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75 relations: Acide aminé, Acide glutamique, Acide nucléique, Acide ribonucléique, Acide ribonucléique de transfert, Alanine, Alignement de séquences, Amide, Angle dièdre, Appariement Hoogsteen, ARN non codant, Azote, Évolution (biologie), Base azotée, Bio-informatique, Biochimie, Biologie structurale, Biopolymère, Carbone, Composé carbonylé, Courbure, Cristallographie, Dénaturation, Diagramme de Ramachandran, Dichroïsme circulaire, Enthalpie libre, Ferrédoxine, Feuillet bêta, Foldamère, Géométrie différentielle, Glycine (acide aminé), Hélice alpha, Hydrogène, Hydrophobie (physique), Hyperchromicité, Infrarouge, Isoleucine, John Kendrew, Leucine, Liaison hydrogène, Linus Pauling, Lysine, Machine à vecteurs de support, Max Ferdinand Perutz, Méthionine, Modèle de Markov caché, Motif structurel, Nucléotide, Oxygène, Paire de bases, ..., Pelote aléatoire, Phénylalanine, Prix Nobel de chimie, Programmation dynamique, Proline, Protéine, Protein Data Bank, Pseudonœud, RasMol, Réseau de neurones (biologie), Résonance magnétique nucléaire, Repliement des protéines, Séquence biologique, Spectroscopie, Structure des protéines, Structure secondaire d'un acide nucléique, Structure tertiaire, Thréonine, Torsion, Tryptophane, Tyrosine, Ultraviolet, Université Stanford, Valine, Wobble pairing. Développer l'indice (25 plus) »
Acide aminé
carbone α est orangé. méthanogènes. α-aminés protéinogènes; il est employé en pharmacie comme antalgique et antiépileptique. Un acide aminé est un acide carboxylique qui possède également un groupe fonctionnel amine.
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Acide glutamique
L'acide glutamique (abréviations IUPAC-IUBMB: Glu et E), ou glutamate sous la forme anionique de l'acide glutamique, est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GAA et GAG.
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Acide nucléique
Un acide nucléique (désoxyribonucléique ou ribonucléique) est un assemblage de macromolécules, un polymère, dont l’unité de base, ou monomère, est un nucléotide et dont les nucléotides sont reliés entre eux par des liaisons phosphodiesters.
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Acide ribonucléique
url texte.
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Acide ribonucléique de transfert
Les acides ribonucléiques de transfert, ou ARN de transfert ou ARNt, sont de courts ARN, longs de 75 à 95 nucléotides, qui interviennent lors de la synthèse des protéines dans la cellule.
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Alanine
L'alanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ala et A) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons GCU, GCC, GCA et GCG.
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Alignement de séquences
En bio-informatique, l'alignement de séquences (ou alignement séquentiel) est une manière de représenter deux ou plusieurs séquences de macromolécules biologiques (ADN, ARN ou protéines) les unes sous les autres, de manière à en faire ressortir les régions homologues ou similaires.
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Amide
Structure générale des amides Un amide est un composé organique dérivé d'un acide carboxylique.
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Angle dièdre
En géométrie, l'angle entre deux plans est appelé angle dièdre, ou angle diédral (anglicisme).
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Appariement Hoogsteen
Guanosine montrant la face Watson-Crick et la face Hoogsteen de la purine L'appariement Hoogsteen (ou paire Hoogsteen ou appariement de Hoogsteen) est un type d'appariement canonique impliquant les purines, observé dans les acides nucléiques.
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ARN non codant
Un ARN non codant (ou ARNnm pour ARN non messager) est un ARN, issu de la transcription de l'ADN, qui ne sera pas traduit en protéine par les ribosomes.
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Azote
L'azote est l'élément chimique de numéro atomique 7, de symbole N (du latin nitrogenium).
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Évolution (biologie)
En biologie, l’évolution est la transformation du monde vivant au cours du temps, qui se manifeste par des changements phénotypiques des organismes à travers les générations.
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Base azotée
Les bases azotées, ou bases nucléiques, ou bases nucléotidiques, voire nucléobases, sont des composés organiques azotés présents dans les acides nucléiques sous forme de nucléotides dans lesquels elles sont liées à un ose, le ribose dans le cas de l'ARN et le désoxyribose dans le cas de l'ADN.
