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Micro-organisme sulfato-réducteur

Indice Micro-organisme sulfato-réducteur

µm de longueur. Les micro-organismes sulfato-réducteurs (MSR) ou réducteurs de sulfate, encore appelés procaryotes sulfato-réducteurs (PSR) sont un groupe de microorganismes comprenant les bactéries sulfato-réductrices (BSR) et les archées sulfato-réducteurs (ASR).

81 relations: Acétogenèse, Acide carboxylique, Acide fumarique, Adénosine diphosphate, Adénosine monophosphate, Adénosine triphosphate, Alcool (chimie), Anaérobie, Anion, Archaea, Archaeoglobus, Bacillota, Bactérie, Bicarbonate, Biocide, Biogenèse, Biosphère profonde, Caldivirga, Cation, Chaîne de transport d'électrons, Champ pétrolifère, Composé aliphatique, Corrosion, Cycle du soufre, Deltaproteobacteria, Dihydrogène, Diméthylsulfoxyde, Dioxygène, Dithionite, Eau, Enzyme, Espèce, Extinction Permien-Trias, Extrêmophile, Fer, Fermentation, Fracturation hydraulique, Gaz de schiste, Genre (biologie), Glucide, Hydrocarbure, Hydrocarbure aromatique, Hydrogénosulfure, Ingénierie, Marais salant, Marqueur moléculaire, Métabolisme méthanogène, Méthane, Méthylation, Méthylmercure, ..., Micro-organisme, Mont hydrothermal, Nappe phréatique, Nitrate, Nitrite, Nitrospirota, Ordre (biologie), Organisme thermophile, Palplanche, Pétrole, Phénotype, Phylogénie, Phylum, Polysulfure, Prokaryota, Pyrite, Respiration aérobie, Respiration anaérobie, Sédiment, Schiste, Soufre, Sulfate, Sulfite, Sulfure d'hydrogène, Tétrathionate, Thermocladium, Thiosulfate, Trithionate, Type trophique, Vasière, 3'-Phosphoadénosine 5'-phosphosulfate. Développer l'indice (31 plus) »

Acétogenèse

L'acétogenèse est la biosynthèse de l'acétate faite par les procaryotes.

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Acide carboxylique

Modèle éclaté d'un groupe carboxyle. En chimie organique, le terme acide carboxylique désigne une molécule comprenant un groupe carboxyle (–C(O)OH).

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Acide fumarique

L'acide fumarique, ou acide trans-butènedioïque, est un acide dicarboxylique insaturé de formule chimique HOOC–CH.

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Adénosine diphosphate

L'adénosine diphosphate ou ADP est un nucléotide.

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Adénosine monophosphate

L’adénosine monophosphate (AMP), également appelée acide 5'-adénylique, est un ribonucléotide constitué de résidus d'adénine, une base nucléique, et de ribose estérifié par un groupe phosphate.

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Adénosine triphosphate

L’adénosine triphosphate, ou ATP, est un nucléotide formé à partir d'un nucléoside associé à un triphosphate.

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Alcool (chimie)

Le méthanol est le plus simple des alcools. On voit le groupe hydroxyle -OH à droite: O est en rouge et H en blanc. En chimie organique, un alcool est un composé organique dont l'un des atomes de carbone (celui-ci étant tétraédrique) est lié à un groupe hydroxyle (-OH).

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Anaérobie

bactéries du genre Desulfovibrio. Un anaérobie ou organisme anaérobie est tout organisme dont le métabolisme redox ne dépend pas du dioxygène.

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Anion

Un anion (du grec ana-: « en haut » et iôn: « qui va ») est un ion qui, ayant gagné un ou plusieurs électrons, porte une ou plusieurs charges électriques élémentaires négatives: par exemple, l’ion chlorure Cl est l’atome de chlore ayant gagné un électron.

