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92 relations: Acide aminé, Acide aspartique, Acide carboxylique, Acide glutamique, Acide ribonucléique messager, Agent chaotropique, Alanine, Amide, Amine (chimie), Anticorps, Arginine, Asparagine, Atome, Épingle à cheveux bêta, Base de données, Bio-informatique, Calmoduline, Cellule (biologie), Code génétique, Composé carbonylé, Cristallographie, Cristallographie aux rayons X, Cryomicroscopie électronique, Cystéine, Dénaturation, Diagramme de Ramachandran, Dichroïsme circulaire, Doigt de zinc, Domaine de liaison à l'ADN, Domaine protéique, Encombrement stérique, Entropie (thermodynamique), Feuillet bêta, Fibrine, Folding@home, Foldit, Force de van der Waals, Glutamine, Glycine (acide aminé), Hélice alpha, Hémoglobine, Histidine, Interaction non covalente, Ion, Isoleucine, Jmol, Kératine, Leucine, Liaison hydrogène, Liaison peptidique, ..., Ligand (biologie), Linus Pauling, Lipide, Lysine, Macromolécule, Main EF, Méthionine, Modélisation de protéines par enfilage, Modélisation de protéines par homologie, Monomère, Myoglobine, Myosine, Navigateur web, Phénylalanine, Pli Rossmann, Polymère, Pont disulfure, Prédiction de la structure des protéines, Proline, Protéine, Protéine membranaire, Protéines intrinsèquement désordonnées, Pyrrolysine, RasMol, Ribosome, Robert Corey, Sélénocystéine, Séquençage des protéines, Séquence biologique, Sérine, Spectroscopie RMN, Structure secondaire, Thréonine, Tonneau bêta, Traduction génétique, Transduction de signal, Trèfle bêta, Trends in Biochemical Sciences, Tryptophane, Tyrosine, Université Stanford, Valine. Développer l'indice (42 plus) »
Acide aminé
carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.
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Acide aspartique
L’acide aspartique (abréviations IUPAC-IUBMB: Asp et D), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAU et GAC.
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Acide carboxylique
Modèle éclaté d'un groupe carboxyle. En chimie organique, le terme acide carboxylique désigne une molécule comprenant un groupe carboxyle (–C(O)OH).
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Acide glutamique
L'acide glutamique (abréviations IUPAC-IUBMB: Glu et E), ou glutamate sous la forme anionique de l'acide glutamique, est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAA et GAG.
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Acide ribonucléique messager
Représentation schématique de la synthèse et de la maturation d'un ARN messager dans une cellule eucaryote. L'acide ribonucléique messager, ARN messager, ou ARNm (en anglais, mRNA, pour messenger ribonucleic acid), est une molécule intermédiaire d'acide ribonucléique (ARN), consistant en une copie transitoire d'une portion de l'ADN correspondant à un ou plusieurs gènes d'un organisme biologique.
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Agent chaotropique
Un chaotrope, ou agent chaotropique par anglicisme, est une molécule qui détruit la structure spatiale (tridimensionnelle) des macromolécules biologiques telles que les protéines et les acides nucléiques — ADN et ARN — et les dénature.
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Alanine
L'alanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ala et A) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GCU, GCC, GCA et GCG.
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Amide
Structure générale des amides Un amide est un composé organique dérivé d'un acide carboxylique.
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Amine (chimie)
Structure de l'ammoniac. Une amine est un composé organique dérivé de l'ammoniac dont au moins un atome d'hydrogène a été remplacé par un groupe carboné.
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Anticorps
Un anticorps est un complexe protéique produit par le système immunitaire adaptatif dans un organisme vivant pour détecter et neutraliser les agents pathogènes de manière spécifique.
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Arginine
L'arginine (abréviations IUPAC-IUBMB: Arg et R) est un α-aminé.
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Asparagine
L'asparagine (abréviations IUPAC-IUBMB: Asn et N) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons AAU et AAC.
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Atome
hélium 4, agrandi à droite, est formé de deux protons et de deux neutrons. Atomes de carbone à la surface de graphite observés par microscope à effet tunnel. Un atome est la plus petite partie d'un corps simple pouvant se combiner chimiquement avec un autre.
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Épingle à cheveux bêta
L'épingle à cheveux bêta (parfois appelée ruban bêta ou unité bêta-bêta) est un motif structurel observée dans la structure secondaire des protéines.
