans le cadre de la photosynthèse, et par phosphorylation au niveau du substrat au cours de certaines réactions chimiques exergoniques, par exemple au cours de la glycolyse ou du cycle de Krebs. Ainsi, le corps humain ne contient à chaque instant qu'environ d'ATP mais consomme et régénère chaque jour de l'ordre de son propre poids en ATP. La molécule d'ATP consiste en un groupe triphosphate lié à l'atome de carbone 5’ d'un résidu de ribose, un pentose, dont l'atome de carbone 1’ est lié à l'atome d'azote 9’ d'un résidu d'adénine, une base purique. Les deux liaisons phosphoanhydride P–O–P du groupe triphosphate sont des liaisons à haut potentiel de transfert, c'est-à-dire que leur clivage par hydrolyse libère une importante quantité d'énergie: il s'agit d'une réaction exergonique. Le couplage d'une telle réaction exergonique avec une réaction endergonique, c'est-à-dire qui absorbe de l'énergie, est susceptible de rendre cette dernière thermodynamiquement possible. De cette façon, les réactions du métabolisme qui nécessitent un apport d'énergie, telles que les réactions de biosynthèse, qui ne se produisent spontanément que très lentement ou pas du tout, peuvent se dérouler bien plus rapidement dans les cellules. L'ATP est le précurseur d'un certain nombre de cofacteurs enzymatiques importants, comme le NAD+ ou la coenzyme A. C'est également une coenzyme de transfert de groupes phosphate associée de manière non covalente aux enzymes de la famille des kinases. Ces dernières interviennent dans la transduction de certaines voies de signalisation cellulaire, par phosphorylation de protéines et d'enzymes cibles, dont l'activité se trouve ainsi régulée, ou par phosphorylation de lipides. L'ATP est également le substrat de l'adénylate cyclase, qui le convertit en AMP cyclique. Celui-ci est un messager secondaire intracellulaire, prenant la suite notamment d'hormones telles que le glucagon et l'adrénaline pour agir sur le métabolisme du glycogène, des glucides et des lipides en général. Le rapport entre la concentration d'ATP et la concentration d'AMP est utilisé par les cellules pour déterminer leur charge énergétique, c'est-à-dire la quantité d'énergie dont elles disposent, ce qui leur permet, selon les cas, d'orienter leur métabolisme vers la production ou vers le stockage de l'énergie métabolique. Par ailleurs, l'ATP est utilisé par les ARN polymérases dans le processus de transcription de l'ADN en ARN ribosomique et en ARN messager. L'ATP a été découvert en 1929 par le biochimiste allemand Karl Lohmann et, parallèlement, par les biochimistes américain Cyrus Fiske et indien. C'est l'Allemand Fritz Albert Lipmann qui a suggéré qu'il joue le rôle d'intermédiaire entre réactions qui libèrent de l'énergie et réactions qui en absorbent. L'ATP a été synthétisé en laboratoire pour la première fois en 1948 par Alexander Robert Todd.

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Adrénaline

L’adrénaline est un neurotransmetteur et une hormone appartenant à la famille des catécholamines.

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Alanine

L'alanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ala et A) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GCU, GCC, GCA et GCG.

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Albert Szent-Györgyi

Albert Szent-Györgyi de Nagyrápolt (à Budapest – à Woods Hole dans le Massachusetts) est un scientifique hongrois.

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Allostérie

L'allostérie (du grec ἄλλoς, allos: autre et στερεός, stereós: solide) est un mode de régulation de l'activité d'une protéine oligomérique par lequel la fixation d'une molécule effectrice en un site modifie les conditions de fixation d'une autre molécule, en un autre site distant de la même protéine.

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Alpha-Cétoglutarate déshydrogénase

L’α-cétoglutarate déshydrogénase, ou 2-oxoglutarate déshydrogénase (OGDH), est une oxydoréductase qui fait partie du complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase, dont elle est l'enzyme E1, complexe qui réalise la conversion de l'α-cétoglutarate en succinyl-CoA et 2: Plus précisément, l'enzyme E1 catalyse la fixation de l'α-cétoglutarate sur un lipoamide avec l'aide de thiamine pyrophosphate (TPP).

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Alpha-Cétoglutarate synthase

L’α-cétoglutarate synthase, ou 2-oxoglutarate synthase, est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: |- align.

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Amine (chimie)

Une amine est un composé organique dérivé de l'ammoniac dont au moins un atome d'hydrogène a été remplacé par un groupe carboné.

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Anaérobie

bactéries du genre Desulfovibrio. On appelle milieu anaérobie un milieu où il n'y a pas présence d'oxygène sous forme de dioxygène.

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Anabolisme

L'anabolisme est l'ensemble des réactions chimiques de synthèse moléculaire de l'organisme considéré.

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Angiogenèse

L'angiogenèse est le processus de croissance de nouveaux vaisseaux sanguins à partir de vaisseaux préexistants.

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Animal

Un animal (du latin animalis « animé, vivant, animal ») est en biologie, selon la classification classique, un être vivant hétérotrophe, c’est-à-dire qu’il se nourrit de substances organiques.

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Années 1930

Les années 1930 couvrent la période de 1930 à 1939.

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Apoptose

La desquamation de l'épiderme est due à la mort cellulaire des cellules de l'épiderme. Sur la photo, la desquamation est pathologique et liée à une scarlatine L'apoptose (ou mort cellulaire programmée) est le processus par lequel des cellules déclenchent leur auto-destruction en réponse à un signal.

