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Biosynthèse des acides gras

Indice Biosynthèse des acides gras

La biosynthèse des acides gras est une voie métabolique essentielle du processus de lipogenèse chez les eucaryotes et les bactéries.

137 relations: Aérobie, Acétyl-coenzyme A, Acétyl-coenzyme A carboxylase, Acide carboxylique, Acide citrique, Acide gras, Acide gras désaturase, Acide gras insaturé, Acide gras saturé, Acide gras synthase, Acide isobutyrique, Acide isopalmitique, Acide isovalérianique, Acide malique, Acide oléique, Acide oxaloacétique, Acide palmitique, Acide palmitoléique, Acide pyruvique, Acide shikimique, Acide tuberculostéarique, Actinomycetales, Acyl-coenzyme A, Allostérie, Anaérobie, ARN polymérase, Atome, ATP citrate lyase, Bacillota, Bacillus, Bacillus subtilis, Bactérie, Bêta-cétoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I, Bêta-oxydation, Biosynthèse, Carbone, Catalyse, Cétoacide, Citrate synthase, Classe (biologie), Clostridia, Coenzyme A, Complexe pyruvate déshydrogénase, Composé alicyclique, Composé aliphatique, Composé cyclique, Composé insaturé, Condensation de Claisen, Cycle de Krebs, Cytochrome b5, ..., Cytosol, Décarboxylation, Dimère, Dioxyde de carbone, Dioxygène, Eau, Enzyme, Escherichia coli, Espèce, Estérification, Ester, Eukaryota, Expression génétique, Foie, Fungi, Gène, Genre (biologie), Glande mammaire, Groupe fonctionnel, Homo sapiens, Inhibiteur enzymatique, Isobutyryl-coenzyme A, Isoleucine, Isomérie, Isomérie cis-trans, Kinase, Lactation, Leucine, Levure, Liaison chimique, Liaison covalente, Liaison double, Lipogenèse, Malate déshydrogénase, Malonyl-coenzyme A, Mammifère, Méthylation, Méthyle, Méthylmalonyl-coenzyme A, Membrane plasmique, Micro-organisme, Mitochondrie, Mycobacterium, Nicotinamide adénine dinucléotide, Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate, Oligomère, Ordre (biologie), Ose, Palmitoyl-coenzyme A, Panse, Phosphate, Phospholipide, Phosphopantéthéine, Phosphorylation, Phylum, Plante, Promoteur (biologie), Protéine, Protéine porteuse d'acyle, Protista, Pseudomonas aeruginosa, Réaction d'oxydoréduction, Réaction de déshydratation, Régulation de la transcription, Régulon, Réplication de l'ADN, Répresseur, Résidu (biochimie), Réticulum endoplasmique, Rétroinhibition, Ruminantia, S-Adénosylméthionine, Saccharomyces cerevisiae, Signalisation cellulaire, Signalisation lipidique, Streptomyces, Thioester, Tissu adipeux, Transamination, Transcription (biologie), Valine, Vibrio, Voie métabolique, 2-Méthylbutyryl-coenzyme A, 2-Oxoacide ramifié décarboxylase, 3-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) déshydratase, 3-hydroxydécanoyl-(acyl-carrier-protein) déshydratase. Développer l'indice (87 plus) »

Aérobie

Un milieu est dit aérobie s'il contient du dioxygène.

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Acétyl-coenzyme A

L'acétyl-coenzyme A, usuellement écrite acétyl-CoA, est la forme « activée » de l'acide acétique, c'est-à-dire le thioester que forme ce dernier avec la coenzyme A. C'est une molécule à haut potentiel d'hydrolyse située au carrefour de plusieurs voies métaboliques importantes.

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Acétyl-coenzyme A carboxylase

L'acétyl-CoA carboxylase (ACCase) est une enzyme très répandue chez les êtres vivants.

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Acide carboxylique

Modèle éclaté d'un groupe carboxyle. En chimie organique, le terme acide carboxylique désigne une molécule comprenant un groupe carboxyle (–C(O)OH).

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Acide citrique

L'acide citrique est un acide tricarboxylique α-hydroxylé présent en abondance dans le citron, d'où son nom.

