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Phylogénétique moléculaire

Indice Phylogénétique moléculaire

Séquençage moléculaire La phylogénétique moléculaire est l'utilisation de séquences de macromolécules biologiques pour obtenir des informations sur l'histoire évolutive des organismes vivants, et notamment sur leurs liens de parenté (leur phylogénie).

74 relations: Acide aminé, Acide désoxyribonucléique, Acide ribonucléique, Acide ribonucléique messager, Acide ribonucléique ribosomique, Adénosine, Algorithme, Alignement de séquences, Allan Wilson, Allozyme, Arbre phylogénétique, ARN ribosomique 16S, ARN ribosomique 18S, ARN ribosomique 23S, ARN ribosomique 28S, Émile Zuckerkandl, Évolution (biologie), Barcoding moléculaire, Charles Gald Sibley, Cladistique, Classification phylogénétique, Convergence évolutive, Cytidine, David Mark Hillis, De Boeck, Dernier ancêtre commun, Empreinte génétique, Eukaryota, Frederick Sanger, Génétique, Génome mitochondrial, Graphe (mathématiques discrètes), Guanosine, Herpétologie, Homologie (évolution), Horloge moléculaire, Immunodiffusion, Inférence bayésienne, Isoenzyme, Jon Edward Ahlquist, Joseph Felsenstein, Linus Pauling, Macromolécule, Maximum de parcimonie, Maximum de vraisemblance, Médecine légale, Méthode probabiliste, Monomère, Mutation génétique, Neighbour joining, ..., Nucléotide, Organisme (physiologie), Ornithologie, Phylogénie, Phylogénomique, Plaste, Polymère, Primates, Prokaryota, Protéine, Réaction en chaîne par polymérase, Réseau phylogénétique, Réversion, Ribosome, Sélection naturelle, Séquençage, Séquençage de l'ADN, Séquence biologique, Statistiques non paramétriques, Système immunitaire, Systématique, Taxon, Thymidine, Unweighted pair group method with arithmetic mean. Développer l'indice (24 plus) »

Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

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Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide ribonucléique

url texte.

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Acide ribonucléique messager

Représentation schématique de la synthèse et de la maturation d'un ARN messager dans une cellule eucaryote. L'acide ribonucléique messager, ARN messager, ou ARNm (en anglais, mRNA, pour messenger ribonucleic acid), est une molécule intermédiaire d'acide ribonucléique (ARN), consistant en une copie transitoire d'une portion de l'ADN correspondant à un ou plusieurs gènes d'un organisme biologique.

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Acide ribonucléique ribosomique

sous-unité 50S des ribosomes de procaryotes.Les protéines sont colorées en bleu et les ARN en orange. Le site actif, l'adénine 2486 est coloré en rouge L'ARN ribosomique (ARNr) ou ARN ribosomal par anglicisme (ribosomal RNA, rRNA, en anglais) est le constituant principal des ribosomes, auxquels il donne leur nom.

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Adénosine

L'adénosine est un nucléoside formé lorsque l'adénine est attachée à un noyau ribose (sous forme de ribofuranose) via une liaison β-N9glucoside.

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Algorithme

triangulation). Un algorithme est une suite finie et non ambiguë d'instructions et d’opérations permettant de résoudre une classe de problèmes.

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Alignement de séquences

En bio-informatique, l'alignement de séquences (ou alignement séquentiel) est une manière de représenter deux ou plusieurs séquences de macromolécules biologiques (ADN, ARN ou protéines) les unes sous les autres, de manière à en faire ressortir les régions homologues ou similaires.

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Allan Wilson

Allan Charles Wilson, né le en Nouvelle-Zélande et mort le à Seattle, est un biochimiste néo-zélandais qui a accompli sa carrière aux États-Unis.

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Allozyme

On appelle allozymes (à ne pas confondre avec les isoenzymes) des enzymes codées par différents allèles d'un même gène.

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Arbre phylogénétique

archées en vert. Un arbre phylogénétique est un arbre schématique qui montre les relations de parenté entre des groupes d'êtres vivants.