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Archaea

sources chaudes volcaniques. Les archées ou Archaea (du grec ancien, « originel, primitif »), anciennement appelés archéobactéries, sont des microorganismes unicellulaires procaryotes, c'est-à-dire des êtres vivants constitués d'une cellule unique qui ne comprend ni noyau ni organites, à l'instar des bactéries.

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Archaeoglobus

Archaeoglobus est un genre d'archées de la famille des Archaeoglobaceae.

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Bacillota

Les Bacillota – anciennement Firmicutes – sont un embranchement du règne des Bacteria.

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Bactérie

Le terme bactérie est un nom vernaculaire qui désigne certains organismes vivants microscopiques et procaryotes présents dans tous les milieux.

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Bicarbonate

Le bicarbonate, ou hydrogénocarbonate, est un ion polyatomique dont la formule chimique est HCO3−.

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Biocide

Un biocide est défini dans l'Union européenne comme substance ou mélange de substances actives, destinée(s) à détruire ou inactiver ou dissuader tout organisme indésirable, par tout moyen autre qu'une simple action physique ou mécanique (voir définition plus précise plus bas); Il existe plusieurs façons de classer les biocides entre eux.

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Biogenèse

La biogenèse est la création d'un nouvel organisme vivant par un ou plusieurs organismes existants, ou encore de nouvelles cellules à partir d'une ancienne.

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Biosphère profonde

La biosphère profonde est la partie de la biosphère située sous les premiers mètres de la surface.

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Caldivirga

Caldivirga est un genre d'archées de la famille des Thermoproteaceae.

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Cation

Un cation (du grec cata-: « en bas » et iôn: « qui va ») est un ion qui, ayant perdu un ou plusieurs électrons, porte une ou plusieurs charges électriques positives: à l’inverse, un anion contient plus d'électrons que de protons.

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Chaîne de transport d'électrons

ferrédoxine-NADP+ réductase assurant les réactions de la photosynthèse dépendantes de la lumière, couplée à l'ATP synthase par un gradient de concentration de protons dans le cadre d'un processus global appelé photophosphorylation. Schéma d'une matrice mitochondriale montrant les complexes I à IV de la chaîne respiratoire, couplés à l'ATP synthase par un gradient de concentration de protons dans le cadre d'un processus global appelé phosphorylation oxydative. Une chaîne de transport d'électrons est une série d'enzymes et de coenzymes qui réalise globalement deux actions simultanément: elle transfère des électrons depuis des donneurs d'électrons vers des accepteurs d'électrons au cours de réactions d'oxydoréduction successives, et elle assure le pompage de protons ou d'autres cations à travers une membrane biologique.

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Champ pétrolifère

Vienne en Autriche. Vue aérienne de Mittelplate, le plus grand champ pétrolifère d'Allemagne. Un champ pétrolifère ou gisement pétrolifère délimite une zone où est enfouie une grande quantité de pétrole et où une tentative pour l'en extraire peut être faite en creusant des puits.

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Composé aliphatique

Les composés aliphatiques (du grec aleiphat-, aleiphar, -atos: huile, graisse), sont les hydrocarbures à chaîne ouverte (linéaire ou ramifiée), et ceux comprenant un ou plusieurs cycles non-aromatiques (composés alicycliques).

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Corrosion

La corrosion désigne l'altération d'un matériau par réaction chimique avec un oxydant (le dioxygène et le cation H+ en majorité).

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Cycle du soufre

Le cycle du soufre est le cycle biogéochimique des différentes formes du soufre.

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Deltaproteobacteria

Les Deltaproteobacteria (en français les Deltaprotéobactéries) sont une classe de bactéries à Gram négatif de l'embranchement des Pseudomonadota.

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Dihydrogène

Le dihydrogène est la forme moléculaire de l'élément hydrogène qui existe à l'état gazeux aux conditions normales de température et de pression.

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Diméthylsulfoxyde

Le diméthylsulfoxyde noté aussi DMSO est un solvant polaire organosulfuré, aprotique, de formule.