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Acide gras

Un acide gras est un acide carboxylique à chaîne aliphatique.

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Acide gras désaturase

Une acide gras désaturase est une oxydoréductase introduisant, par déshydrogénation, une double liaison C.

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Acide gras insaturé

Un acide gras insaturé (AGI) est un acide gras qui comporte une ou plusieurs doubles liaisons carbone-carbone.

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Acide gras saturé

Un acide gras saturé (AGS) est un acide gras ayant des atomes de carbone totalement saturés en hydrogène (voir figure).

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Acide gras synthase

L'acide gras synthase (FAS, de l'anglais fatty acid synthase) est une enzyme, codée chez l'Humain par le gène FASN, ou un système d'enzymes qui réalise la biosynthèse des acides gras linéaires saturés par des condensations de Claisen successives d'unités sur de jusqu'à obtention de l'acide palmitique: On connaît essentiellement deux types d'acide gras synthases.

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Acide isobutyrique

L'acide isobutyrique ou acide 2-méthylpropanoïque ou acide isobutanoïque est l'acide carboxylique de formule semi-développée (CH3)2-CH-COOH.

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Acide isopalmitique

L'acide isopalmitique, ou acide 14-méthylpentadécanoïque, est un acide gras saturé ramifié à de carbone présent dans le lait de vache et produits laitiers tels que le beurre.

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Acide isovalérianique

L’acide isovalérianique ou acide 3-méthylbutanoïque (nom IUPAC) est un acide carboxylique à 5 atomes de carbone, c'est donc un isomère de l'acide pentanoïque.

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Acide malique

L'acide malique est un acide dicarboxylique alpha-hydroxylé de formule.

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Acide oléique

L'acide oléique est un acide gras mono-insaturé à 18 atomes de carbone, son nom vient du latin oleum qui signifie « huile ».

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Acide oxaloacétique

L'acide oxaloacétique, dont la base conjuguée est l'oxaloacétate, est un acide dicarboxylique de formule.

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Acide palmitique

L’acide palmitique (de palmitine avec le suffixe -ique) également appelé acide cétylique, acide hexadécanoïque (nom systématique) ou encore acide palmique, constitue l'un des acides gras saturés les plus courants chez les animaux et les plantes.

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Acide palmitoléique

L'acide palmitoléique, ou acide cis-9-hexadécénoïque, est un acide gras monoinsaturé qui est un constituant courant des glycérides des tissus adipeux humains.

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Acide pyruvique

L’acide pyruvique est un composé chimique de formule.

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Acide shikimique

L'acide shikimique, plus connu sous sa forme anionique, les shikimates, est un intermédiaire biochimique important dans les plantes et les micro-organismes.

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Acide tuberculostéarique

L'acide tuberculostéarique, ou acide 10-méthylstéarique, est un acide gras saturé ramifié à de carbone produit par les bactéries actinomycètes.

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Actinomycetales

Les Actinomycetales sont un ordre de bactéries filamenteuses à Gram positif de la classe des Actinomycetes.

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Acyl-coenzyme A

Acyl-coenzyme A, abrégée en Acyl-CoA, est le nom générique attribué aux thioesters formés par la coenzyme A avec un acide gras à longue chaîne, dont ne demeure plus qu'un résidu acyle.

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Allostérie

L'allostérie (du grec ἄλλoς, allos: autre et στερεός, stereós: solide) est un mode de régulation de l'activité d'une protéine oligomérique par lequel la fixation d'une molécule effectrice en un site modifie les conditions de fixation d'une autre molécule, en un autre site distant de la même protéine.

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Anaérobie

bactéries du genre Desulfovibrio. Un anaérobie ou organisme anaérobie est tout organisme dont le métabolisme redox ne dépend pas du dioxygène.

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ARN polymérase

L'ARN polymérase est un complexe enzymatique responsable de la synthèse de l'acide ribonucléique, ou ARN, à partir d'une matrice d'ADN.

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Atome

hélium 4, agrandi à droite, est formé de deux protons et de deux neutrons. Atomes de carbone à la surface de graphite observés par microscope à effet tunnel. Un atome est la plus petite partie d'un corps simple pouvant se combiner chimiquement avec un autre.

