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Génome

Indice Génome

Le génome (//), ou plus rarement génôme, est l'ensemble du matériel génétique d'une espèce codé dans son acide désoxyribonucléique (ADN), à l'exception de certains virus dont le génome est constitué d'acide ribonucléique (ARN).

107 relations: Acide aminé, Acide ascorbique, Acide désoxyribonucléique, Acide ribonucléique, Acide ribonucléique messager, Actinomycetes, ADN non codant, Algorithme, Algue, Alignement de séquences, Amibe, Années 2000, Arabidopsis thaliana, Archaea, Autosome, Épigénome, Évolution moléculaire, Bactérie, Bactérie phytopathogène, Baylor College of Medicine, Biais d'usage du code, Bio-informatique, Biologie moléculaire, Blé tendre, Caenorhabditis elegans, Caryotype, Caudata, Cellule (biologie), Cellule minimale, Ceratodontimorpha, Chimiogénomique, Chloroplaste, Chromosome, Chromosome Y, Ciliophora, Cytochrome c, Diploïde, Drosophila melanogaster, Escherichia coli, Espèce, Eukaryota, Exon, Filicophyta, Formule topologique, François Képès, Frédéric Dardel, Gène, Génétique, Génome mitochondrial, Génomique, ..., Genome Research, Gonosome, Google Earth, Haemophilus influenzae, Haploïde, Hétérochromatine, Histone, Homo sapiens, Institut J. Craig Venter, Interactomique, Intron, Kinase, Lymphome, Mégabase, Mitochondrie, Mus musculus, Mutation génétique, Mycoplasma laboratorium, Noyau (biologie), Nucléotide, Organite, Paradoxe de la valeur C, Paramécie, Paris japonica, Peptidase, Phagocytose, Pin (plante), Pinophyta, Plante, Plasmide, Programme génétique, Projet Génome humain, Prokaryota, Promoteur (biologie), Protéine, Protéome, Pseudogène, Pyroséquençage, Répétition en tandem, Répétitions dispersées, Saccharomyces cerevisiae, Séquençage de l'ADN, Séquence codante, Séquence de Shine-Dalgarno, Séquence répétée, Science (revue), Terminateur (génétique), Transcriptome, Transgénèse, Université de tous les savoirs, Université Johns-Hopkins, Université Rice, Virus, Virus à ADN, Virus à ARN, Vitamine C, 2009. Développer l'indice (57 plus) »

Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

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Acide ascorbique

L'acide ascorbique, ou acide oxo-3-gulofuranolactone (forme énolique), est un acide organique ayant des propriétés antioxydantes.

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Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide ribonucléique

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Acide ribonucléique messager

Représentation schématique de la synthèse et de la maturation d'un ARN messager dans une cellule eucaryote. L'acide ribonucléique messager, ARN messager, ou ARNm (en anglais, mRNA, pour messenger ribonucleic acid), est une molécule intermédiaire d'acide ribonucléique (ARN), consistant en une copie transitoire d'une portion de l'ADN correspondant à un ou plusieurs gènes d'un organisme biologique.

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Actinomycetes

Les Actinomycetes (en français les Actinomycètes) – anciennement Actinobacteria (les Actinobactéries) – sont une classe de bactéries filamenteuses Gram positives de l'embranchement des Actinomycetota.

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ADN non codant

L’ADN non codant, parfois appelé improprement ADN poubelle ou ADN satellite (en anglais, terme inventé par le chercheur Susumu Ohno en 1972), désigne l’ensemble des séquences du génome qui ne sont pas traduites en protéines.

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Algorithme

triangulation). Un algorithme est une suite finie et non ambiguë d'instructions et d’opérations permettant de résoudre une classe de problèmes.

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Algue

Les algues sont des organismes vivants capables de produire de la photosynthèse oxygénique et dont le cycle de vie se déroule généralement en milieu aquatique.

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Alignement de séquences

En bio-informatique, l'alignement de séquences (ou alignement séquentiel) est une manière de représenter deux ou plusieurs séquences de macromolécules biologiques (ADN, ARN ou protéines) les unes sous les autres, de manière à en faire ressortir les régions homologues ou similaires.

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Amibe

Une amibe est un micro-organisme appartenant à divers groupes de cellules complexes eucaryotes.

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Années 2000

Les années 2000 couvrent la période du au.

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Arabidopsis thaliana

L’Arabette des dames ou Arabette de Thalius (Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.) est une espèce de plantes à fleurs appartenant à la famille des Brassicacées.

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Archaea

sources chaudes volcaniques. Les archées ou Archaea (du grec ancien, « originel, primitif »), anciennement appelés archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries.

