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Cycle de Krebs

Indice Cycle de Krebs

Le cycle de Krebs, aussi appelé cycle des acides tricarboxyliques ou cycle de l'acide citrique par anglicisme, est une voie métabolique présente chez tous les organismes aérobies et dont la fonction première est d'oxyder les groupes acétyle, issus notamment de la dégradation des glucides, des lipides et des protéines, pour en récupérer l'énergie sous forme de huit électrons à haut potentiel de transfert et d'une molécule de GTP ou d'ATP; les électrons à haut potentiel de transfert, récupérés sur le NADH et l'ubiquinol (ou 10 réduite), circulent ensuite à travers la chaîne respiratoire pour former à leur tour des molécules d’ATP supplémentaires par la phosphorylation oxydative.

233 relations: Aérobie, Abiogenèse, Acétyl-coenzyme A, Acétyle, Acide acétique, Acide aconitique, Acide alpha-cétoglutarique, Acide aminé, Acide aminé cétoformateur, Acide aminé essentiel, Acide aminé glucoformateur, Acide aminé protéinogène, Acide aspartique, Acide biliaire, Acide citrique, Acide désoxyribonucléique, Acide fumarique, Acide glutamique, Acide gras, Acide isocitrique, Acide lactique, Acide malique, Acide malonique, Acide nucléique, Acide oxaloacétique, Acide oxalosuccinique, Acide phosphoénolpyruvique, Acide phosphorique, Acide pyruvique, Acide ribonucléique, Acide succinique, Acidocétose diabétique, Aconitase, Adénosine diphosphate, Adénosine monophosphate cyclique, Adénosine triphosphate, Adrénaline, Alanine, Albert Szent-Györgyi, Allostérie, Alpha-Cétoglutarate déshydrogénase, Alpha-Cétoglutarate synthase, Amine (chimie), Anaérobie, Anabolisme, Angiogenèse, Animal, Années 1930, Apoptose, Archaea, ..., Arginine, Asparagine, Atome, ATP citrate lyase, ATP synthase, Évolution (biologie), Bactérie, Base azotée, Bêta-oxydation, Biochimie, Biologie moléculaire, Biosynthèse, Biosynthèse des acides gras, Calcium, Carbone, Carboxylation, Catabolisme, Catalyse, Cation, Cétoacide, Cœur, Cellule (biologie), Chaîne carbonée, Chaîne respiratoire, Chloroplaste, Cholestérol, Citrate synthase, Clivage (chimie), Coenzyme, Coenzyme A, Coenzyme Q10, Cofacteur (biochimie), Complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase, Complexe pyruvate déshydrogénase, Concentration molaire, Corps cétoniques, Crotonisation, Cycle de Calvin, Cycle de l'urée, Cycle du glyoxylate, Cytochrome, Cytoplasme, Cytosol, Décarboxylation, Décarboxylation du pyruvate, Déshydrogénase, Diabète sucré, Dihydrolipoamide S-succinyltransférase, Dihydrolipoyl déshydrogénase, Dihydroxyacétone phosphate, Dioxyde de carbone, Dioxygène, Eau, Enzyme, Espèce, Eukaryota, Facteur de transcription, Facteur induit par l'hypoxie, Fermentation, Flavine adénine dinucléotide, Flavoprotéine, Foie, Fructose-1,6-bisphosphate, Fumarase, Fungi, Glucagon, Glucide, Glucose, Glutamine, Glycéraldéhyde-3-phosphate, Glycérol, Glycolyse, Groupe fonctionnel, Groupement prosthétique, Guanosine diphosphate, Guanosine triphosphate, Hans Adolf Krebs, Hémoglobine, Hémoprotéine, Helicobacter pylori, Homéostasie, Hormone stéroïdienne, Hydrolase, Hydrolyse, Hydroxylation, In vitro, In vivo, Inhibiteur enzymatique, Insuline, Ion, Isocitrate déshydrogénase, Isoforme, Isoleucine, Isomérie, Jeûne, Leucine, Lipide, Lipoamide, Lipolyse, Lyase, Lysine, Magnésium, Malate déshydrogénase, Mammifère, Manganèse, Matrice mitochondriale, Métabolisme cellulaire, Métabolite, Membrane mitochondriale interne, Mitochondrie, Mnémotechnique, Molécule, Mole (unité), Muscle squelettique, Myocyte, Myoglobine, Navette mitochondriale, Néoglucogenèse, Nicotinamide adénine dinucléotide, Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate, Nucléotide, Organisme (physiologie), Oxydoréductase, Peptidase, Phénylalanine, Phosphate de pyridoxal, Phosphoénolpyruvate carboxykinase, Phosphofructokinase-1, Phosphorylation, Phosphorylation oxydative, Photosynthèse, Plante, Polypeptide, Polysaccharide, Porphyrine, Précurseur (chimie), Procollagène-proline dioxygénase, Prokaryota, Proline, Propionyl-coenzyme A, Protéine, Protista, Purine, Pyrimidine, Pyrophosphate de thiamine, Pyruvate carboxylase, Pyruvate déshydrogénase, Pyruvate déshydrogénase phosphatase, Quinone, Réaction anaplérotique, Réaction d'hydratation, Réaction d'oxydoréduction, Réaction de condensation, Réaction de déshydratation, Résidu (biochimie), Rein, Respiration aérobie, Respiration cellulaire, Sang, Semialdéhyde succinique, Substrat enzymatique, Succinate déshydrogénase, Succinate-semialdéhyde déshydrogénase, Succinyl-CoA:acétate CoA-transférase, Succinyl-coenzyme A, Succinyl-coenzyme A synthétase, Synthase, Taxon, Thermodynamique, Thioester, Tissu biologique, Transamination, Triglycéride, Tryptophane, Tyrosine, Ubiquinol, Ubiquinone, Ubiquitine ligase, Vitamine D, Voie des pentoses phosphates, Voie métabolique, 2-Oxoglutarate décarboxylase, 3-Oxoacide CoA-transférase. Développer l'indice (183 plus) »

Aérobie

Un milieu est dit aérobie s'il contient du dioxygène.

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Abiogenèse

L'abiogenèse est l'apparition de la vie à partir de matière inanimée.

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Acétyl-coenzyme A

L'acétyl-coenzyme A, usuellement écrite acétyl-CoA, est la forme « activée » de l'acide acétique, c'est-à-dire le thioester que forme ce dernier avec la coenzyme A. C'est une molécule à haut potentiel d'hydrolyse située au carrefour de plusieurs voies métaboliques importantes.

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Acétyle

Le groupe acétyle est le groupement acyle de l'acide acétique.

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Acide acétique

L'acide éthanoïque ou acide acétique est un acide carboxylique avec une chaîne carbonée théorique en C2, analogue à l'éthane, de formule semi-développée CH3-CO-OH ou courte AcOH, où Ac signifie « CH3CO », du groupe acétyle.

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Acide aconitique

L’acide aconitique, ou acide équisétique, est un acide tricarboxylique de formule.