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ATP citrate lyase

L’ATP citrate lyase est une acyltransférase importante de la biosynthèse des acides gras qui clive le citrate en oxaloacétate et acétyl-CoA avec hydrolyse concomitante d'une molécule d'ATP en ADP et Pi: |- align.

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Bacillota

Les Bacillota – anciennement Firmicutes – sont un embranchement du règne des Bacteria.

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Bacillus

Bacillus est un genre de bactéries à Gram positif, appartenant à la famille des bacillacées (Bacillaceae), l’ordre des caryophanales et la classe des bacilles (Bacilli).

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Bacillus subtilis

Bacillus subtilis est une bactérie catalase-positive que l'on trouve habituellement dans le sol, mais c'est surtout une espèce ubiquitaire.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Bêta-cétoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase I

La bêta-cétoacyl- synthase, ou bêta-cétoacyl-ACP synthase, est une acyltransférase qui catalyse la réaction: C'est l'une des enzymes du complexe acide gras synthase de la biosynthèse des acides gras.

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Bêta-oxydation

La β-oxydation, communément appelée spirale de Lynen, est la principale voie métabolique de dégradation des molécules d'acides gras pour produire.

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Biosynthèse

Cuir de champignon, produit d'une biosynthèse La biosynthèse est la formation de substances par un être vivant ou son symbiote, dans son milieu interne ou dans les excrêtats que sont le mucus, les coquilles des œufs ou des mollusques, l’écorce Elle intéresse les chimistes et les biotechnologistes qui découvrent dans les cellules ou les organismes de nouveaux moyens, moins polluants ou moins énergivores, de produire des molécules complexes.

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Carbone

Le carbone est l'élément chimique de et de Il possède trois isotopes naturels.

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Catalyse

Intérieur du musée de la catalyse à Widnes en Angleterre. En chimie, la catalyse (du nom grec:, « dissolution. ») se réfère à l'accélération ou la réorientation de la cinétique de réaction au moyen d'un catalyseur, et dans certains cas à la sélectivité pour diriger la réaction dans un sens privilégié (réaction concurrente, production d'un produit plutôt qu'un autre).

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Cétoacide

Les cétoacides sont des acides organiques portant une fonction acide carboxylique et une fonction cétone.

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Citrate synthase

La citrate synthase (CS) est une acyltransférase qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient à la du cycle de Krebs, où elle catalyse une réaction irréversible qui engage cette voie métabolique: la condensation du résidu acétyle de l'acétyl-CoA sur l'oxaloacétate pour former du citrate en libérant la coenzyme A; l'oxaloacétate est régénéré après un tour complet du cycle de Krebs.

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Classe (biologie)

Principaux rangs taxinomiques. En biologie, la classe est le troisième niveau de la classification classique (c’est-à-dire n’utilisant pas la notion de distance génétique) des espèces vivantes (voir systématique).

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Clostridia

Les Clostridia sont une classe de bactéries diversifiée contenant un mélange d'organismes Gram positifs et Gram négatifs de l'embranchement des Bacillota.

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Coenzyme A

La coenzyme A (CoA) est une coenzyme de transfert de groupements acyle intervenant dans de très nombreuses voies du métabolisme (cycle de Krebs, bêta-oxydation).

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Complexe pyruvate déshydrogénase

Le complexe pyruvate déshydrogénase (PDC) est l'association de trois enzymes intervenant séquentiellement pour catalyser la décarboxylation oxydative du pyruvate en acétyl-CoA.

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Composé alicyclique

Un composé alicyclique est un composé organique qui est à la fois aliphatique et cyclique.

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Composé aliphatique

Les composés aliphatiques (du grec aleiphat-, aleiphar, -atos: huile, graisse), sont les hydrocarbures à chaîne ouverte (linéaire ou ramifiée), et ceux comprenant un ou plusieurs cycles non-aromatiques (composés alicycliques).

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Composé cyclique

Le benzène est un composé cyclique. En chimie organique, un composé cyclique est une substance dans laquelle au moins une série d'atomes, notamment de carbone, est liée de manière successive par des liaisons covalentes pour former un cycle (une molécule cyclique).