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Autosome

Un autosome est un chromosome non sexuel (par opposition au gonosome qui lui en est un).

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Épigénome

L'épigénome est l'état épigénétique d'une cellule.

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Évolution moléculaire

L'évolution moléculaire ou évolution du génome correspond à l'ensemble des modifications d´un génome au cours de générations successives au sein d'une population.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Bactérie phytopathogène

Galles provoquées par ''Agrobacterium tumefaciens'' sur racines de ''Carya illinoensis''. Les bactéries phytopathogènes sont des bactéries responsables de maladies bactériennes ou bactérioses chez les végétaux.

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Baylor College of Medicine

Le Baylor College of Medicine, anciennement Baylor University College of Medicine, rassemble une faculté de médecine et un centre de recherches.

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Biais d'usage du code

Le biais d'usage du code (RSCU, pour Relative Synonymous Codon Usage en anglais) désigne l'utilisation préférentielle d'un des triplets de nucléotides ou codons possibles pour coder un acide aminé.

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Bio-informatique

La bioinformatique (ou bio-informatique), est un champ de recherche multidisciplinaire de la biotechnologie où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie.

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Biologie moléculaire

La biologie moléculaire (parfois abrégée bio. mol.) est une discipline scientifique de la vie au croisement de la génétique, de la biochimie métabolique et de la physique, dont l'objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau moléculaire.

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Blé tendre

Le Blé tendre ou Froment (Triticum aestivum) est une espèce de plantes monocotylédones de la famille des Poaceae (Graminées), sous-famille des Pooideae.

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Caenorhabditis elegans

Caenorhabditis elegans (C. elegans en abrégé) est un petit ver d'un millimètre environ, transparent et non parasitaire.

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Caryotype

Le caryotype (ou caryogramme) est l'arrangement standard de l'ensemble des chromosomes d'une cellule, à partir d'une prise de vue microscopique.

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Caudata

Les Urodèles (Caudata ou Urodela) forment un ordre d'amphibiens qui gardent une queue à l'état adulte, à la différence des anoures (comme les grenouilles et les crapauds) et des gymnophiones.

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Cellule (biologie)

consulté le.

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Cellule minimale

En biologie cellulaire, une cellule minimale est une cellule viable (capable de se maintenir en vie et de se reproduire) ayant le moins grand nombre possible de gènes.

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Ceratodontimorpha

Les Ceratodontimorpha (Dipneustes ou Poissons pulmonés) sont un super-ordre de poissons osseux de la classe des Sarcopterygii et le seul de la sous-classe des DipnoiMeyer C., ed.

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Chimiogénomique

La chimiogénomique (chimio, racine française) ou chemogénomique (chemo, racine latine; provenant du mot anglais chemogenomics) peut être définie comme la science ayant pour objet l'étude de la réponse du génome à un composé chimique.

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Chloroplaste

Schéma d'un chloroplaste d'une plante. Chloroplastes dans des cellules végétales de ''Plagiomnium'' observées au microscope optique Photographie d'une feuille d'''élodée du Canada'' au microscope optique après une coloration au lugol (coloration des grains d'amidon bien visibles dans les chloroplastes). Les chloroplastes sont des organites présents dans le cytoplasme des cellules eucaryotes photosynthétiques (plantes, algues).

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Chromosome

Description de la structure d'un chromosome. Un chromosome (du grec ancien, « couleur » et, « corps, élément ») est un élément microscopique constitué d'une molécule d'ADN et de protéines, les histones et les protéines non histones.

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Chromosome Y

Photographie microscopique des 23 paires de chromosomes humains, parmi lesquelles on distingue la paire des chromosomes sexuels où l'on range le chromosome Y. Le chromosome Y est l'un des deux chromosomes sexuels (ou gonosomes) d'un mammifère, l'autre étant le chromosome X. Chez l'être humain, les chromosomes sexuels constituent l'une des 23 paires de chromosomes.

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Ciliophora

Les Ciliés (Ciliophora, Ciliata ou Euciliata, autrefois nommés aussi « Infusoires ») sont un embranchement d'eucaryotes unicellulaires du règne des Chromista (historiquement des Protozoaires).

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Cytochrome c

Le cytochrome c est une petite hémoprotéine contenant une centaine de résidus d'acides aminés pour une masse d'environ.

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Diploïde

Une cellule biologique est diploïde (du διπλόος, diploos, « double » et εἶδος eidos, « en forme de ») lorsque les chromosomes qu'elle contient sont présents par paires (2n chromosomes).

