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Microbiote de l'organisme humain

Indice Microbiote de l'organisme humain

Le microbiote de l'organisme humain, anciennement dénommé flore microbienne de l'organisme humain, est l'ensemble des bactéries, microchampignons et autres micro-organismes que le corps humain contient en grand nombre.

76 relations: Acétate, Acné, Agent infectieux, Alimentation, Allergie, Anaérobie, Antigène, Appareil digestif, Archaea, Athérosclérose, Bacillota, Bactérie, Bacteroidota, Bifidobacterium, Biofilm, Bouche humaine, Carie dentaire, Côlon, Champignon, Clostridia, Commensalisme, Communauté, Corps humain, Cutibacterium acnes, Diabète de type 1, Digestion, Eczéma (syndrome), Escherichia coli, Excrétion, Flore, Fusobacteriales, Glucide, Histoire évolutive de la lignée humaine, Immunodéficience, Intestin grêle, Lachnospiraceae, Lactobacille, Maladie, Maladie auto-immune, Mâchoire, Micro-organisme, Microbiote, Microbiote buccal humain, Microbiote intestinal, Microbiote intestinal humain, Microbiote vaginal humain, Micromycète, Obésité, Organisme (physiologie), Oxyde de triméthylamine, ..., Péristaltisme, Philippe Sansonetti, Phylotype, Plaque dentaire, Prébiotique, Probiotique, Prothèse dentaire, Protozoaire, Pseudomonadota, Pseudomonas, Rickettsia, Salmonella, Streptocoque, Sueur, Symbiose, Système immunitaire, Tartre dentaire, Taxonomie, The American Journal of Clinical Nutrition, Tuberculose, Vaginose, Virus, Viscère, Vitamine B8, Vitamine B9, Vitamine K. Développer l'indice (26 plus) »

Acétate

Un acétate ou éthanoate (IUPAC) est un sel ou un ester de l'acide acétique.

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Acné

L' est une maladie dermatologique courante et chronique du système pilosébacé (qui comprend le follicule pileux, la tige pilaire et la glande sébacée sécrétant le sébum, à la racine du poil).

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Agent infectieux

Un est un agent biologique pathogène responsable d'une maladie infectieuse.

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Alimentation

L’alimentation est le choix et l'intégration de la nourriture (ensemble d'aliments) par un être vivant.

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Allergie

L'allergie est un phénomène d'exagération pathologique de la réponse immunitaire, en particulier la réaction inflammatoire, face à un antigène généralement étranger à l'organisme.

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Anaérobie

bactéries du genre Desulfovibrio. Un anaérobie ou organisme anaérobie est tout organisme dont le métabolisme redox ne dépend pas du dioxygène.

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Antigène

Un antigène est une macromolécule naturelle ou synthétique qui, reconnue par des anticorps ou des cellules du système immunitaire d’un organisme, peut déclencher une réaction immunitaire.

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Appareil digestif

Le système digestif, appelé aussi appareil digestif, est l'ensemble des organes qui chez les êtres vivants a pour rôle d'assurer l'ingestion et la digestion des aliments pour en extraire l'énergie et les nutriments nécessaires à la survie de l'organisme qui sont ensuite absorbés par l'organisme.

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Archaea

sources chaudes volcaniques. Les archées ou Archaea (du grec ancien, « originel, primitif »), anciennement appelés archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries.

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Athérosclérose

L'athérosclérose (du grec athêra signifiant « bouillie » et scleros signifiant « dur ») est une maladie touchant les artères de gros et moyen calibre et caractérisée par l'apparition de plaques d'athérome.

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Bacillota

Les Bacillota – anciennement Firmicutes – sont un embranchement du règne des Bacteria.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Bacteroidota

Les Bacteroidota – anciennement Bacteroidetes – sont un embranchement (ou encore phylum, ou division) du règne des Bacteria.

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Bifidobacterium

Bifidobacterium (nom vernaculaire bifidobactérie ou bifidusBifidus est un terme de marketing des entreprises agroalimentaires, apocope de Bifidobacterium. Pour lancer en 1987 un nouveau lait fermenté, à base de Bifidobacterium lactis DN-173 010, souche brevetée par ses soins, Danone désigne dans ses publicités la bactérie active comme « bifidus actif », censée améliorer le transit intestinal.) est un genre d’actinobactéries bifidobacteriales anaérobies à Gram positif.

