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Méthodes d'investigation des interactions protéine–protéine

Indice Méthodes d'investigation des interactions protéine–protéine

Il existe de nombreuses méthodes d'investigation des interactions protéine–protéine.

76 relations: Acide aminé, Acide désoxyribonucléique, Acide nucléique, Acide ribonucléique, Activité de l'eau, Adsorption, Affinité (biochimie), Anisotropie, Anticorps, Bactériophage, Biacore, Cinétique chimique, Complexe (biologie), Complexe (chimie), Concentration molaire, Constante de dissociation, Criblage à haut débit, Désorption-ionisation laser assistée par matrice, Diffusion des ondes, Diffusion dynamique de la lumière, Diffusion Rayleigh, Double hybride, Endogénie, Enthalpie, Entropie (thermodynamique), Enzyme, Fluorescence, Fluorochrome, Génome, Glycane, Guide d'ondes, Immunoélectrophorèse, Immunoprécipitation, Indice de réfraction, Interaction protéine-protéine, Interférence, Interférence par ARN, Interférométrie par double polarisation, Laser, Lectine, Leucine, Ligand (biologie), Ligand (chimie), Macromolécule, Méthanal, Méthionine, Méthode TAP, Microscopie à fluorescence, Oligonucléotide, Onde évanescente, ..., Peptide, Photon, Plaque microtitre, Plasmide, Polarisation (optique), Polymère, Polymérase, Proximity ligation assay, Rapport signal sur bruit, Résonance magnétique nucléaire, Résonance plasmon de surface, Réticulation, Sensibilité et spécificité, Société Max-Planck pour le développement des sciences, Spectrométrie de masse, Spectroscopie de corrélation de fluorescence, Stœchiométrie, Suisse, Thermodynamique, Thermophorèse, Titrage calorimétrique isotherme, Transfert d'énergie entre molécules fluorescentes, Transfert de protéines, Tryptophane, Ultraviolet, Zurich. Développer l'indice (26 plus) »

Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

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Acide désoxyribonucléique

Structure de la double hélice d'ADN. C''' entre les deux armatures de la double hélice, constituées d'une alternance de phosphate et de désoxyribose. L'acide désoxyribonucléique, ou ADN, est une macromolécule biologique présente dans presque toutes les cellules ainsi que chez de nombreux virus.

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Acide nucléique

Un acide nucléique (désoxyribonucléique ou ribonucléique) est un assemblage de macromolécules, un polymère, dont l’unité de base, ou monomère, est un nucléotide et dont les nucléotides sont reliés entre eux par des liaisons phosphodiesters.

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Acide ribonucléique

url texte.

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Activité de l'eau

L'eau. Lactivité de l'eau (symbole a_\mathrm w pour) dans un milieu humide donné correspond à son humidité relative, soit la pression de vapeur d'eau p d'une atmosphère gazeuse en équilibre avec ce milieu divisée par la pression de vapeur saturante p_0 de cette atmosphère à la même température.

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Adsorption

absorption et adsorption. En chimie, l’adsorption est un phénomène de surface par lequel des atomes, des ions ou des molécules - des adsorbats - se fixent sur une surface solide - l'adsorbant - depuis une phase gazeuse, liquide ou une solution solide.

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Affinité (biochimie)

En biochimie, l'affinité décrit la force d'une interaction non covalente entre une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéines, et un ligand qui se fixe sur un site à sa surface.

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Anisotropie

WMAP. Lanisotropie (contraire d'isotropie) est la propriété d'être dépendant de la direction.

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Anticorps

Un anticorps est un complexe protéique produit par le système immunitaire adaptatif dans un organisme vivant pour détecter et neutraliser les agents pathogènes de manière spécifique.

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Bactériophage

doi.

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Biacore

Le Biacore est le nom commercial d'un appareil permettant de mesurer les interactions protéine/protéine ou protéine/ligand et les constantes d'affinité.

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Cinétique chimique

La cinétique chimique est l'étude de la vitesse des réactions chimiques.

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Complexe (biologie)

En biologie et en chimie supramoléculaire, le mot complexe désigne généralement toute association de molécules basée sur des forces autres que la liaison covalente.

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Complexe (chimie)

En chimie, plus particulièrement en chimie inorganique, un complexe est un édifice polyatomique constitué d'une ou de plusieurs entités indépendantes (ions ou molécules), en interaction.

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Concentration molaire

La concentration en quantité de matière (anciennement concentration molaire) ou molarité (obsolète), ou parfois taux molaire, d'une espèce chimique est sa quantité rapportée au volume total du mélange qui contient cette espèce.

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Constante de dissociation

La constante de dissociation est la constante de réaction associée à la dissociation d'un composé chimique.

