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39 relations: Angle dièdre, Atome, Azote, Bioinformatique structurale, Biologie structurale, Carbone, Champ de force (chimie), Charge électrique, Chimie numérique, Chimie quantique, Chlore, Conception de médicament, Coordonnées cartésiennes, Cristallographie aux rayons X, Dynamique moléculaire, Force de van der Waals, Liaison covalente, Loi de Coulomb (électrostatique), Mécanique moléculaire, Mécanique newtonienne, Méthode de Monte-Carlo, Modèle, Modèle compact, Modèle moléculaire boules-bâtonnets, Molécule, Oscillateur harmonique, Phosphore, Potentiel de Lennard-Jones, Principe fondamental de la dynamique, PyMOL, RasMol, Rayon de van der Waals, Simulation de phénomènes, Soufre, Stéréochimie, Structure des protéines, Technique, 1996, 2001.
Angle dièdre
En géométrie, l'angle entre deux plans est appelé angle dièdre, ou angle diédral (anglicisme).
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Atome
hélium 4, agrandi à droite, est formé de deux protons et de deux neutrons. Atomes de carbone à la surface de graphite observés par microscope à effet tunnel. Un atome est la plus petite partie d'un corps simple pouvant se combiner chimiquement avec un autre.
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Azote
L'azote est l'élément chimique de numéro atomique 7, de symbole N (du latin nitrogenium).
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Bioinformatique structurale
Structure tridimensionnelle d'une protéine La bioinformatique structurale est la branche de la bio-informatique liée à l'analyse et à la prédiction de la structure tridimensionnelle des macromolécules biologiques telles que les protéines, l'ARN et l'ADN.
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Biologie structurale
pmid.
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Carbone
Le carbone est l'élément chimique de et de Il possède trois isotopes naturels.
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Champ de force (chimie)
Un champ de force peut par exemple être utilisé afin de minimiser l'énergie d'étirement de cette molécule d'éthane. Dans le cadre de la mécanique moléculaire, un champ de force est un ensemble de potentiels et de paramètres permettant de décrire la structure de l'énergie potentielle d'un système de particules (typiquement, des atomes, mais non exclusivement).
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Charge électrique
La charge électrique est une propriété fondamentale de la matière qui lui permet d'interagir par le biais de champs électromagnétiques.
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Chimie numérique
La chimie numérique ou chimie informatique, parfois aussi chimie computationnelle, est une branche de la chimie et de la physico-chimie qui utilise les lois de la chimie théorique exploitées dans des programmes informatiques spécifiques afin de calculer structures et propriétés d'objets chimiques tels que les molécules, les solides, les agrégats atomiques (ou clusters), les surfaces, etc., en appliquant autant que possible ces programmes à des problèmes chimiques réels.
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Chimie quantique
La chimie quantique est une branche de la chimie théorique qui applique la mécanique quantique aux systèmes moléculaires pour étudier les processus et les propriétés chimiques.
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Chlore
Le chlore est l'élément chimique de numéro atomique 17, de symbole Cl.
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Conception de médicament
La conception de médicament, plus précisément conception de substance pharmacologiquement active plus connue sous sa dénomination anglaise Drug design est l'ensemble des processus nécessaires à l'élaboration d'un médicament.
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Coordonnées cartésiennes
Un système de coordonnées cartésiennes permet de déterminer la position d'un point dans un espace affine (droite, plan, espace de dimension 3, etc.) muni d'un repère cartésien.
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Cristallographie aux rayons X
La cristallographie aux rayons X, radiocristallographie ou diffractométrie de rayons X (DRX, on utilise aussi souvent l'abréviation anglaise XRD pour X-ray diffraction) est une technique d'analyse fondée sur la diffraction des rayons X par la matière, particulièrement quand celle-ci est cristalline.
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Dynamique moléculaire
La dynamique moléculaire est une technique de simulation numérique permettant de modéliser l'évolution d'un système de particules au cours du temps.
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Force de van der Waals
Tête et pattes avant d'un Gecko (espèce non précisée, queue en forme de feuille) En physique et en chimie, une force de van der Waals, interaction de van der Waals ou liaison de van der Waals est un potentiel interatomique dû à une interaction électrique de faible intensité entre deux atomes ou molécules, ou entre une molécule et un cristal.
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Liaison covalente
Une liaison covalente est une liaison chimique dans laquelle deux atomes se partagent deux électrons (un électron chacun ou deux électrons venant du même atome) d'une de leurs couches externes afin de former un doublet d'électrons liant les deux atomes.