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Dioxygène

Le dioxygène, communément nommé oxygène, est une substance constituée de molécules (constituées chacune de deux atomes d'oxygène).

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Dithionite

Structure de l'ion dithionite, remarquable par sa configuration inhabituelle et par la grande longueur de sa liaison S–S. Représentation tridimentionnelle de l'anion. L'anion dithionite (DT) est un oxyanion de soufre de formule dérivant de l'hypothétique acide dithioneux.

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Eau

L'eau est une substance chimique constituée de molécules.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Espèce

classification du vivant. Dans les sciences du vivant, l’espèce (du latin species, « type » ou « apparence ») est le taxon de base de la systématique.

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Extinction Permien-Trias

L'extinction Permien-Trias ou extinction permienne est une extinction massive survenue il y a environ 252 millions d'années (Ma)252,4 à 251,3 millions d'années.

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Extrêmophile

Les thermophiles sont un type d'organismes extrémophiles se développant dans les sources chaudes, comme dans le Grand Prismatic Spring, au Parc national de Yellowstone. doi.

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Fer

Le fer est l'élément chimique de numéro atomique 26, de symbole Fe.

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Fermentation

Exemple de fermentation industrielle: des bulles de dioxyde de carbone (CO2) forment de la mousse à la surface d'un liquide. La fermentation est un processus métabolique convertissant généralement des glucides en acides, en gaz ou en alcools pour en extraire une partie de l'énergie chimique tout en ré-oxydant les coenzymes réduites par ces réactions.

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Fracturation hydraulique

La fracturation hydraulique est la dislocation ciblée de formations géologiques peu perméables par le moyen de l'injection sous très haute pression d'un fluide destiné à fissurer et microfissurer la roche.

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Gaz de schiste

Le gaz de schiste, également appelé gaz de roche-mère (ou plus rarement au Québec « gaz de shale »), est un gaz naturel contenu dans des roches marneuses ou argileuses riches en matières organiques, roches qui peuvent avoir une structure litée de schisteIl s'agit alors de roches sédimentaires et non des schistes métamorphiques, voir schistes-carton.

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Genre (biologie)

nom d'espèce complet est ''Buteo oreophilus''. En systématique, le genre est un rang taxinomique (ou taxonomique) qui regroupe un ensemble d'espèces ayant en commun plusieurs caractères similaires.

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Glucide

Par exemple, le glucose est un glucide à six carbones, cinq groupes hydroxyle et un groupe aldéhyde. Les grains et céréales contiennent une grande quantité de glucides. Les glucides sont définis par l'Union internationale de chimie pure et appliquée (UICPA) comme une classe de composés organiques contenant un groupe carbonyle (aldéhyde ou cétone) et au moins deux groupes hydroxyle (-OH).

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Hydrocarbure

18) est un hydrocarbure que l'on trouve dans le pétrole, les sphères noires représentent les atomes de carbone, les blanches ceux d'hydrogène. Un hydrocarbure (HC) est un composé organique constitué exclusivement d'atomes de carbone (C) et d'hydrogène (H).

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Hydrocarbure aromatique

Un hydrocarbure aromatique ou arène est un hydrocarbure dont la structure moléculaire comprend un cycle possédant une alternance formelle de liaisons simples et doubles, et respectant la règle de Hückel sur l'aromaticité.

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Hydrogénosulfure

L'ion hydrogénosulfure est un anion de formule chimique HS.

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Ingénierie

L'ingénierie est l'ensemble des fonctions qui mènent de la conception et des études, de l'achat et du contrôle de fabrication des équipements, à la construction et à la mise en service d'une installation technique ou industrielle.

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Marais salant

Marais salants de la baie de San Francisco. Les marais salants ou salins correspondent à des installations d'origine anthropique dont le but est de favoriser l'extraction et la collecte de sel marin à partir de l'entrée d'une ressource, l'eau de mer.