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ARN ribosomique 16S

L'ARN ribosomique 16S (ARNr 16S) est l'ARN ribosomique constituant la petite sous-unité des ribosomes des procaryotes.

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ARN ribosomique 18S

L'ARN ribosomique 18S est l'ARN ribosomique constituant la petite sous-unité 40S des ribosomes d'eucaryotes.

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ARN ribosomique 23S

pmc.

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ARN ribosomique 28S

pmc.

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Émile Zuckerkandl

Émile Zuckerkandl, né le à Vienne (Autriche) et décédé le, est un biologiste français d'origine autrichienne considéré comme l'un des fondateurs du domaine de l'évolution moléculaire.

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Évolution (biologie)

En biologie, l’évolution est la transformation du monde vivant au cours du temps, qui se manifeste par des changements phénotypiques des organismes à travers les générations.

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Barcoding moléculaire

Principes du barre-codage de l'ADN Le barcoding moléculaire, ou codage à barres de l'ADN.

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Charles Gald Sibley

Charles Gald Sibley, né le à Fresno en Californie, mort le à Santa Rosa en Californie, est un biologiste moléculaire et ornithologue américain.

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Cladistique

La cladistique (ou systématique phylogénétique) est l'étude des apparentements des êtres vivants selon la théorie des clades, et la reconstruction des relations de parenté entre eux au moyen de cladogrammes (du grec ancien, « branche »).

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Classification phylogénétique

La classification phylogénétique ou classification cladistique est une forme de classification des êtres vivants qui repose sur leur phylogénie.

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Convergence évolutive

La (ou évolution convergente) est le résultat de mécanismes évolutifs ayant conduit des espèces, soumises aux mêmes contraintes environnementales (niches écologiques similaires), à adopter indépendamment plusieurs traits physiologiques, morphologiques, parfois comportementaux semblables.

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Cytidine

La cytidine est une molécule appartenant à la famille des nucléosides, formée lorsqu'une molécule de cytosine et une molécule de ribose cyclique (ribofuranose) sont attachées via une liaison β-N1-glycosidique.

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David Mark Hillis

David Mark Hillis, né le à Copenhague, est un herpétologue et biologiste systématicien américain.

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De Boeck

De Boeck est l'une des plus anciennes maisons d'édition belges.

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Dernier ancêtre commun

En biologie de l'évolution, le concept de dernier ancêtre commun (DAC) à deux lignées d'êtres vivants, ou cénancêtre, correspond à l'espèce la plus récente que ces deux taxons ont pour ancêtre commun.

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Empreinte génétique

CODIS permettant la réalisation d'empreintes génétiques Une empreinte génétique, ou profil génétique, est le résultat d'une analyse génétique de l'ADN, rendant possible l'identification d'une personne à partir d'une petite quantité de ses tissus biologiques (bulbe de cheveu, sang, salive, sécrétion vaginale, sperme).

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Eukaryota

Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.

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Frederick Sanger

Frederick Sanger (à Rendcomb, Royaume-Uni, et mort le à Cambridge) est un biochimiste anglais qui a reçu deux prix Nobel de chimie (en 1958, et en 1980 pour sa méthode de séquençage de l'ADN).

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Génétique

De la molécule d'ADN à la cellule vivante. Le nom de génétique vient de l'adjectif grec, qui qualifie « ce qui est en rapport aux fonctions de génération ».

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Génome mitochondrial

Les mitochondries sont des organites présents dans la grande majorité des cellules eucaryotes qui seraient issues de l'endosymbiose d'une alpha-protéobactérie, il y a environ deux milliards d'années (théorie endosymbiotique).

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Graphe (mathématiques discrètes)

Dans le domaine des mathématiques discrètes, la théorie des graphes définit le graphe, une structure composée d'objets et de relations entre deux de ces objets.

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Guanosine

La guanosine est un nucléoside, formée d'une guanine liée à un cycle ribose (ribofuranose) par une liaison glycosidique β-N9.

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Herpétologie

L’herpétologie (du ἑρπετόν herpetón, « qui rampe, reptile »), ou erpétologie, est la branche de l'histoire naturelle qui traite des amphibiens et des reptiles.

