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-chrom-
Mots avec le préfixe ou le suffixe chrome signifiant "couleur": Chrom-.
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Abi prism 310
L'Abi Prism 310 (TM) est un Séquenceur d'ADN monocapillaire produit par la société PerkinElmer.
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Acridone
L'acridone est un composé organique de formule.
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Adolf von Baeyer
Adolf von Baeyer, né Johann Friedrich Wilhelm Adolf Baeyer le à Berlin et mort le à Starnberg (Empire allemand) est un chimiste allemand qui synthétisa l'indigo et obtint en 1905 le prix Nobel de chimie après avoir été lauréat de la médaille Davy en 1881.
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Affimer
Dans le domaine de la biologie moléculaire, un Affimer est une protéine, petite et très stable ayant la propriété de spontanément se lier à une molécule-cible et à aucune autre (d'une manière similaire à un anticorps; les Affimer font partie des anticorps synthétiques. Ces molécules sont artificiellement produites par biotechnologie, conçues pour imiter les capacités de reconnaissance moléculaire caractéristiques des anticorps monoclonaux dans différentes applications. Les ingénieurs biomolécularistes tentent d'améliorer les propriétés expérimentales de ces réactifs d'affinité (ou Aptamères), en augmentant leur stabilité, en améliorant leur robustesse dans une gamme plus étendue de températures et de pH, en offrant des réactifs de petites tailles (meilleure pénétration cellulaire) et en les rendant faciles à exprimer à hauts rendements dans des bactéries ''E. coli'' et des cellules de mammifères génétiquement modifiées.
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Alexa Fluor
Alexa Fluor est le nom d'une gamme de fluorochromes produit par la société, filiale d'Invitrogen.
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Ambre bleu
Lambre bleu (espagnol: ámbar azul) est une rétinite (résine végétale) contenant du soufre, composée de carbone, d'oxygène et d'hydrogène.
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Aminophénol
L'aminophénol ou hydroxyaniline est un composé aromatique de formule HOC6H4NH2.
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Annexine V
L'annexine V est une protéine possédant une forte affinité pour la phosphatidylsérine (PS).
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Anticorps à domaine unique
CDR3 est de couleur orangée. Un anticorps à domaine unique (sdAb, de l'), également connu sous le nom de nanocorps, est un fragment d'anticorps composé d'un seul domaine d'anticorps variable monomère.
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Antiglobuline
L'antiglobuline est un anticorps dirigé contre une immunoglobuline.
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Autofluorescence
L'autofluorescence est l'émission naturelle de lumière (de fluorescence) par des structures biologiques telles que les mitochondries et les lysosomes lorsqu'ils ont absorbé de la lumière, et est souvent utilisée pour distinguer la lumière provenant de marqueurs fluorescents ajoutés artificiellement (fluorophores).
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Électrophorèse sur gel d'agarose
Cuve remplie de tampon et transformateur utilisés pour l'électrophorèse sur gel d'agarose. L'électrophorèse sur gel d'agarose est une méthode utilisée en biochimie et en biologie moléculaire pour séparer l'ADN, l'ARN ou des protéines en fonction de leur masse moléculaire.
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Étiquette (biologie)
En biologie moléculaire, une étiquette, ou un tag, est une courte séquence d'acides aminés, parfois d'acides nucléiques.
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Évolution dirigée
Exemple d'évolution dirigée en comparaison à l'évolution naturelle. Le cycle interne indique 3 étapes du cycle d'évolution dirigée avec le processus naturel correspondant imité indiqué entre parenthèses. Le cycle externe montre les étapes d'une expérience typique. Les symboles en rouge vif correspondent aux variants fonctionnels, les symboles en rouge pâle correspondent aux variants avec une fonction réduite. L'évolution dirigée est analogue à l'escalade d'une colline dans un paysage adaptatif où l'élévation représente la propriété d'intérêt. Chaque cycle de sélection échantillonne des mutants de tous les côtés du modèle de départ (1), et sélectionne le mutant avec l'élévation la plus haute, qui est ainsi celui qui escalade la colline. Ce processus est répété jusqu'à ce qu'un sommet local soit atteint (2). L'évolution dirigée (ED) est une méthode utilisée en ingénierie des protéines qui imite le processus de sélection naturelle pour "diriger" l'évolution des protéines ou des acides nucléiques vers un certain objectif défini par l'utilisateur.