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Drosophila melanogaster

La drosophile ou mouche du vinaigre (Drosophila melanogaster) est une espèce d'insectes diptères brachycères de la famille des Drosophilidae.

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Escherichia coli

Escherichia coli, en abrégée E. coli, est une bactérie intestinale des organismes à sang chaud, Gram négatif, du genre Escherichia, en forme de bâtonnet appelée parfois colibacille.

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Espèce

classification du vivant. Dans les sciences du vivant, l’espèce (du latin species, « type » ou « apparence ») est le taxon de base de la systématique.

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Eukaryota

Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.

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Exon

Dans les gènes des organismes eucaryotes, les exons sont les segments d’un précurseur ARN qui sont conservés dans l’ARN après épissage et que l'on retrouve dans l'ARN mature dans le cytoplasme.

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Filicophyta

Les Fougères ou Filicophytes (Filicophyta) sont une sous-division de cryptogames vasculaires.

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Formule topologique

La formule topologique est une représentation moléculaire simplifiée utilisée en chimie organique et développée par le chimiste organicien Friedrich Kekulé.

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François Képès

François Képès, né le à Paris, est un biologiste cellulaire français, chercheur et professeur en France et à l'étranger, membre de plusieurs académies.

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Frédéric Dardel

Frédéric Dardel, né le à Neuilly-sur-Seine, est un biologiste moléculaire français.

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Gène

Un gène, du grec ancien (« génération, naissance, origine »), est, en biologie, une séquence discrète et héritable de nucléotides dont l'expression affecte les caractères d'un organisme.

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Génétique

De la molécule d'ADN à la cellule vivante. Le nom de génétique vient de l'adjectif grec, qui qualifie « ce qui est en rapport aux fonctions de génération ».

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Génome mitochondrial

Les mitochondries sont des organites présents dans la grande majorité des cellules eucaryotes qui seraient issues de l'endosymbiose d'une alpha-protéobactérie, il y a environ deux milliards d'années (théorie endosymbiotique).

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Génomique

La génomique est une discipline de la biologie moderne.

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Genome Research

est un journal scientifique mensuel publié par.

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Gonosome

Les gonosomes d'un être humain mâle: à gauche le chromosome X, à droite le chromosome Y On appelle gonosomes, allosomes ou chromosomes sexuels les chromosomes qui déterminent le sexe.

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Google Earth

Google Earth est un logiciel développé par la société Google, permettant une visualisation de la Terre avec un assemblage de photographies aériennes ou satellitaires.

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Haemophilus influenzae

, autrefois appelé bacille de Pfeiffer, est une bactérie strictement humaine de la famille des Pasteurellaceae et de la classe des Gammaproteobacteria.

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Haploïde

Une cellule biologique est haploïde (du grec ἁπλόος (haploos), simple, et εἶδος (eidos), en forme de) lorsque les chromosomes qu'elle contient sont chacun en un seul exemplaire (n chromosomes).

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Hétérochromatine

cellule - l'hétérochromatine est visible en noir dans le noyau L'hétérochromatine est une structure observable de l'ADN, une condensation de la chromatine que l'on distingue de l'euchromatine qui est la structure observable non condensée.

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Histone

Les histones sont des protéines localisées dans le noyau des cellules eucaryotes et dans les archées.

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Homo sapiens

Homo sapiens, plus communément appelé « homme moderne », « homme », « humain », ou « être humain », est une espèce de primates originaire d'Afrique qui s'est aujourd'hui répandue et naturalisée sur l'ensemble de la planète hormis l'Antarctique.

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Institut J. Craig Venter

L'Institut J. Craig Venter (J.) est un institut de recherche américain en génomique, créé en par le regroupement de plusieurs institutions antérieures.

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Interactomique

Le concept d’interactome a été proposé en 1999 par Bernard Jacq (Institut de Biologie du Développement de Marseille Luminy) pour décrire les réseaux biologiques formés par les principaux types de molécules.

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Intron

Un intron est une portion d'un gène qui est transcrite en ARN, au sein d'un ARN précurseur, et qui est ensuite éliminée par un processus d'excision programmé et qu'on ne retrouve donc pas dans l'ARN mature.

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Kinase

Schéma de fonctionnement des kinases Les kinases, (catalyseurs de la phosphorolyse), sont des enzymes du groupe des transférases catalysant les réactions de phosphorylation par l'ajout d'un ion phosphate à une molécule cible à partir de l'ATP.

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Lymphome

Un lymphome, aussi plus rigoureusement appelé lymphome malin ou lymphosarcome, est un cancer du système lymphatique qui se développe aux dépens des lymphocytes.