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Homologie (évolution)

En biologie de l'évolution, une homologie désigne un lien évolutif entre deux traits (en général anatomiques) observés chez deux espèces différentes, qui est dû au fait que toutes deux l'ont hérité d'un ancêtre commun.

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Horloge moléculaire

En génétique, l'hypothèse de l'horloge moléculaire est une hypothèse selon laquelle les mutations génétiques s'accumulent dans un génome à une vitesse constante.

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Immunodiffusion

L'Immunodiffusion ou IMD est un test diagnostique qui implique la diffusion d'anticorps ou d'antigènes à travers une substance solide gélifiée comme l'agar-agar.

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Inférence bayésienne

Illustration comparant les approches fréquentiste et bayésienne (Christophe Michel, 2018). L’inférence bayésienne est une méthode d'inférence statistique par laquelle on calcule les probabilités de diverses causes hypothétiques à partir de l'observation d'événements connus.

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Isoenzyme

Analogues de créatine kinase Les isoenzymes (ou isozymes) sont des enzymes présentant une séquence d'acides aminés différente d'une autre enzyme mais catalysant la même réaction chimique.

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Jon Edward Ahlquist

Jon Edward Ahlquist, né le et mort le à Huntsville, est un biologiste évolutionniste et un ornithologue américain.

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Joseph Felsenstein

Joseph (« Joe ») Felsenstein, né le, est un phylogénéticien et biologiste de l'évolution américain.

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Linus Pauling

Linus Carl Pauling (à Portland, Oregon, États-Unis - à Big Sur, Californie) est un chimiste et physicien américain.

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Macromolécule

Une macromolécule (ou molécule polymère) est une très grande molécule, qui possède une masse moléculaire relativement élevée.

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Maximum de parcimonie

Les méthodes de maximum de parcimonie, ou plus simplement méthodes de parcimonie ou encore parcimonie de Wagner, sont une méthode statistique non-paramétrique très utilisée, notamment pour l'inférence phylogénétique.

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Maximum de vraisemblance

En statistique, l'estimateur du maximum de vraisemblance est un estimateur statistique utilisé pour inférer les paramètres de la loi de probabilité d'un échantillon donné en recherchant les valeurs des paramètres maximisant la fonction de vraisemblance.

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Médecine légale

La médecine légale est une spécialité de la médecine qui consiste à constater et évaluer des lésions de victimes, vivantes ou décédées, et aider la justice.

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Méthode probabiliste

La méthode probabiliste est une méthode non constructive, initialement utilisée en combinatoire et popularisée par Paul Erdős, pour démontrer l'existence d'un type donné d'objet mathématique.

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Monomère

En chimie, un monomère est une substance, le plus souvent organique, utilisée dans la synthèse des oligomères et des polymères au cours d'une réaction d'oligomérisation ou de polymérisation.

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Mutation génétique

Un exemple de mutation homéotique: une drosophile Antennapedia Une est une modification rare, accidentelle ou provoquée, de l'information génétique (séquence d’ADN ou d’ARN) dans le génome.

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Neighbour joining

En bio-informatique, le neighbour joining (ou neighbor joining, souvent abrégé NJ) est une méthode phénétique de reconstruction d'arbres phylogénétiques.

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Nucléotide

Un nucléotide est une molécule organique qui est composée d'une base nucléique (ou base azotée), d'un ose à cinq atomes de carbone, dit pentose, dont l'association forme un nucléoside, et enfin de un à trois groupes phosphate.

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Organisme (physiologie)

Les bactéries ''Escherichia coli'' sont des organismes unicellulaires. Un organisme (du grec organon, « instrument »), ou organisme vivant, est, en biologie et en écologie, un système vivant complexe, organisé et est le produit de variations successives au cours de l'évolution.

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Ornithologie

"Étude de tête d'oiseau" (1867) - les premiers pas vers l'ornithologie... (peinture de William Bouguereau - XIXe siècle) Lornithologie (du grec ancien, « oiseau » et, « parole, discours ») est la branche de la zoologie qui a pour objet l'étude des oiseaux.

