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Super-famille de protéines

Indice Super-famille de protéines

Une superfamille (ou super-famille) de protéines est le regroupement le plus large (clade) de protéines pour lesquelles il est possible d'identifier un ancêtre commun par homologie.

56 relations: Acide aminé protéinogène, Algorithme, Alignement de séquences, Artérite virale équine, Bos taurus, Catalyse, Chimpanzé, Chloroplaste, Chymotrypsine, Clade, Code génétique, Délétion, Dernier ancêtre commun, Dernier ancêtre commun universel, Domaine protéique, Duplication (génétique), Enzyme, Espèce, Eukaryota, Famille de protéines, Feuillet bêta, Fraternité sacerdotale Saint-Pierre, Gène, Génome, Hélice alpha, Histone, Homo sapiens, Homologie (évolution), Insertion (génétique), Mammifère, Mécanisme réactionnel, MEROPS, Mus musculus, Mutation génétique, Orthologie, Paralogie, Peptidase, Plasmine, Prokaryota, Protéase TEV, Protéine, Rattus norvegicus, Règne (biologie), Résidu (biochimie), Repliement des protéines, Séquence biologique, Serpine, Site actif, Staphylocoque doré, Structure secondaire, ..., Structure tertiaire, Substrat enzymatique, Tonneau bêta, Triade catalytique, Trimeresurus stejnegeri, Virus du Nil occidental. Développer l'indice (6 plus) »

Acide aminé protéinogène

groupe aldéhyde sur l'atome d'azote de l'amine primaire Un acide aminé protéinogène est un acide aminé incorporé dans les protéines lors de la traduction de l'ARN messager par les ribosomes.

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Algorithme

triangulation). Un algorithme est une suite finie et non ambiguë d'instructions et d’opérations permettant de résoudre une classe de problèmes.

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Alignement de séquences

En bio-informatique, l'alignement de séquences (ou alignement séquentiel) est une manière de représenter deux ou plusieurs séquences de macromolécules biologiques (ADN, ARN ou protéines) les unes sous les autres, de manière à en faire ressortir les régions homologues ou similaires.

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Artérite virale équine

L'artérite virale équine est une maladie infectieuse liée à un virus à ARN, de la famille des arteriviridae, ordre des nidovirales.

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Bos taurus

Le (Bos taurus) est une espèce de bovins de l'Ancien Monde issu de l'aurochs sauvage.

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Catalyse

Intérieur du musée de la catalyse à Widnes en Angleterre. En chimie, la catalyse (du nom grec:, « dissolution. ») se réfère à l'accélération ou la réorientation de la cinétique de réaction au moyen d'un catalyseur, et dans certains cas à la sélectivité pour diriger la réaction dans un sens privilégié (réaction concurrente, production d'un produit plutôt qu'un autre).

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Chimpanzé

Le Chimpanzé (Pan) est un genre de Simiformes (singes) appartenant à la famille des Hominidés (grands singes).

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Chloroplaste

Schéma d'un chloroplaste d'une plante. Chloroplastes dans des cellules végétales de ''Plagiomnium'' observées au microscope optique Photographie d'une feuille d'''élodée du Canada'' au microscope optique après une coloration au lugol (coloration des grains d'amidon bien visibles dans les chloroplastes). Les chloroplastes sont des organites présents dans le cytoplasme des cellules eucaryotes photosynthétiques (plantes, algues).

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Chymotrypsine

La chymotrypsine est une peptidase digestive sécrétée par le pancréas, de la famille des protéases à sérine, qui catalyse des protéolyses.

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Clade

grade paraphylétique (ou groupe paraphylétique), réuni sur d'autres considérations. Un clade (du grec ancien:, « branche »), aussi appelé groupe monophylétique, est un groupe d'organismes, vivants ou ayant vécu, comprenant un organisme particulier et la totalité de ses descendants.

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Code génétique

bases nucléiques; à droite, les codons correspondants, chacun spécifiant un acide aminé protéinogène. Le code génétique est l'ensemble des règles permettant de traduire les informations contenues dans le génome des cellules vivantes afin de synthétiser les protéines.

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Délétion

La délétion (symbole: Δ) est une mutation génétique caractérisée par la perte de matériel génétique sur un chromosome.

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Dernier ancêtre commun

En biologie de l'évolution, le concept de dernier ancêtre commun (DAC) à deux lignées d'êtres vivants, ou cénancêtre, correspond à l'espèce la plus récente que ces deux taxons ont pour ancêtre commun.

