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Protein Data Bank

Indice Protein Data Bank

La banque de données sur les protéines ou BDP du, plus communément appelée ou PDB est une collection mondiale de données sur la structure tridimensionnelle (ou structure 3D) de macromolécules biologiques: protéines, essentiellement, et acides nucléiques.

39 relations: Acide nucléique, Base de données des enzymes, Biochimie, Biologie structurale, Biologiste, Code source, Cristallographie, Cristallographie aux rayons X, Crystallographic Information File, Département de l'Énergie des États-Unis, Domaine public (propriété intellectuelle), Fonction des protéines, Fondation nationale pour la science, Génomique, Génomique structurale, Good Thing, Inorganic crystal structure database, Institut européen de bio-informatique, Japon, Jmol, Journal of Biological Chemistry, Laboratoire national de Brookhaven, Métadonnée, Microscope électronique, National Center for Biotechnology Information, National Institute of Standards and Technology, Powder diffraction file, Prédiction de la structure des protéines, Protéine, Protein Segment Finder, RasMol, Résonance magnétique nucléaire, Royaume-Uni, Structure des protéines, Swiss-Prot, United States National Library of Medicine, Virtual Reality Markup Language, 1971, 2003.

Acide nucléique

Un acide nucléique (désoxyribonucléique ou ribonucléique) est un assemblage de macromolécules, un polymère, dont l’unité de base, ou monomère, est un nucléotide et dont les nucléotides sont reliés entre eux par des liaisons phosphodiesters.

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Base de données des enzymes

Une base de données des enzymes est une base de données qui permet de rechercher une enzyme par son nom (nomenclature EC), sa classe, sa description ou encore sa composition afin de faciliter la recherche et la communication.

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Biochimie

en Relations schématiques entre la biochimie, la génétique et la biologie moléculaire. La biochimie est l'étude des réactions chimiques qui se déroulent au sein des êtres vivants, et notamment dans les cellules.

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Biologie structurale

pmid.

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Biologiste

Un biologiste est par définition la personne qui étudie le domaine du vivant, en contribuant au progrès de la science.

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Code source

fr.

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Cristallographie

La cristallographie est la science qui se consacre à l'étude des cristaux à l'échelle atomique.

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Cristallographie aux rayons X

La cristallographie aux rayons X, radiocristallographie ou diffractométrie de rayons X (DRX, on utilise aussi souvent l'abréviation anglaise XRD pour X-ray diffraction) est une technique d'analyse fondée sur la diffraction des rayons X par la matière, particulièrement quand celle-ci est cristalline.

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Crystallographic Information File

289x289px Crystallographic Information File (CIF) est un format de fichier texte standard pour échanger des informations sur la structure des cristaux prescrit par l'Union internationale de cristallographie (IUCr).

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Département de l'Énergie des États-Unis

Le département de l'Énergie des États-Unis (United States Department of Energy, ou DoE), est un département de l'administration fédérale américaine, responsable de la politique énergétique et de la sûreté nucléaire.

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Domaine public (propriété intellectuelle)

En droit de la propriété intellectuelle, le domaine public désigne l'ensemble des œuvres de l'esprit et des connaissances dont l'usage n'est pas ou n'est plus restreint par la loi.

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Fonction des protéines

Les '''fonctions''' des protéines sont très diverses au sein de la cellule et de l'organisme.

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Fondation nationale pour la science

La Fondation nationale pour la science (en anglais (US) National Science Foundation, en abrégé NSF) est une agence indépendante du gouvernement des États-Unis, destinée à soutenir financièrement la recherche scientifique fondamentale.

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Génomique

La génomique est une discipline de la biologie moderne.

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Génomique structurale

La génomique structurale (ou génomique structurelle) est une nouvelle discipline issue de la génomique (étude du matériel héréditaire des êtres vivants).

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Good Thing

est une chanson interprétée par le groupe britannique Fine Young Cannibals en 1989, écrite et composée par deux de ses membres, Roland Gift et David Steele.

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Inorganic crystal structure database

L'Inorganic crystal structure database (ICSD) est une base de données regroupant les structures de cristaux inorganiques.

