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33 relations: Acide aminé protéinogène, Acide aspartique, Acide glutamique, Catalyse, Chaîne latérale, Chymotrypsine, Clivage (chimie), Cristallographie aux rayons X, Cystéine, Enzyme, Extrémité C-terminale, Feuillet bêta, Glutamine, Glycine (acide aminé), Histidine, Hydrolyse, Liaison peptidique, Peptidase, Peptide, Polyprotéine, Protéase à cystéine, Protéase à sérine, Prothrombine, Résidu (biochimie), Séquence biologique, Sérine, Substrat enzymatique, Tonneau bêta, Triade catalytique, Trypsine, Tyrosine, Virus, Virus de la gravure du tabac.
Acide aminé protéinogène
groupe aldéhyde sur l'atome d'azote de l'amine primaire Un acide aminé protéinogène est un acide aminé incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.
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Acide aspartique
L’acide aspartique (abréviations IUPAC-IUBMB: Asp et D), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAU et GAC.
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Acide glutamique
L'acide glutamique (abréviations IUPAC-IUBMB: Glu et E), ou glutamate sous la forme anionique de l'acide glutamique, est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAA et GAG.
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Catalyse
Intérieur du musée de la catalyse à Widnes en Angleterre. En chimie, la catalyse (du nom grec:, « dissolution. ») se réfère à l'accélération ou la réorientation de la cinétique de réaction au moyen d'un catalyseur, et dans certains cas à la sélectivité pour diriger la réaction dans un sens privilégié (réaction concurrente, production d'un produit plutôt qu'un autre).
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Chaîne latérale
acides aminés protéinogènes ont la même base, mais chacun a une chaîne latérale différente. En chimie organique et en biochimie, une chaîne latérale est une partie de molécule rattachée au cœur ou à la chaîne principale de la structure.
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Chymotrypsine
La chymotrypsine est une peptidase digestive sécrétée par le pancréas, de la famille des protéases à sérine, qui catalyse des protéolyses.
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Clivage (chimie)
Le clivage d'une liaison chimique ou sa scission ou sa dissociation ou encore sa rupture est l'ouverture de cette liaison.
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Cristallographie aux rayons X
La cristallographie aux rayons X, radiocristallographie ou diffractométrie de rayons X (DRX, on utilise aussi souvent l'abréviation anglaise XRD pour X-ray diffraction) est une technique d'analyse fondée sur la diffraction des rayons X par la matière, particulièrement quand celle-ci est cristalline.
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Cystéine
La cystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Cys et C), du grec ancien (« vessie »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UGU et UGC.
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Enzyme
stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.
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Extrémité C-terminale
Structure d'un tétrapeptide (valine, glycine, sérine, alanine). L'extrémité C-terminale, à droite, est indiquée en bleu. L'extrémité C-terminale, aussi appelée extrémité carboxy-terminale, extrémité COOH ou terminaison carboxyle, est l'une des deux extrémités d'une protéine ou d'un peptide qui sont des polymères linéaires.
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Feuillet bêta
Les feuillets β ou feuillets β plissés est la deuxième forme de structure secondaire régulière observée dans les protéines, avec une fréquence de présence plus faible que les hélices α.
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Glutamine
La glutamine (abréviations IUPAC-IUBMB: Gln et Q) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CAA et CAG.
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Glycine (acide aminé)
La glycine (abréviations UICPA-UIBBM: Gly et G) est un α-aminé et l'un des vingt-deux acides aminés protéinogènes.
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Histidine
L'histidine (abréviations IUPAC-IUBMB: His et H), du grec ancien, (« mât de navire », « métier à tisser », « voile de navire »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, l'un des acides aminés essentiels et fait partie des acides aminés glucoformateur.
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Hydrolyse
Une hydrolyse (du grec hydro: eau et lysis: briser) est une réaction chimique et enzymatique dans laquelle une liaison covalente est rompue par action d'une molécule d'eau.
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Liaison peptidique
Une liaison peptidique est une liaison covalente qui s'établit entre la fonction carboxyle portée par le carbone α d'un acide aminé et la fonction amine portée par le carbone α de l'acide aminé suivant dans la chaîne peptidique.
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Peptidase
Coupure protéolytique d'une chaîne peptidique Les peptidases (ou protéases ou enzymes protéolytiques) sont des enzymes qui brisent les liaisons peptidiques des protéines.
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Peptide
Exemple de peptide. Exemple de peptide. Exemple de peptide. Un peptide est un polymère d’acides aminés reliés entre eux par des liaisons peptidiques.
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Polyprotéine
''Capsid/Coat Protein''. Une polyprotéine est un long polypeptide produit par certains virus et à partir duquel les protéines virales sont produites sous l'action d'endopeptidases déjà présentes dans le virus ou la cellule hôte infectée.
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Protéase à cystéine
Une protéase à cystéine, ou parfois protéase à thiol, est une peptidase dont le résidu d'acide aminé nucléophile de la triade (ou diade) catalytique est une cystéine.
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Protéase à sérine
catalytique des protéases à sérine. Les protéases à sérine sont une famille de protéases, ou peptidases, qui partagent le même mécanisme d'action.
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Prothrombine
La prothrombine ou facteur est une protéine de la coagulation sanguine.
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Résidu (biochimie)
acides aminés. En biochimie et en biologie moléculaire, un résidu est la partie d'une molécule, généralement un monomère, qui est restée inchangée après être entrée dans la composition d'une biomolécule complexe ou d'un polymère.
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Séquence biologique
Une séquence biologique est la description de l'enchaînement des éléments (ou monomères) qui constituent une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine.
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Sérine
La sérine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ser et S) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UCU, UCC, UCA, UCG, AGU et AGC.
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Substrat enzymatique
En enzymologie, on désigne par substrat enzymatique toute molécule subissant une réaction chimique catalysée par une enzyme (ex: l'amidon est hydrolysé par l'amylase en glucose).
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Tonneau bêta
1A0S). 1BRP). Un tonneau β est une structure protéique constituée d'un grand feuillet β qui se tord et s'enroule pour former une structure quasi cylindrique fermée par des liaisons hydrogène.
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Triade catalytique
base) et la cystéine (nucléophile). En biologie moléculaire, on désigne généralement par triade catalytique les trois résidus d'acides aminés qui interviennent ensemble dans le site actif de certaines hydrolases et transférases telles que des peptidases, des amidases, des estérases, des lipases et des β-lactamases.
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Trypsine
La trypsine est une peptidase du suc pancréatique participant à la digestion des protéines.
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Tyrosine
La tyrosine (abréviations IUPAC-IUBMB: Tyr et Y) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, codé sur les ARN messagers par les codons UAU et UAC.
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Virus
Un virus est un agent infectieux nécessitant un hôte, souvent une cellule, dont les constituants et le métabolisme déclenchent la réplication.
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Virus de la gravure du tabac
Le virus de la gravure du tabac (ou TEV, acronyme de Tobacco etch virus) est un phytovirus du genre Potyvirus (famille des Potyviridae).
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