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Composé insaturé

Les composés insaturés sont, en chimie organique, des composés dont le nombre total d'atomes est inférieur à celui que l'on peut déduire de la valence maximale de chacun des atomes constitutifs prise individuellement.

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Condensation de Claisen

La condensation de Claisen (à ne pas confondre avec le réarrangement de Claisen) est une réaction omniprésente en milieu biologique.

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Cycle de Krebs

Le cycle de Krebs, aussi appelé cycle des acides tricarboxyliques ou cycle de l'acide citrique par anglicisme, est une voie métabolique présente chez tous les organismes aérobies et dont la fonction première est d'oxyder les groupes acétyle, issus notamment de la dégradation des glucides, des lipides et des protéines, pour en récupérer l'énergie sous forme de huit électrons à haut potentiel de transfert et d'une molécule de GTP ou d'ATP; les électrons à haut potentiel de transfert, récupérés sur le NADH et l'ubiquinol (ou 10 réduite), circulent ensuite à travers la chaîne respiratoire pour former à leur tour des molécules d’ATP supplémentaires par la phosphorylation oxydative.

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Cytochrome b5

1JEX). Les cytochromes b5 sont des hémoprotéines transporteuses d'électrons ubiquitaires présentes chez les animaux, les plantes, les mycètes et les bactéries pourpres phototrophes.

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Cytosol

Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux), aussi appelé ergastoplasme 6. Appareil de Golgi 7. Cytosquelette 8. Réticulum endoplasmique lisse 9. Mitochondrie 10. Vacuole dans les cellules végétales 11. '''Cytosol''' 12. Lysosome dans les cellules animales 13. Centriole Le cytosol ou cytosole est, en biologie cellulaire, la phase liquide dans laquelle baignent les organites cytoplasmiques présents à l'intérieur des cellules.

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Décarboxylation

La décarboxylation est une réaction chimique au cours de laquelle une molécule de dioxyde de carbone est éliminée (généralement par chauffage) d'une molécule organique portant un groupe carboxyle, selon le schéma général suivant: \rm R-\color \color \xrightarrow\text R-H + CO_2.

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Dimère

Le saccharose, ou sucre de table, est un dimère composé de glucose et de fructose. En chimie, un dimère est une molécule de la famille des polymères ne comportant que deux sous-unités.

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Dioxyde de carbone

Le dioxyde de carbone, aussi appelé gaz carbonique ou anhydride carbonique, est un composé inorganique dont la formule chimique est, la molécule ayant une structure linéaire de la forme O.

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Dioxygène

Le dioxygène, communément nommé oxygène, est une substance constituée de molécules (constituées chacune de deux atomes d'oxygène).

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Eau

L'eau est une substance chimique constituée de molécules.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Escherichia coli

Escherichia coli, en abrégée E. coli, est une bactérie intestinale des organismes à sang chaud, Gram négatif, du genre Escherichia, en forme de bâtonnet appelée parfois colibacille.

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Espèce

classification du vivant. Dans les sciences du vivant, l’espèce (du latin species, « type » ou « apparence ») est le taxon de base de la systématique.

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Estérification

L'estérification est une réaction de chimie organique au cours de laquelle un groupe fonctionnel ester R1-COO-R2 est obtenu par condensation d'un groupe acide carboxylique R1-COOH et d'un groupe alcool R2-OH ainsi que formation d'eau H2O.

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Ester

Séquence de la fonction ester carboxylique. En chimie, la fonction ester désigne un groupement caractéristique formé d'un atome lié simultanément à un atome d'oxygène par une double liaison et à un groupement alkoxyle.

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Eukaryota

Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.

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Expression génétique

L'expression des gènes, encore appelée expression génique ou expression génétique, désigne l'ensemble des processus biochimiques par lesquels l'information héréditaire stockée dans un gène est lue pour aboutir à la fabrication de molécules qui auront un rôle actif dans le fonctionnement cellulaire, comme les protéines ou les ARN.