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Institut européen de bio-informatique

LInstitut européen de bio-informatique (en anglais European Bioinformatics Institute, EBI) est une organisation à but non lucratif qui constitue une sous-division du Laboratoire européen de biologie moléculaire (European Molecular Biology Laboratory, EMBL).

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Japon

Le Japon (en japonais:,, ou) est un pays insulaire de l'Asie de l'Est, situé entre l'océan Pacifique et la mer du Japon, à l'est de la Chine, de la Corée du Sud, de la Corée du Nord et de la Russie, et au nord de Taïwan.

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Jmol

Jmol est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D.

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Journal of Biological Chemistry

Journal of Biological Chemistry (abrégé en J. Biol. Chem. ou JBC) est une revue scientifique à comité de lecture publiée depuis 1905.

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Laboratoire national de Brookhaven

Le laboratoire national de Brookhaven ou Brookhaven National Laboratory (BNL) en anglais, est un laboratoire national américain basé à Brookhaven, dans le hameau d'Upton, sur Long Island.

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Métadonnée

Une métadonnée (mot composé du préfixe grec meta, indiquant l'auto-référence; le mot signifie donc proprement « donnée de/à propos de donnée ») est une donnée servant à définir ou décrire une autre donnée, quel qu'en soit le support (papier, électronique ou autre).

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Microscope électronique

Ernst Ruska en 1933.Collection de microscopes électroniques anciens (National Museum of Health & Medicine). Un microscope électronique (ME) est un type de microscope qui utilise un faisceau d'électrons pour illuminer un échantillon et en créer une image très agrandie.

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National Center for Biotechnology Information

Le National Center for Biotechnology Information (NCBI, en français littéralement « Centre américain pour les informations biotechnologiques ») est un institut national américain pour l'information biologique moléculaire.

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National Institute of Standards and Technology

Le National Institute of Standards and Technology (NIST), est une agence du département du Commerce des États-Unis.

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Powder diffraction file

Le Powder diffraction file (PDF, littéralement « fichier de diffraction de poudre ») est une base de données regroupant des phases (produits chimiques artificiels ou naturels cristallisés), et permettant le dépouillement des diagrammes de diffraction de rayons X.

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Prédiction de la structure des protéines

La prédiction de la structure des protéines est l'inférence de la structure tridimensionnelle des protéines à partir de leur séquences d'acides aminés, c'est-à-dire la prédiction de leur pliage et de leur structures secondaire et tertiaire à partir de leur structure primaire.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Protein Segment Finder

Protein segment finder, ou, est un outil bio-informatique pour identifier des segments de protéines dans le PDB (Protein Data Bank) obéissant à des contraintes structurales primaires, secondaires et tertiaires.

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RasMol

RasMol est un logiciel de graphisme moléculaire gratuit permettant de représenter des molécules en 3D à partir de différents formats standards de fichiers de représentation de molécules. Il fonctionne sur plateformes MacOS, Windows et Linux.

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Résonance magnétique nucléaire

MHz. La résonance magnétique nucléaire (RMN) est une propriété de certains noyaux atomiques possédant un spin nucléaire (par exemple 1H, 13C, 17O, 19F, 31P, 129Xe…), placés dans un champ magnétique.

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Royaume-Uni

Le Royaume-Uni (prononcé en français: Prononciation en français de France retranscrite selon la norme API.), en forme longue le Royaume-Uni de Grande-Bretagne et d'Irlande du Nord.

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Structure des protéines

La structure des protéines est la composition en acides aminés et la conformation en trois dimensions des protéines.

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Swiss-Prot

Swissprot est une banque de données biologiques de séquences protéiques où les informations sont saisies et vérifiées manuellement.

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United States National Library of Medicine

La United States National Library of Medicine (NLM, Bibliothèque américaine de médecine) est une bibliothèque spécialisée en médecine et dans les sciences et techniques associées.

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Virtual Reality Markup Language

Le Virtual Reality Modeling Language (abrégé en VRML) ou Virtual Reality Markup Language est un langage de description d'univers virtuels en 3 dimensions mis au point en 1994.

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1971

L'année 1971 est une année commune qui commence un vendredi.

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2003

L'année 2003 est une année commune qui commence un mercredi.

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Redirections ici:

Banque de données de protéines du RCSB, Banque de données des protéines, Banque de données sur les protéines, RCSB Protein Data Bank.

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