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Dernier ancêtre commun universel

bibcode.

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Domaine protéique

Exemples de structures de protéines organisées en domaines distincts. Le domaine de couleur brique, appelé domaine PH, est commun aux deux protéines,. Sa fonction est de fixer le phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate (PIP3) Un domaine protéique est une partie d'une protéine capable d'adopter une structure de manière autonome ou partiellement autonome du reste de la molécule.

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Duplication (génétique)

En génétique, la duplication génétique correspond à la multiplication de matériel génétique sur un chromosome.

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Enzyme

stop. Diagramme d'une réaction catalysée montrant l'énergie '''E''' requise à différentes étapes suivant l'axe du temps '''t'''. Les substrats A et B en conditions normales requièrent une quantité d'énergie E1 pour atteindre l'état de transition A…B, à la suite duquel le produit de réaction AB peut se former. L'enzyme E crée un microenvironnement dans lequel A et B peuvent atteindre l'état de transition A…E…B moyennant une énergie d'activation E2 plus faible. Ceci accroît considérablement la vitesse de réaction. Action d'une enzyme sur l'énergie d'activation d'une réaction chimique. Une enzyme est une protéine dotée de propriétés catalytiques.

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Espèce

classification du vivant. Dans les sciences du vivant, l’espèce (du latin species, « type » ou « apparence ») est le taxon de base de la systématique.

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Eukaryota

Les eucaryotes (Eukaryota) sont un domaine regroupant tous les organismes, unicellulaires ou multicellulaires, qui se caractérisent par la présence d'un noyau et généralement d'organites spécialisés dans la respiration, en particulier mitochondries chez les aérobies mais aussi hydrogénosomes chez certains anaérobies.

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Famille de protéines

Une famille de protéines est un ensemble de protéines généralement codées par une famille de gènes.

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Feuillet bêta

Les feuillets β ou feuillets β plissés est la deuxième forme de structure secondaire régulière observée dans les protéines, avec une fréquence de présence plus faible que les hélices α.

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Fraternité sacerdotale Saint-Pierre

La Fraternité sacerdotale Saint-Pierre abrégée en FSSP (en latin) est une société de vie apostolique catholique traditionaliste de prêtres et de séminaristes en communion avec le Saint-Siège.

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Gène

Un gène, du grec ancien (« génération, naissance, origine »), est, en biologie, une séquence discrète et héritable de nucléotides dont l'expression affecte les caractères d'un organisme.

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Génome

Le génome (//), ou plus rarement génôme, est l'ensemble du matériel génétique d'une espèce codé dans son acide désoxyribonucléique (ADN), à l'exception de certains virus dont le génome est constitué d'acide ribonucléique (ARN).

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Hélice alpha

Exemple d'hélice alpha. L’hélice alpha (hélice α) est une structure secondaire courante des protéines.

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Histone

Les histones sont des protéines localisées dans le noyau des cellules eucaryotes et dans les archées.

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Homo sapiens

Homo sapiens, plus communément appelé « homme moderne », « homme », « humain », ou « être humain », est une espèce de primates originaire d'Afrique qui s'est aujourd'hui répandue et naturalisée sur l'ensemble de la planète hormis l'Antarctique.

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Homologie (évolution)

En biologie de l'évolution, une homologie désigne un lien évolutif entre deux traits (en général anatomiques) observés chez deux espèces différentes, qui est dû au fait que toutes deux l'ont hérité d'un ancêtre commun.

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Insertion (génétique)

L'insertion est une mutation génétique caractérisée par l'enchâssement de matériel génétique dans un chromosome.

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Mammifère

Les Mammifères (Mammalia) sont une classe d'animaux vertébrés caractérisés par la présence de fourrure (excepté pour certains mammifères marins), d'une oreille moyenne comportant trois os, d'un néocortex et de glandes mammaires, dont les représentants femelles nourrissent leurs juvéniles à partir d'une sécrétion cutanéo-glandulaire spécialisée appelée lait (on dit alors qu'elles allaitent).

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Mécanisme réactionnel

En chimie, un mécanisme réactionnel est l'enchainement d'étapes, de réactions élémentaires, par lequel un changement chimique a lieu.

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MEROPS

MEROPS est une base de données bio-informatique pour les peptidases et leurs inhibiteurs.

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Mus musculus

La Souris grise Murray Wrobel, 2007.

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Mutation génétique

Un exemple de mutation homéotique: une drosophile Antennapedia Une est une modification rare, accidentelle ou provoquée, de l'information génétique (séquence d’ADN ou d’ARN) dans le génome.