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Foie

Le foie est en rouge sur cette représentation du système digestif humain. Le foie est le plus gros organe abdominal et fait partie de l'appareil digestif sécrétant la bile et remplissant plus de vitales, notamment les trois suivantes: une fonction d'épuration, une fonction de synthèse et une fonction de stockage.

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Fungi

spores fongiques dans les conditions optimales. Autre agent actif d'une pourriture du bois, l'Hypholome en touffes, champignon saprotrophe très commun. Les Fonges, également appelés Mycètes, sont un règne d'organismes eucaryotes appelés communément champignons.

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Gène

Un gène, du grec ancien (« génération, naissance, origine »), est, en biologie, une séquence discrète et héritable de nucléotides dont l'expression affecte les caractères d'un organisme.

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Genre (biologie)

nom d'espèce complet est ''Buteo oreophilus''. En systématique, le genre est un rang taxinomique (ou taxonomique) qui regroupe un ensemble d'espèces ayant en commun plusieurs caractères similaires.

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Glande mammaire

Les glandes mammaires sont les glandes des mamelles des mammifères mâles et femelles.

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Groupe fonctionnel

En chimie, les composés organiques peuvent être considérés comme constitués d'un squelette relativement non réactif appelé lalcane parent en nomenclature substitutive, et d’un ou plusieurs groupes fonctionnels.

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Homo sapiens

Homo sapiens, plus communément appelé « homme moderne », « homme », « humain », ou « être humain », est une espèce de primates originaire d'Afrique qui s'est aujourd'hui répandue et naturalisée sur l'ensemble de la planète hormis l'Antarctique.

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Inhibiteur enzymatique

VIH (rubans rouges, bleus et jaunes) associée à l'inhibiteur qu'est le ritonavir (petite structure en bâtons et boules près du centre). Un inhibiteur enzymatique est une substance se liant à une enzyme et qui en diminue l'activité.

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Isobutyryl-coenzyme A

L’isobutyryl-coenzyme A, abrégée en isobutyryl-CoA, est le thioester de l'acide isobutyrique avec la coenzyme A. C'est un intermédiaire du métabolisme de la leucine.

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Isoleucine

L’isoleucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ile et I) est un α-aminé faisant partie des 20 acides aminés majeurs codés par le génome (exception faite de la Sélénocystéine) servant à la synthèse des protéines.

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Isomérie

Différents types d'isomères. En chimie organique, on parle d'isomérie lorsque deux molécules possèdent la même formule brute mais ont des formules développées ou stéréochimiques différentes.

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Isomérie cis-trans

En chimie organique, les préfixes cis et trans servent à préciser la configuration géométrique d'une molécule en spécifiant si, par rapport à la chaine principale de la molécule décrite, les principaux groupes fonctionnels sont situés du même côté (cis-, « ensemble » en latin) ou au contraire de part et d'autre (trans-, « à travers » en latin).

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Kinase

Schéma de fonctionnement des kinases Les kinases, (catalyseurs de la phosphorolyse), sont des enzymes du groupe des transférases catalysant les réactions de phosphorylation par l'ajout d'un ion phosphate à une molécule cible à partir de l'ATP.

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Lactation

chevreau). Tétée d'un jeune babouin hamadryas. Enfant humain en train de téter. Mamelles d'une femme avant la gestation. Les mêmes au moment de la montée de lait. Sécrétion de lait maternel humain La lactation est une fonction physiologique des femelles de mammifères, y compris les femmes.

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Leucine

La leucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Leu et L), du grec ancien (blanc, éclatant), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.

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Levure

Une levure est un champignon unicellulaireCertaines levures sont cependant capables d'arborer un aspect pseudo multicellulaire par la formation, par exemple, de pseudomycélium.

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Liaison chimique

Une liaison chimique est une interaction durable entre plusieurs atomes, ions ou molécules, à une distance permettant la stabilisation du système et la formation d'un agrégat ou d'une substance chimique.

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Liaison covalente

Une liaison covalente est une liaison chimique dans laquelle deux atomes se partagent deux électrons (un électron chacun ou deux électrons venant du même atome) d'une de leurs couches externes afin de former un doublet d'électrons liant les deux atomes.