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Acide alpha-cétoglutarique

L’acide α-cétoglutarique, également appelé acide 2-oxoglutarique, est l'une des deux cétones dérivées de l'acide glutarique, l'autre étant l'acide β-glutarique, bien moins courant.

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Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

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Acide aminé cétoformateur

Un acide aminé cétoformateur est un acide aminé susceptible d'être converti en corps cétoniques par la cétogenèse, par opposition aux acides aminés glucoformateurs qui sont, quant à eux, convertis en glucose.

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Acide aminé essentiel

Formule de la L-Lysine, un acide aminé dont la présence est cruciale en alimentation humaine. Un acide aminé essentiel, ou acide aminé indispensable (en anglais: IAA), est un acide aminé qui ne peut être synthétisé de novo par l'organisme ou qui est synthétisé à une vitesse insuffisante, et doit donc être apporté par l'alimentation, condition nécessaire au bon fonctionnement de l'organisme.

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Acide aminé glucoformateur

Un acide aminé glucoformateur est un acide aminé susceptible d'être converti en glucose par la néoglucogenèse, par opposition aux acides aminés lipoformateurs et acides aminés cétoformateurs, qui sont convertis en corps cétoniques par la cétogenèse.

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Acide aminé protéinogène

groupe aldéhyde sur l'atome d'azote de l'amine primaire Un acide aminé protéinogène est un acide aminé incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.

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Acide aspartique

L’acide aspartique (abréviations IUPAC-IUBMB: Asp et D), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAU et GAC.

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Acide biliaire

Les acides biliaires (également connus sous le nom de sels biliaires) sont formés par des dérivés du cholestérol et par des stéroïdes acides sécrétés par le foie et se trouvent principalement dans la bile des mammifères.

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Acide citrique

L'acide citrique est un acide tricarboxylique α-hydroxylé présent en abondance dans le citron, d'où son nom.

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Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide fumarique

L'acide fumarique, ou acide trans-butènedioïque, est un acide dicarboxylique insaturé de formule chimique HOOC–CH.

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Acide glutamique

L'acide glutamique (abréviations IUPAC-IUBMB: Glu et E), ou glutamate sous la forme anionique de l'acide glutamique, est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAA et GAG.

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Acide gras

Un acide gras est un acide carboxylique à chaîne aliphatique.

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Acide isocitrique

L’acide isocitrique est un composé chimique de formule.

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Acide lactique

Les acides lactiques (acides hydroxypropanoïques) sont des acides organiques dont la chaîne est composée de trois atomes de carbone.

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Acide malique

L'acide malique est un acide dicarboxylique alpha-hydroxylé de formule.

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Acide malonique

L'acide malonique est un diacide carboxylique aliphatique de formule HOOC-CH-COOH.

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Acide nucléique

Un acide nucléique (désoxyribonucléique ou ribonucléique) est un assemblage de macromolécules, un polymère, dont l’unité de base, ou monomère, est un nucléotide et dont les nucléotides sont reliés entre eux par des liaisons phosphodiesters.

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Acide oxaloacétique

L'acide oxaloacétique, dont la base conjuguée est l'oxaloacétate, est un acide dicarboxylique de formule.

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Acide oxalosuccinique

L’acide oxalosuccinique est un cétoacide tricarboxylique de formule.

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Acide phosphoénolpyruvique

L’acide phosphoénolpyruvique — ou phosphoénolpyruvate sous forme déprotonée, abrégée en PEP — est un composé organique important en biochimie, en raison notamment de son groupe phosphate à haut potentiel de transfert (ΔG°'.

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Acide phosphorique

L’acide phosphorique (ou acide orthophosphorique) est un composé chimique de formule.

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Acide pyruvique

L’acide pyruvique est un composé chimique de formule.

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Acide ribonucléique

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Acide succinique

Solution d'acide succinique, d'alcool et d'eau, étendue sur une feuille, forme des cristaux. Février 2023. L'acide succinique ou acide butane-1,4-dioïque est un diacide carboxylique aliphatique de formule semi-développée.

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Acidocétose diabétique

L'insuline est une hormone antilipolytique donc lorsqu'elle est en quantité insuffisante ou ne fonctionne pas dans un diabète, la lipolyse des acides gras n'est plus inhibée.

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Aconitase

L’aconitase (ou aconitate hydratase ou ACO), est une Isomerase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient notamment dans le cycle de Krebs pour réaliser l'isomérisation stéréospécifique du citrate en isocitrate via le.

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Adénosine diphosphate

L'adénosine diphosphate ou ADP est un nucléotide.

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Adénosine monophosphate cyclique

L'adénosine monophosphate cyclique (ou AMP cyclique ou AMPc) est une molécule biologique qui agit souvent en tant qu'intermédiaire, dans l'action des hormones ou des neurotransmetteurs notamment.

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Adénosine triphosphate

L’adénosine triphosphate, ou ATP, est un nucléotide formé à partir d'un nucléoside associé à un triphosphate.

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Adrénaline

L’adrénaline est un neurotransmetteur et une hormone appartenant à la famille des catécholamines.

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Alanine

L'alanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ala et A) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GCU, GCC, GCA et GCG.

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Albert Szent-Györgyi

Albert Szent-Györgyi de Nagyrápolt (à Budapest – à Woods Hole dans le Massachusetts) est un scientifique hongrois.

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Allostérie

L'allostérie (du grec ἄλλoς, allos: autre et στερεός, stereós: solide) est un mode de régulation de l'activité d'une protéine oligomérique par lequel la fixation d'une molécule effectrice en un site modifie les conditions de fixation d'une autre molécule, en un autre site distant de la même protéine.

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Alpha-Cétoglutarate déshydrogénase

L’α-cétoglutarate déshydrogénase, ou 2-oxoglutarate déshydrogénase (OGDH), est une oxydoréductase qui fait partie du complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase, dont elle est l'enzyme E1, complexe qui réalise la conversion de l'α-cétoglutarate en succinyl-CoA et 2: Plus précisément, l'enzyme E1 catalyse la fixation de l'α-cétoglutarate sur un lipoamide avec l'aide de thiamine pyrophosphate (TPP).

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Alpha-Cétoglutarate synthase

L’α-cétoglutarate synthase, ou 2-oxoglutarate synthase, est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: |- align.

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Amine (chimie)

Structure de l'ammoniac. Une amine est un composé organique dérivé de l'ammoniac dont au moins un atome d'hydrogène a été remplacé par un groupe carboné.

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Anaérobie

bactéries du genre Desulfovibrio. Un anaérobie ou organisme anaérobie est tout organisme dont le métabolisme redox ne dépend pas du dioxygène.

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Anabolisme

Lanabolisme est l'ensemble des réactions chimiques de synthèse moléculaire de l'organisme considéré.

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Angiogenèse

L’angiogenèse est le processus de croissance de nouveaux vaisseaux sanguins à partir de vaisseaux préexistants.

