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Techniques de biologie moléculaire

Indice Techniques de biologie moléculaire

Principales techniques utilisées couramment en biologie moléculaire.

43 relations: Acide désoxyribonucléique, Acide ribonucléique, Acrylamide, Amplification aléatoire d'ADN polymorphe, Électrophorèse capillaire, Électrophorèse sur gel, Électrophorèse sur gel d'agarose, Électrophorèse sur gel en gradient dénaturant, Bactérie, Biologie moléculaire, Cellule (biologie), Chromatographie, Clonage, Double hybride, Enzyme de restriction, Extraction d'ADN, Gène, Génome, Hybridation in situ en fluorescence, Immunoélectrophorèse, Immunoprécipitation, Institute for Advanced Biosciences, Marquage des acides nucléiques, Méthode TAP, Minipréparation, Mutagénèse dirigée, PCA protein complementation assay, Plasmide, Polymorphisme de longueur des fragments de restriction, Puce à ADN, Pyroséquençage, Réaction en chaîne par polymérase, Retard sur gel, Séquençage de l'ADN, Séquençage des protéines, Simple hybride, Southern blot, Transcription (biologie), Transfert d'acide ribonucléique, Transfert de protéines, Transformation (génétique), Transgène, Transgénèse.

Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide ribonucléique

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Acrylamide

L'acrylamide ou 2-propénamide (amide acrylique) est un composé organique de formule brute C3H5NO.

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Amplification aléatoire d'ADN polymorphe

L'amplification aléatoire d'ADN polymorphe, plus connue sous le nom de RAPD (pour random amplified polymorphic DNA) est une technique d'analyse de l'ADN utilisée en biologie moléculaire.

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Électrophorèse capillaire

L'électrophorèse capillaire (en anglais capillary electrophoresis: CE) peut être utilisée pour séparer des espèces ioniques selon leur charge et les forces de friction qui s'exercent sur elles.

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Électrophorèse sur gel

ADN en gel d'agarose. Le gel est horizontal baigne dans le tampon qui remplit la cuve. L'ADN est déposé dans des puits à une extrémité du gel. L'alimentation en arrière-plan fournit la tension électrique continue qui permet la migration des fragments d'ADN dans le gel. L'électrophorèse sur gel est une variante de l'électrophorèse de zones.

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Électrophorèse sur gel d'agarose

Cuve remplie de tampon et transformateur utilisés pour l'électrophorèse sur gel d'agarose. L'électrophorèse sur gel d'agarose est une méthode utilisée en biochimie et en biologie moléculaire pour séparer l'ADN, l'ARN ou des protéines en fonction de leur masse moléculaire.

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Électrophorèse sur gel en gradient dénaturant

Fragments d’ADN (en négatif) montrant des gènes DGGE (en négatif). L'électrophorèse sur gel en gradient dénaturant ou DGGE (sigle de l'anglais denaturing gradient gel electrophoresis) est une technique d'électrophorèse permettant la séparation de molécules d'acides nucléiques (ADN ou ARN) de même taille.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Biologie moléculaire

La biologie moléculaire (parfois abrégée bio. mol.) est une discipline scientifique de la vie au croisement de la génétique, de la biochimie métabolique et de la physique, dont l'objet est la compréhension des mécanismes de fonctionnement de la cellule au niveau moléculaire.

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Cellule (biologie)

consulté le.

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Chromatographie

La chromatographie est une méthode physico-chimique qui sert à séparer les différentes substances présentes dans un mélange (échantillon en phase homogène liquide ou gazeuse).

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Clonage

Le clonage désigne principalement deux processus.

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Double hybride

La technique de double hybride est une technique de biologie moléculaire permettant de détecter une interaction physique entre deux protéines.

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Enzyme de restriction

ADNCreated from http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId.

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Extraction d'ADN

L'extraction de l'ADN est une technique permettant d'isoler l'acide désoxyribonucléique (ADN) des cellules ou des tissus.

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Gène

Un gène, du grec ancien (« génération, naissance, origine »), est, en biologie, une séquence discrète et héritable de nucléotides dont l'expression affecte les caractères d'un organisme.

