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Protéine de liaison à l'ADN

Indice Protéine de liaison à l'ADN

1RVA). Une protéine de liaison à l'ADN est une protéine comportant un domaine de liaison à l'ADN et qui possède donc une affinité pour l'ADN monocaténaire ou bicaténaire (en double hélice).

62 relations: Acétylation, Acide, Acide aminé protéinogène, Acide désoxyribonucléique, Acide nucléique, Acide ribonucléique, ADN B, Affinité (biochimie), ARN polymérase, Base (chimie), Base azotée, Bicaténaire, Brin d'acide nucléique, Cellule (biologie), Chromatine, Chromosome, Coloration Hoechst, DAPI, Différenciation cellulaire, Doigt de zinc, Domaine de liaison à l'ADN, Double hélice, EcoRV, Eukaryota, Facteur de transcription, Gène, Génome, Glissière à leucine, Hélice-coude-hélice, Histone, Homo sapiens, Liaison ionique, Ligand (biologie), Méthylation, Modification post-traductionnelle, Monocaténaire, Motif structurel, Nétropsine, Noyau (biologie), Nucléase, Nucléosome, Organisme (physiologie), Ose, Paire de bases, Parasiticide, Pentamidine, Phosphate, Phosphorylation, Polyamide, Polymérase, ..., Prokaryota, Promoteur (biologie), Protéine, Protéine de réplication A, Réparation de l'ADN, Réplication de l'ADN, Résidu (biochimie), Recombinaison génétique, Séquence (acide nucléique), Tige-boucle, Transcription (biologie), Transduction de signal. Développer l'indice (12 plus) »

Acétylation

L'acétylation est une réaction qui introduit un groupe fonctionnel acétyle dans un composé organique.

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Acide

Un acide est un composé chimique minéral ou organique accepteur, au sens large, de doublets électroniques.

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Acide aminé protéinogène

groupe aldéhyde sur l'atome d'azote de l'amine primaire Un acide aminé protéinogène est un acide aminé incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.

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Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide nucléique

Un acide nucléique (désoxyribonucléique ou ribonucléique) est un assemblage de macromolécules, un polymère, dont l’unité de base, ou monomère, est un nucléotide et dont les nucléotides sont reliés entre eux par des liaisons phosphodiesters.

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Acide ribonucléique

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ADN B

Grand et petit sillons de l'ADN B. L'ADN B est la forme a priori la plus courante de la double hélice d'ADN constituant le matériel génétique des cellules vivantes.

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Affinité (biochimie)

En biochimie, l'affinité décrit la force d'une interaction non covalente entre une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéines, et un ligand qui se fixe sur un site à sa surface.

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ARN polymérase

L'ARN polymérase est un complexe enzymatique responsable de la synthèse de l'acide ribonucléique, ou ARN, à partir d'une matrice d'ADN.

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Base (chimie)

Bouteille d'ammoniaque à 25-28%. Une base est un produit chimique qui, à l'inverse d'un acide, est capable de capturer un ou plusieurs protons ou, réciproquement, de fournir des électrons.

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Base azotée

Les bases azotées, ou bases nucléiques, ou bases nucléotidiques, voire nucléobases, sont des composés organiques azotés présents dans les acides nucléiques sous forme de nucléotides dans lesquels elles sont liées à un ose, le ribose dans le cas de l'ARN et le désoxyribose dans le cas de l'ADN.

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Bicaténaire

Un bicaténaire ou double brin (db, en anglais double strand, ds) est une molécule d'acide D-désoxyribonucléique (ADN) ou une molécule d'acide D-ribonucléique (ARN) double brin.

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Brin d'acide nucléique

Les molécules d'acides nucléiques peuvent être assimilées à de long brins ou fil, mais à une échelle atomique.

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Cellule (biologie)

consulté le.

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Chromatine

Compaction de l'ADN au sein de la chromatine. De gauche à droite: l'ADN, le nucléosome, le nucléofilament, la fibre de 30 nm et le chromosome métaphasique. La chromatine est la structure au sein de laquelle l'ADN se trouve empaqueté et compacté dans le volume limité du noyau des cellules eucaryotes.

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Chromosome

Description de la structure d'un chromosome. Un chromosome (du grec ancien, « couleur » et, « corps, élément ») est un élément microscopique constitué d'une molécule d'ADN et de protéines, les histones et les protéines non histones.

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Coloration Hoechst

Structure chimique du colorant Hoechst. Les colorants Hoechst font partie de la famille des colorants à l'aide de marqueurs fluorescents utilisés pour marquer l'ADN.

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DAPI

Le DAPI ou 4',6-diamidino-2-phénylindole est une molécule fluorescente capable de se lier fortement aux bases adénine (A) et thymine (T) de l'ADN.

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Différenciation cellulaire

La différenciation cellulaire est un concept de biologie du développement décrivant le processus par lequel les cellules se spécialisent en un « type » cellulaire avec une structure et une composition spécifiques permettant d'accomplir une ou plusieurs fonctions particulières.