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Animal

Biomasse animale totale (en gigatonne de carbone). Les Animaux (Animalia) (du latin animalis « animé, vivant, animal ») sont en biologie, selon la classification classique, des êtres vivants hétérotrophes (c’est-à-dire qui se nourrissent de substances organiques) et possédant du collagène dans leurs matrices extracellulaires.

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Années 1930

Les années 1930 couvrent la période de 1930 à 1939.

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Apoptose

La desquamation de l'épiderme est due à la mort cellulaire des cellules de l'épiderme. Sur la photo, la desquamation est pathologique et liée à une scarlatine. L'apoptose (ou mort cellulaire programmée) est le processus par lequel des cellules déclenchent leur autodestruction en réponse à un signal.

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Archaea

sources chaudes volcaniques. Les archées ou Archaea (du grec ancien, « originel, primitif »), anciennement appelés archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries.

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Arginine

L'arginine (abréviations IUPAC-IUBMB: Arg et R) est un α-aminé.

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Asparagine

L'asparagine (abréviations IUPAC-IUBMB: Asn et N) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons AAU et AAC.

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Atome

hélium 4, agrandi à droite, est formé de deux protons et de deux neutrons. Atomes de carbone à la surface de graphite observés par microscope à effet tunnel. Un atome est la plus petite partie d'un corps simple pouvant se combiner chimiquement avec un autre.

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ATP citrate lyase

L’ATP citrate lyase est une acyltransférase importante de la biosynthèse des acides gras qui clive le citrate en oxaloacétate et acétyl-CoA avec hydrolyse concomitante d'une molécule d'ATP en ADP et Pi: |- align.

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ATP synthase

L'ATP synthase (EC 7.1.2.2) est un complexe protéique enzymatique qui se trouve dans les crêtes mitochondriales, la membrane interne des thylakoïdes, et la membrane plasmique des bactéries et des archées.

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Évolution (biologie)

En biologie, l’évolution est la transformation du monde vivant au cours du temps, qui se manifeste par des changements phénotypiques des organismes à travers les générations.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Base azotée

Les bases azotées, ou bases nucléiques, ou bases nucléotidiques, voire nucléobases, sont des composés organiques azotés présents dans les acides nucléiques sous forme de nucléotides dans lesquels elles sont liées à un ose, le ribose dans le cas de l'ARN et le désoxyribose dans le cas de l'ADN.

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Bêta-oxydation

La β-oxydation, communément appelée spirale de Lynen, est la principale voie métabolique de dégradation des molécules d'acides gras pour produire.

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Biochimie

en Relations schématiques entre la biochimie, la génétique et la biologie moléculaire. La biochimie est l'étude des réactions chimiques qui se déroulent au sein des êtres vivants, et notamment dans les cellules.

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Biologie moléculaire

La biologie moléculaire (parfois abrégée bio. mol.) est une discipline scientifique de la vie au croisement de la génétique, de la biochimie métabolique et de la physique, dont l'objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau moléculaire.

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Biosynthèse

Cuir de champignon, produit d'une biosynthèse La biosynthèse est la formation de substances par un être vivant ou son symbiote, dans son milieu interne ou dans les excrêtats que sont le mucus, les coquilles des œufs ou des mollusques, l’écorce Elle intéresse les chimistes et les biotechnologistes qui découvrent dans les cellules ou les organismes de nouveaux moyens, moins polluants ou moins énergivores, de produire des molécules complexes.

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Biosynthèse des acides gras

La biosynthèse des acides gras est une voie métabolique essentielle du processus de lipogenèse chez les eucaryotes et les bactéries.

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Calcium

Calcium protégé sous atmosphère d'argon. Le calcium est l'élément chimique de numéro atomique 20, de symbole Ca.

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Carbone

Le carbone est l'élément chimique de et de Il possède trois isotopes naturels.

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Carboxylation

On désigne par le terme carboxylation, toute réaction chimique aboutissant à l'addition d'un groupe fonctionnel carboxyle à une molécule organique.

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Catabolisme

Le catabolisme est l'ensemble des réactions de dégradations moléculaires de l'organisme considéré.

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Catalyse

Intérieur du musée de la catalyse à Widnes en Angleterre. En chimie, la catalyse (du nom grec:, « dissolution. ») se réfère à l'accélération ou la réorientation de la cinétique de réaction au moyen d'un catalyseur, et dans certains cas à la sélectivité pour diriger la réaction dans un sens privilégié (réaction concurrente, production d'un produit plutôt qu'un autre).

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Cation

Un cation (du grec cata-: « en bas » et iôn: « qui va ») est un ion qui, ayant perdu un ou plusieurs électrons, porte une ou plusieurs charges électriques positives: à l’inverse, un anion contient plus d'électrons que de protons.

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Cétoacide

Les cétoacides sont des acides organiques portant une fonction acide carboxylique et une fonction cétone.

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Cœur

Le cœur est un organe musculaire creux qui assure la circulation sanguine en pompant le sang vers les vaisseaux sanguins et les cavités du corps à travers des contractions rythmiques.

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Cellule (biologie)

consulté le.

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Chaîne carbonée

La chaîne carbonée, appelée aussi squelette carboné, est, dans une molécule organique, la chaîne formée par un ensemble d'atomes de carbone contigus, reliés par des liaisons covalentes.

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Chaîne respiratoire

ATP. 320x320px En biochimie, on appelle chaîne respiratoire une chaîne de transport d'électrons réalisant l'oxydation des coenzymes réduites issues de la dégradation de composés organiques ou minéraux.

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Chloroplaste

Schéma d'un chloroplaste d'une plante. Chloroplastes dans des cellules végétales de ''Plagiomnium'' observées au microscope optique Photographie d'une feuille d'''élodée du Canada'' au microscope optique après une coloration au lugol (coloration des grains d'amidon bien visibles dans les chloroplastes). Les chloroplastes sont des organites présents dans le cytoplasme des cellules eucaryotes photosynthétiques (plantes, algues).

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Cholestérol

Le cholestérol est un lipide de la famille des stérols.

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Citrate synthase

La citrate synthase (CS) est une acyltransférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient à la du cycle de Krebs, où elle catalyse une réaction irréversible qui engage cette voie métabolique: la condensation du résidu acétyle de l'acétyl-CoA sur l'oxaloacétate pour former du citrate en libérant la coenzyme A; l'oxaloacétate est régénéré après un tour complet du cycle de Krebs.

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Clivage (chimie)

Le clivage d'une liaison chimique ou sa scission ou sa dissociation ou encore sa rupture est l'ouverture de cette liaison.

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Coenzyme

Les coenzymes (n. f.) sont des molécules organiques particulières, pouvant inclure des ions métalliques, ayant pour spécificité de servir de cofacteurs à certaines enzymes, en participant obligatoirement à la réaction catalytique.

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Coenzyme A

La coenzyme A (CoA) est une coenzyme de transfert de groupements acyle intervenant dans de très nombreuses voies du métabolisme (cycle de Krebs, bêta-oxydation).