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Archaea

sources chaudes volcaniques. Les archées, ou Archaea (du grec ancien, « originel, primitif »), anciennement appelées archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries.

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Arginine

L'arginine (abréviations IUPAC-IUBMB: Arg et R) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CGU, CGC, CGA, CGG, AGA et AGG.

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Asparagine

L'asparagine (abréviations IUPAC-IUBMB: Asn et N) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons AAU et AAC.

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Atome

hélium 4, agrandi à droite, est formé de deux protons et de deux neutrons. Atomes de carbone à la surface de graphite observés par microscope à effet tunnel. Un atome est la plus petite partie d'un corps simple pouvant se combiner chimiquement avec un autre.

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ATP citrate lyase

L’ATP citrate lyase est une acyltransférase importante de la biosynthèse des acides gras qui clive le citrate en oxaloacétate et acétyl-CoA avec hydrolyse concomitante d'une molécule d'ATP en ADP et Pi: |- align.

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ATP synthase

L'ATP synthase (EC 3.6.3.14) est un complexe protéique enzymatique qui se trouve dans les crêtes mitochondriales, la membrane des thylakoïdes, et la membrane plasmique des bactéries et des archées.

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Évolution (biologie)

10.1016/j.resmic.2007.11.019., il montre l'histoire évolutive basée sur les caractères génétiques et l'analyse cladistique des trois domaines du vivant (bactéries, archées et eucaryotes). En biologie, l’évolution désigne la transformation du monde vivant au cours du temps, qui se manifeste par des changements phénotypiques des organismes à travers les générations.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Base azotée

Les bases azotées, ou bases nucléiques, voire nucléobases, sont des composés organiques azotés présents dans les acides nucléiques sous forme de nucléotides dans lesquels elles sont liées à un ose, le ribose dans le cas de l'ARN et le désoxyribose dans le cas de l'ADN.

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Bêta-oxydation

La β-oxydation est la principale voie métabolique de dégradation des molécules d'acides gras pour produire.

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Biochimie

Représentation tridimensionnelle de la neuraminidase. Les coordonnées des atomes ont été obtenues par cristallographie aux rayons X sur un échantillon de protéine cristallisée. en Relations schématiques entre la biochimie, la génétique et la biologie moléculaire. La biochimie est l'étude des réactions chimiques qui se déroulent au sein des êtres vivants, et notamment dans les cellules.

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Biologie moléculaire

paires de bases: thymine–adénine en haut et cytosine–guanine en bas. La biologie moléculaire (parfois abrégée bio. mol.) est une discipline scientifique au croisement de la génétique, de la biochimie et de la physique, dont l'objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau moléculaire.

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Biosynthèse

La biosynthèse est la formation de substances par un être vivant ou son symbiote, dans son milieu interne ou dans les excrêtats que sont le mucus, les coquilles des œufs ou des mollusques, l’écorce, etc.

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Biosynthèse des acides gras

La biosynthèse des acides gras est une voie métabolique essentielle du processus de lipogenèse chez les eucaryotes et les bactéries.

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Calcium

Le calcium est l'élément chimique de numéro atomique 20, de symbole Ca.

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Carbone

Le carbone est l'élément chimique de numéro atomique 6 et de symbole C. Il possède trois isotopes naturels: 12C, 13C et 14C; les deux premiers sont stables tandis que le troisième est radioactif de demi-vie.

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Carboxylation

On désigne par le terme carboxylation, toute réaction chimique aboutissant à l'addition d'un groupe fonctionnel carboxyle à une molécule organique.

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Catabolisme

Le catabolisme est l'ensemble des réactions de dégradations moléculaires de l'organisme considéré.

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Cation

Un cation (du grec cata-: « en bas » et iôn: « qui va ») est un ion qui, ayant perdu un ou plusieurs électrons, porte une ou plusieurs charges électriques positives: à l’inverse, un anion contient plus d'électrons que de protons.

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Cétoacide

Les cétoacides sont des acides organiques portant une fonction acide carboxylique et une fonction cétone.

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Cœur

Le cœur est un organe creux et musculaire qui assure la circulation du sang en pompant le sang par des contractions rythmiques vers les vaisseaux sanguins et les cavités du corps.

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Cellule (biologie)

consulté le.

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Chaîne carbonée

La chaîne carbonée, appelée aussi squelette carboné, est, dans une molécule organique, la chaîne formée par un ensemble d'atomes de carbone contigus, reliés par des liaisons covalentes.

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Chaîne respiratoire

ATP. 320x320px En biochimie, on appelle chaîne respiratoire une chaîne de transport d'électrons réalisant l'oxydation des coenzymes réduites issues de la dégradation de composés organiques ou minéraux.

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Cholestérol

Le cholestérol est un lipide de la famille des stérols qui joue un rôle central dans de nombreux processus biochimiques.

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Citrate synthase

La citrate synthase (CS) est une acyltransférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient à la du cycle de Krebs, où elle catalyse une réaction irréversible qui engage cette voie métabolique: la condensation du résidu acétyle de l'acétyl-CoA sur l'oxaloacétate pour former du citrate en libérant la coenzyme A; l'oxaloacétate est régénéré après un tour complet du cycle de Krebs.

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Clivage (chimie)

Le clivage d'une liaison chimique ou sa scission ou sa dissociation ou encore sa rupture est l'ouverture de cette liaison.

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Coenzyme

Les coenzymes (nom masculin ou féminin) sont des molécules organiques particulières ayant pour spécificité de servir de cofacteurs dans certaines enzymes, en participant à la réaction catalytique.