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Base de données
Une base de données permet de stocker et de retrouver des données structurées, semi-structurées ou des données brutes ou de l'information, souvent en rapport avec un thème ou une activité; celles-ci peuvent être de natures différentes et plus ou moins reliées entre elles.
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Bio-informatique
La bioinformatique (ou bio-informatique), est un champ de recherche multidisciplinaire de la biotechnologie où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie.
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Calmoduline
pmc.
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Cellule (biologie)
consulté le.
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Code génétique
bases nucléiques; à droite, les codons correspondants, chacun spécifiant un acide aminé protéinogène. Le code génétique est l'ensemble des règles permettant de traduire les informations contenues dans le génome des cellules vivantes afin de synthétiser les protéines.
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Composé carbonylé
Un composé carbonylé est un composé organique comportant une double liaison entre un atome de carbone et un atome d'oxygène, l'atome de carbone étant lié communément à des atomes d'hydrogène ou de carbone.
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Cristallographie
La cristallographie est la science qui se consacre à l'étude des cristaux à l'échelle atomique.
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Cristallographie aux rayons X
La cristallographie aux rayons X, radiocristallographie ou diffractométrie de rayons X (DRX, on utilise aussi souvent l'abréviation anglaise XRD pour X-ray diffraction) est une technique d'analyse fondée sur la diffraction des rayons X par la matière, particulièrement quand celle-ci est cristalline.
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Cryomicroscopie électronique
microscope électronique en transmission (2003). La cryomicroscopie électronique (cryo-ME) correspond à une technique particulière de préparation d’échantillons biologiques utilisée en microscopie électronique en transmission.
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Cystéine
La cystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Cys et C), du grec ancien (« vessie »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UGU et UGC.
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Dénaturation
En biochimie, la dénaturation est le processus par lequel une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine, perd sa conformation tridimensionnelle normale: les protéines perdent leur repliement et se déplient, les deux brins appariés des duplex d'acides nucléiques se séparent.
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Diagramme de Ramachandran
Le diagramme de Ramachandran est une représentation graphique permettant d'analyser la conformation du squelette polypeptidique des protéines.
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Dichroïsme circulaire
Effet du dichroïsme circulaire sur deux rayons lumineux polarisés respectivement circulaire gauche et circulaire droite: ils ne subissent pas la même absorption. On dit qu'un matériau présente un dichroïsme circulaire s'il absorbe différemment la lumière selon que sa polarisation est circulaire droite ou circulaire gauche.
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Doigt de zinc
Dessin représentant le doigt de zinc Cys2His2, consistant en une hélice alpha et un feuillet bêta aux brins antiparallèles. L'ion zinc est en vert, complexé à deux histidines (en bas) et deux cystéines (en haut, soufre en doré) Les doigts de zinc sont de petits motifs structuraux trouvés dans les protéines et capables d'ordonner en complexe un ou plusieurs ions zinc pour stabiliser leur repliement.
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Domaine de liaison à l'ADN
Un domaine de liaison à l'ADN (ou DBD de l'anglais DNA-binding domain) est un motif protéique qui est capable de lier à l'ADN double ou simple brin avec une affinité pour une séquence nucléotidique spécifique, ou une affinité relative à l'ADN.
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Domaine protéique
Exemples de structures de protéines organisées en domaines distincts. Le domaine de couleur brique, appelé domaine PH, est commun aux deux protéines,. Sa fonction est de fixer le phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate (PIP3) Un domaine protéique est une partie d'une protéine capable d'adopter une structure de manière autonome ou partiellement autonome du reste de la molécule.
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Encombrement stérique
''tert''-butyle en vert, l’azote en bleu. L' est la gêne provoquée par la disposition et le volume d'une partie d'une molécule lors de l'approche d'un réactif ou d'une autre partie de la molécule.
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Entropie (thermodynamique)
L'entropie est une grandeur physique qui caractérise le degré de désorganisation d'un système.
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Feuillet bêta
Les feuillets β ou feuillets β plissés est la deuxième forme de structure secondaire régulière observée dans les protéines, avec une fréquence de présence plus faible que les hélices α.
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Fibrine
La fibrine est une protéine filamenteuse issue du fibrinogène sous l'action de la thrombine lors de la coagulation sanguine.