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Bâton lumineux
Un bâton lumineux (anglais: glowstick, lightstick) aussi appelé SnapLight ou Cyalume (marques déposées) est un objet destiné à produire de la lumière pour l'éclairage ou la signalisation.
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Biologie chimique
La biologie chimique, ou chémobiologie, est une discipline scientifique qui étudie le vivant à l'aide d'outils chimiques.
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Biophoton
Le biophoton (du grec βιο signifiant « vie » et φωτο signifiant « lumière ») est un photon (corpuscule d’énergie électromagnétique) d'origine biologique n'étant pas issu de produits d'une réaction enzymatique spécifique.
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Caryotype
Le caryotype (ou caryogramme) est l'arrangement standard de l'ensemble des chromosomes d'une cellule, à partir d'une prise de vue microscopique.
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Chimie click
Dans le domaine de la synthèse chimique, la chimie clic, ou chimie click (click chemistry en anglais ou plus communément tagging) est une classe de réactions chimiques biocompatibles utilisées pour joindre à un substrat choisi une biomolécule spécifique (le click peut évoquer le bruit imaginaire d'un clipsage d'une molécule sur l'autre).
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Chimiluminescence
Une réaction chimioluminescente. La chimiluminescence, ou chimioluminescence, est la production de lumière à la suite d'une réaction chimique.
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Ciguatera
La ciguatera (ou "gratte" en Nouvelle-Calédonie) est une forme particulière d’ichtyosarcotoxisme (du grec ichtyos: poisson, sarcos: chair, toxicon: toxique), c'est-à-dire une intoxication alimentaire par les chairs de poissons contaminés par la microalgue benthique Gambierdiscus toxicus présente dans les récifs coralliens.
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Coloration Hoechst
Structure chimique du colorant Hoechst. Les colorants Hoechst font partie de la famille des colorants à l'aide de marqueurs fluorescents utilisés pour marquer l'ADN.
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Croissance bactérienne
La notion de croissance bactérienne recouvre deux aspects: la croissance de la cellule bactérienne (taille, masse, volume), et le phénomène de division cellulaire (population).
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Cytométrie de masse
La cytométrie de masse (ou CyTOF, pour Cytometry by Time of Flight) est une méthode analogue à la cytométrie en flux pour l'analyse de populations cellulaires.
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Cytométrie en flux
La cytométrie en flux (CMF) est une technique de caractérisation individuelle, quantitative et qualitative, de particules en suspension dans un liquide.
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DAPI
Le DAPI ou 4',6-diamidino-2-phénylindole est une molécule fluorescente capable de se lier fortement aux bases adénine (A) et thymine (T) de l'ADN.
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David Klenerman
David Klenerman (né en 1959) est un chimiste biophysique britannique et professeur de chimie biophysique au Département de chimie de l'Université de Cambridge et membre du Christ's College, Cambridge.
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Didésoxyribonucléotide
Un didésoxyribonucléotide (souvent abrégé ddNTP) est un nucléotide dont les groupements 2'OH et 3'OH du ribose sont absents.
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Digoxygénine
La digoxigénine (DIG) est un stéroïde naturellement présent dans les inflorescences et les feuilles de certaines digitales telles que Digitalis purpurea ou Digitalis lanata.
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Diode électroluminescente organique
Prototype de panneaux OLED. Une diode électroluminescente organique ou DELO — usuellement désignée par son acronyme anglais OLED, pour organic light-emitting diode — est un composant électronique qui permet de produire de la lumière.
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Eurogentec
Eurogentec est une société internationale de biotechnologie fondée en 1985 en tant que Startup de l’Université de Liège.