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Criblage à haut débit

Machine de criblage à haut débit en Allemagne Le criblage à haut débit (high-throughput screening, HTS) désigne dans le domaine de la pharmacologie, de la biochimie, de la génomique et de la protéomique, les techniques visant à étudier et à identifier dans les chimiothèques et ciblothèques, des molécules aux propriétés nouvelles, biologiquement actives.

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Désorption-ionisation laser assistée par matrice

La désorption-ionisation laser assistée par matrice (en anglais texte ou MALDI) est une technique d'ionisation douce utilisée en spectrométrie de masse.

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Diffusion des ondes

La diffusion est le phénomène par lequel un rayonnement, comme la lumière, le son ou un faisceau de particules, est dévié dans diverses directions par une interaction avec d'autres objets.

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Diffusion dynamique de la lumière

L'intensité diffusée par des grosses particules (moins mobiles) varie moins vite au cours du temps que pour des petites particules La diffusion dynamique de la lumière (en anglais, dynamic light scattering ou DLS) est une technique d'analyse spectroscopique non destructive permettant d'accéder à la taille de particules en suspension dans un liquide ou de chaînes de polymère en solution de de diamètre environ.

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Diffusion Rayleigh

La diffusion Rayleigh est un mode de diffusion des ondes, par exemple électromagnétiques ou sonores.

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Double hybride

La technique de double hybride est une technique de biologie moléculaire permettant de détecter une interaction physique entre deux protéines.

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Endogénie

L'endogénie est, en biologie, un produit ou une fonction généré à l'intérieur du système (animal, végétal, superorganisme, écosystème), et dans le cas d'un organisme synthétisé par l'organisme lui-même.

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Enthalpie

L'enthalpie de fusion est la chaleur qui doit être apportée pour faire fondre la glace à une pression constante. Elle est retirée du liquide environnant et réchauffe le glaçon. Finalement, la boisson est rafraichie. L'enthalpie de réaction de la combustion d'alcool dans l'air est négative. Il s’agit donc d’une réaction exothermique dans laquelle la chaleur est libérée dans l’environnement. En physique, la variable enthalpie est une quantité reliée à l'énergie d'un système thermodynamique.

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Entropie (thermodynamique)

L'entropie est une grandeur physique qui caractérise le degré de désorganisation d'un système.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Fluorescence

La fluorescence est une émission lumineuse provoquée par l'excitation des électrons d'une molécule (ou atome), généralement par absorption d'un photon immédiatement suivie d'une émission spontanée.

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Fluorochrome

Un fluorochrome ou fluorophore est une substance chimique capable d'émettre de la lumière de fluorescence après excitation.

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Génome

Le génome (//), ou plus rarement génôme, est l'ensemble du matériel génétique d'une espèce codé dans son acide désoxyribonucléique (ADN), à l'exception de certains virus dont le génome est constitué d'acide ribonucléique (ARN).

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Glycane

Un glycane est un polymère composé de monosaccharides reliés entre eux par une liaison glycosidique.

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Guide d'ondes

Un guide d'ondes est un système physique qui sert à guider les ondes électromagnétiques ou les ondes acoustiques, pour les maintenir confinées dans un milieu particulier, sur une certaine distance.

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Immunoélectrophorèse

L'immunoélectrophorèse est une méthode de laboratoire qui, en couplant une électrophorèse avec une solution contenant des anticorps spécifiques, va séparer les molécules composants le sérum ou l'urine en formant un précipité qui sera spécifique de chaque immunoglobuline.

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Immunoprécipitation

L'immunoprécipitation (IP) est la technique qui permet la précipitation d'un antigène (protéine) en solution par un anticorps qui agglutine spécifiquement une protéine particulière.

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Indice de réfraction

fronts d'onde émis par une source ponctuelle mettant en évidence le phénomène de réfraction. La zone inférieure située sous la ligne grise a un plus grand '''indice de réfraction''' et donc une vitesse de propagation proportionnellement inférieure à celle de la zone supérieure (pour une raison de clarté, la réflexion partielle n'est pas montrée). L'indice de réfraction (souvent noté n; en anglais, index of refraction ou IOR) est une grandeur sans dimension caractéristique d'un milieu, décrivant le comportement de la lumière dans celui-ci; il dépend de la longueur d'onde de mesure mais aussi des caractéristiques de l'environnement (notamment pression et température).

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Interaction protéine-protéine

fil de fer ») forme une interaction protéine–protéine avec la protéine de la ribonucléase. Les contacts entre les deux protéines sont représentés sous forme de taches colorées. Une Interaction protéine–protéine apparait lorsque deux ou plusieurs protéines se lient entre elles, le plus souvent pour mener à bien leur fonction biologique.