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Biofilm

biofilm autotrophe constitué de cyanobactéries). lire en ligne.

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Bouche humaine

Pour l'article plus général sur la bouche des animaux, voir Bouche. ----- Cavité buccale. Innervation de la cavité buccale La bouche ou cavité buccale humaine représente le premier segment du tube digestif.

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Carie dentaire

doi.

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Côlon

Le côlon (du latin colon, du grec ancien), est situé, dans l'abdomen, entre la valvule iléo-cæcale et la jonction recto-sigmoïdienne chez les mammifères.

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Champignon

Les champignons sont des eucaryotes pluricellulaires ou unicellulaires.

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Clostridia

Les Clostridia sont une classe de bactéries diversifiée contenant un mélange d'organismes Gram positifs et Gram négatifs de l'embranchement des Bacillota.

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Commensalisme

moineaux cisalpins se nourrit dans une coupe de glace. interactions biologiques. Le commensalisme (du latin cum-, « avec » et mensa, « table », par exemple « compagnon de table » ou « manger à la même table ») est un type d’interaction biologique naturelle et fréquente ou systématique entre deux êtres vivants dans laquelle l'hôte fournit une partie de sa propre nourriture au commensal.

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Communauté

Une communauté est un groupe humain dont les membres sont unis par un lien social.

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Corps humain

Le corps humain est la structure culturelle et physique d'un être humain.

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Cutibacterium acnes

Cutibacterium acnes est une bactérie liée à l’éclosion de l’acné.

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Diabète de type 1

Le diabète de type 1, diabète insulinodépendant (ou insulino-dépendant) (DID), diabète inné (anciennement appelé diabète sucré), ou encore DT1 (terme de plus en plus employé dans le milieu médical), est une maladie auto-immune irréversible.

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Digestion

Système digestif. La digestion est un ensemble de transformations mécaniques et chimiques permettant la réduction des aliments en nutriments assimilables par l'organisme.

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Eczéma (syndrome)

Planche pédagogique médicale (Meyers Konversationslexikon, vers 1885-90. Modèle de cire présentant un ''Eczema papillaris'', destiné à l'enseignement de la dermatologie (Army Medical Services Museum). L'eczéma (ou exéma) est un syndrome, ensemble de signes cliniques et de symptômes communs à plusieurs affections, pouvant correspondre à plusieurs maladies inflammatoires de la peau.

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Escherichia coli

Escherichia coli, en abrégée E. coli, est une bactérie intestinale des organismes à sang chaud, Gram négatif, du genre Escherichia, en forme de bâtonnet appelée parfois colibacille.

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Excrétion

Femelles de cochenilles ''Pulvinaria hydrangeae'' produisant leur excrétion cireuse et protectrice (sur feuille de tilleul). L'excrétion (du verbe excréter) est l'action par laquelle des substances sécrétées (des déchets d'un métabolisme pour la plupart) d'un organisme vivant sont rejetées au-dehors sous forme de solides, liquides, gaz ou mucus.

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Flore

Flore d'une île. La flore est l'ensemble des espèces végétales présentes dans un espace géographique ou un écosystème déterminé (par opposition à la faune).

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Fusobacteriales

Les Fusobacteriales sont un ordre de bacilles Gram négatifs de la classe des Fusobacteriia.

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Glucide

Par exemple, le glucose est un glucide à six carbones, cinq groupes hydroxyle et un groupe aldéhyde. Les grains et céréales contiennent une grande quantité de glucides. Les glucides sont définis par l'Union internationale de chimie pure et appliquée (UICPA) comme une classe de composés organiques contenant un groupe carbonyle (aldéhyde ou cétone) et au moins deux groupes hydroxyle (-OH).

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Histoire évolutive de la lignée humaine

Homininés depuis 10 Ma L'histoire évolutive de la lignée humaine (Hominina) est le processus évolutif conduisant à l'apparition du genre Homo, puis à celle dHomo sapiens (l'Humain actuel).

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Immunodéficience

Un déficit immunitaire, une immunodéficience (IMD) ou une immunodépression, sont une situation pathologique liée à l'insuffisance d'une ou de plusieurs fonctions immunologiques.

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Intestin grêle

Schéma de l'intestin grêle dans le système digestif L'intestin grêle est la partie de l'appareil digestif humain située entre l'estomac et le gros intestin (côlon).

