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Pyroséquençage

Indice Pyroséquençage

Le pyroséquençage est une technique de séquençage de l'ADN qui permet d’effectuer un séquençage rapide et à moindre coût qu’un séquençage par la méthode de Sanger.

34 relations: Acide désoxyribonucléique, Adénine, Adénosine triphosphate, ADN polymérase, Amorce (génétique), Analyse génétique, Apyrase, Biologie moléculaire, Brin transcrit, Capteur photographique CCD, Chimiluminescence, Clonage, Correction sur épreuves (biologie), Cytosine, DNTP, Enzyme, Génome, Génomique, Guanine, Luciférase, Luciférine, Microfabrication, Mostafa Ronaghi, Nucléotide, Phylogénétique moléculaire, Puce à ADN, Pyrophosphate, Séquençage, Séquençage 454, Séquençage de l'ADN, Séquence répétée, Streptavidine, Thymine, 3'-Phosphoadénosine 5'-phosphosulfate.

Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Adénine

L'adénine est un composé organique de formule brute C5H5N5, appartenant à la famille des purines.

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Adénosine triphosphate

L’adénosine triphosphate, ou ATP, est un nucléotide formé à partir d'un nucléoside associé à un triphosphate.

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ADN polymérase

La réplication de l'ADN par une ADN polymérase. Une ADN polymérase est une enzyme faisant partie du complexe enzymatique intervenant dans la réplication de l’ADN au cours du cycle cellulaire lors de la phase S, mais aussi dans des processus de réparation et de recombinaison de l'ADN.

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Amorce (génétique)

En biologie moléculaire, l'amorce est une courte séquence d'ARN ou d'ADN, complémentaire du début d'une matrice, servant de point de départ à la synthèse du brin complémentaire de cette dernière matrice par une ADN polymérase.

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Analyse génétique

Une analyse génétique est une technique d'analyse du génome des cellules d'un organisme.

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Apyrase

L'apyrase est une hydrolase qui catalyse les réactions.

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Biologie moléculaire

La biologie moléculaire (parfois abrégée bio. mol.) est une discipline scientifique de la vie au croisement de la génétique, de la biochimie métabolique et de la physique, dont l'objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau moléculaire.

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Brin transcrit

Le brin transcrit, ou brin matrice, (anglais: template strand) est le morceau de copie d’ADN qui est utilisé pour effectuer la transcription de l’ADN en ARN.

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Capteur photographique CCD

Capteur photographique CCD pour l'imagerie astronomique. Un capteur photographique CCD est un capteur photographique basé sur un dispositif à transfert de charges (charge coupled device, CCD).

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Chimiluminescence

Une réaction chimioluminescente. La chimiluminescence, ou chimioluminescence, est la production de lumière à la suite d'une réaction chimique.

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Clonage

Le clonage désigne principalement deux processus.

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Correction sur épreuves (biologie)

La correction sur épreuves ou proof-reading en anglais désigne en génétique les procédés de correction d'erreurs apparaissant lors de la réplication de l'ADN.

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Cytosine

La cytosine est une base nucléique, et plus exactement une base pyrimidique (voir aussi ADN et ARN).

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DNTP

Un dNTP est un désoxyribonucléoside triphosphate quelconque.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Génome

Le génome (//), ou plus rarement génôme, est l'ensemble du matériel génétique d'une espèce codé dans son acide désoxyribonucléique (ADN), à l'exception de certains virus dont le génome est constitué d'acide ribonucléique (ARN).

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Génomique

La génomique est une discipline de la biologie moderne.

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Guanine

La guanine est une base nucléique, et plus exactement une base purique (voir aussi ADN et ARN).

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Luciférase

Les luciférases sont les enzymes clés de la réaction de bioluminescence.

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Luciférine

Représentation topologique de la luciférine de luciole Les luciférines sont des molécules dont l'oxydation, sous le contrôle d'une enzyme, la luciférase, aboutit à la formation d'oxyluciférine et à l'émission de photons.

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Microfabrication

consulté le.

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Mostafa Ronaghi

Mostafa Ronaghi (en, né en 1968) est un biologiste moléculaire iranien, spécialisé dans la méthodologie de séquençage de l'ADN.

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Nucléotide

Un nucléotide est une molécule organique qui est composée d'une base nucléique (ou base azotée), d'un ose à cinq atomes de carbone, dit pentose, dont l'association forme un nucléoside, et enfin de un à trois groupes phosphate.

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Phylogénétique moléculaire

Séquençage moléculaire La phylogénétique moléculaire est l'utilisation de séquences de macromolécules biologiques pour obtenir des informations sur l'histoire évolutive des organismes vivants, et notamment sur leurs liens de parenté (leur phylogénie).

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Puce à ADN

Principe d'utilisation de la puce à ADN. Une puce à ADN est un ensemble de molécules d'ADN fixées en rangées ordonnées sur une petite surface qui peut être du verre, du silicium ou du plastique.

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Pyrophosphate

Anion pyrophosphate ou PPi. Les pyrophosphates (appelés aussi « diphosphates ») sont l'anion (base conjuguée), les sels et les esters de l'acide pyrophosphorique.

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Séquençage

En biochimie, le séquençage consiste à déterminer l'ordre linéaire des composants d'une macromolécule (les acides aminés d'une protéine, les nucléotides d'un acide nucléique comme l'ADN, les monosaccharides d'un polysaccharide, etc.). En génétique, le séquençage concerne la détermination de la séquence des gènes voire des chromosomes, voire du génome complet, ce qui techniquement revient à effectuer le séquençage de l'ADN constituant ces gènes ou ces chromosomes.

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Séquençage 454

Le séquençage 454 est une technique de séquençage de l'ADN basée sur l'amplification de l'ADN par PCR en émulsion et sur le pyroséquençage.

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Séquençage de l'ADN

Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné.

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Séquence répétée

Chez l'homme, les séquences répétées représentent 50 % du génome.

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Streptavidine

La streptavidine est une protéine de 52,8 kDa purifiée à partir de la bactérie Streptomyces avidinii.

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Thymine

La thymine est une base nucléique (base pyrimidique) entrant dans la constitution des nucléotides, composants de base (ou monomères) des acides nucléiques.

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3'-Phosphoadénosine 5'-phosphosulfate

La 3'-phosphoadénosine 5'-phosphosulfate, dont l'anion est couramment abrégé en PAPS, est un dérivé de l'AMP phosphorylé en position 3' et avec un groupe sulfate sur le phosphate de la position 5'.

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Redirections ici:

Pyrosequencage.

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