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Marqueur moléculaire

Les marqueurs moléculaires sont un type de marqueur génétique composé de fragments d'ADN qui servent de repères pour suivre la transmission d'un segment de chromosome d'une génération à l'autre.

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Métabolisme méthanogène

Les organismes à métabolisme méthanogène, ou simplement les méthanogènes, sont des micro-organismes qui produisent du méthane comme sous-produit métabolique de la vie en conditions anoxiques, par méthanogenèse.

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Méthane

Le méthane est un composé chimique de formule chimique, découvert et isolé par Alessandro Volta entre 1776 et 1778.

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Méthylation

La méthylation est l'addition d'un groupe méthyle, le phénomène inverse étant la déméthylation.

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Méthylmercure

Formule. X désigne un anion quelconque. Modèle 3D. « Méthylmercure » est un nom générique pour désigner un cation organomercuriel regroupant un cation mercure Hg et un ou plusieurs anions méthyl.

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Micro-organisme

Un micro-organisme ou microorganisme (du grec ancien, « petit » et de, « organe ») ou microbe (du grec, « petit » et, « vie ») est un organisme unicellulaire qui ne peut être observé individuellement qu'à l'aide d'un microscope.

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Mont hydrothermal

Une cheminée hydrothermale dans l'océan Atlantique. Les monts hydrothermaux, cheminées hydrothermales, sources hydrothermales ou fumeurs sont des évents hydrothermaux situés sur l'axe des dorsales océaniques ainsi qu'à proximité des bassins arrière-arc.

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Nappe phréatique

alt.

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Nitrate

Vue planaire de la structure de l'ion nitrate. Vue en 3D de la structure de l'ion nitrate. Modèle boules et bâtonnets de la structure de l'ion nitrate. Niveaux de nitrates à la surface des océans''World Ocean Atlas''.. L'ion nitrate est l'ion polyatomique de formule chimique.

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Nitrite

L'ion nitrite est la base conjuguée de l'acide nitreux.

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Nitrospirota

Le phylum des Nitrospirota comprend des bactéries à Gram négatif.

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Ordre (biologie)

Principaux rangs taxinomiques. En biologie, l'ordre est le quatrième niveau de classification classique des espèces vivantes (voir systématique).

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Organisme thermophile

Les organismes thermophiles (du grec thermê, chaleur et philein, aimer) ou hyperthermophiles sont des organismes qui ont besoin d'une température élevée pour vivre.

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Palplanche

Berges en palplanches sur la Deûle à Lambersart (Nord de la France). Palplanches empilées avant battage. Serrure à la jonction de deux palplanches. Une palplanche (composé de pal et planche) est une planche servant à consolider une galerie de mine afin d'éviter les éboulements.

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Pétrole

Pétrole brut Le pétrole est une huile minérale d’origine naturelle composée d'une multitude de composés organiques, essentiellement des hydrocarbures, piégée dans des formations géologiques particulières.

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Phénotype

Variation phénotypique de la couleur des fleurs chez le pétunia. En génétique, le phénotype est l'ensemble des traits observables d'un organisme.

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Phylogénie

La phylogenèse ou phylogénie, du grec ancien, « tribu, famille, clan » et, « genèse », est l'étude des liens de parenté (relations phylogénétiques ou phylétiques) entre les êtres vivants et ceux qui ont disparu.

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Phylum

Principaux rangs taxinomiques. Le '''phylum''' est le niveau situé sous le règne mais au-dessus de la classe. À noter que, tel que repris dans ce schéma, le terme ''division'' ne s'applique qu'au règne végétal, tandis qu'on parle d'embranchement pour le règne animal. En systématique, le phylum (au pluriel phyla) est le deuxième niveau dans la classification classique des espèces vivantes, le premier étant le règne.

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Polysulfure

Les polysulfures sont une classe de composés chimiques contenant des chaînes d'atomes de soufre.

