Nous travaillons à restaurer l'application Unionpedia sur le Google Play Store
SortantEntrants
🌟Nous avons simplifié notre design pour une meilleure navigation !
Instagram Facebook X LinkedIn
Votre propre Unionpédia avec votre logo et votre domaine, à partir de 9,99 USD/mois
Créer mon Unionpédia

Basic Local Alignment Search Tool

Indice Basic Local Alignment Search Tool

BLAST (acronyme de) est une méthode de recherche heuristique utilisée en bioinformatique.

Table des matières

  1. 24 relations: Acide aminé, Algorithme, Algorithme de Needleman-Wunsch, Algorithme de Smith-Waterman, Alignement de séquences, Bio-informatique, Domaine public (propriété intellectuelle), Espérance mathématique, Famille de gènes, François Képès, Frédéric Dardel, GenBank, Heuristique (mathématiques), Itération, Logiciel multiplateforme, Matrice de similarité, Motif, National Center for Biotechnology Information, Nucléotide, Probabilité, Récepteur de la vitamine D, Séquence biologique, UniProt, Variable aléatoire à densité.

Acide aminé

carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Acide aminé

Algorithme

triangulation). Un algorithme est une suite finie et non ambiguë d'instructions et d’opérations permettant de résoudre une classe de problèmes.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Algorithme

Algorithme de Needleman-Wunsch

L'algorithme de Needleman-Wunsch est un algorithme qui effectue un alignement global maximal de deux chaînes de caractères.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Algorithme de Needleman-Wunsch

Algorithme de Smith-Waterman

Exemple d'algorithme de Smith-Waterman. Les flèches montrent le chemin de l'algorithme à travers la matrice. Les flèches rouges montrent le meilleur alignement local final. L'algorithme de Smith-Waterman est un algorithme d'alignement de séquences utilisé notamment en bioinformatique.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Algorithme de Smith-Waterman

Alignement de séquences

En bio-informatique, l'alignement de séquences (ou alignement séquentiel) est une manière de représenter deux ou plusieurs séquences de macromolécules biologiques (ADN, ARN ou protéines) les unes sous les autres, de manière à en faire ressortir les régions homologues ou similaires.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Alignement de séquences

Bio-informatique

La bioinformatique (ou bio-informatique), est un champ de recherche multidisciplinaire de la biotechnologie où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Bio-informatique

Domaine public (propriété intellectuelle)

En droit de la propriété intellectuelle, le domaine public désigne l'ensemble des œuvres de l'esprit et des connaissances dont l'usage n'est pas ou n'est plus restreint par la loi.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Domaine public (propriété intellectuelle)

Espérance mathématique

Avec un dé on peut obtenir chaque nombre entre 1 et 6 avec une probabilité de 1/6. Ainsi, l'espérance vaut \frac(1+2+3+4+5+6)6.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Espérance mathématique

Famille de gènes

Une famille de gènes est un ensemble de gènes codant une série de protéines formant une famille de protéines.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Famille de gènes

François Képès

François Képès, né le à Paris, est un biologiste cellulaire français, chercheur et professeur en France et à l'étranger, membre de plusieurs académies.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et François Képès

Frédéric Dardel

Frédéric Dardel, né le à Neuilly-sur-Seine, est un biologiste moléculaire français.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Frédéric Dardel

GenBank

La GenBank est une base de données de la séquences d'ADN, comprenant toutes les séquences de nucléotides publiquement disponibles et leur traduction en protéines.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et GenBank

Heuristique (mathématiques)

Au sens le plus large, l'heuristique est la psychologie de la découverte, abordée par différents mathématiciens.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Heuristique (mathématiques)

Itération

En mathématiques, une itération désigne l'action de répéter un processus.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Itération

Logiciel multiplateforme

Un logiciel multiplateforme est un logiciel conçu pour fonctionner sur plusieurs plateformes informatiques.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Logiciel multiplateforme

Matrice de similarité

Les matrices de similarité ou matrices de substitution sont des matrices utilisées en bioinformatique pour réaliser des alignements de séquences biologiques reliées évolutivement.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Matrice de similarité

Motif

Un motif est étymologiquement un mouvement mental (à rapprocher de et de), une raison, une cause, une incitation à agir; éventuellement, après l'action, un explication ou une justification de l'action humaine (Trésor de la langue française).

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Motif

National Center for Biotechnology Information

Le National Center for Biotechnology Information (NCBI, en français littéralement « Centre américain pour les informations biotechnologiques ») est un institut national américain pour l'information biologique moléculaire.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et National Center for Biotechnology Information

Nucléotide

Un nucléotide est une molécule organique qui est composée d'une base nucléique (ou base azotée), d'un ose à cinq atomes de carbone, dit pentose, dont l'association forme un nucléoside, et enfin de un à trois groupes phosphate.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Nucléotide

Probabilité

Quatre dés à six faces de quatre couleurs différentes. Les six faces possibles sont visibles. Le terme probabilité possède plusieurs sens: venu historiquement du latin probabilitas, il désigne l'opposé du concept de certitude; il est également une évaluation du caractère probable d'un événement, c'est-à-dire qu'une valeur permet de représenter son degré de certitude; récemment, la probabilité est devenue une science mathématique et est appelée théorie des probabilités ou plus simplement probabilités; enfin une doctrine porte également le nom de probabilisme.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Probabilité

Récepteur de la vitamine D

Le récepteur de la vitamine D (VDR) est une protéine de la superfamille des récepteurs nucléaires liant naturellement la vitamine D.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Récepteur de la vitamine D

Séquence biologique

Une séquence biologique est la description de l'enchaînement des éléments (ou monomères) qui constituent une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Séquence biologique

UniProt

UniProt est une base de données de séquences de protéines.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et UniProt

Variable aléatoire à densité

En théorie des probabilités, une variable aléatoire à densité est une variable aléatoire réelle, scalaire ou vectorielle, pour laquelle la probabilité d'appartenance à un domaine se calcule à l'aide d'une intégrale sur ce domaine.

Voir Basic Local Alignment Search Tool et Variable aléatoire à densité

Également connu sous le nom de BLAST, Blast (bioinformatique).