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Folding@home
Folding@home, parfois désigné par l'abréviation FAH, est un projet de recherche médicale dont le but est de simuler le repliement des protéines dans diverses configurations de température et de pression afin de mieux comprendre ce processus, et d'en tirer des connaissances utiles qui pourraient, entre autres, permettre de développer de nouveaux médicaments, notamment contre la maladie d'Alzheimer, la drépanocytose, certains types de cancers et la maladie à coronavirus 2019.
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Foldit
Foldit (littéralement « Pliez-la », sous-entendant « pliez la protéine ») est un jeu vidéo expérimental sur le repliement des protéines, développé en collaboration entre le département d'informatique et de biochimie de l'université de Washington.
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Force de van der Waals
Tête et pattes avant d'un Gecko (espèce non précisée, queue en forme de feuille) En physique et en chimie, une force de van der Waals, interaction de van der Waals ou liaison de van der Waals est un potentiel interatomique dû à une interaction électrique de faible intensité entre deux atomes ou molécules, ou entre une molécule et un cristal.
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Glutamine
La glutamine (abréviations IUPAC-IUBMB: Gln et Q) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CAA et CAG.
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Glycine (acide aminé)
La glycine (abréviations UICPA-UIBBM: Gly et G) est un α-aminé et l'un des vingt-deux acides aminés protéinogènes.
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Hélice alpha
Exemple d'hélice alpha. L’hélice alpha (hélice α) est une structure secondaire courante des protéines.
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Hémoglobine
L'hémoglobine, couramment symbolisée Hb, parfois Hgb, est un pigment respiratoire (de la famille moléculaire des métalloprotéines, ici contenant du fer) présent essentiellement dans le sang des vertébrés, au sein de leurs globules rouges, ainsi que dans les tissus de certains invertébrés.
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Histidine
L'histidine (abréviations IUPAC-IUBMB: His et H), du grec ancien, (« mât de navire », « métier à tisser », « voile de navire »), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, l'un des acides aminés essentiels et fait partie des acides aminés glucoformateur.
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Interaction non covalente
Une interaction non covalente diffère d'une liaison covalente en ce qu'elle n'implique pas le partage d'électrons, mais implique plutôt des variations plus dispersées des interactions électromagnétiques entre molécules ou au sein d'une molécule.
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Ion
+) a comme logique d'avoir la même structure électronique que le gaz noble (cadre rouge) le plus proche. Un ion est un atome ou un groupe d'atomes portant une charge électrique, parce que son nombre d'électrons est différent de son nombre de protons.
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Isoleucine
L’isoleucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ile et I) est un α-aminé faisant partie des 20 acides aminés majeurs codés par le génome (exception faite de la Sélénocystéine) servant à la synthèse des protéines.
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Jmol
Jmol est un logiciel libre de visualisation de structures chimiques en 3D.
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Kératine
cornes des rhinocéros (un mammifère), comme leur peau, sont en grande partie constituées de kératine. cyclostome) est munie de « dents » cornées formées de kératine. La kératine est une famille de protéines, synthétisée et utilisée par de nombreux êtres vivants comme élément de structure, et également l'exemple-type de protéine fibreuse.
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Leucine
La leucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Leu et L), du grec ancien (blanc, éclatant), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.
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Liaison hydrogène
Liaison hydrogène entre des molécules d'eau. La liaison hydrogène ou pont hydrogène est une force intermoléculaire ou intramoléculaire impliquant un atome d'hydrogène et un atome électronégatif comme l'oxygène, l'azote et le fluor.
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Liaison peptidique
Une liaison peptidique est une liaison covalente qui s'établit entre la fonction carboxyle portée par le carbone α d'un acide aminé et la fonction amine portée par le carbone α de l'acide aminé suivant dans la chaîne peptidique.
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Ligand (biologie)
Myoglobine en bleu lié à son ligand hème en orange. En biologie, un ligand (du latin ligandum, liant) est une molécule qui se lie de manière réversible à une macromolécule ciblée, protéine ou acide nucléique, jouant en général un rôle fonctionnel: stabilisation structurale, catalyse, modulation d'une activité enzymatique, transmission d'un signal.
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Linus Pauling
Linus Carl Pauling (à Portland, Oregon, États-Unis - à Big Sur, Californie) est un chimiste et physicien américain.
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Lipide
estérifié par la phosphocholine (en rouge), l'acide palmitique (en bleu) et l'acide oléique (en vert). polaire » ① et des « queues apolaires » ② de molécules amphiphiles de phosphoglycérides. bicouches lipidiques. Les lipides constituent la matière grasse des êtres vivants.