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Coenzyme Q10

Figure 1: Structure chimique des ubiquinones. ''n'' peut varier de 6 à 10 et forme une chaîne polyisoprénique. La coenzyme Q (CoQ, ou plus simplement Q), également connue sous le nom d’ubiquinone, est une 1,4-Benzoquinone pour laquelle Q fait référence au groupe quinone et 10 au nombre d'unités isopréniques dans sa chaîne latérale.

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Cofacteur (biochimie)

centres fer-soufre et hème. En biochimie, un cofacteur est un composé chimique non protéique mais qui est nécessaire à l'activité biologique d'une protéine, le plus souvent une enzyme.

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Complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase

Le complexe α-cétoglutarate déshydrogénase, également appelé complexe oxoglutarate déshydrogénase (OGDC), est l'association de trois enzymes — une décarboxylase, une acyltransférase et une oxydo-réductase — agissant séquentiellement dans cet ordre pour catalyser la réaction: |- align.

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Complexe pyruvate déshydrogénase

Le complexe pyruvate déshydrogénase (PDC) est l'association de trois enzymes intervenant séquentiellement pour catalyser la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA.

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Concentration molaire

La concentration en quantité de matière (anciennement concentration molaire) ou molarité (obsolète), ou parfois taux molaire, d'une espèce chimique est sa quantité rapportée au volume total du mélange qui contient cette espèce.

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Corps cétoniques

β-D-hydroxybutyrate. Les corps cétoniques sont trois métabolites — l'acétylacétate, le β-D-hydroxybutyrate et l'acétone — produits par le processus de cétogenèse dans le foie.

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Crotonisation

La crotonisation est une réaction de déshydratation d'un bêta-aldol ou d'un bêta-cétol, formant une alpha-énoneMini manuel de Chimie Organique-Édition Dunod.

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Cycle de Calvin

Le cycle de Calvin (aussi connu comme le cycle de Calvin-Benson-Bassham) est une série de réactions biochimiques des organismes photosynthétiques ayant lieu dans le stroma des chloroplastes chez les eucaryotes ou dans le cytoplasme chez les procaryotes.

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Cycle de l'urée

Le cycle de l'urée ou cycle de l'ornithine est un cycle de réactions biochimiques chez les espéces ureotéliques qui produisent de l'urée à partir de l'ammoniac.

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Cycle du glyoxylate

Cycle du glyoxylate avec cycle de Krebs. Le cycle du glyoxylate est une voie métabolique dérivée du cycle de Krebs participant à l'anabolisme des plantes, des bactéries, des protistes et des mycètes (champignons).

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Cytochrome

Les cytochromes sont des coenzymes intermédiaires de la chaîne respiratoire.

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Cytoplasme

Le cytoplasme désigne le contenu d'une cellule vivante et la région comprise entre la membrane plasmique et le noyau d'une cellule eucaryote ou le nucléoïde d'une cellule procaryote.

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Cytosol

Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux), aussi appelé ergastoplasme 6. Appareil de Golgi 7. Cytosquelette 8. Réticulum endoplasmique lisse 9. Mitochondrie 10. Vacuole dans les cellules végétales 11. '''Cytosol''' 12. Lysosome dans les cellules animales 13. Centriole Le cytosol ou cytosole est, en biologie cellulaire, la phase liquide dans laquelle baignent les organites cytoplasmiques présents à l'intérieur des cellules.

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Décarboxylation

La décarboxylation est une réaction chimique au cours de laquelle une molécule de dioxyde de carbone est éliminée (généralement par chauffage) d'une molécule organique portant un groupe carboxyle, selon le schéma général suivant: \rm R-\color \color \xrightarrow\text R-H + CO_2.

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Décarboxylation du pyruvate

La décarboxylation du pyruvate, ou décarboxylation oxydative, est la réaction chimique catalysée par le complexe pyruvate déshydrogénase reliant la glycolyse au cycle de Krebs en convertissant le pyruvate en acétyl-CoA: |- align.

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Déshydrogénase

Une déshydrogénase (appelée aussi DHO dans la littérature) est une enzyme qui oxyde un substrat par le transfert d'un ou plusieurs ions (H) à un accepteur, généralement un coenzyme type NAD+/NADP+ ou flavine comme le FAD ou le FMN.

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Diabète sucré

Le diabète sucré (ou diabète par abus de langage) est une maladie liée à une défaillance des mécanismes biologiques de régulation de la glycémie (concentration de glucose dans le sang) menant à une hyperglycémie chronique.

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Dihydrolipoamide S-succinyltransférase

La dihydrolipoamide S-succinyltransférase est une acyltransférase qui fait partie du complexe α-cétoglutarate déshydrogénase, dont elle est l'enzyme E2, complexe qui réalise la conversion de l'α-cétoglutarate en succinyl-CoA et 2: |- align.

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Dihydrolipoyl déshydrogénase

La dihydrolipoyl déshydrogénase (DLD), également appelée dihydrolipoamide déshydrogénase, est la dernière des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), du complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase et du complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase, constitués chacun d'une décarboxylase, d'une transacétylase et d'une réductase.

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Dihydroxyacétone phosphate

La dihydroxyacétone phosphate (ou phosphodihydroxyacétone, PDHA), couramment abrégé en DHAP (et jadis appelée glycérone phosphate), est un composé organique impliqué dans plusieurs voies métaboliques de la plupart des êtres vivants.

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Dioxyde de carbone

Le dioxyde de carbone, aussi appelé gaz carbonique ou anhydride carbonique, est un composé inorganique dont la formule chimique est, la molécule ayant une structure linéaire de la forme O.

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Dioxygène

Le dioxygène, communément nommé oxygène, est une substance constituée de molécules (constituées chacune de deux atomes d'oxygène).

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Eau

L'eau est une substance chimique constituée de molécules.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Espèce

classification du vivant. Dans les sciences du vivant, l’espèce (du latin species, « type » ou « apparence ») est le taxon de base de la systématique.

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Eukaryota

Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.

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Facteur de transcription

Schéma simplifié du mécanisme d'un activateur. Un facteur de transcription est une protéine nécessaire à l'initiation ou à la régulation de la transcription d'un gène dans l'ensemble du vivant (procaryote ou eucaryote).

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Facteur induit par l'hypoxie

Les facteurs induits par l’hypoxie (ou HIF, de l') sont des protéines agissant comme facteurs de transcription dans tous les tissus et qui sont régulées par l’absence de dioxygène.

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Fermentation

Exemple de fermentation industrielle: des bulles de dioxyde de carbone (CO2) forment de la mousse à la surface d'un liquide. La fermentation est un processus métabolique convertissant généralement des glucides en acides, en gaz ou en alcools pour en extraire une partie de l'énergie chimique tout en ré-oxydant les coenzymes réduites par ces réactions.

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Flavine adénine dinucléotide

La flavine adénine dinucléotide (FAD) est une coenzyme d'oxydo-réduction dérivant de la riboflavine (vitamine B2).

