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Sélénocystéine

Indice Sélénocystéine

La sélénocystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Sec et U) est un α-aminé non standard dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par le codon-stop opale UGA en présence d'une séquence d'insertion dite Selenocysteine Insertion Sequence.

71 relations: Acide aminé, Acide aminé protéinogène, Acide ribonucléique de transfert, Acide ribonucléique messager, Acide sélénophosphorique, Adénine, Adénosine diphosphate, Adénosine triphosphate, Analogue structurel, Anticodon, Archaea, Élément SECIS, Énantiomérie, Bactérie, Biosynthèse des protéines, Carence alimentaire en sélénium, Code génétique, Codon, Codon-stop, Cystéine, Eau, EF-Tu, Enzyme, Escherichia coli, Estérification, Eukaryota, Extrémité C-terminale, Extrémité N-terminale, Facteur d'élongation, Formiate déshydrogénase, Gène, Glutathion peroxydase, Glycine réductase, Groupe fonctionnel, Guanosine triphosphate, Iodothyronine désiodase, Méthylsélénocystéine, Modification post-traductionnelle, O-Phosphosérine, O-Phosphoséryl-ARNt:sélénocystéinyl-ARNt synthase, O-Phosphoséryl-ARNtSec kinase, Oxydoréductase, Phosphate, Polypeptide, Prokaryota, Protéine, Racémique, Ribosome, Sélénium, Séléniure, ..., Sélénocystéine synthase, Sélénol, Sélénophosphate synthase, Sélénoprotéine, Séquence (acide nucléique), Sérine, Sérine-ARNt ligase, Sec, Soufre, Tellure, Tellurocystéine, Thiol, Thiorédoxine réductase, Thyroxine 5'-désiodase, Thyroxine 5-désiodase, Tige-boucle, Traduction génétique, UGA, Union internationale de biochimie et de biologie moléculaire, Union internationale de chimie pure et appliquée, Université de Calgary. Développer l'indice (21 plus) »

Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

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Acide aminé protéinogène

groupe aldéhyde sur l'atome d'azote de l'amine primaire Un acide aminé protéinogène est un acide aminé incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.

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Acide ribonucléique de transfert

Les acides ribonucléiques de transfert, ou ARN de transfert ou ARNt, sont de courts ARN, longs de 75 à 95 nucléotides, qui interviennent lors de la synthèse des protéines dans la cellule.

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Acide ribonucléique messager

Représentation schématique de la synthèse et de la maturation d'un ARN messager dans une cellule eucaryote. L'acide ribonucléique messager, ARN messager, ou ARNm (en anglais, mRNA, pour messenger ribonucleic acid), est une molécule intermédiaire d'acide ribonucléique (ARN), consistant en une copie transitoire d'une portion de l'ADN correspondant à un ou plusieurs gènes d'un organisme biologique.

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Acide sélénophosphorique

L'acide sélénophosphorique est un composé chimique de formule O.

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Adénine

L'adénine est un composé organique de formule brute C5H5N5, appartenant à la famille des purines.

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Adénosine diphosphate

L'adénosine diphosphate ou ADP est un nucléotide.

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Adénosine triphosphate

L’adénosine triphosphate, ou ATP, est un nucléotide formé à partir d'un nucléoside associé à un triphosphate.

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Analogue structurel

En chimie, un analogue structurel, analogue chimique ou simplement analogue, est un composé ayant une structure chimique similaire à un autre composé, mais différant de celui-ci par un certain composant.

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Anticodon

L'anticodon est un groupe de trois nucléotides localisé dans la structure des ARN de transfert, qui joue un rôle important dans la traduction de l'ARNm lors de la biosynthèse des protéines.

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Archaea

sources chaudes volcaniques. Les archées ou Archaea (du grec ancien, « originel, primitif »), anciennement appelés archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries.

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Élément SECIS

bases nucléiques sur l'élément SECIS. Un élément SECIS, de l'anglais selenocysteine insertion structure, est un élément cis-régulateur d'ARN messager long d'une soixantaine de nucléotides caractérisé par sa forme en épingle à cheveux, ou « tige-boucle ».