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Fluorescéine
La fluorescéine (ou 3H-xanthène-3-one), dont le sel de sodium se nomme fluorescéine sodique ou uranine, est un composé organique dont la structure comporte deux molécules de phénol liées à un cycle pyrane lui-même connecté en position ortho à un acide benzoïque.
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Fluorescence
La fluorescence est une émission lumineuse provoquée par l'excitation des électrons d'une molécule (ou atome), généralement par absorption d'un photon immédiatement suivie d'une émission spontanée.
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Hédi Mattoussi
Hédi Mattoussi, né le en Tunisie, est un scientifique des matériaux tuniso-américain et professeur à l'université d'État de Floride.
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Hybridation génomique comparative
L'hybridation génomique comparative (en anglais, Comparative Genomic Hybridization ou CGH) est une technique de cytogénétique moléculaire permettant d'analyser les variations du nombre de copies dans l'ADN.
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Immunofluorescence
noyau des cellules. En vert, les filaments d'actine. L’immunofluorescence est une technique d’immunomarquage, qui utilise des anticorps ainsi que des fluorochromes.
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Immunohistochimie
ganglion de souris, vue par immunofluorescence. L'immunohistochimie (IHC) est une méthode de localisation de protéines dans les cellules d'une coupe de tissu, par la détection d'antigènes au moyen d'anticorps.
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Invitrogen
Invitrogen est une société spécialisée en produit pour la biologie moléculaire.
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Iodure de potassium
L'iodure de potassium est un composé inorganique de formule chimique KI.
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Isothiocyanate de fluorescéine
L'isothiocyanate de fluorescéine ou est un dérivé de la fluorescéine, utilisé dans un large spectre d'applications comme la cytométrie en flux.
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Lectine
Les lectines sont des protéines qui se lient spécifiquement et de façon réversible à certains glucides.
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Lidar
FASOR, lidar à fluorescence expérimental utilisé pour sonder la densité de la haute atmosphère en excitant les atomes de sodium. La télédétection par laser ou lidar, acronyme de l'expression en langue anglaise « light detection and ranging » ou « laser imaging detection and ranging » (soit en français « détection et estimation de la distance par la lumière » ou « par laser »), est une technique de mesure à distance fondée sur l'analyse des propriétés d'un faisceau de lumière renvoyé vers son émetteur.
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Lipide fluorescent
Un lipide fluorescent est un lipide qui a été transformé chimiquement pour qu'il conserve approximativement les propriétés du composé de départ tout en incluant un fluorophore.
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Méthodes d'investigation des interactions protéine–protéine
Il existe de nombreuses méthodes d'investigation des interactions protéine–protéine.
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Microscope confocal
Schéma de principe du microscope confocal par Marvin Minsky en 1957. Principe de fonctionnement du microscope à fluorescence puis du microscope confocal. Un microscope confocal, appelé plus rarement microscope monofocal, est un microscope optique qui a la propriété de réaliser des images de très faible profondeur de champ (environ) appelées « sections optiques ».
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Microscopie à fluorescence
La microscopie en fluorescence (ou en épifluorescence) est une technique utilisant un microscope optique en tirant profit du phénomène de fluorescence et de phosphorescence, au lieu de, ou en plus de l'observation classique par réflexion ou absorption de la lumière visible naturelle ou artificielleSpring KR, Davidson MW;; Nikon Microscopy (consulté le 28/09/2008).
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Microscopie PALM
La microscopie PALM (ou microscopie par localisation photoactivée) est une microscopie à fluorescence en champ large permettant de dépasser la limite de diffraction (super-résolue) pour atteindre des résolutions typiques de l'ordre de 20nm.
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Microscopie par excitation à deux photons
Microscopie par excitation à 2 photons de l'intestin d'une souris. Rouge: actine. Vert: noyaux des cellules. Bleu: mucus des cellules caliciformes. Obtenu à 780 nm avec un laser Ti-sapph. La microscopie par excitation à deux photons (M2P, TPEF ou 2PEF en anglais, aussi appelée « microscopie 2 photons ») est une technique d'imagerie optique combinant les principes de microscopie à fluorescence et de l'absorption à deux photons, faisant partie de la famille des microscopies multiphotons.