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Flavoprotéine

Une flavoprotéine est une classe de transporteurs protéiques d'électrons, intervenant dans la chaîne respiratoire.

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Foie

Le foie est en rouge sur cette représentation du système digestif humain. Le foie est le plus gros organe abdominal et fait partie de l'appareil digestif sécrétant la bile et remplissant plus de vitales, notamment les trois suivantes: une fonction d'épuration, une fonction de synthèse et une fonction de stockage.

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Fructose-1,6-bisphosphate

Le fructose-1,6-bisphosphate (Fru-1,6-BP), souvent appelé fructose-1,6-diphosphate, est un composé organique présent dans de très nombreuses cellules vivantes sous forme de l'isomère β-D-fructose-1,6-bisphosphate, le seul qui soit biologiquement actif.

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Fumarase

La fumarase, ou fumarate hydratase, est une lyase qui catalyse la réaction: |- align.

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Fungi

spores fongiques dans les conditions optimales. Autre agent actif d'une pourriture du bois, l'Hypholome en touffes, champignon saprotrophe très commun. Les Fonges, également appelés Mycètes, sont un règne d'organismes eucaryotes appelés communément champignons.

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Glucagon

Le glucagon est une hormone hyperglycémiante (qui provoque une augmentation de la quantité de glucose dans le sang) sécrétée par les cellules α2 (ou cellules A) des îlots de Langerhans du pancréas, et qui agit principalement sur le foie en provoquant une glycogénolyse.

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Glucide

Par exemple, le glucose est un glucide à six carbones, cinq groupes hydroxyle et un groupe aldéhyde. Les grains et céréales contiennent une grande quantité de glucides. Les glucides sont définis par l'Union internationale de chimie pure et appliquée (UICPA) comme une classe de composés organiques contenant un groupe carbonyle (aldéhyde ou cétone) et au moins deux groupes hydroxyle (-OH).

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Glucose

Les glucoses sont des sucres de formule brute.

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Glutamine

La glutamine (abréviations IUPAC-IUBMB: Gln et Q) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CAA et CAG.

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Glycéraldéhyde-3-phosphate

Le glycéraldéhyde-3-phosphate, également appelé 3-phosphoglycéraldéhyde et couramment abrégé en G3P ou GAP (ou PGAL par les anglophones), est un composé organique intervenant de façon centrale dans plusieurs voies métaboliques de la plupart des êtres vivants.

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Glycérol

Le glycérol, ou glycérine, est un composé organique de formule.

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Glycolyse

La glycolyse (γλῠκὖς glykýs « sucré » et λύσις lýsis « libération ») ou voie d'Embden-Meyerhof-Parnas est une voie métabolique d'assimilation du glucose et de production d'énergie.

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Groupe fonctionnel

En chimie, les composés organiques peuvent être considérés comme constitués d'un squelette relativement non réactif appelé lalcane parent en nomenclature substitutive, et d’un ou plusieurs groupes fonctionnels.

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Groupement prosthétique

Il s'agit d'un composé organique non protéique maintenu dans une structure protéique (nommée alors apoprotéine) au moyen de liaisons covalentes permanentes, mais aussi éventuellement de liaisons faibles (ex: liaisons ioniques, liaisons hydrogène).

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Guanosine diphosphate

La guanosine diphosphate, abrégée en GDP, est un nucléotide.

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Guanosine triphosphate

Le guanosine triphosphate (GTP) est une coenzyme de transfert de groupements phosphate.

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Hans Adolf Krebs

Hans Adolf Krebs (à Hildesheim, province de Hanovre - à Oxford, Angleterre) est un médecin allemand, lauréat du prix Nobel de physiologie ou médecine de 1953 en même temps que Fritz Albert Lipmann.

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Hémoglobine

L'hémoglobine, couramment symbolisée Hb, parfois Hgb, est un pigment respiratoire (de la famille moléculaire des métalloprotéines, ici contenant du fer) présent essentiellement dans le sang des vertébrés, au sein de leurs globules rouges, ainsi que dans les tissus de certains invertébrés.

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Hémoprotéine

Liaison de l'oxygène à un groupe hème, partie caractéristique d'une hémoprotéine. Une hémoprotéine (également appelée protéine à hème) est une protéine qui contient un groupe hème comme cofacteur.

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Helicobacter pylori

Helicobacter pylori est une bactérie qui infecte la muqueuse gastrique.

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Homéostasie

En biologie et en systémique, l’homéostasie est un phénomène par lequel un facteur clé (par exemple, la température) est maintenu autour d'une valeur bénéfique pour le système considéré, grâce à un processus de régulation.

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Hormone stéroïdienne

Les hormones stéroïdiennes sont des stéroïdes se comportant comme des hormones.

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Hydrolase

Les hydrolases constituent une classe d'enzymes qui catalysent les réactions d'hydrolyse de molécules suivant la réaction générale: On y trouve par exemple.

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Hydrolyse

Une hydrolyse (du grec hydro: eau et lysis: briser) est une réaction chimique et enzymatique dans laquelle une liaison covalente est rompue par action d'une molécule d'eau.

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Hydroxylation

L'hydroxylation est une réaction chimique consistant à introduire un groupe hydroxyle (-OH) sur une molécule.

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In vitro

la (en latin: « sous verre ») s'applique à toute activité expérimentale réalisée sur micro-organismes, organes ou cellules en dehors de leur contexte naturel (en dehors de l'environnement, de l'organisme vivant ou de la cellule) et en conditions définies et contrôlées. Un exemple est la fécondation ''in vitro'' (FIV).

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In vivo

In vivo (en latin: « au sein du vivant ») est une expression latine qualifiant des recherches ou des examens pratiqués sur un organisme vivant, par opposition à in vitro ou ex vivo.

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Inhibiteur enzymatique

VIH (rubans rouges, bleus et jaunes) associée à l'inhibiteur qu'est le ritonavir (petite structure en bâtons et boules près du centre). Un inhibiteur enzymatique est une substance se liant à une enzyme et qui en diminue l'activité.

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Insuline

Les deux chaines de l'insuline bovine. En rouge les ponts disulfures. Modélisation 3D d'une molécule d'insuline. L'insuline (du « île ») est une hormone protéique sécrétée par les cellules β des îlots de Langerhans dans le pancréas, ainsi que dans les corps de Brockmann de certains poissons téléostéens.

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Ion

+) a comme logique d'avoir la même structure électronique que le gaz noble (cadre rouge) le plus proche. Un ion est un atome ou un groupe d'atomes portant une charge électrique, parce que son nombre d'électrons est différent de son nombre de protons.

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Isocitrate déshydrogénase

L´isocitrate déshydrogénase (IDH) est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette réaction globale se déroule en deux étapes.

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Isoforme

Dans le domaine de la biologie cellulaire, les isoformes d'une protéine sont les différentes formes qu'elle prend lorsqu'elle est issue d'un même gène.