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Énantiomérie

Les deux énantiomères du bromochlorofluorométhane. L’énantiomérie est une propriété de certaines molécules stéréoisomères, dont deux des isomères sont l'image l'un de l'autre dans un miroir plan, mais ne sont pas superposables.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Biosynthèse des protéines

ARN messager en protéine par un ribosome. ARN de transfert. L'anticodon est en rouge. ARNm. La biosynthèse des protéines est l'ensemble des processus biochimiques permettant aux cellules de produire leurs protéines à partir de leurs gènes afin de compenser les pertes en protéines par sécrétion ou par dégradation.

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Carence alimentaire en sélénium

La carence alimentaire en sélénium est un manque dans le corps de l'oligo-élément essentiel qu'est le sélénium.

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Code génétique

bases nucléiques; à droite, les codons correspondants, chacun spécifiant un acide aminé protéinogène. Le code génétique est l'ensemble des règles permettant de traduire les informations contenues dans le génome des cellules vivantes afin de synthétiser les protéines.

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Codon

Un codon est une séquence de trois nucléotides sur un acide ribonucléique messager (ARNm) spécifiant l'un des vingt-deux acides aminés protéinogènes dont la succession sur l'ARN messager détermine la structure primaire de la protéine à synthétiser.

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Codon-stop

alt.

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Cystéine

La cystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Cys et C), du grec ancien (« vessie »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UGU et UGC.

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Eau

L'eau est une substance chimique constituée de molécules.

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EF-Tu

La protéine EF-Tu est un facteur d'élongation procaryote qui joue un rôle essentiel dans la traduction génétique en s'associant aux ARNt aminoacylés qui apportent les acides aminés au ribosome.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Escherichia coli

Escherichia coli, en abrégée E. coli, est une bactérie intestinale des organismes à sang chaud, Gram négatif, du genre Escherichia, en forme de bâtonnet appelée parfois colibacille.

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Estérification

L'estérification est une réaction de chimie organique au cours de laquelle un groupe fonctionnel ester R1-COO-R2 est obtenu par condensation d'un groupe acide carboxylique R1-COOH et d'un groupe alcool R2-OH ainsi que formation d'eau H2O.

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Eukaryota

Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.

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Extrémité C-terminale

Structure d'un tétrapeptide (valine, glycine, sérine, alanine). L'extrémité C-terminale, à droite, est indiquée en bleu. L'extrémité C-terminale, aussi appelée extrémité carboxy-terminale, extrémité COOH ou terminaison carboxyle, est l'une des deux extrémités d'une protéine ou d'un peptide qui sont des polymères linéaires.

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Extrémité N-terminale

L'extrémité N-terminale (ou terminaison amine, terminaison aminée, terminaison N ou terminaison NH2) réfère à l’extrémité d'une protéine ou d'un polypeptide se terminant par un acide aminé avec une fonction amine libre (-NH2).

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Facteur d'élongation

Les facteurs d'élongation sont une famille d'enzymes qui interviennent dans la biosynthèse des protéines lors de l'ajout d'acides aminés à l'''C''-terminale de la chaîne polypeptidique naissante.

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Formiate déshydrogénase

Une formiate déshydrogénase est une oxydoréductase qui catalyse l'oxydation du formiate en dioxyde de carbone.

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Gène

Un gène, du grec ancien (« génération, naissance, origine »), est, en biologie, une séquence discrète et héritable de nucléotides dont l'expression affecte les caractères d'un organisme.

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Glutathion peroxydase

La glutathion peroxydase (GPx) est une sélénoprotéine ayant fonction d'enzyme, formée de quatre sous-unités contenant chacune un atome de sélénium incorporé dans une molécule de sélénocystéine (dans laquelle le soufre du groupement thiol de la cystéine est remplacé par le sélénium).

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Glycine réductase

La glycine réductase est une oxydoréductase qui catalyse la réaction: L'enzyme observée chez Eubacterium acidaminophilum est constituée de sous-unités A, B et C. La sous-unité B contient de la sélénocystéine et un résidu pyruvyle, fixe la glycine et libère l'ammoniac; la sous-unité A contient également de la glycine, est réduite par la thiorédoxine et produit un intermédiaire réactionnel utilisé par la sous-unité C pour produire le phosphate d'acétyle.