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Coenzyme A

La coenzyme A (CoA) est une coenzyme de transfert de groupements acyle intervenant dans de très nombreuses voies du métabolisme (cycle de Krebs, bêta-oxydation).

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Coenzyme Q10

Figure 1: Structure chimique des ubiquinones. ''n'' peut varier de 6 à 10 et forme une chaîne polyisoprénique. La coenzyme Q (CoQ, ou plus simplement Q), également connue sous le nom d’ubiquinone, est une 1,4-benzoquinone pour laquelle Q fait référence au groupe quinone et 10 au nombre d'unités isopréniques dans sa chaîne latérale.

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Cofacteur (biochimie)

centres fer-soufre et hème. En biochimie, un cofacteur est un composé chimique non protéique mais qui est nécessaire à l'activité biologique d'une protéine, le plus souvent une enzyme.

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Complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase

Le complexe α-cétoglutarate déshydrogénase, également appelé complexe oxoglutarate déshydrogénase (OGDC), est l'association de trois enzymes — une décarboxylase, une acyltransférase et une oxydo-réductase — agissant séquentiellement dans cet ordre pour catalyser la réaction: |- align.

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Complexe pyruvate déshydrogénase

Le complexe pyruvate déshydrogénase (PDC) est l'association de trois enzymes intervenant séquentiellement pour catalyser la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA.

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Concentration molaire

La concentration molaire ou molarité, ou parfois taux molaire, d'une espèce chimique est sa quantité rapportée au volume total du mélange qui contient cette espèce.

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Corps cétoniques

β-D-hydroxybutyrate. Les corps cétoniques sont trois métabolites — l'acétylacétate, le β-D-hydroxybutyrate et l'acétone — produits par le processus de cétogenèse dans le foie à partir de la dégradation des lipides, et plus particulièrement des acides gras, lorsque l'organisme ne dispose plus de réserves suffisantes en glucides, et notamment en glucose.

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Crotonisation

La crotonisation est une réaction de déshydratation d'un bêta-aldol ou d'un bêta-cétol, formant une alpha-énoneMini manuel de Chimie Organique-Édition Dunod.

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Cycle du glyoxylate

Cycle du glyoxylate avec cycle de Krebs. Le cycle du glyoxylate est une voie métabolique dérivée du cycle de Krebs participant à l'anabolisme des plantes, des bactéries, des protistes et des mycètes (champignons).

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Cytochrome

Les cytochromes sont des coenzymes intermédiaires de la chaîne respiratoire.

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Cytoplasme

Le cytoplasme (Anglais: cytoplasm) désigne le contenu d'une cellule vivante chez les procaryotes et la région comprise entre la membrane plasmique et le noyau d'une cellule eucaryote.

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Cytosol

Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux), aussi appelé ergastoplasme 6. Appareil de Golgi 7. Cytosquelette 8. Réticulum endoplasmique lisse 9. Mitochondrie 10. Vacuole 11. '''Cytosol''' 12. Lysosome 13. Centriole Le cytosol ou cytosole est, en biologie cellulaire, la phase liquide dans laquelle baignent les organites cytoplasmiques, présents à l'intérieur des cellules.

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Décarboxylation

La décarboxylation est une réaction chimique au cours de laquelle une molécule de dioxyde de carbone (CO2) est éliminée (généralement par chauffage) d'une molécule organique portant un groupement carboxyle, selon le schéma général suivant: \rm R-\color \color \xrightarrow R-H + CO_2.

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Décarboxylation du pyruvate

La décarboxylation du pyruvate, ou décarboxylation oxydative, est la réaction chimique catalysée par le complexe pyruvate déshydrogénase reliant la glycolyse au cycle de Krebs en convertissant le pyruvate en acétyl-CoA: |- align.

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Déshydrogénase

Une déshydrogénase (appelée aussi DHO dans la littérature) est une enzyme qui oxyde un substrat par le transfert d'un ou plusieurs ions (H+) à un accepteur, généralement un coenzyme type NAD+/NADP+ ou flavine comme le FAD ou le FMN.

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Diabète sucré

Le diabète sucré (ou diabète par abus de langage) est une maladie liée à une défaillance des mécanismes biologiques de régulation de la glycémie (concentration de glucose dans le sang) menant à une hyperglycémie.

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Dihydrolipoamide S-succinyltransférase

La dihydrolipoamide S-succinyltransférase est une acyltransférase qui fait partie du complexe α-cétoglutarate déshydrogénase, dont elle est l'enzyme E2, complexe qui réalise la conversion de l'α-cétoglutarate en succinyl-CoA et 2: |- align.

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Dihydrolipoyl déshydrogénase

La dihydrolipoyl déshydrogénase (DLD), également appelée dihydrolipoamide déshydrogénase, est la dernière des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), du complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase et du complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase, constitués chacun d'une décarboxylase, d'une transacétylase et d'une réductase.

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Dihydroxyacétone phosphate

La dihydroxyacétone phosphate, couramment abrégé en DHAP (et jadis appelée glycérone phosphate), est un composé organique impliqué dans plusieurs voies métaboliques de la plupart des êtres vivants.

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Dioxyde de carbone

Le dioxyde de carbone, aussi appelé gaz carbonique ou anhydride carbonique, est un composé inorganique dont la formule chimique est, la molécule ayant une structure linéaire de la forme O.

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Dioxygène

Le dioxygène, couramment nommé à l'oral oxygène ou molécule d'oxygène par vulgarisation, est une substance gazeuse dans les conditions normales de température et de pression.

