Table des matières
12 relations: Analyse en composantes principales, Étude d'association pangénomique, Caryotype, Consanguinité, Déséquilibre de liaison, Gestion des données, GigaScience, Indice de fixation, Open source, Paquet (logiciel), Principe de Hardy-Weinberg, R (langage).
Analyse en composantes principales
L'analyse en composantes principales (ACP ou PCA en anglais pour principal component analysis), ou, selon le domaine d'application, transformation de Karhunen–Loève (KLT) ou transformation de Hotelling, est une méthode de la famille de l'analyse des données et plus généralement de la statistique multivariée, qui consiste à transformer des variables liées entre elles (dites « corrélées » en statistique) en nouvelles variables décorrélées les unes des autres.
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Étude d'association pangénomique
Une étude d'association pangénomique (en anglais genome-wide association study, GWAS) est une analyse de nombreuses variations génétiques chez de nombreux individus, afin d'étudier leurs corrélations avec des traits phénotypiques.
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Caryotype
Le caryotype (ou caryogramme) est l'arrangement standard de l'ensemble des chromosomes d'une cellule, à partir d'une prise de vue microscopique.
Voir PLINK et Caryotype
Consanguinité
En génétique des populations, la consanguinité est définie comme étant le résultat d’une reproduction sexuée entre deux individus apparentés (c'est-à-dire ayant un ou plusieurs ancêtres communs).
Déséquilibre de liaison
Within a family, linkage occurs when two genetic markers (points on a chromosome) remain linked on a chromosome rather than being broken apart by recombination events during meiosis, shown as red lines. In a population, contiguous stretches of founder chromosomes from the initial generation are sequentially reduced in size by recombination events.
Voir PLINK et Déséquilibre de liaison
Gestion des données
La gestion des données est une discipline de gestion qui tend à valoriser les données en tant que ressources numériques.
Voir PLINK et Gestion des données
GigaScience
GigaScience est une revue scientifique à comité de lecture créée en 2012.
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Indice de fixation
Distances génétiques (FST) entre les populations humaines L'indice de fixation (FST), aussi appelé indice de différenciation, est un indice permettant de mesurer la différenciation des populations à partir du polymorphisme génétique.
Voir PLINK et Indice de fixation
Open source
Logo de l'Open Source Initiative, une organisation de soutien au mouvement open source. La désignation open source, ou code source ouvert, s'applique aux logiciels (et s'étend maintenant aux œuvres de l'esprit) dont la licence respecte des critères précisément établis par l', c'est-à-dire les possibilités de libre redistribution, d'accès au code source et de création de travaux dérivés.
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Paquet (logiciel)
En informatique, et en particulier dans le contexte des systèmes UNIX, on appelle paquet (ou parfois paquetage, en anglais) une archive (fichier compressé) comprenant les fichiers informatiques, les informations et procédures nécessaires à l'installation d'un logiciel sur un système d'exploitation au sein d'un agrégat logiciel, en s'assurant de la cohérence fonctionnelle du système ainsi modifié.
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Principe de Hardy-Weinberg
Le principe de Hardy-Weinberg (aussi connu sous le nom de loi de Hardy-Weinberg ou équilibre de Hardy-Weinberg, Hardy–Weinberg equilibrium en anglais) est une théorie de génétique des populations qui postule qu'au sein d'une population (idéale), il y a un équilibre des fréquences alléliques et génotypiques d'une génération à l'autre.
Voir PLINK et Principe de Hardy-Weinberg
R (langage)
R est un langage de programmation et un logiciel libre destiné aux statistiques et à la science des données soutenu par la R Foundation for Statistical Computing.
Voir PLINK et R (langage)