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Groupe fonctionnel

En chimie, les composés organiques peuvent être considérés comme constitués d'un squelette relativement non réactif appelé lalcane parent en nomenclature substitutive, et d’un ou plusieurs groupes fonctionnels.

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Guanosine triphosphate

Le guanosine triphosphate (GTP) est une coenzyme de transfert de groupements phosphate.

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Iodothyronine désiodase

thyroïdienne. Triiodothyronine (T3), hormone active. 3,3',5'-triiodothyronine (rT3), inactive. Une iodothyronine désiodase est une oxydoréductase qui catalyse la désiodation d'un dérivé iodé de la thyronine, ou iodothyronine, c'est-à-dire de la thyroxine, de la triiodothyronine ou de la, abrégées respectivement T4, T3 et rT3 (T3 inverse).

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Méthylsélénocystéine

La méthylsélénocystéine, ou Se-méthylsélénocystéine, est un analogue structurel de la ''S''-méthylcystéine dans lequel l'atome de soufre est remplacé par un atome de sélénium.

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Modification post-traductionnelle

Une modification post-traductionnelle est une modification chimique d'une protéine, réalisée le plus souvent par une enzyme, après sa synthèse ou au cours de sa vie dans la cellule.

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O-Phosphosérine

La O-phosphosérine est un dérivé phosphorylé de la sérine, un acide α-aminé protéinogène, présent dans de nombreuses protéines.

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O-Phosphoséryl-ARNt:sélénocystéinyl-ARNt synthase

La O-phosphoséryl-ARNt:sélénocystéinyl-ARNt synthase (SepSecS) est une transférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme utilise le phosphate de pyridoxal comme cofacteur.

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O-Phosphoséryl-ARNtSec kinase

La O-phosphoséryl-ARNtSec kinase (PSTK) est une transférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient chez les archées et les eucaryotes dans la formation du sélénocystéinyl-ARNtSec.

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Oxydoréductase

En biochimie, les oxydoréductases sont des enzymes catalysant les réactions d'oxydoréduction en transférant les ions H+ et des électrons.

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Phosphate

Atlas mondial des océans).. Phosphate dans une coupelle. Un phosphate est un composé dérivé de l'acide phosphorique par perte ou substitution d'un ou plusieurs atomes d'hydrogène, par d'autres atomes ou groupes fonctionnels.

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Polypeptide

Un polypeptide est une chaîne d'acides aminés reliés par des liaisons peptidiques.

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Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Racémique

En chimie, un racémique ou racémate est un mélange en proportions égales des énantiomères lévogyre et dextrogyre d'un composé chiral.

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Ribosome

Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux) (REG) (6) Appareil de Golgi (7) Cytosquelette (8) Réticulum endoplasmique lisse (9) Mitochondries (10) Vacuole (absent des cellules animales) (11) Cytosol (12) Lysosome (13) Centrosome (constitué de deux centrioles) (14) Membrane plasmique Les ribosomes sont des complexes ribonucléoprotéiques présents dans les cellules eucaryotes et procaryotes.

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Sélénium

Le sélénium est l'élément chimique de numéro atomique 34, de symbole Se.

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Séléniure

Séléniure de cobalt. Un séléniure est un composé chimique contenant un anion sélénium avec un nombre d’oxydation de −2 (Se), tout comme le soufre dans un sulfure.

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Sélénocystéine synthase

La sélénocystéine synthase est une transférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans la biosynthèse de la sélénocystéine à partir de la sérine en convertissant le L-séryl-ARNtSec en L-sélénocystéinyl-ARNtSec à partir de sélénophosphate.

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Sélénol

Structure générique d'un sélénol. Un sélénol est un composé organosélénié de formule générique, où R est un résidu organique, Se un atome de sélénium et H un atome d'hydrogène.

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Sélénophosphate synthase

La sélénophosphate synthase est une phosphotransférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans la biosynthèse de la sélénocystéine à partir de la sérine en produisant le sélénophosphate utilisé pour convertir le L-séryl-ARNtSec en L-sélénocystéinyl-ARNtSec par la sélénocystéine synthase.

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Sélénoprotéine

Structure de la protéine GPX1. Basé sur l’aperçu PyMOL de PDB 2f8a. Une sélénoprotéine est une protéine dont l'un au moins des acides aminés constituant la chaîne polypeptidique contient du sélénium comme la sélénométhionine ou la sélénocystéine.