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Lachnospiraceae

Les Lachnospiraceae forment une famille de bactéries anaérobiques présentes dans le microbiote intestinal des mammifères.

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Lactobacille

Le Lactobacille (Lactobacillus) est un genre de bactéries à gram positif, de la famille des Lactobacillaceae.

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Maladie

''The Sick Girl'' (''La Fille malade'') de Michael Ancher La maladie est une altération des fonctions ou de la santé d'un organisme vivant.

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Maladie auto-immune

Une est consécutive à une anomalie du système immunitaire conduisant ce dernier à s'attaquer aux composants normaux de l'organisme (le « soi », d'où la racine auto- pour parler de ce trouble de l'immunité).

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Mâchoire

mâchoires de fouine (sous-espèce ''Martes foina foina''). Les mâchoires sont les deux structures opposables (maxillaire et mandibule) formant la bouche (ou près de l’entrée de la bouche).

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Micro-organisme

Un micro-organisme ou microorganisme (du grec ancien, « petit » et de, « organe ») ou microbe (du grec, « petit » et, « vie ») est un organisme unicellulaire qui ne peut être observé individuellement qu'à l'aide d'un microscope.

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Microbiote

''Escherichia coli'', l'une des espèces bactériennes sous-dominantes du microbiote intestinal. Le microbiote est l'ensemble des micro-organismes vivant dans un environnement spécifique (appelé microbiome) chez un hôte (animal: zoobiote; végétal: phytobiote; sol: microbiote tellurique; air: aérobiote) ou une matière (d'origine animale ou végétale).

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Microbiote buccal humain

Candidose buccale provoquée par le champignon ''Candida albicans''. Le microbiote buccal humain est l'ensemble des micro-organismes présents dans la bouche des êtres humains.

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Microbiote intestinal

bactéries présente dans la « flore » intestinale. Le microbiote intestinal, également appelé flore intestinale, est l'ensemble des micro-organismes (archées, bactéries, eucaryotes) qui se trouvent dans le tube digestif des animaux.

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Microbiote intestinal humain

Rôles du microbiote intestinal: il protège contre des pathogènes, synthétise des vitamines, participe au développement et à la maturation du système immunitaire, promeut l'angiogenèse, participe à la prise de poids, fermente les fibres en AGCC (acides gras à chaînes courtes), module le SNC (système nerveux central). Le microbiote intestinal humain, anciennement appelé flore intestinale humaine, est l'ensemble des microorganismes (archées, bactéries et levures — et les virus qui les infectent) du tractus digestif humain, c'est-à-dire. Il constitue le plus grand réservoir du microbiote de l'organisme humain et un réservoir d’activités enzymatiques essentiel pour la digestion et la physiologie humaines. À ce titre, il influe sur la santé. Ce microbiote et son hôte humain sont un exemple de symbiose mutualiste (coopération entre différentes sortes d’organismes impliquant un avantage pour chacun) et de commensalisme. Le microbiote peut réguler l’expression de certains gènes de l'hôte, ce qui fait évoquer des relations symbiotiques avancées Dethlefsen L, Eckburg PB, Bik EM, Relman DA. « » Trends Ecol Evol. 21, 517–523 (2006) Larsson, E. 61, 1124–31 (2012). Chez un individu en bonne santé, l'activité métabolique de ce microbiote en fait l'équivalent d'un organe à part entière dans la physiologie humaine. Il est impliqué dans la maturation du système immunitaire et de l'épithélium intestinal de l'hôte Mazmanian SK, Liu CH, Tzianabos AO, Kasper DL. 122, 107–118 (2005). Il intervient dans de nombreuses voies métaboliques fondamentales comme la fermentation des sucres et des protéines ainsi que le métabolisme des acides biliaires et des xénobiotiques. En matière de nutrition, il permet aux systèmes digestifs de fermenter les fibres alimentaires et il synthétise des vitamines essentielles Bäckhed F, Ley RE, Sonnenburg JL, Peterson DA, Gordon JI. 307, 1915 (2005) Ley RE, Lozupone CA, Hamady M, Knight R, Gordon JI. « » Nat Rev Microbiol. 6, 776–788 (2008). En cas de dysbiose, c’est‐à‐dire de changement dans la composition ou la stabilité des populations bactériennes de l’intestin, le microbiote peut être associé à des maladies métaboliques telles que le diabète de type 2, l'obésité ou les maladies cardiovasculaires. Par ailleurs, certaines composantes du microbiote ont été associées aux maladies inflammatoires chroniques de l'intestin telles que la maladie de Crohn ou la rectocolite hémorragique Manichanh C. 55, 205–11 (2006) Vasquez N. 13, 684–692 (2007), mais aussi au développement d'allergies MacDonald TT, Bell I, Monteleone G. « » Biochem Soc Trans. 39, 1061–1066 (2011) et au cancer colorectal Sobhani I. Microbial Dysbiosis in Colorectal Cancer (CRC) Patients« Microbial Dysbiosis in Colorectal Cancer (CRC) Patients » PLoS ONE 6, e16393 (2011). Bien que les recherches aient progressé depuis les années 2000, grâce aux techniques de séquençage haut débit du matériel génétique, la connaissance dans ce domaine est encore exploratoire et scientifiquement incomplète. Ces hypothèses scientifiques ouvrent des pistes prometteuses, que la vulgarisation scientifique et médiatique simplifie parfois sous le terme de « deuxième cerveau ». Les relations de cause à effet de corrélations observées doivent toutefois être généralement mieux établies.