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Doigt de zinc

Dessin représentant le doigt de zinc Cys2His2, consistant en une hélice alpha et un feuillet bêta aux brins antiparallèles. L'ion zinc est en vert, complexé à deux histidines (en bas) et deux cystéines (en haut, soufre en doré) Les doigts de zinc sont de petits motifs structuraux trouvés dans les protéines et capables d'ordonner en complexe un ou plusieurs ions zinc pour stabiliser leur repliement.

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Domaine de liaison à l'ADN

Un domaine de liaison à l'ADN (ou DBD de l'anglais DNA-binding domain) est un motif protéique qui est capable de lier à l'ADN double ou simple brin avec une affinité pour une séquence nucléotidique spécifique, ou une affinité relative à l'ADN.

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Double hélice

ADN B bicaténaire, soulignant le grand sillon et le petit sillon. En biologie moléculaire, la double hélice est la structure secondaire de l'ADN bicaténaire découverte grâce aux travaux de cristallographie aux rayons X réalisés par Rosalind Franklin avec l'aide de Raymond Gosling, à travers son ouvrage, publié en 1968.

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EcoRV

séquence clivée par l'endonucléase EcoRV. L'endonucléase EcoRV (prononcer « eco-R5 ») est une enzyme de restriction de type présente chez certaines souches dEscherichia coli.

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Eukaryota

Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.

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Facteur de transcription

Schéma simplifié du mécanisme d'un activateur. Un facteur de transcription est une protéine nécessaire à l'initiation ou à la régulation de la transcription d'un gène dans l'ensemble du vivant (procaryote ou eucaryote).

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Gène

Un gène, du grec ancien (« génération, naissance, origine »), est, en biologie, une séquence discrète et héritable de nucléotides dont l'expression affecte les caractères d'un organisme.

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Génome

Le génome (//), ou plus rarement génôme, est l'ensemble du matériel génétique d'une espèce codé dans son acide désoxyribonucléique (ADN), à l'exception de certains virus dont le génome est constitué d'acide ribonucléique (ARN).

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Glissière à leucine

résidus de leucines sont représentés en rouge, faisant apparaître l'interaction de leur chaîne latérale isobutane. Une glissière à leucine, ou leucine zipper en anglais, est un domaine fonctionnel tridimensionnel courant des protéines.

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Hélice-coude-hélice

1LMB). Un domaine hélice-coude-hélice (HTH, ou Helix-Turn-Helix en anglais) est un élément de structure secondaire des protéines et un motif structurel important des protéines de liaison à l'ADN.

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Histone

Les histones sont des protéines localisées dans le noyau des cellules eucaryotes et dans les archées.

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Homo sapiens

Homo sapiens, plus communément appelé « homme moderne », « homme », « humain », ou « être humain », est une espèce de primates originaire d'Afrique qui s'est aujourd'hui répandue et naturalisée sur l'ensemble de la planète hormis l'Antarctique.

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Liaison ionique

Une liaison ionique (ou liaison électrovalente) est un type de liaison chimique qui peut être formé par une paire d'atomes possédant une grande différence d'électronégativité (par convention, supérieure à 1,7) typiquement entre un non-métal et un métal.

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Ligand (biologie)

Myoglobine en bleu lié à son ligand hème en orange. En biologie, un ligand (du latin ligandum, liant) est une molécule qui se lie de manière réversible à une macromolécule ciblée, protéine ou acide nucléique, jouant en général un rôle fonctionnel: stabilisation structurale, catalyse, modulation d'une activité enzymatique, transmission d'un signal.

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Méthylation

La méthylation est l'addition d'un groupe méthyle, le phénomène inverse étant la déméthylation.

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Modification post-traductionnelle

Une modification post-traductionnelle est une modification chimique d'une protéine, réalisée le plus souvent par une enzyme, après sa synthèse ou au cours de sa vie dans la cellule.

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Monocaténaire

Monocaténaire ou simple brin (sb, en anglais single strand, ss) définit une molécule d'acide nucléique (ADN ou ARN) non appariée à une autre molécule complémentaire.

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Motif structurel

Motif structurel En biochimie, un motif structurel, également écrit motif structural, est un arrangement tridimensionnel d'au moins deux structures secondaires de biopolymères, tels que des protéines ou des acides nucléiques, ayant une signification fonctionnelle ou faisant partie d'un domaine protéique John Kuriyan, The Molecules of Life: Physical and Chemical Principles, Garland Science, 2012,.

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Nétropsine

La nétropsine, également appelée congocidine et sinanomycine, est un polyamide pourvu d'une activité antibiotique et antivirale.

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Noyau (biologie)

En biologie cellulaire, le noyau est une structure cellulaire présente dans la majorité des cellules eucaryotes et chez tous les organismes eucaryotes, et contenant l'essentiel du matériel génétique de la cellule (ADN).