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Génome

Le génome (//), ou plus rarement génôme, est l'ensemble du matériel génétique d'une espèce codé dans son acide désoxyribonucléique (ADN), à l'exception de certains virus dont le génome est constitué d'acide ribonucléique (ARN).

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Hybridation in situ en fluorescence

Exemple d'imagerie en ''FISH'': réarragement chromosomique bcr/abl caractéristique de la leucémie myéloïde chronique vue en FISH. Les chromosomes sont en bleu. L''étiquette'' verte et rouge (en haut à gauche) désigne le chromosome où l'arrangement pathogène est présent. Technique de l'hybridation fluorescente in situ. En A: sonde. B: sonde colorée à l'aide d'un fluorochrome. C: hybridation avec l'ADN nucléaire. D: apparence du chromosome métaphasique où la sonde s'est fixée. Principe d'hybridation fluorescente ''in situ''. Obtention d'une sonde marquée par'' Nick Translation'', hybridation ''in situ'' avec l'ADN dénaturé puis traitement avec des anticorps fluorescents pour localiser le gène d'intérêt au microscope à épifluorescence. L'hybridation in situ en fluorescence (FISH, de l'anglais fluorescence in situ hybridization) est une technique de biologie moléculaire d'hybridation ''in situ'' qui consiste à analyser des coupes en microscopie et en imagerie moléculaire en recourant à des sondes disposant d'un marqueur fluorescent.

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Immunoélectrophorèse

L'immunoélectrophorèse est une méthode de laboratoire qui, en couplant une électrophorèse avec une solution contenant des anticorps spécifiques, va séparer les molécules composants le sérum ou l'urine en formant un précipité qui sera spécifique de chaque immunoglobuline.

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Immunoprécipitation

L'immunoprécipitation (IP) est la technique qui permet la précipitation d'un antigène (protéine) en solution par un anticorps qui agglutine spécifiquement une protéine particulière.

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Institute for Advanced Biosciences

Institute for Advanced Biosciences ou Institut pour l'avancée des biosciences ou IAB est un centre de recherche de renommée internationale dans la recherche biomédicale fondamentale et translationnelle. Installé sur le campus santé de Grenoble, l'institut est un centre de recherche multi-tutelles (CR UGA / Inserm U1209 / CNRS UMR5039) et compte environ 300 personnes travaillant principalement sur l'épigénétique, la recherche clinique pour les maladies chroniques et le cancer.

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Marquage des acides nucléiques

Il existe deux principales méthodes de marquage des acides nucléiques.

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Méthode TAP

représentation schématique des trois étapes de la purification par la méthode TAP La méthode TAP (TAP-TAG) est une méthode de purification par immunoprécipitation de complexes protéiques basée sur l'utilisation de protéines chimériques portant une étiquette composée de deux domaines d'affinité (historiquement CBP et protéine A).

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Minipréparation

En biologie moléculaire, une minipréparation ou miniprep est une technique permettant d'extraire une petite quantité (100 ng à 5 μg) d'ADN sous forme de plasmide provenant de bactéries ayant subi une transformation, le plus souvent effectué sur Escherichia coli.

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Mutagénèse dirigée

La mutagénèse dirigée est l'induction d'une ou plusieurs mutations dans un génome, de façon précise et volontaire.

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PCA protein complementation assay

PCA pour Protein-fragment Complementation Assay, est une technique de biologie moléculaire consistant à vérifier des interactions protéine-protéine en couplant chacune de nos protéines d'intérêt avec des fragments d'une protéine rapporteuse (luciférase entre autres), et en testant la restauration de l'activité de notre rapporteur.

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Plasmide

Schéma représentant une bactérie contenant des plasmides. En microbiologie et en biologie moléculaire, un plasmide est une molécule d'ADN distincte de l'ADN chromosomique, capable de réplication autonome et non essentielle à la survie de la cellule.

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Polymorphisme de longueur des fragments de restriction

En biologie moléculaire, le polymorphisme de longueur des fragments de restriction (ou RFLP, de l'anglais restriction fragment length polymorphism) est utilisé dans deux sens.

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Puce à ADN

Principe d'utilisation de la puce à ADN. Une puce à ADN est un ensemble de molécules d'ADN fixées en rangées ordonnées sur une petite surface qui peut être du verre, du silicium ou du plastique.