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Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Pyrite

cm) La pyrite est une espèce minérale composée de disulfure de fer, polymorphe de la marcassite; elle contient généralement des traces de métaux précieux (argent (Ag), or (Au)), et de métaux lourds et métalloïdes toxiques nickel (Ni), cobalt (Co), arsenic (As), cuivre (Cu), zinc (Zn), thallium (Tl), sélénium (Se) et vanadium (V), et qui rendent son exploitation en tant que minerai très polluante.

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Respiration aérobie

La respiration aérobie est un mode de respiration utilisant l'oxygène comme comburant.

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Respiration anaérobie

La respiration anaérobie est un mécanisme dans lequel des électrons passent sur une chaîne de transporteurs dont l'accepteur final est une substance minérale autre que le dioxygène, contrairement à une respiration aérobie où l'accepteur final est du dioxygène.

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Sédiment

Le processus de sédimentation est d'abord une loi physique, liée à la pesanteur. Des phénomènes biologiques peuvent l'accélérer ou le réduire, intervenant notamment dans les cycles écologiques et biogéochimiques. La sédimentation dépend du contexte géomorphologique, climatique, écologique et de la vitesse de l'eau. Une faune spécifique aux sédiments contribue à leur nature, à leur mobilité et à la biodisponibilité des éléments qu'ils contiennent; particules, nutriments, ou polluants. Les vers Polychaete typiques des vases des estuaires y contribuent, mais ils contribuent aussi à aérer les sédiments. Les polluants peuvent être accumulés dans la chaîne alimentaire et quitter le sédiment pour recontaminer d'autres compartiments de l'écosystème, via la bioturbation. État de Washington, États-Unis). Les matériaux se déposent différentiellement selon leur poids, caractéristique utilisée par les chercheurs d'or pour prospecter les sédiments. La sédimentation est à l'origine des roches sédimentaires, dont la craie et le pétrole qui jouent un rôle majeur dans le cycle du carbone. Un sédiment est un ensemble de particules en suspension dans l'eau, l'atmosphère ou la glace et qui a fini par se déposer sous l'effet de la pesanteur, souvent en couches ou strates successives.

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Schiste

Un schiste est une roche qui a pour particularité d'avoir un aspect feuilleté, et de se débiter en plaques fines ou « feuillets rocheux »: on dit qu'elle présente une schistosité.

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Soufre

Le soufre est l'élément chimique de numéro atomique 16, de symbole S. C'est un membre du groupe des chalcogènes.

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Sulfate

Un sulfate est un sel de l'acide sulfurique HSO.

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Sulfite

Les sulfites sont les sels de l'hypothétique acide sulfureux (H2SO3).

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Sulfure d'hydrogène

Le sulfure d'hydrogène, ou hydrogène sulfuré, est un composé chimique de formule, constitué de soufre et d'hydrogène.

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Tétrathionate

L'ion tétrathionate est un anion de formule S4O62−.

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Thermocladium

Thermocladium est un genre d'archées de la famille des Thermoproteaceae.

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Thiosulfate

Le thiosulfate (autrefois dit hyposulfite) est un ion qui a pour formule S2O32−.

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Trithionate

Le trithionate est un oxyanion du soufre.

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Type trophique

Le type trophique (du mot grec θροφη, « nourriture ») définit la manière dont un organisme vivant constitue sa propre matière organique et produit l'énergie dont il a besoin.

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Vasière

Vasière dans le bassin d'Arcachon. Une vasière est un habitat littoral, estuarien ou sous-marin ou d'eau douce constitué de matériaux sédimentés fins non sableux.

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3'-Phosphoadénosine 5'-phosphosulfate

La 3'-phosphoadénosine 5'-phosphosulfate, dont l'anion est couramment abrégé en PAPS, est un dérivé de l'AMP phosphorylé en position 3' et avec un groupe sulfate sur le phosphate de la position 5'.

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Redirections ici:

Bactérie sulfato-réductrice.

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