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Eau

L'eau est une substance chimique constituée de molécules.

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Enzyme

substrat — ici, le maltose — au-dessus des produits de réaction — deux molécules de glucose. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A...B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A...E...B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Espèce

L'espèce est l'unité de base de la classification du vivant. Dans les sciences du vivant, l’espèce (du latin species, « type » ou « apparence ») est le taxon de base de la systématique.

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Eukaryota

Les eucaryotes (ou Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou pluricellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement de mitochondries dans leurs cellules.

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Facteur de transcription

Schéma simplifié du mécanisme d'un activateur. Un facteur de transcription est une protéine nécessaire à l'initiation ou à la régulation de la transcription d'un gène dans l'ensemble du règne du vivant (procaryote, eucaryote et archaea).

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Facteur induit par l’hypoxie

Les facteurs induits par l’hypoxie (ou HIF, sigle de l’anglais Hypoxia Inducible Factors) sont des protéines agissant comme facteurs de transcription dans tous les tissus et régulés par l’absence d’oxygène.

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Fermentation

Fermentation industrielle. La fermentation est un processus métabolique convertissant généralement des glucides en acides, en gaz ou en alcools pour en extraire une partie de l'énergie chimique tout en ré-oxydant les coenzymes réduites par ces réactions.

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Flavine adénine dinucléotide

La Flavine adénine dinucléotide (FAD) est un cofacteur d'oxydo-réduction dérivant de la riboflavine (vitamine B2).

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Flavoprotéine

Une flavoprotéine est une classe de transporteurs d'électrons dans la chaîne respiratoire.

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Foie

Le foie est en rouge sur cette représentation du système digestif humain. Le foie est un organe abdominal de l'appareil digestif des vertébrés sécrétant la bile et remplissant plus de vitales, notamment les trois suivantes: une fonction d'épuration, une fonction de synthèse et une fonction de stockage.

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Fructose-1,6-bisphosphate

Le fructose-1,6-bisphosphate (Fru-1,6-BP), souvent appelé fructose-1,6-diphosphate, est un composé organique présent dans de très nombreuses cellules vivantes sous forme de l'isomère β-D-fructose-1,6-bisphosphate, le seul qui soit biologiquement actif.

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Fumarase

La fumarase, ou fumarate hydratase, est une lyase qui catalyse la réaction: |- align.

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Fungi

Le règne des Fungi, aussi appelé Mycota ou Mycètes ou fonge, constitue un taxon regroupant des organismes eucaryotes appelés plus communément champignons.

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Glucagon

Le glucagon est une hormone hyperglycémiante (qui provoque une augmentation de la quantité de glucose dans le sang) sécrétée par les cellules alpha des îlots de Langerhans du pancréas, et qui agit principalement sur le foie en provoquant une glycogénolyse.

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Glucide

OH;- un groupe aldéhyde. Les grains et céréales contiennent une grande quantité de glucides L'Union internationale de chimie pure et appliquée (IUPAC) définit les glucides comme une classe de composés organiques contenant un groupe carbonyle (aldéhyde ou cétone) et au moins deux groupes hydroxyle (-OH).

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Glucose

Le glucose est un sucre de formule brute.

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Glutamine

La glutamine (abréviations IUPAC-IUBMB: Gln et Q) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CAA et CAG.

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Glycéraldéhyde-3-phosphate

Le glycéraldéhyde-3-phosphate, également appelé 3-phosphoglycéraldéhyde et couramment abrégé en G3P (ou PGAL par les anglophones), est un composé organique intervenant de façon centrale dans plusieurs voies métaboliques de la plupart des êtres vivants.

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Glycérol

Le glycérol, ou glycérine, est un composé chimique de formule.

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Glycolyse

La glycolyse (γλῠκὖς glykýs « sucré » et λύσις lýsis « libération ») ou voie d'Embden-Meyerhof-Parnas est une voie métabolique d'assimilation du glucose et de production d'énergie.

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Graisse alimentaire

Molécule de triglycéride, constituant principal de la graisse. La graisse alimentaire est un macronutriment énergétique constitué de matière grasse d'origine animale ou végétale et utilisée comme aliment.

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Groupe fonctionnel

En chimie, les composés organiques peuvent être considérés comme constitués d'un squelette relativement non réactif appelé lalcane parent en nomenclature substitutive, et d’un ou plusieurs groupes fonctionnels.

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Groupement prosthétique

Il s'agit d'une molécule organique non protéique maintenue dans une structure protéique (nommée alors apoprotéine) au moyen de liaisons covalentes permanentes, mais aussi éventuellement des liaisons faibles (ex: liaisons ioniques, liaisons hydrogène).

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Guanosine diphosphate

La guanosine diphosphate, abrégée en GDP, est un nucléotide.

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Guanosine triphosphate

La guanosine triphosphate (GTP) est un coenzyme de transfert de groupements phosphate.

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Hans Adolf Krebs

Hans Adolf Krebs (à Hildesheim, Allemagne - à Oxford, Angleterre) est un médecin allemand, lauréat du prix Nobel de physiologie ou médecine de 1953 en même temps que Fritz Albert Lipmann.

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Hémoglobine

L'hémoglobine, couramment symbolisée par Hb, parfois Hgb, est une métalloprotéine contenant du fer, présente essentiellement dans le sang des vertébrés au sein de leurs globules rouges, ainsi que dans les tissus de certains invertébrés.