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Pyroséquençage

Le pyroséquençage est une technique de séquençage de l'ADN qui permet d’effectuer un séquençage rapide et à moindre coût qu’un séquençage par la méthode de Sanger.

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Réaction en chaîne par polymérase

Diagramme des quatre premiers cycles de la PCR. Lamplification en chaîne par polymérase (ACP) ou réaction de polymérisation en chaîne, généralement siglée PCR (de l'polymerase chain reaction) est une méthode de biologie moléculaire permettant d'obtenir rapidement, in vitro, un grand nombre de segments d'ADN identiques, à partir d'une séquence initiale.

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Retard sur gel

Le retard sur gel (EMSA ou electrophoretic mobility shift assay) est une technique de biologie moléculaire permettant de détecter une interaction entre une protéine et de l'ADN ou de l'ARN (du moins, une sonde oligonucléotidique).

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Séquençage de l'ADN

Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné.

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Séquençage des protéines

Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique.

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Simple hybride

Le simple hybride est une technique de biologie moléculaire, variante de la technique de double hybride.

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Southern blot

Le ou (également appelé transfert d'ADN ou buvardage de Southern) est une méthode de biologie moléculaire permettant l'analyse de l'ADN.

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Transcription (biologie)

En biologie moléculaire, la transcription est la première étape de l'expression génique basée sur l'ADN, au cours de laquelle un segment particulier d'ADN est « copié » en ARN par une enzyme appelée ARN polymérase.

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Transfert d'acide ribonucléique

Le transfert d'acide ribonucléique (en anglais) ou buvardage de northern), est une méthode de biologie moléculaire permettant l'analyse de l'acide ribonucléique (ARN). Elle dérive du Southern blot (appelé ainsi par le biologiste Edwin Southern qui a aussi inspiré le nom western blot qui fait référence aux séquences en acides aminés des protéines), sauf qu'au lieu d'étudier de l'acide désoxyribonucléique(ADN), on étudie de l'ARN. L'ARN va être analysé par électrophorèse, permettant de séparer les ARN en fonction de leur taille. Puis ils sont détectés par une sonde. Une autre différence du procédé par rapport au transfert de Southern est l'utilisation de formaldéhyde dans le gel d'électrophorèse comme dénaturant, parce que le traitement d'hydroxyde de sodium utilisé en transfert de southern dégraderait l'ARN. Bien que les ARN soient déjà simple-brin cela permet de casser les structures secondaires. Comme dans le transfert de Southern, la sonde d'hybridation peut être faite à partir d'ADN ou d'ARN. Le transfert d'acide ribonucléique permet d'apprécier la distribution des ARN dans les tissus et d'étudier leur abondance relative. On peut alors déduire de ces observations l'expression plus ou moins importante de certains gènes. Enfin cette technique sert à détecter les intermédiaires de maturation et les différentes formes d'épissage des ARN. Le principe des puces à ADN, dont l'utilisation s'est répandue vers la fin des années 1990, est apparenté puisqu'il est fondé sur la fixation sur un support de fragments isolés d'ADN rétrostranscrits et l'hybridation avec une sonde faite à partir d'ADN.

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Transfert de protéines

Le transfert de protéines, en anglais western blot (également appelé buvardage de western ou encore technique des immuno-empreintes), est une méthode de biologie moléculaire permettant la détection et l'identification de protéines spécifiques dans un échantillon biologique (sérum ou autre extrait ou homogénat tissulaire) à l'aide d'anticorps dirigés contre ces protéines que l'on souhaite détecter.

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Transformation (génétique)

En génétique, une transformation génétique est l'intégration d'un fragment d'ADN étranger dans une cellule, ce qui peut entraîner une modification héréditaire du phénotype de l'organisme receveur.

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Transgène

Un transgène est la séquence isolée d'un gène, transférée d'un organisme à un autre, lors de la mise en œuvre de la transgenèse.

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Transgénèse

Schéma d'un gène chez les eucaryotes La transgenèseArticle « La transgenèse », Encyclopædia Universalis.

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Redirections ici:

Digestion enzymatique, Sonde de biologie moléculaire, Technique de biologie moléculaire, Techniques de biologie moleculaire.

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