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Nucléase

Une nucléase est une hydrolase qui clive les liaisons phosphodiester de brins d'acides nucléiques entre deux nucléotides.

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Nucléosome

Schéma de trois '''nucléosomes''' mis bout à bout, formant une partie d'un nucléofilament de 11 nm. Le nucléosome est un complexe comportant un segment d’ADN de 146 ou 147 paires de nucléotides, enroulé autour d'un cœur formé de protéines (les histones).

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Organisme (physiologie)

Les bactéries ''Escherichia coli'' sont des organismes unicellulaires. Un organisme (du grec organon, « instrument »), ou organisme vivant, est, en biologie et en écologie, un système vivant complexe, organisé et est le produit de variations successives au cours de l'évolution.

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Ose

Un ose (ou monosaccharide) est un monomère de glucide.

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Paire de bases

Paire de base GC avec ses 3 liaisons hydrogène intermoléculaires Paire de base AT avec ses 2 liaisons hydrogène intermoléculaires Les paires de bases (en gris clair) relient les deux brins de l'ADN (en gris foncé) Une paire de bases est l'appariement de deux bases nucléiques situées sur deux brins complémentaires d'ADN ou ARN.

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Parasiticide

Un parasiticide ou antiparasitaire est un produit chimique capable de détruire (tuer) les parasites.

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Pentamidine

La pentamidine est un médicament antiparasitaire de la famille des trypanicides.

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Phosphate

Atlas mondial des océans).. Phosphate dans une coupelle. Un phosphate est un composé dérivé de l'acide phosphorique par perte ou substitution d'un ou plusieurs atomes d'hydrogène, par d'autres atomes ou groupes fonctionnels.

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Phosphorylation

chaîne latérale de sérine phosphorylée. Les atomes d'oxygène sont en rouge, ceux de phosphore, en orange, le carbone en gris et l'azote en bleu. Les atomes d'hydrogène ne sont pas représentés. La phosphorylation est l'addition d'un groupe phosphate (un phosphoryl PO32− plus précisément) qui est transféré à une protéine ou à une petite molécule, tel le glucose, l'adénine ou les glycérolipides.

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Polyamide

Un polyamide (PA) est un polymère contenant des fonctions amide \mathrm pouvant résulter de la polycondensation entre les fonctions acide carboxylique et amine.

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Polymérase

Les polymérases sont des enzymes qui ont pour rôle la synthèse d'un brin de polynucléotides (ADN ou ARN), le plus souvent en utilisant un brin complémentaire comme matrice et des nucléotides triphosphate (NTP ou dNTP) comme monomères.

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Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Promoteur (biologie)

Un promoteur, ou séquence promotrice, est une région de l'ADN située à proximité d'un gène et indispensable à la transcription de l'ADN en ARN.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Protéine de réplication A

La protéine de réplication A (RPA) est une protéine de liaison à l’ADN simple brin présente chez les organismes eucaryotes.

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Réparation de l'ADN

Chromosomes montrant de nombreuses lésions. La réparation de l'ADN est un ensemble de processus par lesquels une cellule identifie et corrige les dommages aux molécules d'ADN qui codent son génome.

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Réplication de l'ADN

vignette La réplication de l'ADN, aussi appelée duplication de l'ADN ou synthèse de l'ADN, est le processus au cours duquel l'ADN est synthétisé.

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Résidu (biochimie)

acides aminés. En biochimie et en biologie moléculaire, un résidu est la partie d'une molécule, généralement un monomère, qui est restée inchangée après être entrée dans la composition d'une biomolécule complexe ou d'un polymère.

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Recombinaison génétique

La est.

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Séquence (acide nucléique)

ARN messager faisant apparaître ses codons. La séquence d'un acide nucléique — ADN ou ARN — est la succession des nucléotides qui le constituent.

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Tige-boucle

Structure en tige et boucle formée par une séquence répétée inversée sur l'ARN. Une tige-boucle (ou "structure en tige et boucle"), également connue sous le nom de structure en épingle à cheveux, est une structure intramoléculaire qui se forme sur un brin d'acide nucléique.

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Transcription (biologie)

En biologie moléculaire, la transcription est la première étape de l'expression génique basée sur l'ADN, au cours de laquelle un segment particulier d'ADN est « copié » en ARN par une enzyme appelée ARN polymérase.

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Transduction de signal

La transduction de signal désigne le mécanisme par lequel une cellule répond à l'information qu'elle reçoit, par des agents chimiques ou autres signaux (tension,...). Elle commande une cascade de signaux secondaires, internes à la cellule (« signalling ») ou externes (ex: action sur d'autres types cellulaires via des interleukines), et des processus cellulaires internes (métabolisme, cycle cellulaire, motilité,...). La transduction est la deuxième étape de ce que l'on appelle la cascade de signalisation.

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