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Hémoprotéine

Liaison de l'oxygène à un groupe hème, partie caractéristique d'une hémoprotéine. Une hémoprotéine (également appelée protéine à hème) est une protéine qui contient un groupe hème comme cofacteur.

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Helicobacter pylori

Helicobacter pylori est une bactérie qui infecte la muqueuse gastrique.

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Homéostasie

En biologie et en systémique, l’homéostasie est un phénomène par lequel un facteur clé (par exemple, température) est maintenu autour d'une valeur bénéfique pour le système considéré, grâce à un processus de régulation.

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Hormone stéroïdienne

Les hormones stéroïdiennes sont des stéroïdes se comportant comme des hormones.

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Hydrolase

Les hydrolases constituent une classe d'enzymes qui catalysent les réactions d'hydrolyse de molécules suivant la réaction générale: R-R' + H2O ⇌ R-OH + R'-H On y trouve par exemple.

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Hydrolyse

Une hydrolyse (du grec hydro: eau et lysis: briser) est une réaction chimique dans laquelle une liaison covalente est rompue par action d'une molécule d'eau.

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Hydroxylation

L'hydroxylation est une réaction chimique consistant à ajouter un groupe hydroxyle (-OH) à une molécule.

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In vitro

la In vitro (en latin: « dans le verre ») signifie un test en tube, ou, plus généralement, en dehors de l'organisme vivant ou de la cellule.

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In vivo

la In vivo (en latin: « au sein du vivant ») est une expression latine qualifiant des recherches ou des examens pratiqués sur un organisme vivant, par opposition à in vitro ou ex vivo.

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Inhibiteur enzymatique

VIH (rubans rouges, bleus et jaunes) associée à l'inhibiteur qu'est le ritonavir (petite structure en bâtons et boules près du centre). Un inhibiteur enzymatique est une substance se liant à une enzyme et qui en diminue l'activité.

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Insuline

Les deux chaines de l'insuline bovine. En rouge les ponts disulfures. L'insuline (du « île ») est une hormone protéique sécrétée par les cellules β des îlots de Langerhans dans le pancréas, ainsi que dans le chez certains poissons téléostéens.

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Ion

+) a comme logique d'avoir la même structure électronique que le gaz noble (cadre rouge) le plus proche. Un ion est un atome ou une molécule portant une charge électrique, parce que son nombre d'électrons est différent de son nombre de protons.

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Isocitrate déshydrogénase

L´isocitrate déshydrogénase (IDH) est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette réaction globale se déroule en deux étapes.

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Isoforme

Dans le domaine de la biologie cellulaire, les isoformes d'une protéine sont les différentes formes qu'elle prend lorsqu'elle est issue de gènes différents, ou du même gène par épissage alternatif.

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Isoleucine

L’isoleucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ile et I) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.

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Isomérie

Différents types d'isomères. En chimie organique, on parle d'isomérie lorsque deux molécules possèdent la même formule brute mais ont des formules développées ou stéréochimiques différentes.

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Jeûne

Illustration du jeûne dans la culture occidentale: une assiette vide avec un verre d'eau. Le jeûne est la privation, volontaire ou non, de nourriture, accompagnée ou pas d'une privation de boisson.

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Leucine

La leucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Leu et L), du grec ancien (blanc, éclatant), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.

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Lipide

estérifié par la phosphocholine (en rouge), l'acide palmitique (en bleu) et l'acide oléique (en vert). polaire » ① et des « queues apolaires » ② de molécules amphiphiles de phosphoglycérides. bicouches lipidiques. Les lipides constituent la matière grasse des êtres vivants.

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Lipoamide

Le lipoamide est le nom trivial du 5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamide qui contient un cycle dithiolane.

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Lipolyse

La lipolyse est la dégradation des lipides qui conduit à la libération des acides gras estérifiant du glycérol par hydrolyse des glycérides (triglycérides, diglycérides et monoglycérides).

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Lyase

En biochimie, une lyase est une enzyme qui catalyse la rupture de différentes liaisons chimiques par des moyens autres que l'hydrolyse ou l'oxydation, formant ainsi souvent une nouvelle liaison double ou un nouveau cycle.

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Lysine

La lysine (abréviations IUPAC-IUBMB: Lys et K) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.

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Magnésium

Le magnésium est l'élément chimique de numéro atomique 12, de symbole Mg.

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Malate déshydrogénase

La malate déshydrogénase (MDH) est une oxydoréductase du cycle de Krebs qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans plusieurs voies métaboliques majeures, notamment le cycle de Krebs.

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Mammifère

Voir l'article détaillé Les Mammifères (Mammalia) sont un taxon et un clade (un regroupement cladistique de lignées biologiques) d'animaux vertébrés.

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Manganèse

Le manganèse est l'élément chimique de numéro atomique 25, de symbole Mn.

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Matrice mitochondriale

Dans une mitochondrie, on appelle matrice mitochondriale le milieu, délimité par la membrane mitochondriale interne, qui contient les ribosomes, le matériel génétique et les enzymes solubles impliquées dans la production d'acétyl-CoA — β-oxydation, complexe pyruvate déshydrogénase — et l'oxydation de ce métabolite — cycle de Krebs.

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Métabolite

Un métabolite est un composé organique intermédiaire ou issu du métabolisme.

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Membrane mitochondriale interne

Dans une mitochondrie, la membrane mitochondriale interne délimite la matrice mitochondriale et contient un grand nombre de protéines membranaires essentiellement hydrophobes impliquées notamment dans la respiration cellulaire, la production d'ATP et le transport de divers métabolites.