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Isoleucine

L’isoleucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ile et I) est un α-aminé faisant partie des 20 acides aminés majeurs codés par le génome (exception faite de la Sélénocystéine) servant à la synthèse des protéines.

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Isomérie

Différents types d'isomères. En chimie organique, on parle d'isomérie lorsque deux molécules possèdent la même formule brute mais ont des formules développées ou stéréochimiques différentes.

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Jeûne

Illustration du jeûne dans la culture occidentale. Le jeûne est la privation, volontaire ou non, de nourriture, accompagnée ou pas d'une privation de boisson.

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Leucine

La leucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Leu et L), du grec ancien (blanc, éclatant), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Lipide

estérifié par la phosphocholine (en rouge), l'acide palmitique (en bleu) et l'acide oléique (en vert). polaire » ① et des « queues apolaires » ② de molécules amphiphiles de phosphoglycérides. bicouches lipidiques. Les lipides constituent la matière grasse des êtres vivants.

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Lipoamide

Le lipoamide est le nom trivial du 5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamide qui contient un cycle dithiolane.

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Lipolyse

Schéma illustrant la lipolyse d'un triglycéride La lipolyse est la dégradation des lipides qui conduit à la libération des acides gras estérifiant du glycérol par hydrolyse des glycérides (triglycérides, diglycérides et monoglycérides).

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Lyase

Amas d'enzymes En biochimie, une lyase est une enzyme qui catalyse la rupture de différentes liaisons chimiques par des moyens autres que l'hydrolyse ou l'oxydation, formant ainsi souvent une nouvelle liaison double ou un nouveau cycle.

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Lysine

La lysine (abréviations IUPAC-IUBMB: Lys et K) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des neuf acides aminés essentiels pour l'homme.

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Magnésium

Le magnésium est l'élément chimique de numéro atomique 12, de symbole Mg.

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Malate déshydrogénase

La malate déshydrogénase (MDH) est une oxydoréductase du cycle de Krebs qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans plusieurs voies métaboliques majeures, notamment le cycle de Krebs.

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Mammifère

Les Mammifères (Mammalia) sont une classe d'animaux vertébrés caractérisés par la présence de fourrure (excepté pour certains mammifères marins), d'une oreille moyenne comportant trois os, d'un néocortex et de glandes mammaires, dont les représentants femelles nourrissent leurs juvéniles à partir d'une sécrétion cutanéo-glandulaire spécialisée appelée lait (on dit alors qu'elles allaitent).

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Manganèse

Le manganèse (symbole Mn) est un élément chimique possédant un seul isotope stable, et dont le numéro atomique est 25.

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Matrice mitochondriale

Dans une mitochondrie, on appelle matrice mitochondriale le milieu, délimité par la membrane mitochondriale interne, qui contient les ribosomes, le matériel génétique et les enzymes solubles impliquées dans la production d'acétyl-CoA — β-oxydation, complexe pyruvate déshydrogénase — et l'oxydation de ce métabolite — cycle de Krebs.

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Métabolisme cellulaire

Le métabolisme d'une cellule est la somme du catabolisme, ou activité de dégradation, et de l'anabolisme, ou activité de synthèse.

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Métabolite

Un métabolite est un composé organique intermédiaire ou issu du métabolisme.

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Membrane mitochondriale interne

Dans une mitochondrie, la membrane mitochondriale interne délimite la matrice mitochondriale et contient un grand nombre de protéines membranaires essentiellement hydrophobes impliquées notamment dans la respiration cellulaire, la production d'ATP et le transport de divers métabolites.

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Mitochondrie

Une mitochondrie est un organite, possédant toutes les caractéristiques d'un organisme procaryote, entourée d'une double membrane composée chacune d'une double couche phospholipidique, et retrouvée chez la plupart des cellules eucaryotes.

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Mnémotechnique

Exemple de mnémonique visuel, pour aider à mémoriser l'emplacement de sa voiture dans un stationnement. La mnémotechnique, ou mnémonique, décrit l'ensemble des applications pratiques de la recherche en psychologie sur la mémoire, et des techniques, parfois très anciennes, augmentant la mémorisation de l'information.

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Molécule

alt.

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Mole (unité)

La mole (symbole: mol.) est une des unités de base du Système international, adoptée en 1971, qui est principalement utilisée en physique et en chimie.

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Muscle squelettique

Les muscles squelettiques sont les muscles sous contrôle volontaire du système nerveux central.

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Myocyte

Les myocytes, ou fibres musculaires, sont des cellules capables de contraction (syncytium, fusion de plusieurs cellules). On distingue principalement les des myocytes lisses. Les propriétés contractiles des cellules musculaires tiennent de la présence d'éléments du cytosquelette capables de se contracter à la suite d'une augmentation de la concentration en calcium intracellulaire. Ces éléments contractiles élémentaires sont constitués de microfilaments d'actine couplés à des myofilaments de myosine. La myosine effectue un cycle de détachement/réattachement accompagné d'un mouvement transversal le long de l'actine. Ce cycle aboutit à un raccourcissement de la fibre, qui est à la base de la contraction générale de la cellule. Ce cycle est accompagné d'une hydrolyse d'ATP qui fournit l'énergie nécessaire à la force mécanique développée et est régulé par le calcium. L'unité contractile du myocyte est le sarcomère. Si l'on considère schématiquement celui-ci, il se définit comme l'espace entre deux stries Z, et est composé de filaments d'actine et de myosine enchevêtrés les uns dans les autres. Les filaments d'actine sont liés directement aux stries Z alors que la myosine est maintenue au centre du sarcomère par une protéine: la titine elle-même liée à la strie Z.

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Myoglobine

3RGK). La myoglobine, couramment symbolisée par Mb, est une métalloprotéine contenant du fer présente dans les muscles des vertébrés, et particulièrement des mammifères.

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Navette mitochondriale

Une navette mitochondriale est un mécanisme d'échange de molécules des cellules eucaryotes permettant de transférer aux mitochondries les électrons à haut potentiel de transfert libérés dans le cytosol par des réactions d'oxydoréduction telles que la glycolyse afin d'être entièrement oxydés par la chaîne respiratoire de la phosphorylation oxydative.

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Néoglucogenèse

La néoglucogenèse, aussi appelée gluconéogenèse, est la synthèse du glucose à partir de composés non glucidiques.

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Nicotinamide adénine dinucléotide

Le nicotinamide adénine dinucléotide (NAD) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.

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Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate

Le nicotinamide adénine dinucléotide phosphate (NADP) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.

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Nucléotide

Un nucléotide est une molécule organique qui est composée d'une base nucléique (ou base azotée), d'un ose à cinq atomes de carbone, dit pentose, dont l'association forme un nucléoside, et enfin de un à trois groupes phosphate.

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Organisme (physiologie)

Les bactéries ''Escherichia coli'' sont des organismes unicellulaires. Un organisme (du grec organon, « instrument »), ou organisme vivant, est, en biologie et en écologie, un système vivant complexe, organisé et est le produit de variations successives au cours de l'évolution.