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Loi de Coulomb (électrostatique)
Dans les deux cas, la force est proportionnelle au produit des charges et varie en carré inverse de la distance entre les charges. La loi de Coulomb exprime, en électrostatique, la force de l'interaction électrique entre deux particules chargées électriquement.
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Mécanique moléculaire
Physique à l'échelle moléculaire La mécanique moléculaire correspond à l'utilisation de la mécanique newtonienne pour modéliser la structure des systèmes moléculaires.
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Mécanique newtonienne
La mécanique newtonienne est une branche de la physique.
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Méthode de Monte-Carlo
Une méthode de Monte-Carlo, ou méthode Monte-Carlo, est une méthode algorithmique visant à calculer une valeur numérique approchée en utilisant des procédés aléatoires, c'est-à-dire des techniques probabilistes.
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Modèle
Le modèle concerne la notion de ressemblance, d’imitation, de représentation, il désigne.
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Modèle compact
acétyl-CoA, une coenzyme d'activation des groupes acétyle. En chimie, le modèle compact est un mode de représentation des molécules en trois dimensions dans lequel les atomes sont représentés par des sphères dont le rayon est proportionnel au rayon atomique et dont la distance entre les centres de deux sphères est proportionnelle à la distance entre les noyaux des atomes représentés par ces sphères, toutes ces distances étant reproduites à la même échelle.
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Modèle moléculaire boules-bâtonnets
392x392px En chimie, un modèle moléculaire boules-bâtonnets est un modèle moléculaire d'une substance chimique qui permet la visualisation en trois dimensions de la position de ses atomes et des liaisons chimiques qui les unissent.
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Molécule
alt.
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Oscillateur harmonique
Un oscillateur harmonique est un oscillateur idéal dont l'évolution au cours du temps est décrite par une fonction sinusoïdale, dont la fréquence ne dépend que des caractéristiques du système et dont l'amplitude est constante.
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Phosphore
Le phosphore est l'élément chimique de numéro atomique 15, de symbole P. C'est un membre du groupe des pnictogènes.
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Potentiel de Lennard-Jones
Le potentiel de Lennard-Jones, qui est plus précisément une énergie potentielle, décrit l'interaction entre deux atomes au sein d'un gaz monoatomique de type gaz rare.
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Principe fondamental de la dynamique
Lois de Newton rédigées en latin. Le principe fondamental de la dynamique (en abréviation, PFD) désigne une loi de physique mettant en relation la masse d'un objet, et l'accélération qu'il reçoit si des forces lui sont appliquées.
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PyMOL
PyMOL est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D créé par Warren DeLano.
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RasMol
RasMol est un logiciel de graphisme moléculaire gratuit permettant de représenter des molécules en 3D à partir de différents formats standards de fichiers de représentation de molécules. Il fonctionne sur plateformes MacOS, Windows et Linux.
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Rayon de van der Waals
Le rayon de van der Waals, r_, d'un atome est le rayon d'une sphère géométrique théorique qui peut être utilisée, dans beaucoup de raisonnements adéquats, pour modéliser l'atome.
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Simulation de phénomènes
La simulation de phénomènes est un outil utilisé dans le domaine de la recherche et du développement.
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Soufre
Le soufre est l'élément chimique de numéro atomique 16, de symbole S. C'est un membre du groupe des chalcogènes.
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Stéréochimie
La stéréochimie, est une sous-discipline de la chimie; elle implique l'étude de l'arrangement spatial relatif des atomes au sein des molécules.
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Structure des protéines
La structure des protéines est la composition en acides aminés et la conformation en trois dimensions des protéines.
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Technique
Une technique (du grec ancien Voir la section #Étymologie)) est une méthode ou un ensemble de méthodes, notamment dans les métiers manuels (menuiserie, art de la forge, etc.), où elle est souvent associée à un savoir-faire professionnel. La technique couvre l'ensemble des procédés de fabrication, de maintenance et de gestion, qui utilisent des méthodes issues de connaissances scientifiques ou simplement des méthodes issues du savoir-faire artisanal et industriel; c'est le produit de l'ensemble de l'histoire de l'humanité. On peut alors parler d'art, dans son sens de « métier », d'« habileté », et de science appliquée.
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1996
L'année 1996 est une année bissextile qui commence un lundi.
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2001
L'année 2001 est une année commune qui commence un lundi.
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Redirections ici:
Modelisation moleculaire, Modélisation Moléculaire, Simulation moléculaire.