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Phylogénie

La phylogenèse ou phylogénie, du grec ancien, « tribu, famille, clan » et, « genèse », est l'étude des liens de parenté (relations phylogénétiques ou phylétiques) entre les êtres vivants et ceux qui ont disparu.

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Phylogénomique

La phylogénomique désigne la rencontre de deux champs de recherche: la phylogénie et la génomique.

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Plaste

Le plaste, appelé aussi plastide, est un organite présent dans les cellules des eucaryotes chlorophylliens (algues et plantes).

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Polymère

Fibres de polyester observées au Microscopie électronique à balayage. renforts. Les polymères (étymologie: du grec polus, plusieurs, et meros, partie) constituent une classe de matériaux.

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Primates

Les Primates– du latin, signifiant – constituent un ordre de mammifères placentaires.

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Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Réaction en chaîne par polymérase

Diagramme des quatre premiers cycles de la PCR. Lamplification en chaîne par polymérase (ACP) ou réaction de polymérisation en chaîne, généralement siglée PCR (de l'polymerase chain reaction) est une méthode de biologie moléculaire permettant d'obtenir rapidement, in vitro, un grand nombre de segments d'ADN identiques, à partir d'une séquence initiale.

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Réseau phylogénétique

Un réseau phylogénétique est un graphe utilisé pour visualiser les relations liées à l'évolution entre des espèces ou des organismes.

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Réversion

La réversion est, en génétique, plus précisément dans le domaine de la biologie de l'évolution, le retour d'un caractère à un état primitif se manifestant par une mutation génique dans l'ADN permettant de retrouver les fonctions d'un gène après qu'il les a perdues à la suite d'une première mutation.

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Ribosome

Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux) (REG) (6) Appareil de Golgi (7) Cytosquelette (8) Réticulum endoplasmique lisse (9) Mitochondries (10) Vacuole (absent des cellules animales) (11) Cytosol (12) Lysosome (13) Centrosome (constitué de deux centrioles) (14) Membrane plasmique Les ribosomes sont des complexes ribonucléoprotéiques présents dans les cellules eucaryotes et procaryotes.

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Sélection naturelle

texte.

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Séquençage

En biochimie, le séquençage consiste à déterminer l'ordre linéaire des composants d'une macromolécule (les acides aminés d'une protéine, les nucléotides d'un acide nucléique comme l'ADN, les monosaccharides d'un polysaccharide, etc.). En génétique, le séquençage concerne la détermination de la séquence des gènes voire des chromosomes, voire du génome complet, ce qui techniquement revient à effectuer le séquençage de l'ADN constituant ces gènes ou ces chromosomes.

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Séquençage de l'ADN

Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné.

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Séquence biologique

Une séquence biologique est la description de l'enchaînement des éléments (ou monomères) qui constituent une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine.

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Statistiques non paramétriques

La statistique non paramétrique est un domaine de la statistique qui ne repose pas sur des familles de loi de probabilité paramétriques.

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Système immunitaire

Un lymphocyte, principale composante du système immunitaire adaptatif des vertébrés. Le système immunitaire d'un organisme est un système biologique complexe constitué d'un ensemble coordonné d'éléments de reconnaissance et de défense qui discrimine le soi du non-soi.

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Systématique

La systématique (spécifiquement: biosystématique ou systématique biologique) est une discipline des sciences naturelles et de l'histoire naturelle, qui a pour objet d'inventorier tous les organismes vivants, existants ou ayant existé.

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Taxon

Genre 7-Espèce Un taxon est une entité conceptuelle qui regroupe tous les organismes vivants possédant en commun certains caractères taxinomiques ou diagnostiques bien définis.

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Thymidine

La thymidine, ou désoxythymidine, est un désoxyribonucléoside constitué de résidus de thymine et de combinés par une liaison glycosidique.

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Unweighted pair group method with arithmetic mean

UPGMA (Unweighted pair group method with arithmetic mean) est le nom d'un algorithme destiné à la construction d'un arbre phylogénétique.

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Redirections ici:

Phylogenie moleculaire, Phylogénie moléculaire.

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