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Mégabase

La mégabase (Mb) est une unité de mesure en biologie moléculaire représentant une longueur d'un million de paires de bases d'ADN ou d'ARN.

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Mitochondrie

Une mitochondrie est un organite, possédant toutes les caractéristiques d'un organisme procaryote, entourée d'une double membrane composée chacune d'une double couche phospholipidique, et retrouvée chez la plupart des cellules eucaryotes.

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Mus musculus

La Souris grise Murray Wrobel, 2007.

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Mutation génétique

Un exemple de mutation homéotique: une drosophile Antennapedia Une est une modification rare, accidentelle ou provoquée, de l'information génétique (séquence d’ADN ou d’ARN) dans le génome.

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Mycoplasma laboratorium

Mycoplasma laboratorium serait la première espèce de bactérie de synthèse, dérivée du génome de Mycoplasma genitalium qui présente 517 gènes et qui a donc été allégée d'un quart de ses gènes soit le minimum nécessaire à sa survie en conditions de laboratoire.

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Noyau (biologie)

En biologie cellulaire, le noyau est une structure cellulaire présente dans la majorité des cellules eucaryotes et chez tous les organismes eucaryotes, et contenant l'essentiel du matériel génétique de la cellule (ADN).

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Nucléotide

Un nucléotide est une molécule organique qui est composée d'une base nucléique (ou base azotée), d'un ose à cinq atomes de carbone, dit pentose, dont l'association forme un nucléoside, et enfin de un à trois groupes phosphate.

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Organite

Les organites (de temps en temps nommés organelles par anglicisme) sont les différentes structures spécialisées contenues dans le cytoplasme et délimitées du reste de la cellule par une membrane phospholipidique.

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Paradoxe de la valeur C

La valeur C représente la taille d'un génome, exprimée en nombre de paires de bases, ou en picogramme.

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Paramécie

Les paramécies sont des eucaryotes unicellulaires constituant le genre Paramecium, de la famille des (embranchement des Ciliés, division des Alvéolés).

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Paris japonica

Paris japonica est une espèce de plantes du genre Paris de la famille des Melanthiaceae, originaire des régions montagneuses du Japon.

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Peptidase

Coupure protéolytique d'une chaîne peptidique Les peptidases (ou protéases ou enzymes protéolytiques) sont des enzymes qui brisent les liaisons peptidiques des protéines.

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Phagocytose

Illustration de la phagocytose d'une particule (en noir) par un phagocyte (en rose). La phagocytose, en biologie, est le processus cellulaire par lequel certaines cellules regroupées sous la dénomination générale de phagocyte peuvent ingérer des particules étrangères solides d'échelle micrométrique.

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Pin (plante)

Alois Kirnig. « Pin » est la désignation générique des conifères appartenant au genre Pinus, de la famille des Pinacées.

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Pinophyta

L'embranchement des Pinophytes (ou Conifères), anciennement connu sous le nom de Coniférophytes (ou Coniferophyta), ne comprend qu'une classe: celle des Pinopsida.

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Plante

Les plantes (Plantae) sont des organismes photosynthétiques et autotrophes, caractérisés par des cellules végétales.

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Plasmide

Schéma représentant une bactérie contenant des plasmides. En microbiologie et en biologie moléculaire, un plasmide est une molécule d'ADN distincte de l'ADN chromosomique, capable de réplication autonome et non essentielle à la survie de la cellule.

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Programme génétique

Le programme génétique est l'ensemble des informations contenues dans le noyau des cellules.

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Projet Génome humain

Le génome humain est constitué de l'ensemble de l'information portée par nos 23 paires de chromosomes. Le (PGH, ou HGP pour l'anglais Human Genome Project) est un programme lancé fin 1988 dont la mission était d'établir le séquençage complet de l'ADN du génome humain.

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Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Promoteur (biologie)

Un promoteur, ou séquence promotrice, est une région de l'ADN située à proximité d'un gène et indispensable à la transcription de l'ADN en ARN.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Protéome

Le protéome est l'ensemble des protéines exprimées dans une cellule, une partie d'une cellule (membranes, organites) ou un groupe de cellules (organe, organisme, groupe d'organismes) dans des conditions données et à un moment donné.

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Pseudogène

Schéma montrant le mécanisme d'apparition d'un pseudogène. Un pseudogène est, d'après sa définition originale, un gène inactif au sein d'un génome, du fait d'altérations génétiques le rendant non fonctionnel et donc incapable de conduire à l'expression d'une protéineOhno, S. (1972).