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Liaison double

texte.

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Lipogenèse

''acyl carrier protein'' (ACP). La lipogenèse désigne l'ensemble des processus biochimiques permettant la synthèse des lipides en général et des acides gras en particulier.

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Malate déshydrogénase

La malate déshydrogénase (MDH) est une oxydoréductase du cycle de Krebs qui catalyse la réaction: Cette enzyme intervient dans plusieurs voies métaboliques majeures, notamment le cycle de Krebs.

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Malonyl-coenzyme A

La malonyl-coenzyme A, souvent écrite malonyl-CoA, est un thioester entre l'une des fonctions acide carboxylique de l'acide malonique et la fonction thiol de la coenzyme A. C'est une molécule clé dans la biosynthèse des acides gras et des polycétides.

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Mammifère

Les Mammifères (Mammalia) sont une classe d'animaux vertébrés caractérisés par la présence de fourrure (excepté pour certains mammifères marins), d'une oreille moyenne comportant trois os, d'un néocortex et de glandes mammaires, dont les représentants femelles nourrissent leurs juvéniles à partir d'une sécrétion cutanéo-glandulaire spécialisée appelée lait (on dit alors qu'elles allaitent).

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Méthylation

La méthylation est l'addition d'un groupe méthyle, le phénomène inverse étant la déméthylation.

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Méthyle

En chimie, le groupe méthyle (souvent abrégé Me) est le radical alkyle hydrophobe dérivé du méthane (CH4).

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Méthylmalonyl-coenzyme A

La méthylmalonyl-coenzyme A, généralement écrite méthylmalonyl-CoA, est un thioester de la coenzyme A et de l'acide méthylmalonique.

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Membrane plasmique

La membrane plasmique, également appelée membrane cellulaire, membrane cytoplasmique, voire plasmalemme, est une membrane biologique séparant l'intérieur d'une cellule, appelé cytoplasme, de son environnement extérieur, c'est-à-dire du milieu extracellulaire.

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Micro-organisme

Un micro-organisme ou microorganisme (du grec ancien, « petit » et de, « organe ») ou microbe (du grec, « petit » et, « vie ») est un organisme unicellulaire qui ne peut être observé individuellement qu'à l'aide d'un microscope.

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Mitochondrie

Une mitochondrie est un organite, possédant toutes les caractéristiques d'un organisme procaryote, entourée d'une double membrane composée chacune d'une double couche phospholipidique, et retrouvée chez la plupart des cellules eucaryotes.

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Mycobacterium

Mycobacterium, la Mycobactérie, est un genre de bactéries de la famille des Mycobacteriaceae.

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Nicotinamide adénine dinucléotide

Le nicotinamide adénine dinucléotide (NAD) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.

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Nicotinamide adénine dinucléotide phosphate

Le nicotinamide adénine dinucléotide phosphate (NADP) est une coenzyme présente dans toutes les cellules vivantes.

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Oligomère

Un oligomère est une molécule constituée d'un petit nombre (généralement inférieur à dix) d'éléments identiques ou très semblables (pour un grand nombre on parle de polymère).

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Ordre (biologie)

Principaux rangs taxinomiques. En biologie, l'ordre est le quatrième niveau de classification classique des espèces vivantes (voir systématique).

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Ose

Un ose (ou monosaccharide) est un monomère de glucide.

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Palmitoyl-coenzyme A

La palmitoyl-coenzyme A ou palmitoyl-CoA est la forme « activée » de l'acide palmitique, c'est-à-dire le thioester que ce dernier forme avec la coenzyme A (CoA).

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Panse

caillette, '''t.''' partie pylorique de la caillette. La panse, aussi appelée rumen, est le premier des quatre compartiments du système digestif des ruminants.

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Phosphate

Atlas mondial des océans).. Phosphate dans une coupelle. Un phosphate est un composé dérivé de l'acide phosphorique par perte ou substitution d'un ou plusieurs atomes d'hydrogène, par d'autres atomes ou groupes fonctionnels.