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Microbiote vaginal humain

Composition du microbiote vaginal chez des femmes porteuses d'une vaginose: flore normale (Controls), flore intermédiaire (Intermediate), flore en cas de vaginose bactérienne (BV). Le, ou flore vaginale, est l'ensemble des micro-organismes qui se trouvent dans le vagin.

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Micromycète

bourgeonnant (cicatrices de bourgeonnement en vert), vue au microscope à fluorescence. Le groupe des micromycètes, microchampignons ou microfungi rassemble des champignons eucaryotes de très petite taille ou microscopiques.

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Obésité

L’obésité est une maladie non transmissible qui se caractérise par un excès de graisse corporelle résultant d'un apport énergétique issu de l'alimentation largement supérieur aux besoins de l'individu concerné.

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Organisme (physiologie)

Les bactéries ''Escherichia coli'' sont des organismes unicellulaires. Un organisme (du grec organon, « instrument »), ou organisme vivant, est, en biologie et en écologie, un système vivant complexe, organisé et est le produit de variations successives au cours de l'évolution.

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Oxyde de triméthylamine

L'oxyde de triméthylamine est un composé organique de formule brute N(CH)O.

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Péristaltisme

On appelle péristaltisme l'ensemble des contractions musculaires (« mouvements péristaltiques ») permettant la progression d'un contenu à l'intérieur d'un organe creux.

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Philippe Sansonetti

Philippe Sansonetti, né le, est un médecin et chercheur en microbiologie français.

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Phylotype

En biologie, un phylotype est une définition opérationnelle utilisée pour regrouper des individus phylogénétiquement proches, quel que soit le rang taxonomique concerné (classe, genre, espèce...). Le regroupement est généralement basé sur la similarité de la séquence d'ADN d'un gène donné, qui sert de marqueur taxonomique (par exemple, l'ADNr 16S pour les bactéries et les archaea).

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Plaque dentaire

Biofilm développé sur la dentine, ici traité à la chlorhexidine (photographie après 5 minutes). La plaque dentaire bactérienne est une substance blanchâtre qui se dépose à la surface de la dent.

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Prébiotique

Exemple de prébiotique, un galactooligosaccharide. Les prébiotiques sont des substances alimentaires composées généralement de glucides complexes connus sous le vocable d'oligosaccharides et de polysaccharides à courte chaîne, étant définis comme « un substrat qui est utilisé sélectivement par les microorganismes de l'hôte pour conférer des bénéfices sur la santé ».

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Probiotique

Mécanismes proposés des actions des souches probiotiques au niveau de l'épithélium intestinal: compétition avec les pathogènes pour les nutriments nécessaires à leur multiplication (A), compétition pour l’adhésion aux sites récepteurs (B), stimulation immunitaire par leurs activités enzymatiques (C), action antagoniste directe par production de peptides antimicrobiens qui inhibent la croissance des pathogènes (D). Les probiotiques sont des micro-organismes vivants (bactéries ou levures) ajoutés à certains produits alimentaires comme les yaourts et vendus comme promoteurs de santé humaine.