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Oxydoréductase

En biochimie, les oxydoréductases sont des enzymes catalysant les réactions d'oxydoréduction en transférant les ions H+ et des électrons.

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Peptidase

Coupure protéolytique d'une chaîne peptidique Les peptidases (ou protéases ou enzymes protéolytiques) sont des enzymes qui brisent les liaisons peptidiques des protéines.

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Phénylalanine

La phénylalanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Phe et F) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.

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Phosphate de pyridoxal

Le phosphate de pyridoxal (PLP) est une coenzyme dérivée d'une vitamine, la 6).

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Phosphoénolpyruvate carboxykinase

La phosphoénolpyruvate carboxykinase (PEPCK) est une lyase qui catalyse la réaction chimique: L'ITP peut également être le donneur de phosphate dans cette réaction, qui est l'étape limitante de la néoglucogenèse.

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Phosphofructokinase-1

La phosphofructokinase-1 (PFK-1) est une phosphotransférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient à la de la glycolyse pour catalyser la conversion du β-D-fructose-6-phosphate en β-D-fructose-1,6-bisphosphate par phosphorylation à partir d'une molécule d'ATP, hydrolysée en.

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Phosphorylation

chaîne latérale de sérine phosphorylée. Les atomes d'oxygène sont en rouge, ceux de phosphore, en orange, le carbone en gris et l'azote en bleu. Les atomes d'hydrogène ne sont pas représentés. La phosphorylation est l'addition d'un groupe phosphate (un phosphoryl PO32− plus précisément) qui est transféré à une protéine ou à une petite molécule, tel le glucose, l'adénine ou les glycérolipides.

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Phosphorylation oxydative

pompes à protons pour générer un gradient de concentration de protons autour de la membrane mitochondriale interne. Le gradient électrochimique qui en résulte fournit l'énergie nécessaire pour actionner un rotor moléculaire qui permet à l'ATP synthase de produire de l'ATP. En biologie moléculaire, la phosphorylation oxydative est le processus permettant la phosphorylation de l'ADP en ATP grâce à l'énergie libérée par l'oxydation de donneurs d'électrons par la chaîne respiratoire.

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Photosynthèse

produire des glucides. Équation de la photosynthèse. spermatophytes. Vue composite montrant la distribution de l'activité photosynthétique à la surface de la Terre, le rouge foncé indiquant les zones les plus actives du phytoplancton des milieux aquatiques et le bleu-vert celles de la végétation sur la terre ferme. La photosynthèse (du grec φῶς phōs « lumière » et σύνθεσις sýnthesis « combinaison ») est le processus bioénergétique qui permet à des organismes de synthétiser de la matière organique en utilisant l'énergie lumineuse, l'eau et le dioxyde de carbone.

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Plante

Les plantes (Plantae) sont des organismes photosynthétiques et autotrophes, caractérisés par des cellules végétales.

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Polypeptide

Un polypeptide est une chaîne d'acides aminés reliés par des liaisons peptidiques.

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Polysaccharide

Les polysaccharides (parfois appelés glycanes, polyosides, polyholosides ou glucides complexes) sont des polymères de la famille des glucides constitués de plusieurs oses liés entre eux par des liaisons osidiques.

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Porphyrine

Les porphyrines sont des molécules à structures cycliques impliquées dans le transport du dioxygène et pouvant jouer le rôle de cofacteur lié (groupement prosthétique) à certaines enzymes.

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Précurseur (chimie)

En chimie, un précurseur est un composé participant à une réaction qui produit un ou plusieurs autres composés.

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Procollagène-proline dioxygénase

La procollagène-proline dioxygénase, souvent appelée prolyle hydroxylase, est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette enzyme est une dioxygénase dépendant de l'α-oxoglutarate, qui catalysent l'incorporation d'oxygène dans des composés organiques à l'aide d'un mécanisme impliquant l'α-oxoglutarate, des cations de fer Fe2+ et du L-ascorbate; cette enzyme-ci catalyse la formation d'hydroxyproline, qui est le résidu d'acide aminé résultant d'une modification post-traductionnelle le plus abondant du protéome humain.

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Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Proline

La proline (abréviations IUPAC-IUBMB: Pro et P) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CCU, CCC, CCA et CCG.

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Propionyl-coenzyme A

La propionyl-coenzyme A, généralement écrite propionyl-CoA, est un thioester de la coenzyme A et d'acide propionique.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Protista

Les protistes, sont des microorganismes eucaryotes à organisation cellulaire dite simple, unicellulaire le plus souvent, multicellulaire parfois mais sans tissus spécialisés.

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Purine

La purine est une molécule azotée hétérocyclique constituée d'un cycle pyrimidine fusionné à un cycle imidazole.

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Pyrimidine

La pyrimidine (ou 1,3-diazine) est une molécule azotée hétérocyclique aromatique (C4H4N2) voisine de la pyridine et comportant deux atomes d'azote.

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Pyrophosphate de thiamine

Le Pyrophosphate de thiamine ou thiamine pyrophosphate (TPP) ou diphosphate de thiamine ou thiamine diphosphate (ThDP), est un dérivé de la 1, ou thiamine, qui se forme sous l'action d'une enzyme, la thiamine diphosphokinase.

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Pyruvate carboxylase

La pyruvate carboxylase est une ligase qui catalyse la carboxylation du pyruvate en oxaloacétate avec hydrolyse concomitante d'une molécule d'ATP en ADP + Pi: |- align.

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Pyruvate déshydrogénase

La pyruvate déshydrogénase (ou PDH) — à ne pas confondre avec la pyruvate décarboxylase bien qu'on l'appelle parfois également ainsi — est la première des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), constitué d'une décarboxylase, d'une acétyltransférase et d'une oxydoréductase intervenant séquentiellement pour catalyser la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA, réaction qui assure notamment la liaison entre la glycolyse et le cycle de Krebs.

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Pyruvate déshydrogénase phosphatase

La pyruvate déshydrogénase phosphatase est une hydrolase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans l'activation de la pyruvate déshydrogénase, composante E1 du complexe pyruvate déshydrogénase.

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Quinone

Les quinones constituent une série de diènes plutôt que des composés aromatiques comportant un noyau de benzène sur lequel deux atomes d'hydrogène sont remplacés par deux atomes d'oxygène formant deux liaisons carbonyles (dicétones éthylèniques conjuguées cycliques).

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Réaction anaplérotique

En biochimie, une réaction anaplérotique qualifie une réaction chimique qui produit un métabolite, c'est-à-dire une espèce chimique intermédiaire d'une voie métabolique.

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Réaction d'hydratation

En chimie organique, la réaction d’hydratation est une addition électrophile d'une molécule d'eau sur un composé organique.

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Réaction d'oxydoréduction

L'aluminothermie est une réaction d'oxydoréduction entre l'aluminium et certains oxydes métalliques. Une réaction d'oxydoréduction ou réaction rédox est une réaction chimique au cours de laquelle se produit un transfert d'électrons.