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Phospholipide

polaire et - deux « queues » aliphatiques. Organisation des phospholipides en milieu aqueux. en Représentation d'une membrane cellulaire montrant l'organisation des phospholipides en bicouche lipidique. Structure générique de sphingomyéline. stéaryl-phosphatidylcholine. Un phospholipide est un lipide contenant un groupe acide phosphorique en tant que mono ou di-ester.

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Phosphopantéthéine

La 4'-phosphopantéthéine est un groupe prosthétique dérivé de la pantéthéine entrant dans la constitution de la (CoA) ainsi que l'acyl carrier protein'' (ACP).

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Phosphorylation

chaîne latérale de sérine phosphorylée. Les atomes d'oxygène sont en rouge, ceux de phosphore, en orange, le carbone en gris et l'azote en bleu. Les atomes d'hydrogène ne sont pas représentés. La phosphorylation est l'addition d'un groupe phosphate (un phosphoryl PO32− plus précisément) qui est transféré à une protéine ou à une petite molécule, tel le glucose, l'adénine ou les glycérolipides.

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Phylum

Principaux rangs taxinomiques. Le '''phylum''' est le niveau situé sous le règne mais au-dessus de la classe. À noter que, tel que repris dans ce schéma, le terme ''division'' ne s'applique qu'au règne végétal, tandis qu'on parle d'embranchement pour le règne animal. En systématique, le phylum (au pluriel phyla) est le deuxième niveau dans la classification classique des espèces vivantes, le premier étant le règne.

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Plante

Les plantes (Plantae) sont des organismes photosynthétiques et autotrophes, caractérisés par des cellules végétales.

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Promoteur (biologie)

Un promoteur, ou séquence promotrice, est une région de l'ADN située à proximité d'un gène et indispensable à la transcription de l'ADN en ARN.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Protéine porteuse d'acyle

groupe acyle lié à une ACP. 4'-phosphopantéthéine. Exemple d'une apoprotéine d'ACP. Une protéine porteuse d'acyle, généralement désignée par le terme anglais acyl carrier protein (ACP), est une protéine déterminante dans la biosynthèse des acides gras et des polycétides qui possède un résidu de phosphopantéthéine capable d'établir une liaison thioester avec un groupe acyle susceptible d'être allongé par des condensations de Claisen.

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Protista

Les protistes, sont des microorganismes eucaryotes à organisation cellulaire dite simple, unicellulaire le plus souvent, multicellulaire parfois mais sans tissus spécialisés.

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Pseudomonas aeruginosa

Pseudomonas aeruginosa, autrement connu sous le nom de bacille pyocyanique, bacille du pus bleu ou pyo, est une bactérie gram-négative du genre Pseudomonas.

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Réaction d'oxydoréduction

L'aluminothermie est une réaction d'oxydoréduction entre l'aluminium et certains oxydes métalliques. Une réaction d'oxydoréduction ou réaction rédox est une réaction chimique au cours de laquelle se produit un transfert d'électrons.

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Réaction de déshydratation

En chimie, une réaction de déshydratation est une réaction chimique dans laquelle le réactif de départ perd un atome d'hydrogène et un groupe hydroxyle, soit une molécule d'eau, l'inverse de la réaction d'hydratation.

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Régulation de la transcription

La régulation de la transcription est la phase du contrôle de l'expression des gènes agissant au niveau de la transcription de l'ADN.

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Régulon

Un régulon est un ensemble fonctionnel de gènes organisés en opéron ou non, dont l'expression est corégulée.

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Réplication de l'ADN

vignette La réplication de l'ADN, aussi appelée duplication de l'ADN ou synthèse de l'ADN, est le processus au cours duquel l'ADN est synthétisé.

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Répresseur

Répresseur lactose complexé à son site opérateur Un répresseur est une molécule, souvent une protéine, régulant négativement la transcription d'un ou de plusieurs gènes en se liant à une séquence spécifique sur l'ADN, appelée opérateur.

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Résidu (biochimie)

acides aminés. En biochimie et en biologie moléculaire, un résidu est la partie d'une molécule, généralement un monomère, qui est restée inchangée après être entrée dans la composition d'une biomolécule complexe ou d'un polymère.