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Microscopie STED
La microscopie STED (stimulated-emission-depletion ou déplétion par émission stimulée) est une microscopie de fluorescence à balayage dont l'illumination est mise en forme pour dépasser la limite de résolution imposée par la diffraction.
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Optode
Une optode ou optrode est un capteur optique qui mesure une substance spécifique, généralement à l'aide d'un transducteur chimique.
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Oxalate de di(2,4,6-trichlorophényle)
Le TCPO ou oxalate de di(2,4,6-trichlorophényle) est le diester du 2,4,6-trichlorophénol et de l'acide oxalique.
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Perte de fluorescence induite par photoblanchiment
Fluorescence diminuant dans une région définie (rectangle rouge), adjacente à une région photoblanchie (cercle rouge). La Perte de fluorescence induite par photoblanchiment, plus communément désignée par son acronyme anglais FLIP (pour Fluorescence Loss Induced by Photobleaching), est une technique de microscopie à fluorescence qu'on utilise pour observer le mouvement de molécules à l'intérieur des cellules et des membranes.
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Phalloïdine
La phalloïdine fait partie des toxines extraites des champignons comme l'amanite phalloïde, Amanita phalloides, mais aussi d'Amanita verna, d'Amanita virosa et Galerina marginata connues sous le nom de phallotoxines.
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Phénotypage
Le phénotypage est la caractérisation du phénotype, l'ensemble des caractères apparents d'un individu, correspondant à une réalisation du génotype.
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Phred
Phred est un programme informatique permettant l'identification des bases d'une séquence d'ADN à partir de données d'un électrophorègramme générées par des séquences marquées à l'aide de fluorochromes et séparées par électrophorèse sur un séquenceur d'ADN automatisé.
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Polymorphisme de longueur des fragments de restriction terminaux
Le polymorphisme de longueur des fragments de restriction terminaux (TRFLP, tRFLP ou parfois T-RFLP, pour l'anglais terminal restriction fragment length polymorphism) est une technique de biologie moléculaire permettant de dresser le profil des communautés microbiennes dans un échantillon ou un milieu en se basant sur la position d'un site de restriction la plus proche d'une extrémité marquée d'un gène amplifié.
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Porphyrine
Les porphyrines sont des molécules à structures cycliques impliquées dans le transport du dioxygène et pouvant jouer le rôle de cofacteur lié (groupement prosthétique) à certaines enzymes.
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Puce à ADN
Principe d'utilisation de la puce à ADN. Une puce à ADN est un ensemble de molécules d'ADN fixées en rangées ordonnées sur une petite surface qui peut être du verre, du silicium ou du plastique.
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Rendement quantique
Le rendement quantique (Φ) d'un processus induit par le rayonnement est égal au nombre de fois qu'un évènement donné arrive divisé par le nombre de photons absorbé par le système.
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Rhodamine
Les rhodamines constituent une famille de composés organiques hétérotricycliques fluorescents basés sur la fluorone.
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Séquençage de l'ADN
Résultat du séquençage par la méthode de Sanger. L'ordre de chaque bande indique la position d'un nucléotide A,T,C ou G Le séquençage de l'ADN consiste à déterminer l'ordre d'enchaînement des nucléotides pour un fragment d’ADN donné.
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Séquenceur d'ADN
Un séquenceur d'ADN est un appareil conçu pour effectuer le séquençage de l'ADN de manière automatique.
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Sclérochronologie
La sclérochronologie (du grec; sklêros: dur; khronos: temps; logos: étude) est l'étude des parties dures des êtres vivants (coquillages, coraux, etc.) par comptage des stries d'accroissement appelées aussi stries de croissance.
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Sequencing analysis
Sequencing analysis (TM) est le logiciel chargé d'analyser les données brutes de séquençage sur le séquenceur de gène Abi prism 310.