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Lysine
La lysine (abréviations IUPAC-IUBMB: Lys et K) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des neuf acides aminés essentiels pour l'homme.
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Macromolécule
Une macromolécule (ou molécule polymère) est une très grande molécule, qui possède une masse moléculaire relativement élevée.
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Main EF
Modèle schématisé et représentation 3D d'une main EF, avec les deux numérotations des acides aminés impliqués dans la chélation de l'ion calcium. La main EF (EF Hand) est un motif structurel observé dans les protéines, il est constitué de l'association deux hélices α liées à une boucle formée d'une douzaine d'acides aminés.
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Méthionine
La méthionine (abréviations IUPAC-IUBMB: Met et M) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.
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Modélisation de protéines par enfilage
La modélisation d'une protéine par enfilage ou modélisation par reconnaissance des repliements est une technique utilisée pour modéliser des protéines dont on souhaite qu'elles présentent les mêmes coudes que des structures de protéines connues, mais qui ne possèdent pas de protéines homologues recensées dans la banque de données sur les protéines (PDB).
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Modélisation de protéines par homologie
Modélisation de protéines par homologie La modélisation de protéines par homologie, également connue sous le nom de modélisation comparative des protéines, se réfère à la construction d’un modèle d’une protéine « cible », dont la résolution est de niveau atomique, à partir de sa séquence d’acides aminés et d'une structure expérimentale tridimensionnelle d’une protéine homologue connexe (le « modèle »).
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Monomère
En chimie, un monomère est une substance, le plus souvent organique, utilisée dans la synthèse des oligomères et des polymères au cours d'une réaction d'oligomérisation ou de polymérisation.
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Myoglobine
3RGK). La myoglobine, couramment symbolisée par Mb, est une métalloprotéine contenant du fer présente dans les muscles des vertébrés, et particulièrement des mammifères.
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Myosine
La myosine est une protéine qui joue un rôle fondamental dans les mécanismes de la contraction musculaire.
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Navigateur web
Chronologie des versions de navigateurs. Un navigateur web, navigateur Web.
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Phénylalanine
La phénylalanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Phe et F) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.
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Pli Rossmann
1G5Q). L'image présente également la flavine mononucléotide liée. Le pli Rossmann (de l'anglais Rossmann fold) est un motif structurel protéique présent dans les protéines qui lient les nucléotides et notamment le nicotinamide adénine dinucléotide (NAD).
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Polymère
Fibres de polyester observées au Microscopie électronique à balayage. renforts. Les polymères (étymologie: du grec polus, plusieurs, et meros, partie) constituent une classe de matériaux.
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Pont disulfure
Un pont disulfure (liaison S-S) est une liaison covalente qui se forme par oxydation dans les protéines, de manière post-traductionnelle ou par des agents oxydants mis en œuvre par l'homme.
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Prédiction de la structure des protéines
La prédiction de la structure des protéines est l'inférence de la structure tridimensionnelle des protéines à partir de leur séquences d'acides aminés, c'est-à-dire la prédiction de leur pliage et de leur structures secondaire et tertiaire à partir de leur structure primaire.
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Proline
La proline (abréviations IUPAC-IUBMB: Pro et P) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CCU, CCC, CCA et CCG.
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Protéine
groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.
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Protéine membranaire
Les protéines membranaires constituent l'une des trois principales classes de protéines à côté des protéines fibreuses et des protéines globulaires.
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Protéines intrinsèquement désordonnées
Les protéines intrinsèquement désordonnées ou intrinsèquement non structurées sont des protéines qui manquent de structure tridimensionnelle stable, ce qui leur confère une forte plasticité qui est à l'origine de leur importance dans les phénomènes biologiques.
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Pyrrolysine
La pyrrolysine (abréviations IUPAC-IUBMB: Pyl et O) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par le codon-stop ambre UAG en présence d'une séquence d'insertion appelée Pyrrolysine Insertion Sequence.
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RasMol
RasMol est un logiciel de graphisme moléculaire gratuit permettant de représenter des molécules en 3D à partir de différents formats standards de fichiers de représentation de molécules. Il fonctionne sur plateformes MacOS, Windows et Linux.