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Mitochondrie

Une mitochondrie est un organite, possédant toutes les caractéristiques d'un organisme procaryote, entourée d'une double membrane et retrouvée chez la plupart des cellules eucaryotes.

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Mole (unité)

La mole (symbole: mol) est une des unités de base du Système international, adoptée en 1971, qui est principalement utilisée en physique et en chimie.

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Muscle squelettique

Les muscles squelettiques sont les muscles sous contrôle volontaire du système nerveux central.

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Myocyte

Les myocytes, ou fibres musculaires, sont des "cellules" capables de contraction (syncytium, fusion de plusieurs cellules). On distingue principalement les myocytes striées des myocytes lisses. Les propriétés contractiles des cellules musculaires tiennent de la présence d'éléments du cytosquelette capables de se contracter à la suite d'une augmentation de la concentration en calcium intracellulaire. Ces éléments contractiles élémentaires sont constitués de microfilaments d'actine couplés à des myofilaments de myosine. La myosine effectue un cycle de détachement/réattachement accompagné d'un mouvement transversal le long de l'actine. Ce cycle aboutit à un raccourcissement de la fibre, qui est à la base de la contraction générale de la cellule. Ce cycle est accompagné d'une hydrolyse d'ATP qui fournit l'énergie nécessaire à la force mécanique développée et est régulé par le calcium. L'unité contractile du myocyte est le sarcomère. Si l'on considère schématiquement celui-ci, il se définit comme l'espace entre deux lignes Z, et est composé de filaments d'actine et de myosine enchevêtrés les uns dans les autres. Les filaments d'actine sont liés directement aux lignes Z alors que la myosine est maintenue au centre du sarcomère par une protéine: la titine elle-même liée à la ligne Z.

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Myoglobine

La myoglobine, couramment symbolisée par Mb, est une métalloprotéine contenant du fer présente dans les muscles des vertébrés, et particulièrement des mammifères.

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Navette mitochondriale

Une navette mitochondriale est un mécanisme d'échange de molécules des cellules eucaryotes permettant de transférer aux mitochondries les électrons à haut potentiel de transfert libérés dans le cytosol par des réactions d'oxydoréduction telles que la glycolyse afin d'être entièrement oxydés par la chaîne respiratoire de la phosphorylation oxydative.

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Néoglucogenèse

La néoglucogenèse, aussi appelée gluconéogenèse est la synthèse du glucose à partir de composés non-glucidiques.

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Nicotinamide adénine dinucléotide

Le nicotinamide adénine dinucléotide (NAD) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.

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Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate

Le nicotinamide adénine dinucléotide phosphate (NADP) est un cofacteur d'oxydoréduction.

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Nucléotide

Un nucléotide est une molécule organique qui est l'élément de base d'un acide nucléique tel que l'ADN ou l'ARN.

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Organisme (physiologie)

Un organisme (du grec organon, « instrument »), ou organisme vivant, est, en biologie et en écologie, un système vivant complexe, organisé et est le produit de variations successives au cours de l'évolution.

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Origine de la vie

Les origines de la vie sur Terre demeurent incertaines.

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Oxydoréductase

En biochimie, les oxydoréductases sont des enzymes catalysant les réactions d'oxydoréduction en transférant les ions H+ et des électrons.

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Peptidase

Coupure protéolytique d'une chaîne peptidique Les peptidases (ou protéases ou enzymes protéolytiques) sont des enzymes qui brisent les liaisons peptidiques des protéines.

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Phénylalanine

La phénylalanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Phe et F) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Phosphate de pyridoxal

Le phosphate de pyridoxal (PLP) est une coenzyme dérivée d'une vitamine, la 6).

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Phosphoénolpyruvate carboxykinase

La phosphoénolpyruvate carboxykinase (PEPCK) est une lyase qui catalyse la réaction chimique: L'ITP peut également être le donneur de phosphate dans cette réaction, qui est l'étape limitante de la néoglucogenèse.

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Phosphofructokinase-1

La phosphofructokinase-1 (PFK-1) est une phosphotransférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient à la de la glycolyse pour catalyser la conversion du β-D-fructose-6-phosphate en β-D-fructose-1,6-bisphosphate par phosphorylation à partir d'une molécule d'ATP, hydrolysée en.

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Phosphorylation

chaîne latérale de sérine phosphorylée. Les atomes d'oxygène sont en rouge, ceux de phosphore, en orange, le carbone en gris et l'azote en bleu. Les atomes d'hydrogène ne sont pas représentés. La phosphorylation est l'addition d'un groupe phosphate (un phosphoryl PO32- plus précisément) qui est transféré à une protéine ou à une petite molécule, tel le glucose ou l'adénine.

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Phosphorylation oxydative

pompes à protons pour générer un gradient de concentration de protons autour de la membrane mitochondriale interne. Le gradient électrochimique qui en résulte fournit l'énergie nécessaire pour actionner un rotor moléculaire qui permet à l'ATP synthase de produire de l'ATP. En biologie moléculaire, la phosphorylation oxydative est le processus permettant la phosphorylation de l'ADP en ATP grâce à l'énergie libérée par l'oxydation de donneurs d'électrons par la chaîne respiratoire.

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Plante

Les plantes (Plantae) sont des organismes photosynthétiques et autotrophes, caractérisés par des cellules végétales.

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Polypeptide

Un polypeptide est une chaîne d'acides aminés reliés par des liaisons peptidiques.