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Southern blot
Le ou (également appelé transfert d'ADN ou buvardage de Southern) est une méthode de biologie moléculaire permettant l'analyse de l'ADN.
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Spectroscopie de corrélation de fluorescence
Exemple de SCF La Spectroscopie de Corrélation de Fluorescence (SCF ou FCS pour l'anglais Fluorescence Correlation Spectroscopy) repose sur l'analyse des corrélations des fluctuations de l'intensité de la fluorescence.
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Suivi de particules uniques
Principe du SPT: Les rectangles représentent les images issues d'une acquisition d'image à des instants ''t''.
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SYBR Green I
Le SYBR I est un composé organique aromatique de formule chimique C32H37N4S faisant partie des cyanines asymétriques (fluorophores).
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Tadeusz Estreicher
Tadeusz Estreicher, né le et mort le à Cracovie, est un chimiste, historien et chercheur en cryogénie polonais, professeur à l'Université Jagellon de Cracovie.
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TaqMan
Les sondes TaqMan sont des sondes d'hydrolyse conçues pour accroître la spécificité des techniques de PCR quantitative. La méthode a été pour la première fois décrite en 1991 par des chercheurs de l'entreprise Cetus Corporation, avant que le développement de cette technologie ne soit poursuivi par Roche Molecular Diagnostics pour des applications de diagnostics cliniques et Applied Bioscience pour des applications en recherche.
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Tétrazine
Une tétrazine est un composé organique instable constitué d'un noyau aromatique à six atomes contenant quatre atomes d'azote et deux de carbone.
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Thiazole orange
Le thiazole orange est un pigment fluorochome utilisé en histologie.
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Transfert d'énergie entre molécules fluorescentes
Le transfert d'énergie entre molécules fluorescentes ou transfert d'énergie par résonance de type Förster (en anglais, Förster resonance energy transfer ou FRET, resonance energy transfer ou RET ou electronic energy transfer ou EET), bien qu’observé par Perrin au début du, est décrit pour la première fois par Theodor Förster en 1946.
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Tri cellulaire magnétique
Le tri cellulaire magnétique est une technique de tri cellulaire permettant de sélectionner certains types de cellules et de les isoler grâce à un champ magnétique.
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Variantes de la PCR
La polyvalence de la réaction en chaîne par polymérase (PCR) a conduit au développement d'un grand nombre de variantes de la PCR.
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Vitamine B8
La vitamine, correspondant à la biotine, est une vitamine hydrosoluble encore souvent appelée coenzyme R,, ou encore 7''' dans de nombreux pays, notamment en Allemagne ou dans les pays anglo-saxons (chez ces derniers, la est une appellation erronée pour l'AMP, tandis qu'en France la désigne improprement l'inositol, ces deux composés n'ayant aucun rapport entre eux ni avec la biotine).
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1,1,2,3,4,5 Hexaphénylsilole
Le 1,1,2,3,4,5 hexaphénylsilole, noté HPS, est un composé organique de formule chimique.
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1-Chloro-9,10-bis(phényléthynyl)anthracène
Le 1-chloro-9,10-bis(phényléthynyl)anthracène est un fluorochrome courant de lumière vert-jaune.. Cette substance chimique est utilisée dans les bâtons lumineux haute intensité de 30 min.
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3-Aminophénol
Le 3-aminophénol est un composé organique aromatique de formule C6H4(NH2)(OH).
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5,12-Bis(phényléthynyl)naphtacène
Le 5,12-bis(phényléthynyl)naphtacène, également abrégé en BPEN, est un hydrocarbure aromatique polycyclique de formule utilisé comme fluorochrome pour glowsticks; il émet une lumière orangée.
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7-Aminoactinomycine D
La 7-aminoactinomycine D (7-AAD) est un composé chimique fluorescent dérivé de l'actinomycine D, avec laquelle elle partage une forte affinité pour l'ADN.
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Redirections ici:
Fluorochromes, Fluorophore, Fluorophores.
