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Pyruvate déshydrogénase

Indice Pyruvate déshydrogénase

La pyruvate déshydrogénase (ou PDH) — à ne pas confondre avec la pyruvate décarboxylase bien qu'on l'appelle parfois également ainsi — est la première des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), constitué d'une décarboxylase, d'une acétyltransférase et d'une oxydoréductase intervenant séquentiellement pour catalyser la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA, réaction qui assure notamment la liaison entre la glycolyse et le cycle de Krebs.

45 relations: Acétaldéhyde, Acétyl-coenzyme A, Acétylation, Acétyltransférase, Acide glutamique, Acide pyruvique, Alcoolate, Alpha-Cétoglutarate déshydrogénase, Catalyse, Cétone, Coenzyme A, Cofacteur (biochimie), Complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase, Complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase, Complexe pyruvate déshydrogénase, Composé cyclique, Cycle de Krebs, Cytosine, Décarboxylase, Décarboxylation, Décarboxylation du pyruvate, Dihydrolipoamide S-acétyltransférase, Dihydrolipoyl déshydrogénase, Dioxyde de carbone, Enzyme, Fermentation alcoolique, Flavine adénine dinucléotide, Glycolyse, Hétérocycle, Liaison covalente, Liaison hydrogène, Lipoamide, Lysine, Magnésium, Nicotinamide adénine dinucléotide, Oxydoréductase, Potassium, Pyrophosphate de thiamine, Pyruvate décarboxylase, Pyruvate déshydrogénase kinase, Thiazole (groupe), Vitamine B1, Ylure, 1,3-dipôle, 3-Méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase.

Acétaldéhyde

L'acétaldéhyde (nom UICPA préféré), aussi appelé éthanal (nom UICPA systématique), aldéhyde acétique, éthyl aldéhyde ou oxoéthane, est un composé organique, un aldéhyde de formule chimique CH3CHO.

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Acétyl-coenzyme A

L'acétyl-coenzyme A, usuellement écrite acétyl-CoA, est la forme « activée » de l'acide acétique, c'est-à-dire le thioester que forme ce dernier avec la coenzyme A. C'est une molécule à haut potentiel d'hydrolyse située au carrefour de plusieurs voies métaboliques importantes.

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Acétylation

L'acétylation est une réaction qui introduit un groupe fonctionnel acétyle dans un composé organique.

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Acétyltransférase

Structure d'un groupe acétyle Une acétyltransférase (ou transacétylase) est une enzyme de type transférase qui transfère un groupe acétyle.

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Acide glutamique

L'acide glutamique (abréviations IUPAC-IUBMB: Glu et E), ou glutamate sous la forme anionique de l'acide glutamique, est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAA et GAG.

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Acide pyruvique

L’acide pyruvique est un composé chimique de formule.

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Alcoolate

Structure d'un alcoolate. Un alcoolate (ou alkoxyde), de formule R-O, est la base conjuguée d'un alcool.

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Alpha-Cétoglutarate déshydrogénase

L’α-cétoglutarate déshydrogénase, ou 2-oxoglutarate déshydrogénase (OGDH), est une oxydoréductase qui fait partie du complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase, dont elle est l'enzyme E1, complexe qui réalise la conversion de l'α-cétoglutarate en succinyl-CoA et 2: Plus précisément, l'enzyme E1 catalyse la fixation de l'α-cétoglutarate sur un lipoamide avec l'aide de thiamine pyrophosphate (TPP).

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Catalyse

Intérieur du musée de la catalyse à Widnes en Angleterre. En chimie, la catalyse (du nom grec:, « dissolution. ») se réfère à l'accélération ou la réorientation de la cinétique de réaction au moyen d'un catalyseur, et dans certains cas à la sélectivité pour diriger la réaction dans un sens privilégié (réaction concurrente, production d'un produit plutôt qu'un autre).

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Cétone

Cétone. Une cétone est un composé organique faisant partie de la famille des composés carbonylés, c'est-à-dire dont l'un des carbones porte un groupement carbonyle.

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Coenzyme A

La coenzyme A (CoA) est une coenzyme de transfert de groupements acyle intervenant dans de très nombreuses voies du métabolisme (cycle de Krebs, bêta-oxydation).