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Réaction de condensation

Une réaction de condensation est une réaction chimique au cours de laquelle deux molécules, ou deux parties d'une même molécule, se combinent pour former une molécule (le condensat) en éliminant une molécule simple (le sous-produit), telle l'eau (le plus souvent), le sulfure d'hydrogène, le méthanol ou l'acide acétique.

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Réaction de déshydratation

En chimie, une réaction de déshydratation est une réaction chimique dans laquelle le réactif de départ perd un atome d'hydrogène et un groupe hydroxyle, soit une molécule d'eau, l'inverse de la réaction d'hydratation.

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Résidu (biochimie)

acides aminés. En biochimie et en biologie moléculaire, un résidu est la partie d'une molécule, généralement un monomère, qui est restée inchangée après être entrée dans la composition d'une biomolécule complexe ou d'un polymère.

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Rein

Le rein est un organe de l'appareil urinaire des vertébrés.

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Respiration aérobie

La respiration aérobie est un mode de respiration utilisant l'oxygène comme comburant.

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Respiration cellulaire

Schéma de principe de la phosphorylation oxydative dans une mitochondrie illustrant l'intégration du cycle de Krebs avec la chaîne respiratoire, et le couplage de celle-ci avec l'ATP synthase au moyen d'un gradient électrochimique issu d'un gradient de concentration de protons à travers la membrane mitochondriale interne. La respiration cellulaire est l'ensemble des processus du métabolisme cellulaire convertissant l'énergie chimique contenue dans le glucose en adénosine triphosphate (ATP).

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Sang

Au contact du dioxygène, le sang doit sa couleur rouge à l’hémoglobine. microscopie à fond noir. Début de coagulation (en haut à droite). globule blanc. Le sang est un liquide biologique vital qui circule continuellement dans les vaisseaux sanguins et le cœur, notamment grâce à la pompe cardiaque.

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Semialdéhyde succinique

Le semialdéhyde succinique est un composé chimique de formule.

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Substrat enzymatique

En enzymologie, on désigne par substrat enzymatique toute molécule subissant une réaction chimique catalysée par une enzyme (ex: l'amidon est hydrolysé par l'amylase en glucose).

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Succinate déshydrogénase

La succinate déshydrogénase (SDH), ou complexe de la chaîne respiratoire, également appelée succinate-coenzyme Q réductase (SQR), est une oxydoréductase membranaire qui catalyse la réaction: Cette enzyme est présente chez un très grand nombre d'êtres vivants.

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Succinate-semialdéhyde déshydrogénase

La succinate semialdéhyde déshydrogénase est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: Cette enzyme est présente chez des êtres vivants appartenant aux trois domaines du vivant: eucaryotes, bactéries et archées.

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Succinyl-CoA:acétate CoA-transférase

La succinyl-CoA:acétate CoA-transférase est une transférase qui catalyse la réaction: Chez les bactéries qui produisent de l'acide acétique, cette enzyme catalyse la conversion de l'acétate en acétyl-CoA.

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Succinyl-coenzyme A

La succinyl-coenzyme A, usuellement abrégée en succinyl-CoA, est l'un des intermédiaires du Cycle de Krebs.

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Succinyl-coenzyme A synthétase

La succinyl-CoA synthétase (SCS), également appelée succinate thiokinase et succinate-CoA ligase, est une ligase qui catalyse la réaction: Cette enzyme de la matrice mitochondriale des eucaryotes catalyse la seule phosphorylation au niveau du substrat du cycle de Krebs.

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Synthase

Une synthase est une enzyme qui catalyse un processus de biosynthèse.

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Taxon

Genre 7-Espèce Un taxon est une entité conceptuelle qui regroupe tous les organismes vivants possédant en commun certains caractères taxinomiques ou diagnostiques bien définis.

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Thermodynamique

La thermodynamique est la branche de la physique qui traite de la dépendance des propriétés physiques des corps à la température, des phénomènes où interviennent des échanges thermiques, et des transformations de l'énergie entre différentes formes.

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Thioester

Structure générale d'un thioester Les thioesters - aussi dénommés esters sulfuriques - sont des composés résultant de la condensation d'un sulfure avec un groupement acyle.

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Tissu biologique

Un tissu en biologie est le niveau d'organisation intermédiaire entre la cellule et l'organe.

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Transamination

La réaction de transamination est une réaction chimique toujours réversible qui consiste en l'échange d'un fonction amine primaire entre un acide α-aminé et un α-cétoacide.

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Triglycéride

Les triglycérides (aussi appelés triacylglycérols, triacylglycérides, TG ou TAG) sont des glycérides dans lesquels les trois groupes hydroxyle du glycérol sont estérifiés par des acides gras.

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Tryptophane

Le tryptophane (abréviations IUPAC-IUBMB: Trp et W) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Tyrosine

La tyrosine (abréviations IUPAC-IUBMB: Tyr et Y) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, codé sur les ARN messagers par les codons UAU et UAC.

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Ubiquinol

L’ubiquinol est une benzoquinone réduite (forme phénolique), liposoluble présente dans pratiquement toutes les cellules des mammifères.

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Ubiquinone

Structure générique des ubiquinones. Une ubiquinone est une molécule appartenant à une famille de composés qui se distinguent par leur nombre n d'unités terpéniques — n typiquement compris entre 6 et 10 — présents chez tous les êtres vivants et jouant le rôle de transporteurs d'électrons dans la chaîne respiratoire.

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Ubiquitine ligase

L’ubiquitine ligase, ou ubiquitine ligase E3, est une ligase qui catalyse la réaction: Cette enzyme recrute l' E2 chargée en ubiquitine, reconnaît une protéine substrat, et assiste ou catalyse directement le transfert de l'ubiquitine de l'enzyme E2 vers la protéine substrat.

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Vitamine D

La vitamine D est une vitamine liposoluble (soluble dans les lipides).

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Voie des pentoses phosphates

Voie des pentoses phosphates. La voie des pentoses phosphates, ou voie de Warburg-Dickens-Horecker, est l'une des quatre voies métaboliques principales du métabolisme énergétique, avec la glycolyse, la voie d'Entner-Doudoroff de dégradation du glucose en pyruvate et la voie du méthylglyoxal.

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Voie métabolique

Une voie métabolique est un ensemble de réactions chimiques catalysées par une série d'enzymes qui agissent de manière séquentielle.

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2-Oxoglutarate décarboxylase

La 2-oxoglutarate décarboxylase, ou α-cétoglutarate décarboxylase, est une lyase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient chez certains procaryotes dans la conversion de l'α-cétoglutarate en succinate comme voie alternative aux et du cycle de Krebs.

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3-Oxoacide CoA-transférase

La 3-oxoacide CoA-transférase est une transférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans le métabolisme des corps cétoniques (cétogenèse) et du butyrate ainsi que dans la dégradation des acides aminés ramifiés (valine, leucine et isoleucine).

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Redirections ici:

Cycle de l'acide citrique, Cycle des acides tricarboxyliques.

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