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Interférence

Interférence d'ondes circulaires émises par deux sources voisines. En mécanique ondulatoire, les interférences sont la combinaison de deux ondes susceptibles d'interagir.

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Interférence par ARN

Un ARN interférent est un acide ribonucléique (ARN) simple ou double brin dont l'interférence avec un ARN messager spécifique conduit à sa dégradation et à la diminution de sa traduction en protéine.

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Interférométrie par double polarisation

L'interférométrie par double polarisation (Dual Polarization Interferometry ou DPI) est une technique analytique permettant de détecter des éléments adsorbés à la surface d'un guide d'ondes, même si leur épaisseur est de l'ordre de la molécule.

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Laser

nm). Rayon laser à travers un dispositif optique. Démonstration de laser hélium-néon au laboratoire Kastler-Brossel à l'Université Pierre-et-Marie-Curie. Un laser (acronyme issu de l'anglais light amplification by stimulated emission of radiation qui signifie « amplification de la lumière par émission stimulée de radiation ») est un système photonique.

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Lectine

Les lectines sont des protéines qui se lient spécifiquement et de façon réversible à certains glucides.

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Leucine

La leucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Leu et L), du grec ancien (blanc, éclatant), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Ligand (biologie)

Myoglobine en bleu lié à son ligand hème en orange. En biologie, un ligand (du latin ligandum, liant) est une molécule qui se lie de manière réversible à une macromolécule ciblée, protéine ou acide nucléique, jouant en général un rôle fonctionnel: stabilisation structurale, catalyse, modulation d'une activité enzymatique, transmission d'un signal.

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Ligand (chimie)

Un ligand est un atome, un ion ou une molécule portant des groupes fonctionnels lui permettant de se lier à un ou plusieurs atomes ou ions centraux.

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Macromolécule

Une macromolécule (ou molécule polymère) est une très grande molécule, qui possède une masse moléculaire relativement élevée.

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Méthanal

Le méthanal ou formaldéhyde ou aldéhyde formique ou formol est un composé organique de la famille des aldéhydes, de formule chimique CH2O.

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Méthionine

La méthionine (abréviations IUPAC-IUBMB: Met et M) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.

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Méthode TAP

représentation schématique des trois étapes de la purification par la méthode TAP La méthode TAP (TAP-TAG) est une méthode de purification par immunoprécipitation de complexes protéiques basée sur l'utilisation de protéines chimériques portant une étiquette composée de deux domaines d'affinité (historiquement CBP et protéine A).

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Microscopie à fluorescence

La microscopie en fluorescence (ou en épifluorescence) est une technique utilisant un microscope optique en tirant profit du phénomène de fluorescence et de phosphorescence, au lieu de, ou en plus de l'observation classique par réflexion ou absorption de la lumière visible naturelle ou artificielleSpring KR, Davidson MW;; Nikon Microscopy (consulté le 28/09/2008).

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Oligonucléotide

Les oligonucléotides sont de courts segments de chaines d'acides nucléiques (ARN ou ADN) de quelques dizaines de nucléotides.

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Onde évanescente

L'onde plane évanescente est une onde plane particulière dont l'amplitude varie exponentiellement dans une direction orthogonale à sa direction de propagation.

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Peptide

Exemple de peptide. Exemple de peptide. Exemple de peptide. Un peptide est un polymère d’acides aminés reliés entre eux par des liaisons peptidiques.

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Photon

Pas de description.

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Plaque microtitre

Une plaque microtitre est une plaque avec de multiples « puits » utilisés comme de petites éprouvettes.

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Plasmide

Schéma représentant une bactérie contenant des plasmides. En microbiologie et en biologie moléculaire, un plasmide est une molécule d'ADN distincte de l'ADN chromosomique, capable de réplication autonome et non essentielle à la survie de la cellule.

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Polarisation (optique)

La polarisation est une propriété qu'ont les ondes vectorielles (ondes qui peuvent osciller selon plus d'une orientation) de présenter une répartition privilégiée de l'orientation des vibrations qui les composent.

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Polymère

Fibres de polyester observées au Microscopie électronique à balayage. renforts. Les polymères (étymologie: du grec polus, plusieurs, et meros, partie) constituent une classe de matériaux.

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Polymérase

Les polymérases sont des enzymes qui ont pour rôle la synthèse d'un brin de polynucléotides (ADN ou ARN), le plus souvent en utilisant un brin complémentaire comme matrice et des nucléotides triphosphate (NTP ou dNTP) comme monomères.

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Proximity ligation assay

Le test de lien entre protéines (Proximity Ligation Assay) est une technique qui étend les capacités de mesure de la présence ou de la concentration d'une protéine dans une solution.