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Polysaccharide

Les polysaccharides (parfois appelés glycanes, polyosides, polyholosides ou glucides complexes) sont des polymères constitués de plusieurs oses liés entre eux par des liaisons osidiques.

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Porphyrine

Les porphyrines sont des molécules à structures cycliques impliquées dans le transport du dioxygène et pouvant jouer le rôle de cofacteur lié (groupement prosthétique) à certaines enzymes.

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Précurseur (chimie)

En chimie, un précurseur est un composé participant à une réaction qui produit un ou plusieurs autres composés.

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Procollagène-proline dioxygénase

La procollagène-proline dioxygénase, souvent appelée prolyle hydroxylase, est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette enzyme est une dépendant de l'α-oxoglutarate, qui catalysent l'incorporation d'oxygène dans des composés organiques à l'aide d'un mécanisme impliquant l'α-oxoglutarate, des cations de fer Fe2+ et du L-ascorbate; cette enzyme-ci catalyse la formation d'hydroxyproline, qui est le résidu d'acide aminé résultant d'une modification post-traductionnelle le plus abondant du protéome humain.

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Prokaryota

Un procaryote (ou Prokaryota) est un être vivant dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Proline

La proline (abréviations IUPAC-IUBMB: Pro et P) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CCU, CCC, CCA et CCG.

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Propionyl-coenzyme A

La propionyl-coenzyme A, généralement écrite propionyl-CoA, est un thioester de la coenzyme A et d'acide propionique.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Protista

Un protiste (terme forgé par Ernst Haeckel en 1866, à partir du grec protestos, superlatif de protos, « premier », le biologiste plaçant dans ce taxon les organismes qu'il considérait comme les premiers êtres vivants sur terre) est un microorganisme eucaryote à organisation cellulaire dite simple, unicellulaire le plus souvent, multicellulaire parfois mais sans tissus spécialisés.

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Purine

La purine est une molécule azotée hétérocyclique constituée d'un cycle pyrimidine fusionné à un cycle imidazole.

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Pyrimidine

La pyrimidine (ou 1,3-diazine) est une molécule azotée hétérocyclique aromatique (C4H4N2) voisine de la pyridine et comportant deux atomes d'azote.

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Pyruvate carboxylase

La pyruvate carboxylase est une ligase qui catalyse la carboxylation du pyruvate en oxaloacétate avec hydrolyse concomitante d'une molécule d'ATP en ADP + Pi: |- align.

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Pyruvate déshydrogénase

La pyruvate déshydrogénase (ou PDH) — à ne pas confondre avec la pyruvate décarboxylase bien qu'on l'appelle parfois également ainsi — est la première des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), constitué d'une décarboxylase, d'une acétyltransférase et d'une oxydoréductase intervenant séquentiellement pour catalyser la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA, réaction qui assure notamment la liaison entre la glycolyse et le cycle de Krebs.

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Pyruvate déshydrogénase phosphatase

La pyruvate déshydrogénase phosphatase est une hydrolase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans l'activation de la pyruvate déshydrogénase, composante E1 du complexe pyruvate déshydrogénase.

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Quinone

Les quinones constituent une série de diènes plutôt que des composés aromatiques comportant un noyau de benzène sur lequel deux atomes d'hydrogène sont remplacés par deux atomes d'oxygène formant deux liaisons carbonyles (dicétones éthylèniques conjuguées cycliques).

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Réaction anaplérotique

En biochimie, une réaction anaplérotique qualifie une réaction chimique qui produit un métabolite, c'est-à-dire une espèce chimique intermédiaire d'une voie métabolique.

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Réaction d'hydratation

En chimie organique, la réaction d’hydratation est une addition électrophile d'une molécule d'eau sur un composé organique.

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Réaction d'oxydoréduction

Une réaction d'oxydoréduction ou réaction redox est une réaction chimique au cours de laquelle se produit un transfert d'électrons.

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Réaction de condensation

Une réaction de condensation est une réaction chimique au cours de laquelle deux molécules, ou deux parties d'une même molécule, se combinent pour former une molécule (le condensat) en éliminant une molécule simple (le sous-produit), telle l'eau (le plus souvent), le sulfure d'hydrogène, le méthanol ou l'acide acétique.

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Réaction de déshydratation

En chimie, une réaction de déshydratation est une réaction chimique dans laquelle le réactif de départ perd un atome d'hydrogène et un groupe hydroxyle, soit une molécule d'eau, l'inverse de la réaction d'hydratation.

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Résidu (biochimie)

acides aminés. En biochimie et en biologie moléculaire, un résidu est la partie d'une molécule qui est restée inchangée après être entrée dans la composition d'une biomolécule complexe ou d'un polymère.

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Rein

Schéma des reins humains vu par l'arrière sans colonne vertébrale. Le rein est un organe du corps de nombreux animaux.

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Respiration aérobie

Le mode de respiration utilisant l'oxygène comme comburant est dit aérobie.

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Respiration cellulaire

Schéma de principe de la phosphorylation oxydative dans une mitochondrie illustrant l'intégration du cycle de Krebs avec la chaîne respiratoire, et le couplage de celle-ci avec l'ATP synthase au moyen d'un gradient électrochimique issu d'un gradient de concentration de protons à travers la membrane mitochondriale interne. La respiration cellulaire est l'ensemble des processus du métabolisme cellulaire convertissant l'énergie chimique contenue dans les nutriments en adénosine triphosphate.