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Bio-informatique
La bioinformatique (ou bio-informatique), est un champ de recherche multidisciplinaire de la biotechnologie où travaillent de concert biologistes, médecins, informaticiens, mathématiciens, physiciens et bioinformaticiens, dans le but de résoudre un problème scientifique posé par la biologie.
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Biochimie
en Relations schématiques entre la biochimie, la génétique et la biologie moléculaire. La biochimie est l'étude des réactions chimiques qui se déroulent au sein des êtres vivants, et notamment dans les cellules.
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Biologie structurale
pmid.
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Biopolymère
De gauche à droite, les structures de l'ADN A, B et Z. La structure d'une molécule d'ADN dépend de son environnement. Dans les environnements aqueux, y compris la majorité de l'ADN dans une cellule, l'ADN-B est la structure la plus courante. La structure A-ADN domine dans les échantillons déshydratés et est similaire à l'ARN double brin et aux hybrides ADN/ARN. L'ADN-Z est une structure plus rare que l'on trouve dans l'ADN lié à certaines protéines. Les biopolymères sont des polymères issus de la biomasse, c'est-à-dire produits par des êtres vivants (végétaux, algaux, animaux, fongiques).
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Carbone
Le carbone est l'élément chimique de et de Il possède trois isotopes naturels.
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Composé carbonylé
Un composé carbonylé est un composé organique comportant une double liaison entre un atome de carbone et un atome d'oxygène, l'atome de carbone étant lié communément à des atomes d'hydrogène ou de carbone.
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Courbure
Le déplacement d'une ''Dictyostelium discoideum'' dont la couleur du contour est fonction de la courbure. Échelle: 5 µm; durée: 22 secondes. Intuitivement, courbe s'oppose à droit: la courbure d'un objet géométrique est une mesure quantitative du caractère « plus ou moins courbé » de cet objet.
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Cristallographie
La cristallographie est la science qui se consacre à l'étude des cristaux à l'échelle atomique.
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Dénaturation
En biochimie, la dénaturation est le processus par lequel une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine, perd sa conformation tridimensionnelle normale: les protéines perdent leur repliement et se déplient, les deux brins appariés des duplex d'acides nucléiques se séparent.
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Diagramme de Ramachandran
Le diagramme de Ramachandran est une représentation graphique permettant d'analyser la conformation du squelette polypeptidique des protéines.
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Dichroïsme circulaire
Effet du dichroïsme circulaire sur deux rayons lumineux polarisés respectivement circulaire gauche et circulaire droite: ils ne subissent pas la même absorption. On dit qu'un matériau présente un dichroïsme circulaire s'il absorbe différemment la lumière selon que sa polarisation est circulaire droite ou circulaire gauche.
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Enthalpie libre
L’enthalpie libre, appelée aussi énergie libre de Gibbs ou simplement énergie de Gibbs, est une fonction d'état extensive introduite par Willard Gibbs, et généralement notée.
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Ferrédoxine
Une ferrédoxine est une protéine fer-soufre réalisant des transferts d'électrons dans un grand nombre de réactions d'oxydoréduction du métabolisme cellulaire grâce à leurs dont les cations de fer oscillent entre les états d'oxydation +2 (ferreux) et +3 (ferrique).
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Feuillet bêta
Les feuillets β ou feuillets β plissés est la deuxième forme de structure secondaire régulière observée dans les protéines, avec une fréquence de présence plus faible que les hélices α.
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Foldamère
Un foldamère est un polymère ayant une forte tendance à adopter une conformation compacte bien définie.
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Géométrie différentielle
Exemple d'objets étudiés en géométrie différentielle. Un triangle dans une surface de type selle de cheval (un paraboloïde hyperbolique), ainsi que deux droites parallèles. En mathématiques, la géométrie différentielle est l'application des outils du calcul différentiel à l'étude de la géométrie.
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Glycine (acide aminé)
La glycine (abréviations UICPA-UIBBM: Gly et G) est un α-aminé et l'un des vingt-deux acides aminés protéinogènes.
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Hélice alpha
Exemple d'hélice alpha. L’hélice alpha (hélice α) est une structure secondaire courante des protéines.
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Hydrogène
Lhydrogène est l'élément chimique de numéro atomique 1, de symbole H. L'hydrogène présent sur Terre est presque entièrement constitué de l'isotope H (ou protium, comportant un proton et zéro neutron) et d'environ 0,01 % de deutérium H (un proton, un neutron).