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Réticulum endoplasmique

En biologie cellulaire, le réticulum endoplasmique (forme abrégée: RE) est un organite présent dans les cellules eucaryotes et lié à la membrane nucléaire.

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Rétroinhibition

La rétroinhibition se produit lors d'une réaction enzymatique.

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Ruminantia

Les Ruminants (avec une majuscule), Ruminantia, forment un sous-ordre de mammifères cétartiodactyles.

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S-Adénosylméthionine

La S-adénosylméthionine, ou SAM, est un métabolite présent dans les cellules et qui est impliqué en premier lieu comme coenzyme dans les réactions de transfert de groupes méthyle.

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Saccharomyces cerevisiae

Saccharomyces cerevisiae est une espèce de levures employée notamment dans la fermentation de la bière.

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Signalisation cellulaire

La signalisation cellulaire est un système complexe de communication qui régit les processus fondamentaux des cellules et coordonne leur activité.

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Signalisation lipidique

Exemples de lipides de signalisation cellulaire: - '''LPA''': acide lysophosphatidique, - '''S1P''': sphingosine-1-phosphate, - '''PAF''': facteur d'activation plaquettaire, - '''AEA''': anandamide. La signalisation lipidique désigne l'ensemble des processus biochimiques de signalisation cellulaire impliquant des lipides qui se fixent sur une protéine cible, telle qu'un récepteur, une kinase ou une phosphatase, laquelle déclenche à son tour d'autres processus au sein de la cellule en fonction des messagers lipidiques.

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Streptomyces

Le genre Streptomyces désigne des bactéries filamenteuses Gram-positif non pathogènes appartenant à l'ordre des Actinomycètes, qui comprend notamment les genres Mycobacterium, Corynebacterium, Nocardia, Rhodococcus et Frankia.

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Thioester

Structure générale d'un thioester Les thioesters - aussi dénommés esters sulfuriques - sont des composés résultant de la condensation d'un sulfure avec un groupement acyle.

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Tissu adipeux

Le tissu adipeux, masse grasse ou graisse corporelle, est un tissu conjonctif, ses cellules sont séparées par de la matrice extracellulaire.

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Transamination

La réaction de transamination est une réaction chimique toujours réversible qui consiste en l'échange d'un fonction amine primaire entre un acide α-aminé et un α-cétoacide.

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Transcription (biologie)

En biologie moléculaire, la transcription est la première étape de l'expression génique basée sur l'ADN, au cours de laquelle un segment particulier d'ADN est « copié » en ARN par une enzyme appelée ARN polymérase.

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Valine

La valine (abréviations IUPAC-IUBMB: Val et V) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.

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Vibrio

Vibrio (en français les Vibrions) est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Vibrionaceae.

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Voie métabolique

Une voie métabolique est un ensemble de réactions chimiques catalysées par une série d'enzymes qui agissent de manière séquentielle.

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2-Méthylbutyryl-coenzyme A

La 2-méthylbutyryl-coenzyme A, abrégée en 2-méthylbutyryl-CoA, est le thioester de l'acide 2-méthylbutanoïque avec la coenzyme A. C'est un intermédiaire du métabolisme de l'isoleucine.

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2-Oxoacide ramifié décarboxylase

La 2-oxoacide ramifié décarboxylase (BCKA décarboxylase, de l'« branched-chain α-keto-acid decarboxylase »), est une lyase qui catalyse la réaction: Cette enzyme est capable d'agir sur un grand nombre de substrats différents, qui ont en commun d'être des α-cétoacides jouant le rôle d'amorces dans la biosynthèse des acides gras ramifiés.

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3-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) déshydratase

La 3-hydroxyacyl- déshydratase, ou 3-hydroxyacyl-ACP déshydratase, est une lyase qui catalyse la réaction: C'est l'une des enzymes du complexe acide gras synthase de la biosynthèse des acides gras.

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3-hydroxydécanoyl-(acyl-carrier-protein) déshydratase

La 3-hydroxydécanoyl- déshydratase est une lyase, spécifique aux résidus à liés à l'''acyl carrier protein'' au cours de la synthèse des acides gras linéaires saturés, qui intervient notamment dans le processus de désaturation anaérobie chez les bactéries.

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