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Cofacteur (biochimie)

centres fer-soufre et hème. En biochimie, un cofacteur est un composé chimique non protéique mais qui est nécessaire à l'activité biologique d'une protéine, le plus souvent une enzyme.

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Complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase

Le complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase est l'association de trois enzymes — une décarboxylase, une acyltransférase et une oxydo-réductase — agissant séquentiellement dans cet ordre: |- | style.

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Complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase

Le complexe α-cétoglutarate déshydrogénase, également appelé complexe oxoglutarate déshydrogénase (OGDC), est l'association de trois enzymes — une décarboxylase, une acyltransférase et une oxydo-réductase — agissant séquentiellement dans cet ordre pour catalyser la réaction: |- align.

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Complexe pyruvate déshydrogénase

Le complexe pyruvate déshydrogénase (PDC) est l'association de trois enzymes intervenant séquentiellement pour catalyser la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA.

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Composé cyclique

Le benzène est un composé cyclique. En chimie organique, un composé cyclique est une substance dans laquelle au moins une série d'atomes, notamment de carbone, est liée de manière successive par des liaisons covalentes pour former un cycle (une molécule cyclique).

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Cycle de Krebs

Le cycle de Krebs, aussi appelé cycle des acides tricarboxyliques ou cycle de l'acide citrique par anglicisme, est une voie métabolique présente chez tous les organismes aérobies et dont la fonction première est d'oxyder les groupes acétyle, issus notamment de la dégradation des glucides, des lipides et des protéines, pour en récupérer l'énergie sous forme de huit électrons à haut potentiel de transfert et d'une molécule de GTP ou d'ATP; les électrons à haut potentiel de transfert, récupérés sur le NADH et l'ubiquinol (ou 10 réduite), circulent ensuite à travers la chaîne respiratoire pour former à leur tour des molécules d’ATP supplémentaires par la phosphorylation oxydative.

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Cytosine

La cytosine est une base nucléique, et plus exactement une base pyrimidique (voir aussi ADN et ARN).

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Décarboxylase

Les décarboxylases sont des groupes d'enzymes réalisant la décarboxylation d'acides aminés, d'α-cétaocides ou de β-cétoacides (2-cétoacides ou 3-cétoacides), c'est-à-dire qui catalysent une transformation chimique de ces acides aboutissant à la perte d'un groupe carboxyle (COO−).

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Décarboxylation

La décarboxylation est une réaction chimique au cours de laquelle une molécule de dioxyde de carbone est éliminée (généralement par chauffage) d'une molécule organique portant un groupe carboxyle, selon le schéma général suivant: \rm R-\color \color \xrightarrow\text R-H + CO_2.

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Décarboxylation du pyruvate

La décarboxylation du pyruvate, ou décarboxylation oxydative, est la réaction chimique catalysée par le complexe pyruvate déshydrogénase reliant la glycolyse au cycle de Krebs en convertissant le pyruvate en acétyl-CoA: |- align.

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Dihydrolipoamide S-acétyltransférase

La dihydrolipoamide S-acétyltransférase (E2), ou dihydrolipoyl transacétylase, est la deuxième des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), constitué d'une décarboxylase, d'une transacétylase et d'une réductase agissant séquentiellement dans la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA, réaction qui réalise notamment la liaison entre la glycolyse et le cycle de Krebs; les autres enzymes du complexe sont la pyruvate déshydrogénase (E1) et la dihydrolipoyl déshydrogénase (E3).

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Dihydrolipoyl déshydrogénase

La dihydrolipoyl déshydrogénase (DLD), également appelée dihydrolipoamide déshydrogénase, est la dernière des trois enzymes du complexe pyruvate déshydrogénase (PDC), du complexe alpha-cétoglutarate déshydrogénase et du complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase, constitués chacun d'une décarboxylase, d'une transacétylase et d'une réductase.

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Dioxyde de carbone

Le dioxyde de carbone, aussi appelé gaz carbonique ou anhydride carbonique, est un composé inorganique dont la formule chimique est, la molécule ayant une structure linéaire de la forme O.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Fermentation alcoolique

Bulles de gaz carbonique produites par la fermentation alcoolique du vin. La fermentation alcoolique est un processus biochimique par lequel des sucres (glucides, principalement le glucose) sont transformés en alcool (éthanol) dans un milieu liquide, privé d'air.