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Pyroséquençage

Le pyroséquençage est une technique de séquençage de l'ADN qui permet d’effectuer un séquençage rapide et à moindre coût qu’un séquençage par la méthode de Sanger.

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Répétition en tandem

En bio-informatique, une répétition en tandem est une suite de plusieurs motifs de nucléotides, adjacents dans une séquence d'ADN et qui se répètent à l'identique.

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Répétitions dispersées

Mécanisme général de duplication des séquences répétées. Les éléments autonomes (à gauche) codent une ou plusieurs enzymes permettant la réplication et l'intégration à un nouveau site dans l'ADN génomique. Les éléments non-autonomes (à droite) utilisent ''en trans'' les enzymes codées par des éléments autonomes situés ailleurs dans le génome. Les répétitions dispersées sont des séquences d'ADN présentes dans le génome des organismes vivants et qui sont répétées à plusieurs endroits différents sur les chromosomes.

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Saccharomyces cerevisiae

Saccharomyces cerevisiae est une espèce de levures employée notamment dans la fermentation de la bière.

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Séquençage de l'ADN

Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné.

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Séquence codante

454x454px La séquence codante d'un gène, également appelée région codante ou CDS (pour l'anglais coding DNA sequence), est la partie de l'ADN ou de l'ARN du gène, composée des exons, qui est traduite en protéine.

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Séquence de Shine-Dalgarno

La séquence de Shine-Dalgarno ou site de fixation du ribosome (en anglais RBS, pour ribosome binding site) est une séquence de nucléotides présente sur les ARN messagers des bactéries, en amont du codon d'initiation.

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Séquence répétée

Chez l'homme, les séquences répétées représentent 50 % du génome.

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Science (revue)

Science est une revue scientifique généraliste américaine hebdomadaire qui publie des articles dans tous les domaines scientifiques (biologie, chimie, physique, mathématiques, anthropologie, archéologie).

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Terminateur (génétique)

structure en tige-boucle provoque une pause de l'ARN polymérase (bleue). L'interaction entre l'ARNm et le brin d'ADN matrice est alors seulement constitué d'appariements A-U, faibles, et l'ARNm se détache. En génétique, un terminateur ou terminateur de transcription est une séquence du génome qui marque la fin de la transcription d'un gène ou d'un opéron en ARN messager par l'ARN polymérase.

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Transcriptome

Puces à ADN employée pour analyser l'expression de gènes humains à gauche, de souris à droite. Le transcriptome est l'ensemble des ARN issus de la transcription du génome.

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Transgénèse

Schéma d'un gène chez les eucaryotes La transgenèseArticle « La transgenèse », Encyclopædia Universalis.

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Université de tous les savoirs

L'Université de tous les savoirs (2000), UTLS, est un ensemble de 366 leçons magistrales données au Conservatoire national des arts et métiers (ministère de l'Enseignement supérieur et de la Recherche) à Paris, du au Cf.

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Université Johns-Hopkins

L’université Johns-Hopkins (Johns Hopkins University, ou JHU) est une université privée américaine, située à Baltimore dans le Maryland.

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Université Rice

L'université Rice est une université de recherche américaine privée, située à Houston (Texas).

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Virus

Un virus est un agent infectieux nécessitant un hôte, souvent une cellule, dont les constituants et le métabolisme déclenchent la réplication.

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Virus à ADN

Un virus à ADN est un virus qui possède de l'ADN dans son génome et n'utilise pas d'intermédiaire à ARN durant sa réplication.

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Virus à ARN

Un virus à ARN, parfois appelé ribovirus, est un virus dont le matériel génétique est constitué d'ARN.

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Vitamine C

La vitamine C est une vitamine hydrosoluble sensible à la chaleur et à la lumière jouant un rôle important dans le métabolisme de l'être humain et de nombreux autres mammifères. Chimiquement parlant, il s'agit de l'acide L-ascorbique, un des stéréoisomères de l'acide ascorbique, et de ses sels, les ascorbates. Les plus courants sont l'ascorbate de sodium et l'ascorbate de calcium. On parle d'acide ascorbique ou acide L-(+)-ascorbique donc dextrogyre de numéro CAS et il est le seul autorisé à porter le nom de « vitamine C ». L'acide ascorbique lévogyre (acide D-(–)-ascorbique) n'a pas d'effet vitaminique suffisant.

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2009

L'année 2009 est une année commune qui commence un jeudi.

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Redirections ici:

ADN génomique, Annotation des génomes, Genome, Genome humain, Génome nucléaire, Génomes, Génôme, Matériel génétique.

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