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Domaine de liaison à l'ADN

Indice Domaine de liaison à l'ADN

Un domaine de liaison à l'ADN (ou DBD de l'anglais DNA-binding domain) est un motif protéique qui est capable de lier à l'ADN double ou simple brin avec une affinité pour une séquence nucléotidique spécifique, ou une affinité relative à l'ADN.

21 relations: Acide aminé, Acide désoxyribonucléique, Acide ribonucléique messager, Boîte de Pribnow, Brin d'acide nucléique, Chélation, Cystéine, Escherichia coli, Extrémité C-terminale, Extrémité N-terminale, Facteur de transcription, Feuillet bêta, FOX (famille de protéines), Genes and Development, Glissière à leucine, Hélice alpha, Histidine, Holoenzyme, Leucine, Protéine, Séquence (acide nucléique).

Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

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Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide ribonucléique messager

Représentation schématique de la synthèse et de la maturation d'un ARN messager dans une cellule eucaryote. L'acide ribonucléique messager, ARN messager, ou ARNm (en anglais, mRNA, pour messenger ribonucleic acid), est une molécule intermédiaire d'acide ribonucléique (ARN), consistant en une copie transitoire d'une portion de l'ADN correspondant à un ou plusieurs gènes d'un organisme biologique.

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Boîte de Pribnow

La boîte de Pribnow est une séquence nucléotidique spécifique située sur les promoteurs des gènes bactériens à environ -10 nucléotides en amont du site d'initiation de la transcription.

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Brin d'acide nucléique

Les molécules d'acides nucléiques peuvent être assimilées à de long brins ou fil, mais à une échelle atomique.

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Chélation

La chélation (prononcer kélassion, du grec, « pince, serre de certains animaux »), appelée aussi séquestration ou complexation, est un processus physico-chimique au cours duquel est formé un complexe, le chélate, entre un ligand, dit « chélateur » (ou chélatant), et un cation (ou atome) métallique, alors complexé, dit « chélaté ».

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Cystéine

La cystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Cys et C), du grec ancien (« vessie »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UGU et UGC.

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Escherichia coli

Escherichia coli, en abrégée E. coli, est une bactérie intestinale des organismes à sang chaud, Gram négatif, du genre Escherichia, en forme de bâtonnet appelée parfois colibacille.

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Extrémité C-terminale

Structure d'un tétrapeptide (valine, glycine, sérine, alanine). L'extrémité C-terminale, à droite, est indiquée en bleu. L'extrémité C-terminale, aussi appelée extrémité carboxy-terminale, extrémité COOH ou terminaison carboxyle, est l'une des deux extrémités d'une protéine ou d'un peptide qui sont des polymères linéaires.

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Extrémité N-terminale

L'extrémité N-terminale (ou terminaison amine, terminaison aminée, terminaison N ou terminaison NH2) réfère à l’extrémité d'une protéine ou d'un polypeptide se terminant par un acide aminé avec une fonction amine libre (-NH2).

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Facteur de transcription

Schéma simplifié du mécanisme d'un activateur. Un facteur de transcription est une protéine nécessaire à l'initiation ou à la régulation de la transcription d'un gène dans l'ensemble du vivant (procaryote ou eucaryote).

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Feuillet bêta

Les feuillets β ou feuillets β plissés est la deuxième forme de structure secondaire régulière observée dans les protéines, avec une fréquence de présence plus faible que les hélices α.

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FOX (famille de protéines)

Les protéines FOX (abréviation de Forkhead box) constituent une famille de protéines ayant un rôle de facteur de transcription et jouent un rôle important dans la régulation de l'expression des gènes responsables de la croissance et de la différenciation cellulaire.

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Genes and Development

Genes and Development (abrégé en Genes Dev.) est une revue scientifique à comité de lecture spécialisée dans la recherche sur la génétique et la biologie moléculaire, Genes and Development, consulté 1_ npvembre 2020.

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Glissière à leucine

résidus de leucines sont représentés en rouge, faisant apparaître l'interaction de leur chaîne latérale isobutane. Une glissière à leucine, ou leucine zipper en anglais, est un domaine fonctionnel tridimensionnel courant des protéines.

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Hélice alpha

Exemple d'hélice alpha. L’hélice alpha (hélice α) est une structure secondaire courante des protéines.

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Histidine

L'histidine (abréviations IUPAC-IUBMB: His et H), du grec ancien, (« mât de navire », « métier à tisser », « voile de navire »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, l'un des acides aminés essentiels et fait partie des acides aminés glucoformateur.

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Holoenzyme

Le terme holoenzyme (ou plus rarement hétéroenzyme), du grec holos, entier, est l'assemblage du cofacteur (qui peut être un ion métallique, un agrégat atomique ou une molécule organique) et d'une ou plusieurs chaînes protéiques, formant ainsi une enzyme complète et active.

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Leucine

La leucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Leu et L), du grec ancien (blanc, éclatant), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Séquence (acide nucléique)

ARN messager faisant apparaître ses codons. La séquence d'un acide nucléique — ADN ou ARN — est la succession des nucléotides qui le constituent.

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Redirections ici:

DNA Binding Domain, Domaine de liaison a l'ADN, Liaison à l'ADN.

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