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Rapport signal sur bruit

En électronique, le rapport signal sur bruit (SNR) est le rapport des puissances entre la partie du signal qui représente une information et le reste, qui constitue un bruit de fond.

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Résonance magnétique nucléaire

MHz. La résonance magnétique nucléaire (RMN) est une propriété de certains noyaux atomiques possédant un spin nucléaire (par exemple 1H, 13C, 17O, 19F, 31P, 129Xe…), placés dans un champ magnétique.

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Résonance plasmon de surface

La résonance des plasmons de surface (ou) est un phénomène physique d'interaction lumière-matière principalement connu pour son utilisation comme méthode de mesure de la liaison d'un « ligand » sur un « récepteur » adsorbé à la surface d'une couche métallique.

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Réticulation

En chimie des polymères, la réticulation correspond à la formation d'un ou de plusieurs réseaux tridimensionnels, par voie chimique ou physique.

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Sensibilité et spécificité

En statistique, la sensibilité (ou sélectivité) d'un test mesure sa capacité à donner un résultat positif lorsqu'une hypothèse est vérifiée.

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Société Max-Planck pour le développement des sciences

vignette La société Max-Planck pour le développement des sciences (en abrégé MPG) est une association à but non lucratif allemande financée par l’État fédéral et par les seize Länder allemands, remplissant une mission de recherche fondamentale.

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Spectrométrie de masse

Spectromètre de masse. La spectrométrie de masse est une technique physique d'analyse permettant de détecter et d'identifier des molécules d’intérêt par mesure de leur masse, et de caractériser leur structure chimique.

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Spectroscopie de corrélation de fluorescence

Exemple de SCF La Spectroscopie de Corrélation de Fluorescence (SCF ou FCS pour l'anglais Fluorescence Correlation Spectroscopy) repose sur l'analyse des corrélations des fluctuations de l'intensité de la fluorescence.

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Stœchiométrie

Équation de réaction équilibrée illustrant la stœchiométrie de la réaction de combustion du méthane. En chimie, la stœchiométrie, du grec ancien / (« élément ») et / (« mesure »), est un calcul qui permet d'analyser les quantités de réactifs et de produits qui sont en jeu au cours d'une réaction chimique.

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Suisse

La Suisse, en forme longue la Confédération suisse, est un pays fédéral d'Europe centrale et de l'Ouest, formé de.

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Thermodynamique

La thermodynamique est la branche de la physique qui traite de la dépendance des propriétés physiques des corps à la température, des phénomènes où interviennent des échanges thermiques, et des transformations de l'énergie entre différentes formes.

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Thermophorèse

La thermophorèse, ou thermodiffusion, ou thermomigration, ou effet Soret, ou encore, effet Ludwig-Soret, est un phénomène observé dans les préparations de particules en mouvement où les différentes catégories de particules présentent des réponses différentes lorsqu'elles sont soumises à un gradient de température.

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Titrage calorimétrique isotherme

Un titrage calorimétrique isotherme (en anglais, isothermal titration calorimetry, ITC) est une méthode de titrage par calorimétrie isotherme durant laquelle on mesure la chaleur de réaction d’une solution en fonction du volume du réactif titrant ajouté dans le but de déterminer la concentration d'une espèce chimique dans cette solution.

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Transfert d'énergie entre molécules fluorescentes

Le transfert d'énergie entre molécules fluorescentes ou transfert d'énergie par résonance de type Förster (en anglais, Förster resonance energy transfer ou FRET, resonance energy transfer ou RET ou electronic energy transfer ou EET), bien qu’observé par Perrin au début du, est décrit pour la première fois par Theodor Förster en 1946.

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Transfert de protéines

Le transfert de protéines, en anglais western blot (également appelé buvardage de western ou encore technique des immuno-empreintes), est une méthode de biologie moléculaire permettant la détection et l'identification de protéines spécifiques dans un échantillon biologique (sérum ou autre extrait ou homogénat tissulaire) à l'aide d'anticorps dirigés contre ces protéines que l'on souhaite détecter.

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Tryptophane

Le tryptophane (abréviations IUPAC-IUBMB: Trp et W) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Ultraviolet

longueurs d'onde (avec des exemples de tailles), les fréquences correspondantes, et les températures du corps noir dont l'émission est maximum à ces longueurs d'onde. Le rayonnement ultraviolet (UV), également appelé « lumière noire » parce que généralement invisible à l’œil nu, est un rayonnement électromagnétique de longueur d'onde inférieure à celle de la lumière visible, mais supérieure à celle des.

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Zurich

Zurich (ou) (allemand: Zürich, suisse allemand: Züri, en Suisse, italien: Zurigo, romanche: Turitg) est une ville de Suisse, capitale du canton de Zurich.

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Redirections ici:

Méthodes d'investigation des interactions protéine-protéine.

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