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Hydrophobie (physique)
L’hydrophobie (du bas latin, issu du grec, de, « eau », et, « action de chasser, d’effaroucher, d’effrayer ») caractérise les surfaces qui semblent repousser l'eau.
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Hyperchromicité
Courbe de fusion d'un acide nucléique en fonction de la température. L'augmentation de l'absorption UV caractérise le phénomène d'hyperchromicité L'hyperchromicité ou effet hyperchrome est la propriété des polymères biologiques, et en particulier l'ADN et l'ARN, de voir leur absorption dans l'UV augmenter lorsqu'ils subissent une dénaturation, c'est-à-dire une perte de leur structure secondaire.
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Infrarouge
Le rayonnement infrarouge (IR) est un rayonnement électromagnétique de longueur d'onde supérieure à celle du spectre visible mais plus courte que celle des micro-ondes ou du domaine térahertz.
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Isoleucine
L’isoleucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Ile et I) est un α-aminé faisant partie des 20 acides aminés majeurs codés par le génome (exception faite de la Sélénocystéine) servant à la synthèse des protéines.
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John Kendrew
John Cowdery Kendrew (à Oxford - à Cambridge) est un biochimiste britannique.
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Leucine
La leucine (abréviations IUPAC-IUBMB: Leu et L), du grec ancien (blanc, éclatant), est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.
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Liaison hydrogène
Liaison hydrogène entre des molécules d'eau. La liaison hydrogène ou pont hydrogène est une force intermoléculaire ou intramoléculaire impliquant un atome d'hydrogène et un atome électronégatif comme l'oxygène, l'azote et le fluor.
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Linus Pauling
Linus Carl Pauling (à Portland, Oregon, États-Unis - à Big Sur, Californie) est un chimiste et physicien américain.
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Lysine
La lysine (abréviations IUPAC-IUBMB: Lys et K) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des neuf acides aminés essentiels pour l'homme.
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Machine à vecteurs de support
Les machines à vecteurs de support ou séparateurs à vaste marge (en anglais, SVM) sont un ensemble de techniques d'apprentissage supervisé destinées à résoudre des problèmes de discriminationLe terme anglais pour discrimination est, qui a un sens différent en français (se rapporte au). On utilise aussi le terme classement à la place de discrimination, plus proche du terme anglais, et plus compréhensible.
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Max Ferdinand Perutz
Max Ferdinand Perutz, né le à Vienne et mort le à Cambridge, est un chimiste anglo-autrichien.
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Méthionine
La méthionine (abréviations IUPAC-IUBMB: Met et M) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.
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Modèle de Markov caché
Un modèle de Markov caché (MMC, terme et définition normalisés par l’ISO/CÉI) — (HMM)—, ou plus correctement (mais non employé) automate de Markov à états cachés, est un modèle statistique dans lequel le système modélisé est supposé être un processus markovien de paramètres inconnus.
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Motif structurel
Motif structurel En biochimie, un motif structurel, également écrit motif structural, est un arrangement tridimensionnel d'au moins deux structures secondaires de biopolymères, tels que des protéines ou des acides nucléiques, ayant une signification fonctionnelle ou faisant partie d'un domaine protéique John Kuriyan, The Molecules of Life: Physical and Chemical Principles, Garland Science, 2012,.
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Nucléotide
Un nucléotide est une molécule organique qui est composée d'une base nucléique (ou base azotée), d'un ose à cinq atomes de carbone, dit pentose, dont l'association forme un nucléoside, et enfin de un à trois groupes phosphate.
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Oxygène
L'oxygène est l'élément chimique de numéro atomique 8, de symbole O. C'est la tête de file du groupe des chalcogènes, souvent appelé groupe de l'oxygène.
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Paire de bases
Paire de base GC avec ses 3 liaisons hydrogène intermoléculaires Paire de base AT avec ses 2 liaisons hydrogène intermoléculaires Les paires de bases (en gris clair) relient les deux brins de l'ADN (en gris foncé) Une paire de bases est l'appariement de deux bases nucléiques situées sur deux brins complémentaires d'ADN ou ARN.
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Pelote aléatoire
Polypeptide tridimensionnel en conformation pelote aléatoire Une pelote aléatoire est une conformation d'un polymère dans laquelle les unités monomères sont orientées de façon aléatoire, en étant néanmoins liées aux unités adjacentes.