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Orthologie

En biologie de l'évolution, une orthologie est un lien évolutif entre deux gènes présents chez deux espèces différentes.

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Paralogie

En biologie de l'évolution, une paralogie est un lien évolutif entre deux gènes issus d'un évènement de duplication.

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Peptidase

Coupure protéolytique d'une chaîne peptidique Les peptidases (ou protéases ou enzymes protéolytiques) sont des enzymes qui brisent les liaisons peptidiques des protéines.

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Plasmine

La plasmine est une peptidase qui catalyse l'hydrolyse des liaisons peptidiques situées préférentiellement après un résidu de lysine ou un résidu d'arginine.

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Prokaryota

Un procaryote est un micro-organisme unicellulaire dont la structure cellulaire ne comporte pas de noyau, et presque jamais d'organites membranés (la seule exception étant les thylakoïdes chez les cyanobactéries).

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Protéase TEV

La protéase TEV, ou protéase du virus de la gravure du tabac, est une protéase à cystéine du virus de la gravure du tabac.

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Protéine

groupes prosthétiques caractéristiques de cette protéine. acides aminés. Les protéines sont des macromolécules biologiques présentes dans toutes les cellules vivantes.

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Rattus norvegicus

Le rat brun (Rattus norvegicus) est une espèce de rat.

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Règne (biologie)

Principaux rangs taxinomiques. Le règne (du latin « regnum », au pluriel « regna ») est, dans la taxonomie de Carl von Linné (qui classe la biodiversité en fonction des caractères communs partagés), le plus haut niveau de classification des êtres vivants.

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Résidu (biochimie)

acides aminés. En biochimie et en biologie moléculaire, un résidu est la partie d'une molécule, généralement un monomère, qui est restée inchangée après être entrée dans la composition d'une biomolécule complexe ou d'un polymère.

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Repliement des protéines

Repliement des protéines Le repliement des protéines est le processus physique par lequel un polypeptide se replie dans sa structure tridimensionnelle caractéristique dans laquelle il est fonctionnel.

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Séquence biologique

Une séquence biologique est la description de l'enchaînement des éléments (ou monomères) qui constituent une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéine.

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Serpine

Les serpines (de l'anglais serpin, mot-valise pour ine rotease hibitor) sont des protéines aux structures semblables, connues historiquement pour leur capacité à inhiber les protéases à sérine.

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Site actif

Le site actif désigne en catalyse la partie du catalyseur qui va interagir avec le(s) substrat(s) pour former le(s) produit(s).

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Staphylocoque doré

Le staphylocoque doré (Staphylococcus aureus) est l'espèce la plus pathogène du genre Staphylococcus.

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Structure secondaire

feuillets β. Cette protéine est la première dont la structure a été résolue par cristallographie en 1958, par Max Perutz et John Kendrew, ce qui leur a valu l'attribution du prix Nobel de chimie en 1962. En biochimie et en biologie structurale, la structure secondaire se rapporte uniquement à la description de la structure tridimensionnelle localement adoptée par certains segments de molécules biologiques (molécules définies comme étant des biopolymères, comme c’est le cas pour les protéines et les acides nucléiques (ADN/ARN)).

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Structure tertiaire

En biochimie, la structure tertiaire ou tridimensionnelle est le repliement dans l'espace d'une chaîne polypeptidique.

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Substrat enzymatique

En enzymologie, on désigne par substrat enzymatique toute molécule subissant une réaction chimique catalysée par une enzyme (ex: l'amidon est hydrolysé par l'amylase en glucose).

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Tonneau bêta

1A0S). 1BRP). Un tonneau β est une structure protéique constituée d'un grand feuillet β qui se tord et s'enroule pour former une structure quasi cylindrique fermée par des liaisons hydrogène.

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Triade catalytique

base) et la cystéine (nucléophile). En biologie moléculaire, on désigne généralement par triade catalytique les trois résidus d'acides aminés qui interviennent ensemble dans le site actif de certaines hydrolases et transférases telles que des peptidases, des amidases, des estérases, des lipases et des β-lactamases.

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Trimeresurus stejnegeri

Trimeresurus stejnegeri ou Vipère des Bambous est une espèce de serpents de la famille des Viperidae.

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Virus du Nil occidental

Le virus du Nil occidental (en) est l'agent infectieux qui, chez l'humain, provoque la fièvre du Nil occidental.

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Redirections ici:

Superfamille de protéines.

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