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Flavine adénine dinucléotide

La flavine adénine dinucléotide (FAD) est une coenzyme d'oxydo-réduction dérivant de la riboflavine (vitamine B2).

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Glycolyse

La glycolyse (γλῠκὖς glykýs « sucré » et λύσις lýsis « libération ») ou voie d'Embden-Meyerhof-Parnas est une voie métabolique d'assimilation du glucose et de production d'énergie.

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Hétérocycle

Carbocycle de la pyridine: chaque sommet est occupé par un atome, dont un est l'azote (N) et les cinq autres le carbone. Les hétérocycles ou composés hétérocycliques sont les composés organiques comportant un cycle constitué d'atomes d'au moins deux éléments différents.

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Liaison covalente

Une liaison covalente est une liaison chimique dans laquelle deux atomes se partagent deux électrons (un électron chacun ou deux électrons venant du même atome) d'une de leurs couches externes afin de former un doublet d'électrons liant les deux atomes.

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Liaison hydrogène

Liaison hydrogène entre des molécules d'eau. La liaison hydrogène ou pont hydrogène est une force intermoléculaire ou intramoléculaire impliquant un atome d'hydrogène et un atome électronégatif comme l'oxygène, l'azote et le fluor.

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Lipoamide

Le lipoamide est le nom trivial du 5-(1,2-dithiolan-3-yl)pentanamide qui contient un cycle dithiolane.

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Lysine

La lysine (abréviations IUPAC-IUBMB: Lys et K) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des neuf acides aminés essentiels pour l'homme.

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Magnésium

Le magnésium est l'élément chimique de numéro atomique 12, de symbole Mg.

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Nicotinamide adénine dinucléotide

Le nicotinamide adénine dinucléotide (NAD) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.

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Oxydoréductase

En biochimie, les oxydoréductases sont des enzymes catalysant les réactions d'oxydoréduction en transférant les ions H+ et des électrons.

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Potassium

Le potassium est l'élément chimique de numéro atomique 19, de symbole K (du latin kalium).

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Pyrophosphate de thiamine

Le Pyrophosphate de thiamine ou thiamine pyrophosphate (TPP) ou diphosphate de thiamine ou thiamine diphosphate (ThDP), est un dérivé de la 1, ou thiamine, qui se forme sous l'action d'une enzyme, la thiamine diphosphokinase.

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Pyruvate décarboxylase

La pyruvate décarboxylase — à ne pas confondre avec la pyruvate déshydrogénase — est une décarboxylase intervenant dans la fermentation alcoolique de la levure, notamment celle du genre Saccharomyces, dont Saccharomyces cerevisiae (levure de bière) est la plus connue.

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Pyruvate déshydrogénase kinase

La pyruvate déshydrogénase kinase ou PDHK est une classe d'enzymes inhibant la pyruvate déshydrogénase.

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Thiazole (groupe)

Les thiazoles sont une famille de composés organiques comportant un hétérocycle à cinq atomes, dont l'un est un atome d'azote, et un autre est un atome de soufre.

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Vitamine B1

La thiamine ou vitamine (ou encore aneurine) est une vitamine hydrosoluble de la famille des vitamines B que les animaux doivent trouver dans leur alimentation.

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Ylure

Un ylure est une espèce chimique moléculaire neutre et dipolaire dont un atome possède une charge formelle négative (il s'agit souvent d'un atome de carbone, la molécule étant dans ce cas un carbanion) tandis qu'un atome adjacent, de nature différente (généralement d'azote, de phosphore ou de soufre), possède une charge formelle positive, ces deux atomes ayant chacun leur octet complet d'électrons de valence.

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1,3-dipôle

Un 1,3-dipôle ou dipôle 1,3 est un type de composés organiques avec un système de 4 électrons-π délocalisés sur trois atomes.

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3-Méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase

La 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase, ou alpha-cétoisovalérate déshydrogénase, est une oxydoréductase faisant partie du complexe 3-méthyl-2-oxobutanoate déshydrogénase dont elle est l'enzyme E1.

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Redirections ici:

Pyruvate deshydrogenase.

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