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Sang

Au contact du dioxygène, le sang doit sa couleur rouge à l’hémoglobine. microscopie à fond noir. Début de coagulation (en haut à droite). De gauche à droite: globule rouge, plaquette sanguine et globule blanc. Le sang est un liquide biologique vital qui circule continuellement dans les vaisseaux sanguins et le cœur, notamment grâce à la pompe cardiaque.

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Semialdéhyde succinique

Le semialdéhyde succinique est un composé chimique de formule.

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Substrat enzymatique

En enzymologie, on désigne par substrat enzymatique toute molécule subissant une réaction chimique catalysée par une enzyme (ex: l'amidon est hydrolysé par l'amylase en glucoses).

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Succinate déshydrogénase

La succinate déshydrogénase (SDH), ou complexe de la chaîne respiratoire, également appelée succinate-coenzyme Q réductase (SQR), est une oxydoréductase membranaire qui catalyse la réaction: Cette enzyme est présente chez un très grand nombre d'être vivants.

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Succinate-semialdéhyde déshydrogénase

La succinate semialdéhyde déshydrogénase est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette enzyme est présente chez des êtres vivants appartenant aux trois domaines du vivant: eucaryotes, bactéries et archées.

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Succinyl-CoA:acétate CoA-transférase

La succinyl-CoA:acétate CoA-transférase est une transférase qui catalyse la réaction: Chez les bactéries qui produisent de l'acide acétique, cette enzyme catalyse la conversion de l'acétate en acétyl-CoA.

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Succinyl-coenzyme A

La succinyl-coenzyme A, usuellement abrégée en succinyl-CoA, est l'un des intermédiaires du Cycle de Krebs.

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Succinyl-coenzyme A synthétase

La succinyl-CoA synthétase (SCS), également appelée succinate thiokinase et succinate-CoA ligase, est une ligase qui catalyse la réaction: Cette enzyme de la matrice mitochondriale des eucaryotes catalyse la seule phosphorylation au niveau du substrat du cycle de Krebs.

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Synthase

Une synthase est une enzyme appartenant à la classe des lyases.

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Taxon

entités nommées, constituées d'organismes vivants regroupés et identifiés par la taxonomie Un taxonLe pluriel souhaitable en français est simplement « taxons »; les anglophones utilisent un pluriel faussement hellénisant «  » alors que le pluriel grec correct de serait.

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Thermodynamique

On peut définir la thermodynamique de deux façons simples: la science de la chaleur et des machines thermiques ou la science des grands systèmes en équilibre.

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Thiamine pyrophosphate

La thiamine pyrophosphate (TPP) est un cofacteur de transfert.

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Thioester

Structure générale d'un thioester Les thioesters - aussi dénommés esters sulfuriques - sont des composés résultant de la condensation d'un sulfure avec un groupement acyle.

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Tissu biologique

Un tissu en biologie est le niveau d'organisation intermédiaire entre la cellule et l'organe.

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Transamination

La réaction de transamination est une réaction chimique réversible qui consiste en l'échange d'une fonction amine primaire entre un acide α-aminé et un α-cétoacide.

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Triglycéride

Les triglycérides (aussi appelés triacylglycérols, triacylglycérides ou TAG) sont des glycérides dans lesquels les trois groupes hydroxyle du glycérol sont estérifiés par des acides gras.

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Tryptophane

Le tryptophane (abréviations IUPAC-IUBMB: Trp et W) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.

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Tyrosine

La tyrosine (abréviations IUPAC-IUBMB: Tyr et Y) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UAU et UAC.

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Ubiquinol

L’ubiquinol est une benzoquinone réduite (forme phénolique), liposoluble présente dans pratiquement toutes les cellules des mammifères.

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Ubiquinone

Structure générique des ubiquinones. Une ubiquinone est une molécule appartenant à une famille de composés qui se distinguent par leur nombre n d'unités terpéniques — n typiquement compris entre 6 et 10 — présents chez tous les êtres vivants et jouant le rôle de transporteurs d'électrons dans la chaîne respiratoire.

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Ubiquitine ligase

L’ubiquitine ligase, ou ubiquitine ligase E3, est une ligase qui catalyse la réaction: Cette enzyme recrute l' E2 chargée en ubiquitine, reconnaît une protéine substrat, et assiste ou catalyse directement le transfert de l'ubiquitine de l'enzyme E2 vers la protéine substrat.

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Vitamine D

La vitamine D est une vitamine liposoluble (soluble dans les lipides).

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Voie des pentoses phosphates

Voie des pentoses phosphates La voie des pentoses phosphates, ou voie de Warburg-Dickens-Horecker, est l'une des quatre voies métaboliques principales du métabolisme énergétique, avec la glycolyse, la voie d'Entner-Doudoroff de dégradation du glucose en pyruvate et la voie du méthylglyoxal.

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Voie métabolique

Une voie métabolique est un ensemble de réactions chimiques se déroulant dans une cellule vivante et catalysées par une série d'enzymes qui agissent de manière séquentielle.

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2-Oxoglutarate décarboxylase

La 2-oxoglutarate décarboxylase, ou α-cétoglutarate décarboxylase, est une lyase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient chez certains procaryotes dans la conversion de l'α-cétoglutarate en succinate comme voie alternative aux et du cycle de Krebs.

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3-Oxoacide CoA-transférase

La 3-oxoacide CoA-transférase est une transférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans le métabolisme des corps cétoniques (cétogenèse) et du butyrate ainsi que dans la dégradation des acides aminés ramifiés (valine, leucine et isoleucine).

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Redirections ici:

Cycle De Krebs, Cycle de krebs, Cycle de l'acide citrique, Cycle des acides tricarboxyliques.

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