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Phénylalanine
La phénylalanine (abréviations IUPAC-IUBMB: Phe et F) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'Homme.
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Prix Nobel de chimie
Le prix Nobel de chimie est une récompense décernée une fois par an, depuis 1901, par l'Académie royale des sciences de Suède à un scientifique dont l'œuvre et les travaux ont rendu de grands services à l'humanité par une contribution exceptionnelle en chimie.
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Programmation dynamique
En informatique, la programmation dynamique est une méthode algorithmique pour résoudre des problèmes d'optimisation.
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Proline
La proline (abréviations IUPAC-IUBMB: Pro et P) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, encodé sur les ARN messagers par les codons CCU, CCC, CCA et CCG.
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Protéine
groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.
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Protein Data Bank
La banque de données sur les protéines ou BDP du, plus communément appelée ou PDB est une collection mondiale de données sur la structure tridimensionnelle (ou structure 3D) de macromolécules biologiques: protéines, essentiellement, et acides nucléiques.
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Pseudonœud
Un pseudonœud est un élément de structure de l'ARN.
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RasMol
RasMol est un logiciel de graphisme moléculaire gratuit permettant de représenter des molécules en 3D à partir de différents formats standards de fichiers de représentation de molécules. Il fonctionne sur plateformes MacOS, Windows et Linux.
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Réseau de neurones (biologie)
En neurosciences, un réseau de neurones correspond, schématiquement.
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Résonance magnétique nucléaire
MHz. La résonance magnétique nucléaire (RMN) est une propriété de certains noyaux atomiques possédant un spin nucléaire (par exemple 1H, 13C, 17O, 19F, 31P, 129Xe…), placés dans un champ magnétique.
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Repliement des protéines
Repliement des protéines Le repliement des protéines est le processus physique par lequel un polypeptide se replie dans sa structure tridimensionnelle caractéristique dans laquelle il est fonctionnel.
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Séquence biologique
Une séquence biologique est la description de l'enchaînement des éléments (ou monomères) qui constituent une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine.
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Spectroscopie
La spectroscopie, ou spectrométrie, est l'étude expérimentale du spectre d'un phénomène physique, c'est-à-dire de sa décomposition sur une échelle d'énergie, ou toute autre grandeur se ramenant à une énergie (fréquence, longueur d'onde).
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Structure des protéines
La structure des protéines est la composition en acides aminés et la conformation en trois dimensions des protéines.
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Structure secondaire d'un acide nucléique
PDB: http://www.rcsb.org/pdb/explore/explore.do?structureId.
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Structure tertiaire
En biochimie, la structure tertiaire ou tridimensionnelle est le repliement dans l'espace d'une chaîne polypeptidique.
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Thréonine
La thréonine (abréviations IUPAC-IUBMB: Thr et T) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.
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Torsion
La torsion est le fait de vriller une pièce, comme lorsque l'on essore une serpillière — notons que dans le langage courant, « tordre » désigne plutôt ce que l'on appelle la flexion en mécanique.
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Tryptophane
Le tryptophane (abréviations IUPAC-IUBMB: Trp et W) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes et l'un des acides aminés essentiels pour l'humain.
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Tyrosine
La tyrosine (abréviations IUPAC-IUBMB: Tyr et Y) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des 22 acides aminés protéinogènes, codé sur les ARN messagers par les codons UAU et UAC.
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Ultraviolet
longueurs d'onde (avec des exemples de tailles), les fréquences correspondantes, et les températures du corps noir dont l'émission est maximum à ces longueurs d'onde. Le rayonnement ultraviolet (UV), également appelé « lumière noire » parce que généralement invisible à l’œil nu, est un rayonnement électromagnétique de longueur d'onde inférieure à celle de la lumière visible, mais supérieure à celle des.
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Université Stanford
La Leland Stanford Junior University, plus connue sous le nom d'université Stanford, est une université américaine privée, située dans la Silicon Valley au sud de San Francisco.
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Valine
La valine (abréviations IUPAC-IUBMB: Val et V) est un α-aminé dont l'énantiomère L est l'un des acides aminés protéinogènes, et l'un des acides aminés essentiels pour l'homme.
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Wobble pairing
Appariements ''wobble'' pour l'inosine et la guanine Le wobble pairing, littéralement « appariement bancal », est un mode d'appariement non canonique entre bases nucléiques que l'on observe principalement dans l'ARN.
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