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Ribosome
Réticulum endoplasmique rugueux (ou granuleux) (REG) (6) Appareil de Golgi (7) Cytosquelette (8) Réticulum endoplasmique lisse (9) Mitochondries (10) Vacuole (absent des cellules animales) (11) Cytosol (12) Lysosome (13) Centrosome (constitué de deux centrioles) (14) Membrane plasmique Les ribosomes sont des complexes ribonucléoprotéiques présents dans les cellules eucaryotes et procaryotes.
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Robert Corey
Robert Brainard Corey (-) était un biochimiste américain dont les principaux travaux ont porté sur la structure des protéines.
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Sélénocystéine
La sélénocystéine (abréviations IUPAC-IUBMB: Sec et U) est un α-aminé non standard dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par le codon-stop opale UGA en présence d'une séquence d'insertion dite Selenocysteine Insertion Sequence.
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Séquençage des protéines
Le séquençage des protéines est la détermination de la séquence polypeptidique.
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Séquence biologique
Une séquence biologique est la description de l'enchaînement des éléments (ou monomères) qui constituent une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine.
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Sérine
La sérine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ser et S) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons UCU, UCC, UCA, UCG, AGU et AGC.
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Spectroscopie RMN
MHz avec passeur automatique d'échantillons utilisé en chimie organique pour la détermination des structures chimiques. Animation présentant le principe de la Résonance Magnétique Nucléaire (RMN). La spectroscopie RMN est une technique qui exploite les propriétés magnétiques de certains noyaux atomiques.
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Structure secondaire
feuillets β. Cette protéine est la première dont la structure a été résolue par cristallographie en 1958, par Max Perutz et John Kendrew, ce qui leur a valu l'attribution du prix Nobel de chimie en 1962. En biochimie et en biologie structurale, la structure secondaire se rapporte uniquement à la description de la structure tridimensionnelle localement adoptée par certains segments de molécules biologiques (molécules définies comme étant des biopolymères, comme c’est le cas pour les protéines et les acides nucléiques (ADN/ARN)).
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Thréonine
La thréonine (abréviations IUPAC-IUBMB: Thr et T) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.
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Tonneau bêta
1A0S). 1BRP). Un tonneau β est une structure protéique constituée d'un grand feuillet β qui se tord et s'enroule pour former une structure quasi cylindrique fermée par des liaisons hydrogène.
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Traduction génétique
Cycle de l'élongation de la traduction par le ribosome. Les ARNt (vert foncé) apportent les acides aminés (carrés) au site A. Une fois l'accommodation codon-anticodon réalisée, il y a formation de la nouvelle liaison peptidique, puis translocation du ribosome d'un codon le long de l'ARNm. En biologie moléculaire, la traduction génétique est l'étape de synthèse des protéines par les ribosomes, à partir de l'information génétique contenue dans les ARN messagers.
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Transduction de signal
La transduction de signal désigne le mécanisme par lequel une cellule répond à l'information qu'elle reçoit, par des agents chimiques ou autres signaux (tension,...). Elle commande une cascade de signaux secondaires, internes à la cellule (« signalling ») ou externes (ex: action sur d'autres types cellulaires via des interleukines), et des processus cellulaires internes (métabolisme, cycle cellulaire, motilité,...). La transduction est la deuxième étape de ce que l'on appelle la cascade de signalisation.
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Trèfle bêta
Un trèfle β est une structure protéique comprenant trois séquences β–β–β–boucle–β repliées de telle sorte que deux épingles à cheveux β à deux brins se forment avec le premier et le dernier brin β pour la première, et avec les deuxième et troisième brins β pour la seconde épingle à cheveux β.
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Trends in Biochemical Sciences
Trends in Biochemical Sciences (abrégé en Trends Biochem. Sci.) est une revue scientifique à comité de lecture qui publie des articles de revue spécialisés dans tous les aspects de la recherche concernant la biochimie.
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Tryptophane
Le tryptophane (abréviations IUPAC-IUBMB: Trp et W) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.
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Tyrosine
La tyrosine (abréviations IUPAC-IUBMB: Tyr et Y) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, codé sur les ARN messagers par les codons UAU et UAC.
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Université Stanford
La Leland Stanford Junior University, plus connue sous le nom d'université Stanford, est une université américaine privée, située dans la Silicon Valley au sud de San Francisco.
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Valine
La valine (abréviations IUPAC-IUBMB: Val et V) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.
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Redirections ici:
Structure des proteines, Structure protéique.