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Séquence (acide nucléique)

ARN messager faisant apparaître ses codons. La séquence d'un acide nucléique — ADN ou ARN — est la succession des nucléotides qui le constituent.

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Sérine

La sérine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ser et S) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UCU, UCC, UCA, UCG, AGU et AGC.

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Sérine-ARNt ligase

La sérine-ARNt ligase, ou séryl-ARNt synthétase, est une ligase qui catalyse les réactions: Cette enzyme fixe la sérine, un α-aminé protéinogène, sur son ARN de transfert, noté ARNtSer.

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Sec

Dans la langue courante, sec est un adjectif (féminin: sèche) qui qualifie ce qui n'a pas d'eau (le substantif correspondant est).

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Soufre

Le soufre est l'élément chimique de numéro atomique 16, de symbole S. C'est un membre du groupe des chalcogènes.

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Tellure

Le tellure est l'élément chimique de numéro atomique 52, de symbole Te.

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Tellurocystéine

La tellurocystéine est un acide L-α-aminé analogue de la cystéine et de la sélénocystéine dans lequel un atome de tellure remplace respectivement l'atome de soufre et de sélénium.

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Thiol

groupe sulfhydryle en bleu. Un thiol est un composé organosulfuré de formule générique R–SH, où R est un radical organique (alkyle ou aryle, par exemple) et –SH le groupe sulfhydryle, analogue au groupe hydroxyle –OH des alcools en remplaçant l'atome d'oxygène par un atome de soufre.

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Thiorédoxine réductase

Les thiorédoxine réductases sont les seules enzymes connues susceptibles de réduire la thiorédoxine.

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Thyroxine 5'-désiodase

thyroïdienne. Triiodothyronine (T3), hormone active. La thyroxine 5'-désiodase est une oxydoréductase qui catalyse la désiodation de la thyroxine, ou hormone thyroïdienne T4, en triiodothyronine, ou T3.

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Thyroxine 5-désiodase

thyroïdienne. Triiodothyronine (T3), hormone active. 3,3',5'-triiodothyronine (rT3), inactive. La thyroxine 5-désiodase est une oxydoréductase qui catalyse la désiodation de la thyroxine, ou prohormone thyroïdienne T4, et de la triiodothyronine, ou hormone thyroïdienne T3, respectivement en («  » ou rT3) et (T2), qui sont inactives.

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Tige-boucle

Structure en tige et boucle formée par une séquence répétée inversée sur l'ARN. Une tige-boucle (ou "structure en tige et boucle"), également connue sous le nom de structure en épingle à cheveux, est une structure intramoléculaire qui se forme sur un brin d'acide nucléique.

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Traduction génétique

Cycle de l'élongation de la traduction par le ribosome. Les ARNt (vert foncé) apportent les acides aminés (carrés) au site A. Une fois l'accommodation codon-anticodon réalisée, il y a formation de la nouvelle liaison peptidique, puis translocation du ribosome d'un codon le long de l'ARNm. En biologie moléculaire, la traduction génétique est l'étape de synthèse des protéines par les ribosomes, à partir de l'information génétique contenue dans les ARN messagers.

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UGA

UGA est un code, qui signifie.

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Union internationale de biochimie et de biologie moléculaire

LUnion internationale de biochimie et de biologie moléculaire (en anglais, International union for biochemistry and molecular biology ou IUBMB) est une Organisation non gouvernementale internationale qui fédère les sociétés savantes nationales dans le domaine de la biochimie et de la biologie moléculaire.

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Union internationale de chimie pure et appliquée

L’Union internationale de chimie pure et appliquée (UICPA, en anglais: International Union of Pure and Applied Chemistry, IUPAC) est une organisation non gouvernementale ayant son siège à Zurich, créée en 1919 qui s’intéresse aux progrès en chimie, chimie physique, biochimie Elle a pour membres des sociétés nationales de chimie.

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Université de Calgary

L’Université de Calgary (en anglais, University of Calgary: UofC) est une université canadienne située à Calgary, en Alberta.

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Redirections ici:

10236-58-5, C3H7NO2Se, Selenocysteine.

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