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Prothèse dentaire

La prothèse dentaire est un dispositif dentaire remplaçant une ou plusieurs dents absentes et, si nécessaire, les structures anatomiques associées.

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Protozoaire

En biologie, le terme protozoaire (Protozoa), du grec (« premier ») et (« animal »), désigne les protistes (eucaryotes généralement unicellulaires et sans tissus spécialisés) hétérotrophes mobiles qui ingèrent leur nourriture par phagocytose, contrairement à d'autres protistes.

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Pseudomonadota

Les Pseudomonadota – anciennement Proteobacteria (en français les Protéobactéries) – sont un vaste embranchement (ou division, ou phylum) du règne des Bacteria.

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Pseudomonas

Les bactéries du genre Pseudomonas peuvent être définies par.

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Rickettsia

La Rickettsie, Rickettsia, est un genre de bactéries de la famille des Rickettsiaceae et de la tribu des Rickettsieae.

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Salmonella

Salmonella (en français les Salmonelles) est un genre de bacilles Gram négatifs (BGN) de la famille des Enterobacteriaceae.

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Streptocoque

Les streptocoques (le genre Streptococcus) regroupent un vaste ensemble de bactéries ubiquitaires et qui comprend de nombreuses espèces.

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Sueur

Gouttes de sueur La sueur est un liquide biologique sécrété par les glandes sudoripares lors du phénomène de transpiration qui joue un rôle important pour le contrôle de la température du corps (évacuation de soit par litre de sueur évaporée).

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Symbiose

racine. La symbiose (du grec, « avec, ensemble » et du nom, « vie ») est une association intime, durable entre deux organismes hétérospécifiques.

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Système immunitaire

Un lymphocyte, principale composante du système immunitaire adaptatif des vertébrés. Le système immunitaire d'un organisme est un système biologique complexe constitué d'un ensemble coordonné d'éléments de reconnaissance et de défense qui discrimine le soi du non-soi.

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Tartre dentaire

Plaque de tartre Radiographie montrant (flèches) des calcifications du tartre dentaire. Le tartre dentaire apparait par la minéralisation de la plaque dentaire.

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Taxonomie

La taxonomie ou taxinomie est une branche des sciences naturelles qui a pour objet l'étude de la diversité du monde vivant.

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The American Journal of Clinical Nutrition

(abrégé en Am. J. Clin. Nutr. ou AJCN) est une revue médicale américaine de nutrition clinique.

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Tuberculose

La tuberculose est une maladie infectieuse causée par la bactérie Mycobacterium tuberculosis, qui se transmet par voie aérienne, avec des signes cliniques variables.

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Vaginose

La vaginose, ou vaginose bactérienne, est un déséquilibre de la flore microbienne du vagin.

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Virus

Un virus est un agent infectieux nécessitant un hôte, souvent une cellule, dont les constituants et le métabolisme déclenchent la réplication.

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Viscère

Planche anatomique présentant des viscères humains: appareil digestif (intestins, estomac, etc.), poumons, cœur, etc. Un viscère (du latin signifiant « partie interne du corps ») désigne en anatomie un organe se situant dans une cavité corporelle: la boîte crânienne, la cage thoracique ou la cavité abdominale.

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Vitamine B8

La vitamine, correspondant à la biotine, est une vitamine hydrosoluble encore souvent appelée coenzyme R,, ou encore 7''' dans de nombreux pays, notamment en Allemagne ou dans les pays anglo-saxons (chez ces derniers, la est une appellation erronée pour l'AMP, tandis qu'en France la désigne improprement l'inositol, ces deux composés n'ayant aucun rapport entre eux ni avec la biotine).

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Vitamine B9

La vitamine B, autre nom de l'acide folique (folate, folacine ou vitamine M, acide pteroyl-L-glutamique, pteroyl-L-glutamate et acide pteroylmonoglutamique), est une vitamine hydrosoluble.

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Vitamine K

Les vitamines K forment un groupe de vitamines liposolubles requises pour les modifications post-traductionnelles de certaines protéines intervenant essentiellement dans la coagulation sanguine mais aussi dans le métabolisme des os et d'autres tissus.

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Redirections ici:

Flore commensale de l'organisme humain, Flore de l'organisme humain, Les bactéries dans le corps humain, Microbiote de l'homme, Microbiote humain.

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